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ECOLOGÍA MICROBIANA

PREPARADO: ING. SEGUNDO FAUSTO


RONCAL VERGARA
INTRODUCCIÓN

La visión general sobre la ecología es meramente antropocéntrica y


está relacionada con los problemas de contaminación y en el mejor de
los casos con la interacción que el hombre tiene con su ambiente. Sin
embargo, las interacciones de los organismos con su entorno
comenzaron desde el origen de la vida y han moldeado a nuestro
planeta. Por lo que entender el pasado y futuro evolutivos de la vida en
la Tierra requiere de un entendimiento de la naturaleza de la vida y de
los modos en los que ésta ha surgido y evolucionado en el ambiente
con sus componentes bióticos y abióticos. Para nosotros, los ecólogos
bacterianos, la pregunta central es tratar de discernir porqué los
organismos están en un sitio dado con ciertas abundancias en un
tiempo determinado. Dentro del marco de estudio de la ecología es
importante evaluar la diversidad, abundancia y distribución de los
organismos a diferentes escalas que van desde el paisaje, el
ecosistema, las comunidades y finalmente las poblaciones de las
diversas especies.
¿POR QUÉ ES IMPORTANTE ESTUDIAR LA
ECOLOGÍA?
• Estudiar la ecología de cualquier organismo nos permite entender
muchas cosas, como los cambios ecológicos que ha sufrido y sufrirá
nuestro planeta, relacionadas al organismo en cuestión sino del
ecosistema al que pertenece, los datos ecológicos nos dan información
sobre la historia de los organismos y de su ecosistema así como sobre
las cadenas tróficas y los procesos demográficos. Todo esto nos ha
permitido formular teorías sobre los cambios y evoluciones.
• En otras palabras, entender la ecología nos ayuda a comprender cómo
interaccionan organismos con su ambiente y cómo ambos cambian
debido a estas interacciones, comprender la ecología significa entender
los sutiles cambios en el tiempo que constantemente llevan a la
adaptación de los organismos.
• Así, comprender la ecología es entender, en parte, la evolución.

Ej.: Caracterizar y contar bacterias no es tan fácil como estudiar plantas o


mamíferos. Sin embargo, gracias al descubrimiento de diferentes estrategias
moleculares que permiten identificar a los microorganismos a partir de su DNA
ahora podemos caracterizar y contar bacterias casi tan fácilmente.
DIVERSIDAD Y COEXISTENCIA

• La biomasa de microorganismos terrestres en la superficie de


nuestro planeta ha sido estimada como igual a la de todas las
plantas marinas y terrestres y tal vez sea el constituyente principal
de la biomasa de la Tierra. A pesar que la diversidad genómica de
los microorganismos en el agua y en el suelo puede ser distinta, el
número máximo de individuos que integran el taxón dominante es
similar: ˜ 104-105 individuos por gramo o mililitro. Este hallazgo
sugiere que debe existir algún mecanismo o mecanismos que
controlen la densidad de los taxa y que estos deben funcionar de
manera más o menos similar en todos los ambientes, mientras que
los mecanismos que controlan la diversidad total de la comunidad
bacteriana funcionan de modos distintos en agua y suelo. Existen
algunas ideas sobre los mecanismos que controlan la diversidad
procarionte y ambas tienen que ver con la ecología:
INTERACCIONES TRÓFICAS

• Hutchinson, 3, se preguntaba por qué hay tantas especies de


fitoplancton en un medio aparentemente homogéneo, en donde
todas las especies presentes parecen competir por el mismo tipo de
nutrimentos. Dentro de los procariontes los competidores pueden
coexistir si existe algún mecanismo de pérdida selectiva de
especies que evite que los competidores más exitosos secuestren
todos los recursos.
• Por ejemplo, existe depredación selectiva en tamaño, llevada a
cabo por protozoarios, lo que permite la coexistencia de bacterias y
fitoplancton de diferentes tallas, esta interacción determina cómo se
distribuye la biomasa en grupos funcionales. Otra interacción
frecuente en el mundo de las comunidades microscópicas es la que
existe entre virus y bacterias, este parasitismo es generalmente
específico y ello permite la coexistencia de varios taxa de bacterias
en una comunidad. Este tipo de interacción ha sido asociada con la
especiación dentro de grupos funcionales,
La BIOSFERA en realidad no es
LA BIOSFERA una capa de la Tierra; es el
conjunto de todos los ecosistemas
existentes en la Tierra, es decir, de
todos los seres vivos junto con el
medio en el que viven.
La Biosfera es parte de la corteza
terrestre, pero también es parte de
la Hidrosfera y de la Atmósfera. Las
principales características de la
Biosfera son:

