Sunteți pe pagina 1din 33

Aplicações de marcadores moleculares

como ferramenta auxiliar em


programas de conservação,
caracterização e uso de germoplasma e
melhoramento genético vegetal
Claudio Magalhães Gurgel
Introdução

 Grande quantidade de informações sobre identidade genética, diversidade,


frequência gênica, relacionamentos filogenéticos, mapeamento genético, seleção
assistida, entre outras.
 Úteis em programas de conservação, caracterização e uso de germoplasma e
melhoramento genético.
 Ferramentas poderosas na geração de informações úteis em diferentes etapas,
desde a coleta, caracterização e uso de recursos genéticos, passando por
atividades de pré-melhoramento, melhoramento e pós-melhoramento.
 Aumentar a eficiência dos processos de coleta;
 direcionar o enriquecimento da base genética;
 formar e validar coleções nucleares e de trabalho;
 analisar a diversidade e a pureza genética;
 identificar acessos duplicados e redundantes;
 auxiliar trabalhos de classificação botânica e filogenia e subsidiar a seleção de
genitores, o planejamento dos cruzamentos e a seleção de genótipos com
características desejadas em programas de melhoramento genético.
Análise da distribuição geográfica da variabilidade genética

 O princípio dessa aplicação dos marcadores moleculares é confrontar a


variabilidade genética molecular com a distribuição geográfica de vários acessos
do germoplasma.
 Informações de latitude e longitude do local de coleta de cada acesso podem ser
plotadas conjuntamente com mapas do Sistema de Informação Geográfica.
 Descritores ecológicos do local de coleta de cada acesso, como o tipo de
vegetação, tipo de solo, estado, município, bacia hidrográfica, pluviometria
média, entre outros, podem ser obtidos.
Distribuição geográfica de acessos de Stylosanthes macrocephala
(A), salientando as áreas (B) onde foram coletados acessos com
maior diversidade genética entre si com base em marcadores
moleculares.
 Marcadores moleculares associados a sistemas de informação geográfica têm
permitido estudos da diversidade genética de acessos por regiões, identificação
de regiões de maior ou menor diversidade.
 Dados fenotípicos e geográficos e têm orientado a escolha de locais para
conservação in situ, atividades de coleta para conservação ex situ e a busca de
combinações gênicas de interesse para programas de melhoramento genético.
Estratégias de amostragem para coleta de recursos genéticos

 Escolha inadequada dos locais de coleta pode fazer com que não haja uma boa
representatividade da variabilidade genética que precisa ser conservada e
utilizada.
 Estudos da diversidade genética molecular de acessos ou populações em
diferentes regiões podem fornecer informações importantes sobre estratégias de
amostragem para realização de eficientes trabalhos de coleta
Análises de acessos duplicados ou redundantes

 A presença de acessos duplicados ou redundantes, em conjunto com problemas


de sinonímia, homonímia e erros de identificação, dificulta transferência de
resultados e recomendações entre diferentes programas de melhoramento e
aumenta o gasto de tempo e recursos para a conservação e avaliação do
potencial genético dos acessos.
Análise de pureza genética e contaminação de germoplasma

 Análise da pureza genética dessas sementes pode ser feita utilizando marcadores
moleculares.
 O princípio dessa aplicação é estimar o parentesco genético entre as sementes
com base na similaridade genética calculada a partir dos marcadores
moleculares.
 Quantificar taxas de polinização cruzada.
 Verificar contaminações genéticas em amostras de sementes de um determinado
acesso.
 Manutenção da integridade e da estabilidade genética dos recursos genéticos é
um dos principais objetivos dos programas de conservação.
Análise da diversidade genética e frequência gênica
populacional

 As informações de diversidade genética e frequência gênica obtidas com o uso


dos marcadores moleculares geram uma grande quantidade de características
adicionais, que podem ser combinadas com dados de pedigree, do local de coleta
e com características morfológicas, fisiológicas e agronômicas, fornecendo uma
análise mais completa da coleção e de cada acesso
Auxílio em trabalhos de classificação botânica e filogenia

 Utilização de marcadores moleculares nesses estudos foi se tornando cada vez


mais comum.
 Os marcadores moleculares, principalmente aqueles baseados em análises de
sequência, têm um grande potencial como ferramenta auxiliar em trabalhos de
classificação botânica e em estudos de filogenia, origem genética e evolução.
Composição e validação de coleções nucleares e de trabalho

