cunoască rolul laboratorului în stabilirea diagnosticului unei boli infecţioase şi monitorizarea terapiei antimicrobiene şi să descrie principalele metode utilizate în acest scop Diferenţierea bolilor şi stabilirea unui diagnostic pozitiv se bazează pe trepiedul anamneză – examen clinic – explorări de laborator şi paraclinice.
În prezent laboratorul dispune de numeroase teste,
unele mai simple, ieftine şi uşor de realizat, altele complexe, necesitând personal specializat, timp îndelungat şi costuri ridicate.
Informaţiile aduse de acestea pot fi decisive pentru
iniţierea antibioterapiei şi a măsurilor de limitare a răspândirii unui anumit microb în comunitate. În mod particulat în domeniul bolilor infecţioase laboratorul ajută clinicianul în stabilirea diagnosticului etiologic prin identificarea unui anumit microorganism a unor componente ale acestuia (antigene, structuri genomice) prin depistarea răspunsului organismului după contactul cu acesta (diagnostic microbiologic şi serologic)
După identificarea microorganismului cauzal pot fi
efectuate teste care să stabilească sensibilitatea acestuia la medicamentele antimicrobiene. Recoltarea probelor biologice trebuie să respecte următoarele principii:
funcţie de sindromul identificat se vor recolta toate produsele biologice în care
este posibilă identificarea agentului microbian cauzal
recoltarea se va efectua astfel încăt să se evite contaminarea cu flora din
mediul înconjurător
probele vor fi recoltate pe căt posibil înainte de iniţierea antibioterapiei; dacă
aceasta a fost totuşi introdusă se va menţiona acest lucru în biletul de însoţire a probelor
probele vor fi recoltate cât mai aproape de debutul bolii
examenele serologice presupun recoltarea de seruri perechi: o probă la debutul bolii şi o alta după două săptămâni
probele trimise către laborator trebuie etichetate corect (nume, prenume,
salonul, numărul foii de observaţie, suspiciunea diagnostică, tipul de analiză solicitată, data recoltării, eventual ora recoltării, riscul biologic funcţie de microbul suspectat)
probele se trimit cât mai rapid către laboratorul de analize
Identificarea microorganismului sau a componentelor acestuia
Examenul microscopic permite evidenţierea unor bacterii,
virusuri, paraziţi sau fungi.
La microscopul optic se pot examina produse native sau
colorate
Există tehnici optice speciale
microscop cu câmp întunecat folosit pentru evidenţierea Treponemei pallidum
microscop cu ultraviolete ce permite identificarea microbilor după colorarea
acestora cu seruri fluorescente
Pentru microscopia electronică preparatele necesită
pregătiri speciale. Imagine la microscopul cu camp intunecat Imagini la microscopul UV La microscopul optice se pot observa:
detalii structurale: ex forma unor bacterii (coci,
bacili, spirili, vibrioni), dimensiunile acestora, unele caracteristici structurale (aspect reniform, prezenţa capsulei sau a unor cili, sporularea), dispunerea acestora (in diplo, în grămezi, în lanţuri, intra- sau extracelular)
afinitatea faţă de diferiţi coloranţi: ex. albastru de
metilen, Gram (Gram pozitivi / Gram negativi), Ziehl-Nielsen sau alte tehnici speciale Cultivarea microbilor urmăreşte izolarea şi identificarea acestora şi, în unele cazuri, testarea sensibilităţii la antimicrobiene.
Spre deosebire de microscopie cultivarea ne oferă date
despre viabilitatea germenilor patogeni.
Pentru bacterii se utilizează medii de cultură universale
(bulion, geloză simplă sau geloză-sânge) sau medii speciale, selective, pentru identificarea unor anumiţi patogeni (ex. mediul Lowenstein pentru micobacterii, nediile MIU şi TSI pentru identificarea unor bacili Gram negativi, etc). Mediul universal pentru cultivarea fungilor este mediul Sabouraud. Virusurile pot fi cultivate pe medii celulare diverse (tehnică laborioasă, disponibilă doar laboratoarelor de cercetare).
Tehnica necesită timp (creşterea bacteriilor se observă
după o incubaţie de 24 ore, unele necesitând o perioadă mai mare – ex. bK – 21-30 zile).
Funcţie de produsul patologic cultivabil deosebim
hemocultura, bilicultura, urocultura, coprocultura. Identificarea antigenelor structurale este o metodă imunologică ce identifică componente microbiene diverse; nu necesită existenţa unor microbi viabili.