• La diversidad, llamada
BIODIVERSIDAD, es decir, la gran
variedad de seres vivos y de formas
de vida que se pueden encontrar
en nuestro planeta.
• La interrelación y el equilibrio entre
todos los componentes de la
Biosfera, responsable de que
cada alteración que se produce en
un lugar determinado pueda
extenderse por toda la biosfera
LAS FORMAS DE VIDA PUEDEN SÓLO SER MANIFESTADAS EN FORMA
QUÍMICA CUANDO HAY UN ENREJADO ARMÓNICO QUE CREA LA
BIÓSFERA

• ATMOSFERA
• HIDROSFERA
• LITOSFERA
• ECOSFERA
REFERENCIA
• La historia de la vida en la tierra ha sido mayormente microbiana. Desde que comenzó la
vida hace 3800 millones de años hasta la fecha los microbios son las mas abundantes y
efectivas formas de vida en la tierra.
• Los microbios, además han jugado un papel importante en los procesos biogeoquímicos,
que ayudaron a hacer la biosfera un lugar mas habitable para otras formas de vida, y que
siguen siendo indispensables en la mineralización y ciclo de nutrientes.

• La Ecología Microbiana, es la ciencia encargada del


estudiar el papel que juegan los microorganismos en la
biosfera. Este puente de unión entre la Ecología y la
Microbiología, se caracteriza por avances significativos
hacia un mejor entendimiento de los principios
fundamentales que rigen la estructura y función de
ecosistemas acuáticos, aéreos y terrestres y el papel
que juegan los microorganismos dentro de estos
REFERENCIA 2
• Los mecanismos que la diversidad microbiana mantienen en biosfera son la
base de la dinámica de los ecosistemas. Por ejemplo, son la base de la
existencia por ejemplo de las selvas y de los sistemas agrícolas. Por otra
parte, la diversidad microbiana del suelo es la causa de la fertilidad del mismo.
• La importancia de los microbios es además ejemplificado por el papel crucial
de sus relaciones simbióticas con plantas y animales. Relaciones parasitarias
simbiontes son capaces de causar enfermedades virulentas y son un factor
significativo en la conducción de la diversidad biológica. En el polo opuesto,
mutualismos con microorganismos, alguna vez considerados como raros y de
escasa importancia, son ahora reconocidos por haber influenciado la
evolución de la vida en una gran variedad de formas.
• Este mundo invisible, presente en todo los ambientes cuyas condiciones
permitan de alguna manera la vida, ha sido durante largo tiempo ignorado o
tratado de forma muy rudimentaria en los estudios de Ecología clásicos. Pero
su participación en la mayoría de los ciclos fundamentales que permiten la
vida sobre la tierra ha generado un auge en su estudio principalmente a través
de técnicas de biología molecular, las cuales han ido avanzando muy en
paralelo con los nuevos descubrimientos en este campo.
DEFINAMOS:

• Rama de la ecología que estudia a los microorganismos en su ambiente


natural, los cuales mantienen una actividad continua imprescindible
para la vida en la Tierra.
• Los mecanismos que mantienen la diversidad microbiana de la biosfera
son la base de la dinámica de los ecosistemas terrestres, acuáticos y
aéreos. Es decir, la base de la existencia de las selvas y de los sistemas
agrícolas, entre otros. Por otra parte, la diversidad microbiana del suelo
es la causa de la fertilidad del mismo.
• Esto va más allá del papel que se les adjudicaba tradicionalmente, el
cual se restringía a la degradación y reciclaje de la materia orgánica y
al mantenimiento de los principales ciclos de fijación, captación y
liberación de algunos elementos químicos y sus principales compuestos.
Comúnmente no se concibe la extinción de las comunidades
microbianas; sin embargo, el impacto de esta posibilidad será evidente
cuando decaigan las funciones ecosistémicas reguladas por los
microorganismos. ya que esto nos ayuda a mejorar la calidad de vida
ECOLOGIA MICROBIANA
MOS  MICROORGANISMOS

Estudio de los microorganismos en su ambiente natural


Ambiente es todo aquello que rodea a un organismo
vivo.
Por ejemplo los factores químicos, físicos y biológicos.
Los microorganismos (MOs) son parte de comunidades
organizadas llamadas ecosistemas.
Los MOs interactúan con el entorno y pueden cambiar
en forma marcada las características del mismo.
Desempeñan papeles importantes en la síntesis y
degradación de distintos compuestos.
CONTINUA…

• MOs autotróficos: generan materia orgánica a


partir de CO2
• MOs organotróficos: participan en la
biodegradación y reciclado de materia orgánica.
• Se puede definir un ciclo biogeoquímico para los
elementos clave (C, N, S, Fe) en el cual los mismos
sufren distintos estados de óxido reducción a
medida que se mueven a través de un ecosistema.
• Los MOs participan en las reacciones
biogeoquímicas. Para muchos elementos son los
únicos capaces de generar los compuestos clave
capaces de ser utilizados por otros organismos.
ECOLOGIA MICROBIANA

M.O. en sus ambiente

Ambiente: lo que rodea a un organismo viviente 


Factores físicos, químicos y biológicos.

Ecosistemas: comunidades de organismos


transforman y modifican el ambiente
CICLOS BIOGEOQUÍMICOS
Cambios que experimenta un elemento químico
a medida que se mueve en un ecosistema.

La ecología microbiana tiene dos grandes


objetivos:

- Apreciar la biodiversidad de los M.O. y entender


la interacción entre los diferentes grupos que
componen la comunidad.

- Medir la actividad de los M.O. en la naturaleza y


controlar sus efectos en el ecosistema.
ECOLOGÍA ES EL ESTUDIO DE LOS
ORGANISMOS EN SUS AMBIENTES
El crecimiento de los M.O. en la naturaleza
depende de los recursos disponibles
(nutrientes) y de las condiciones de
crecimiento (pH, T, humedad, luz, O2, etc.
Los M.O. son muy pequeños por lo que sus
hábitat también lo son.
La teoría ecológica dice que para cada
organismo existe al menos un nicho, que es
el principal, aquel en el que crece mejor,
pero también puede crecer en otros con
menos éxito.
EL MICROORGANISMO Y SU
MICROAMBIENTE
Niveles nutritivos y velocidades de
crecimiento
Superficie y biofilm
biofilm  adherencia a sólidos
Los biofilmes son microcolonias de células
bacterianas revestidas de células bacterianas
adheridas a una superficie por medio de
polisacáridos adhesivos excretados por las
mismas
células.
Ejemplos
En minerales en biolixiviacion, formación de
la placa dental, corrosion de los barcos.
PERFIL DE DIFERENTES
CONCENTRACIONES DE OXÍGENO EN
UNA MUESTRA DE SUELO
RELACIONES ENTRE LOS
MICROORGANISMOS EN UN
MICROAMBIENTE

• Competencia entre M.O. en un ambiente


natural
• Colaboración metabólica (sintrofía)
• Ej.
• NH3 + O2  NO2- Nitrosomonas
• NO2- + O2  NO3- Nitrobacter
METODOS DE LA ECOLOGIA
MICROBIANA

• La biodiversidad que incluye aislamiento,


identificación y cuantificación de los M.O. en
diferentes hábitats.
• La actividad microbiana, lo que los M.O. hacen en
su hábitat.
MICROAMBIENTE NATURAL

• La producción de células en el ambiente es


mucho menor que en el laboratorio, debido
a algunas características del medio natural:
• Disponibilidad de nutrientes, suele ser baja.
• La distribución de dichos nutrientes a lo
largo del hábitat microbiano no suele ser
uniforme.
• Salvo raras excepciones los
microorganismos no se encuentran en
cultivos axénicos en los medios naturales,
por lo que deben competir por los
nutrientes.
MÉTODOS DE ENRIQUECIMIENTO Y
AISLAMIENTO

• Se requiere un inóculo adecuado


• Dar condiciones selectivas (inhibidores
de algunos)
• Existen numerosos métodos desarrollados
para los diferentes tipos de M.O.
• Métodos de cultivos líquidos y sólidos
(agar)

• Se ha demostrado que no todos los M.O.