Sunt disponibile o multitudine de teste, cele mai folosite
fiind latex-aglutinarea, contraimunelectroforeza, imunofluorescenţa directă sau ELISA. Poate fi folosită pentru toată gama de microorganisme. Exemple de structuri identificabile: Streptococcus pneumoniae – antigenul capsular, Salmonella typhi – antigenul H flagelar, virusul hepatitic B - atg HBs, Cryptococcus neoformans – antigenul capsular, etc. Identificarea structurilor genomice poate fi făcută în scopul identificării microbilor (determinare calitativă) sau în scopul monitorizării evoluţiei bolii, eventual în urma tratamentelor specifice aplicate (determinare cantitativă). Evidenţierea unor gene de rezistenţă la antibiotice poate fi utilă pentru conducerea terapiei.
Alte metode: testul Limulus poate evidenţia
endotoxina bacililor Gram negativi; fermentarea unor zaharuri în mediul de cultură poate fi utilă pentru identificare; evidenţierea unor aminoacizi sau a unor produşi de metabolism poate fi demonstrată după aproximativ 7 zile pe mediul Lowenstein, înainte de apariţia coloniilor bK. Evidenţierea răspunsului gazdei la contactul cu un anumit microb poate fi specifică (sinteza de anticorpi ) sau nespecifică (modificări hematologice – leucocitoză sau leucopenie, neutrofilie sau limfocitoză, incluziuni toxice leucocitare -, apariţia unor proteine în contextul inflamaţiei – proteina C reactivă, procalcitonina, presepsin, interleukine proinflamatorii sau TNF, modificări metabolice – scăderea pH-ului sau apariţia de nitriţi la nivel urinar ). Dintre anticorpi importanţă practică au cei de tip IgM (cu semnificaţia de infecţie acută) şi cei de tip IgG (cu semnificaţia de contact în trecut cu un anumit microorganism, infecţia putând fi vindecată sau cronicizată). Există o multitudine de teste pentru evidenţierea acestor anticorpi – hemaglutinoinhibare, hemaglutinare pasiva, contraimunelectroforeză, reacţie de fixare a complementului, neutralizare, precipitare, imunifluorescenţă directă, ELISA, etc). În cazul în care nu se identifică subtipul anticorpilor, pentru diagnostic se vor practica determinări serologice perechi, la interval de două săptămâni, semnificativă fiind creşterea titrului cu cel puţin patru trepte. În unele etape ale unor infecţii pot coexista la un moment dat anticorpi de tip IgM cu cei de tip IgG. Sinteza anticorpilor IgM are loc în medie la două săptămâni (sau chiar mai mult, săptămâni/luni – ex. în infecţia cu HIV sau cu virusul hepatitic C) după contactul infectant, până la apariţia acestora nefiind posibil diagnosticul pe baze serologice (perioada de „fereastră” a anticorpilor). La noul născut este posibilă evidenţierea unor anticorpi de tip IgG de origine maternă, ce au traversat bariera placentară, în acest caz diagnosticul fiind fals pozitiv; de regulă, în această situaţie anticorpii dispar treptat în perioada următoare. La persoanele cu agamaglobulinemie testarea serologică poate fi fals negativă. Prin intradermoreacţii se poate testa susceptibilitatea organismului la unele infecţii (ex. tuberculoză, bruceloză, histoplasmoză); se bazează pe migrarea leucocitelor la contactul cu un anumit component microbian. Nu se utilizează la persoane cu imunodepresie pe linie celulară. Rolul laboratorului în iniţierea şi conducerea antibioterapiei
Prin teste de laborator poate fi evidenţiată
sensibilitatea microbilor la antibiotice (determinarea fenotipului de sensibilitate, antibiograma); metoda se bazează pe cultivarea germenului pe un mediu de cultură (însămânţare prin „inundare”) şi punerea acestuia în contact cu microdiscuri conţinând o cantitate determinată dintr-un anumit antibiotic; funcţie de mărimea zonei de inhibiţie a creşterii din jurul microcomprimatului se stabileşte dacă microbul este sensibil la antibioticul în cauză, sensibil funcţie de concentraţie (sau intermediar sensibil), ori rezistent. Metoda se practică curent pe medii de cultură solide, pentru bacterii şi fungi. Există metode ce utilizează medii de cultivare lichide, ce determină şi concentraţia minimă de antibiotic necesară pentru inhibarea creşterii microbului (CMI) sau pentru bactericidie (CMB). CMI poate fi determinată şi pe mediile de cultură solide cu ajutorul unor benzi de test impregnate cu diferite concentraţii ale antibioticului de testat (metoda E-test). Pentru virusuri determinarea fenotipului de rezistenţă este o metodă complexă şi scumpă. Pentru bacteriile comune informaţiile privind sensibilitatea acestora la antibiotice se obţin după 48 de ore. În sânge sau alte lichide biologice se poate determina nivelul de antibiotic (nivelul inhibitor sau bactericid); metoda este laborioasă, necesită timp şi se practică doar în cazurile complicate sau în scop de cercetare. Funcţie de informaţiile obţinute clinicianul poate alege un anumit antibiotic, poate opta pentru o anumită doză sau o poate modifica în aşa fel încât distrugerea microbiană să fie maximală la locul infecţiei.