de un ecosistema son cultivables
CULTIVO DE ENRIQUECIMIENTO

• Se requiere un inóculo apropiado (hábitat


adecuado).
• Se siembra en un medio selectivo.
• Se han desarrollado muchos métodos de
cultivo, por lo menos uno por cada M.O.
seleccionado.
• Además de los nutrientes del medio se
requiere también las condiciones generales
de incubación (aerobiosis, anaerobiosis, luz,
pH, temperatura,etc.
COLUMNA DE WINOGRADSKY
• Se diseñó en 1880 para estudiar M.O.
anaeróbicos del suelo, pero representa
un sistema útil para tener una reserva de
diversos procariotas a largo plazo.
• Se prepara con lodo rico en materia
orgánica incluyendo paja, restos de
papel, serrín, hojarasca,carne picada,
huevo duro, etc. Se agrega algo de
CaSO4 y CaCO3. Se aprieta y se cubre
con agua de un lago y se tapa. Se
coloca frente a una ventana orientada
al norte.
COLUMNA DE WINOGRADSKY
COLUMNA DE WINOGRADSKY
COLUMNA DE WINOGRADSKY

• Se ha utilizado como medio de


enriquecimiento para diversos procariotas,
tanto aeróbicos como anaeróbicos.
• Permite añadirle cualquier compuesto cuya
degradación se desee estudiar, y luego
seleccionar los microorganismos que
realizan tal degradación.
• La columna se asemeja mas al ambiente
natural que los medios de cultivo.
CULTIVO AXÉNICO

• El objetivo del estudio de un cultivo de


enriquecimiento es la obtención de un cultivo
axénico (que contiene un único tipo de M.O.)
• Los métodos mas empleados son:
Siembra por estrías*
Tubo de agar
Métodos por dilución
• *De una colonia bien aislada, y repitiendo el
proceso varias veces, se puede traspasar a un
medio líquido.
• Posteriormente se requiere hacer pruebas
microscópicas y metabólicas para verificar
pureza del cultivo.
CULTIVO POR DILUCIÓN DE CÉLULAS
ANAERÓBICAS
IDENTIFICACIÓN Y CUANTIFICACIÓN DE
MICROORGANISMOS

• Los métodos de cultivo y cuantificación


de células viables sólo medirán una
fracción de la comunidad microbiana.
• Puede ser que los M.O. que se desea
cuantificar sean no cultivables, en ese
caso se requiere alguna técnica que
pueda al menos detectar su presencia.
• Se han desarrollado métodos que se
basan en la especificidad de los
anticuerpos y otros en la secuencia de
ácidos nucleicos.
IDENTIFICACIÓN Y CUANTIFICACIÓN
DE MICROORGANISMOS

Tinción y anticuerpos fluorescentes


• Existen varios compuestos que producen
fluorescencia a la luz ultravioleta que se
utilizan para teñir las células vivas, con el
objeto de verlas y contarlas en una
muestra.
• Uno muy utilizado es el naranja de
acridina el que se une al DNA y al RNA.
• Esta tinción se utiliza para calcular el
número total
de M.O. en el suelo o en el agua.
MICROFOTOGRAFÍA FLUORESCENTE DE
UNA COMUNIDAD BACTERIANA
ANTICUERPOS FLUORESCENTES

• El uso de anticuerpos fluorescentes permite


la identificación de un determinado M.O.
los cuales se unen específicamente a
constituyentes de la superficie celular.
• Los anticuerpos pueden hacerse
fluorescentes uniéndolos covalentemente a
compuestos orgánicos fluorescentes como
rodamina B de fluorescencia roja o
isotiocianato de fluoresceína que da una
fluorescencia amarilla verdosa.
ANTICUERPOS FLUORESCENTES

• Esta técnica es muy útil en ecología


microbiana, donde representa uno de los
pocos métodos que existe para la
identificación directa de células
microbianas en ambientes naturales.
• Se utilizan dos técnicas de tinción distintas
de anticuerpos fluorescentes, la directa y la
indirecta.
• En la directa es el propio anticuerpo contra
el M.O. que es fluorescente.
MÉTODO DE TINCIÓN DIRECTA
MÉTODO DE TINCIÓN INDIRECTA
• En este método la presencia de un
anticuerpo no fluorescente sobre la
superficie de la célula se detecta
mediante un anticuerpo fluorescente
dirigido contra el anticuerpo no
fluorescente.
• Esto se consigue inmunizando un conejo
con bacterias, el que producirá
globulinas específicas. Luego se utilizan
Iglob anti-conejo marcadas con un
colorante fluorescente.
• La ventaja de este método es que no se
requiere un
OBSERVACIÓN AL MICROSCOPIO DE
CÉLULAS TEÑIDAS MEDIANTE
ANTICUERPOS FLUORESCENTE
IDENTIFICACIÓN Y CUANTIFICACIÓN DE
MICROORGANISMOS
• Sondas de ácidos nucleicos: una sonda
es un pequeño fragmento de DNA o RNA
complementario, en secuencia de bases,
a la parte de un gen con el cual puede
hibridarse.
• Algunas sondas emplean secuencias
rRNA 16S como herramientas para
diferenciar M.O. en ambientes naturales.
• Actualmente se cuenta con una gran
cantidad de secuencias de rRNA 16S por
lo que es posible construir sondas muy
específicas, capaces de diferenciar
organismos dentro de un mismo dominio
SONDAS DE ACIDOS NUCLEICOS

• En las sondas filogenéticas se utilizan dos


formas de marcado: los isótopos radiactivos
y las tinciones fluorescentes.
• El método de los isótopos radiactivos
emplea sondas marcadas con 35S o 32P, que
se añaden a células fijadas, previamente
permeabilizadas de modo que penetre a la
célula y se fije a un ribosoma. El marcado
de las células se verifica haciendo una
autoradiografía (exposición de una
emulsión fotosensible a la radiactividad de
los ribosomas.
SONDAS DE ACIDOS NUCLEICOS

• En las tinciones fluorescentes se emplean


colorantes fluorescentes que se unen
químicamente a la sonda, lo que permite
hacer visibles a las células cuando se
observan mediante microscopio de
fluorescencia.
• Utilizando sondas unidas a distintos
colorantes es posible identificar y cuantificar
distintos tipos de células en una
determinada muestra.
SONDAS DE ACIDOS NUCLEICOS PARA
IDENTIFICACION DE M.O.: CONTRASTE DE FASE,
TEÑIDAS CON SONDA UNIVERSAL (RNAR) Y TEÑIDAS
CON SONDA EUCARIOTICA
ESTUDIO DE COMUNIDADES
MICROBIANAS POR MEDIO DE SONDAS
• Se puede estudiar la biodiversidad de las
comunidades microbianas utilizando
sondas de RNA ribosómico.
• Los métodos se basan en la extracción
total del DNA o RNA de toda la
comunidad microbiana y a continuación
utilizando sondas específicas de ácidos
nucleicos, se hace amplificación de los
genes RNA ribosómicos mediante la
reacción en cadena de la polimerasa
(PCR), lo que generará clones de RNA
ribosómico, los que pueden secuenciarse
y utilizarse para construir los árboles
ESTUDIO DE COMUNIDADES
MICROBIANAS POR MEDIO DE SONDAS

• Los análisis filogenéticos de las


comunidades microbianas han demostrado
en casi todos los casos la existencia de M.O.
que no habían sido detectados
previamente por métodos de cultivos.
• También se pueden utilizar sondas en tareas
de seguimiento de M.O. en determinados
hábitats.
• Es una excelente metodología que sólo
permite la detección, enumeración o
localización filogenética de los M.O. en
una muestra pero no da cuenta de su
MEDICIONES DE ACTIVIDAD
MICROBIANA

• Uso de radioisotopos
• Se utilizan compuestos que contienen
(C14)
•- autótrofos 14CO2  células
•- reductores SO4=  H2S35
•- metanogénicos 14CO2  14CH4
•- quimiolitotróficos
• glucosa 14C  incorp. C org.
• AA 14C  incorp. C org.
• Uso de microelectrodos : pH, Oxigeno,
USO DE RADIOISÓTOPOS PARA MEDIR ACTIVIDAD
MICROBIANA EN LA NATURALEZA
MICROELECTRODOS
AMBIENTES ACUÁTICOS
• Fitoplancton (algas flotantes)
• Algas bénticas (unidas al fondo)

• Serían los productores primarios


(fototróficos)
luz (superficie)
• Actividad biológica en zonas mas
cercanas a la costa:
• algas y cianobacterias,
• bacterias heterótrofas con metabolismo
fermentativo y metabolismo anaeróbico
DISTRIBUCIÓN DE CLOROFILA EN MAR Y
LAGOS EN COSTA ESTE DE USA
OXÍGENO EN LAGOS Y RIOS

• El oxígeno se encuentra en el aire en un


21%, su solubilidad en agua es limitada y
el intercambio entre el oxígeno disuelto y
el oxígeno atmosférico en las grandes
masas de agua es bajo.
• La producción de oxígeno fotosintético
en mares y lagos se lleva a cabo sólo en
las capas mas superficiales donde llega
la luz.
• La materia orgánica que no se consume
en estos estratos superiores va a dar al
fondo, donde se descompone por
acción de los M.O. facultativos, que
DESARROLLO DE CONDICIONES
ANÓXICAS EN LAS PROFUNDIDADES DE
UN LAGO DE CLIMA MODERADO
OXÍGENO EN LAGOS Y RIOS

• El oxígeno es de particular interés en


especial en los ríos que reciben mucha
materia orgánica procedente de aguas
residuales y de contaminación industrial.
Aunque existe una buena mezcla, se
puede producir un déficit de oxígeno, si
el aporte de materia orgánica es muy
elevado. Esto no es conveniente para los
animales, además se desarrollan M.O.
anaeróbicos que pueden producir
compuestos tóxicos como H2S.
EFECTO DE LA INCORPORACIÓN DE
AGUAS DE DESECHO, RICAS EN MATERIA
ORGÁNICA EN UN RIO
DEMANDA BIOQUÍMICA DE OXIGENO

DBO5: propiedad consumidora del


oxigeno de un cuerpo de agua (por
materia orgánica) (act. microbiana). Se
determina mediante la aireación de una
muestra de agua, sellándola e
incubándola por 5 dias.

• C.O.D.: demanda química de oxigeno,


oxidación con dicromato de potasio.

• T.O.C.: Carbono orgánico total


AMBIENTES TERRESTRES

• Suelos se forman como resultado de la


combinación de los procesos químicos,
físicos y biológicos

• Suelos orgánicos: provienen de


sedimentación en pantanos.

• Suelos minerales: provienen de las


condiciones atmosféricas y otros
materiales inorgánicos.
Estos son los predominantes.
AGREGADO DE SUELO, INTEGRADO POR
MINERALES Y COMPONENTES
ORGÁNICOS
AMBIENTES TERRESTRES

• Algas – líquenes – hongos 


muchos microambientes

• El factor mas importante que influye en la actividad


microbiana en la tierra superficial es la
disponibilidad de agua.
OBSERVACIÓN AL MICROSCOPIO
ELECTRÓNICO DE MICROORGANIMOS EN
UNA PARTÍCULA DE SUELO
LIQUENES CUBRIENDO LA SUPERFICIE DE
UNA GRAN ROCA
AMBIENTES TERRESTRES
• En la tierra profunda la disponibilidad de
nutrientes es la que tiene mayor
influencia.
• En algunos suelos los nutrientes
inorgánicos son los mayores limitantes.
• Las algas y líquenes producen materia
orgánica, lo que lleva al desarrollo de
bacterias quimioorganotróficas y hongos.
Estos pueden generar CO2 por
respiración de la materia orgánica,
según:
• C6H12O6 + 6O2 6 CO2 +6 H2O
AMBIENTES TERRESTRES
• CO2 + H2O  H2CO3
• El ácido carbónico es un agente importante en
la disolución de las rocas.
• También algunos quimioorganótrofos producen
ácidos orgánicos al ambiente los que causan
disolución de las rocas en pequeños tamaños.
Se producen grietas en las rocas y hendiduras
en las cuales se pueden desarrollar lentamente
plantas.
MICROBIOLOGIA DE EL MAR
PROFUNDO
• Region fótica (hasta 300m)
(fototrofos)
• Hasta 1.000m se tiene actividad biológica
• Mas abajo: mar muerto
• Mar profundo: temperatura baja, presion
alta,
bajos niveles de nutrientes
• Ta 100 m 2.3ºC constante
• P 1atm por cada 10m, asi a 5.000 m 500
atm
MICROBIOLOGIA DE EL MAR
PROFUNDO
• Existen asi M.O. barotolerantes y otros
barofilicos (requieren alta presión) son
además psicrofilos.
• Se sabe que la presion afecta la fisiología
y la bioquímica celular
• Crecimiento lento por las bajas
temperaturas
enzima – sustrato: mas lento

• Proteínas superficiales diferentes para las


bacterias no barófilas
• Mayor cantidad de ác. grasos
RESPIRADEROS HIDROTERMICOS
• Zonas de excepción a los psicrófilos, son
zonas con manantiales termales de
aguas profundas.
• Se encuentran animales invertebrados
(gusanos, almejas, etc.)

• ¿Como viven sin materia orgánica?


• Bacterias litótrofas oxidantes de
compuestos de S reducido, viven en
simbiosis con animales, entregándoles
materia orgánica para su desarrollo.
MORFOLOGÍA Y PRINCIPALES ESPECIES
QUÍMICAS PRESENTES EN LAS FUENTES
HIDROTERMALES TEMPLADAS Y EN LAS
CHIMENEAS NEGRAS SUBMARINAS
CHIMENEAS NEGRAS LIBERANDO AGUA RICA
EN SULFURO Y MINERAL A TEMPERATURAS DE
350OC
POGONÓFORO RIFIA, QUE VIVE EN
FUENTES HIDROTERMALES SUBMARINAS
CHIMENEAS NEGRAS
• Fluido hidrotermico contiene sulfuros de hierro

• Se ha aislado litótrofos y organótrofos desde Tº


de 120 – 150ºC o superiores: no

• Procariotas quimiolitótrofas para productividad


primaria
BACTERIAS QUIMIOLITÓTROFAS OXIDADORAS DE
AZUFRE ASOCIADAS AL TEJIDO DEL TROFOSOMA
DE POGONÓFOROS DE FUENTES HIDROTERMALES
SUBMARINAS
PROCARIOTAS QUIMIOLITOTROFAS
PARA PRODUCTIVIDAD PRIMARIA

donador e-
aceptor e-
• Bact. azufre oxid HS-, S, S2 O3= O2,
NO3-
• Bact. nitrificantes NH4+ NO2-
O2
• Bact. sulfato reduct H2
S,SO4=
• Arq. metanogenicas H2
CO2
• Bact. oxid. H2 O2 NO3_-
• Bact. oxid. Fe, Mn+2 Fe+2, Mn+2
VIDA MICROBIANA EN PROFUNDIDADES
DE LA TIERRA

• Bacterias quimioorganotróficas viables en


varios miles de metros por debajo del
suelo (superficie)
• Basaltos: rocas volcánicas ricas en Fe
(1.500m)
• Bacterias quimiolitotróficas anaeróbicas:
Metanogénicas:
4 H2 + CO2  CH4 + 2 H2O
Homoacetogénicas
4 H2 + 2HCO3- + H+ CH3- COO- +
H2O
Sulfato reductoras
VIDA MICROBIANA EN PROFUNDIDADES
DE LA TIERRA

• Todas estas bacterias requieren H2, el que


es producido normalmente por
degradación de la materia orgánica por
bacterias anaeróbicas.
• En los basaltos se encuentra muy poca
materia orgánica, por lo que se ha
postulado y demostrado
experimentalmente que el H2 proviene de
la siguiente reacción:
• FeO + H2O  H2 + FeO3/2
• Así estos procariotas utilizarían
compuestos originados químicamente,
CICLO DEL CARBONO
Aire 0.03% CO2
CO2 + OH-  HCO3-
HCO3- + OH-  H2O + CO3-
[HCO3-] = 0.002M en aguas oceánicas

Fijación de CO2 en océanos: 12 X 1010


ton
anuales

Fijación de CO2 en la tierra: 1.6 X 1010


ton
anuales
CICLO DEL CARBONO

CO2 UTILIZADO POR AUTOTROFOS


FOTOSINTÉTICOS

QUIMIOLITOTROFOS
CICLO DEL CARBONO
CICLO DE OXIDOREDUCCIÓN DEL
CARBONO
MINERALIZACION
Células muertas + bacterias y hongos + O2
(materia orgánica) por Respiración Aeróbica
 material celular + CO2

Células muertas + bacterias y hongos


(anaeróbicos) por fermentación o Respiración
Anaeróbica  material celular + CH4
CICLO BIOGEOQUÍMICO DEL NITRÓGENO

• Nitrógeno es uno de los componentes


principales de las biomoléculas, siempre en
la forma de –NH2.
• Varias de las reacciones clave de
óxidoreducción del nitrógeno que tienen
lugar en la naturaleza las llevan a cabo casi
exclusivamente los microorganismos, por lo
que su participación en el ciclo del
nitrógeno es de gran importancia.
• N2 es la forma más estable y su reservorio se
encuentra en la atmósfera (78%).
CICLO BIOGEOQUÍMICO DEL NITRÓGENO

• Las principales reacciones del ciclo del nitrógeno


tienen relación con los compuestos más
importantes de éste en la naturaleza:
• Fijación del Nitrógeno
• Nitrificación y Desnitrificación
• Amonificación
FIJACIÓN DEL NITRÓGENO

• Implica reacciones de transformación de


N en compuestos nitrogenados.
• La más importante de las reacciones es
la fijación biológica (85%) dada por:
N2 + H2  2 NH3
Realizada por M.O. de vida libre
(bacterias y algas) o simbióticos (viven en
simbiosis con leguminosas).
• Otras reacciones, no biológicas, son la
formación de óxidos de nitrógeno, por
combustión a alta temperatura:
N2 + 2O2 2 NO2
DESNITRIFICACIÓN
DESNITRIFICACIÓN

• En general el producto de la reducción


desasimilatoria del nitrato es el nitrógeno
(N2) y este es el modo principal en que se
forma N2 biológicamente.
• Así la desnitrificación es un proceso
perjudicial para la agricultura.
• Para el tratamiento de aguas residuales
es un proceso benéfico ya que elimina el
nitrato de las aguas, el que podría servir
de nutriente a las algas, estimulando su
crecimiento durante los tratamientos.
AMONIFICACIÓN

• Comp. nitrogenados formados por


plantas y algas son utilizados por
animales  NH4+ o NH3 o ác. úrico o
urea.

• El amoniaco (NH3) se produce durante la


descomposición de la materia orgánica.
A pH neutro se encuentra como amonio
(NH4+) . En condiciones anóxicas el
amoníaco es estable y en esa forma se
encuentra en los sedimentos anóxicos.
NITRIFICACIÓN

4 NH3 + 6 O2 4 NO2- +4 H2O + 4H+


(Nitrosomonas)
NO2- +1/2 O2  NO3- (Nitrobacter)

Bacterias quimioautotróficas, aeróbicas


obligadas
Producen suelos ricos en nitratos
Como fertilizantes o abonos, soluciones
diluidas de amonio.
CICLO BIOGEOQUÍMICO DEL AZUFRE

• La mayor parte del azufre se encuentra en


forma de sulfatos en rocas (yesos) o sulfuros
(pirita).
• Azufre presenta una gran variedad de
estados de oxidación, por lo que existe una
gran variedad de reacciones de
transformación, tanto químicas como
biológicas.
• Las reacciones biológicas más importantes
son
Oxidación de S y de sulfuros por
bacterias.
CICLO BIOGEOQUÍMICO DEL AZUFRE

• Sulfato es uno de los iones mayoritarios


presentes en el agua de mar y es usado
por las bacterias sulfato reductoras.
• El producto final es el ácido sulfhídrico
(H2S) producto natural que participa en
muchos procesos biogeoquímicos.
• Sulfato puede ser reducido también a –SH
por las plantas, hongos, procariontes, en
la reducción asimilatoria (proceso
aeróbico) pasando a formar parte del
material celular.
COMPUESTOS ORGÁNICOS DE
AZUFRE
• Dimetilsulfuro (CH3-S-CH3) se origina en
ambientes marinos como producto de la
degradación del dimetilsulfonato, uno de
los principales osmoreguladores de las
algas marinas.
• Dimetilsulfuro puede ser utilizado por M.O.
como fuente de energía y de carbono.
• Producción anual 45millones de
toneladas
• H2S “ “ 90 “ “ “
• SO2 de combustibles 50 “ “ “
• H2S y SO2 de actividad volcánica 0.7 “
COMPUESTOS ORGÁNICOS DE
AZUFRE
• En la atmósfera el dimetil sulfuro se oxida:
(CH3)2S + O2  CH3SO3 + SO2 + SO4-2
• En hábitats anóxicos puede ser utilizado
por bacterias anaeróbicas:
(CH3)2S  CH4 + H2S
• Por bacterias fototróficas produciendo
DMSO (dimetilsulfoxido)
• Como donador de electrones por
bacterias quimioorganótrofas y
quimiolitótrofas produciendo DMSO.
• Existen otros compuestos de azufre
orgánico pero mucho menos importantes

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