 A coleção nuclear é um grupo de acessos que representa a diversidade genética


de uma coleção original.
 Coleção nuclear possui 10% a 15% do tamanho e representa mais de 70% da
variabilidade genética da coleção original.
 Entre as características utilizadas, marcadores moleculares têm sido utilizados
tanto para a composição quanto para a validação de coleções nucleares.
 O uso de marcadores moleculares pode aumentar consideravelmente, na coleção
nuclear, a representatividade da variabilidade genética da coleção original.
Caracterização de germoplasma

 Para que a variabilidade genética de acessos de espécies cultivadas e silvestres


conservada nos bancos de germoplasma seja utilizada e aproveitada de forma
prática, atividades de caracterização são essenciais.
 Nos últimos anos, houve um aumento significativo do uso de marcadores
moleculares na caracterização de germoplasma.
 Com base nas características moleculares geradas pelos polimorfismos do DNA
dos diferentes acessos ou espécies do banco de germoplasma, várias
informações podem ser obtidas.
Auxílio na seleção de genitores para programas de
melhoramento genético

 A escolha de genitores e o planejamento de cruzamentos em programas de


melhoramento genético são etapas iniciais e fundamentais para o sucesso do
programa.
 Caracterização genética refinada e completa da coleção e de cada acesso do
germoplasma, a qual é obtida com base na avaliação acurada de características
morfológicas, fisiológicas e agronômicas, além dos dados de pedigree.
Confirmações de hibridações e autofecundações

 Normalmente, os melhoristas utilizam marcadores morfológicos para confirmar


que a planta originada de uma hibridação artificial é realmente híbrida e não
originada por autofecundação.
 Utilização de marcadores morfológicos, apesar de muito útil, apresenta
limitações práticas para o melhorista.
 Para contornar tais limitações, marcadores moleculares podem ser utilizados
para a confirmação de hibridações e autofecundações.
Testes de ascendência genética e paternidade

 Baseando-se no mesmo princípio da utilização de marcadores moleculares para


confirmação de hibridações e autofecundações, a análise da herança de cada
marcador molecular ao longo das gerações oferece uma poderosa ferramenta
para a realização de testes de ascendência genética e paternidade.
Recuperação mais rápida do genitor recorrente

 O método dos retrocruzamentos é muito utilizado para transferir características


de alta herdabilidade para genótipos elite Possível reduzir o número de ciclos de
retrocruzamento de sete para três e recuperar 99% do genoma recorrente,
utilizando-se 80 marcadores para genotipar 50 plantas a cada ciclo de
retrocruzamentos.
Desenvolvimento de mapas genéticos

 Desenvolvimento de mapas genéticos é considerado uma das aplicações de


maior impacto da tecnologia de marcadores moleculares na análise genética de
espécies, e, potencialmente, no melhoramento genético, possibilitando:
 A cobertura e análise completa de genomas;
 A decomposição de características genéticas complexas nos seus componentes
Mendelianos;
 A localização de regiões genômicas que controlam características de importância;
 A canalização de toda essa informação para uso em programas de
melhoramento, principalmente pensando na seleção assistida por marcadores
moleculares.
Mapeamento comparativo

 A facilidade para construir mapas genéticos para diferentes espécies utilizando


marcadores moleculares tem possibilitado análises comparativas da estrutura
genômica dessas espécies, quanto à homologia de genes e conservação de
distância e ordem de ligação desses genes nos cromossomos.
Mapeamento gênico

 O desenvolvimento de um número praticamente ilimitado de marcadores


genéticos moleculares associados à evolução dos aparatos computacionais para
cálculos de co-segregação, agrupamento e distâncias entre as marcas e sua
associação com características de interesse tem permitido o mapeamento de
importantes genes em diferentes espécies.
 No caso das características quantitativas, naturalmente controladas por vários
genes, os marcadores moleculares permitem a identificação e análise de cada um
dos genes significativamente associados à característica.
Seleção assistida por marcadores moleculares

 A seleção assistida por marcadores moleculares (SAMM) é uma forma de seleção


indireta de características de interesse com base em marcadores moleculares.
 Uma das vantagens da utilização de marcadores moleculares como característica
auxiliar na seleção indireta é que a acurácia é máxima, ou seja, é igual a 1.
 A utilização dos marcadores moleculares na seleção de características
qualitativas é uma realidade, embora existam, ainda, algumas restrições por
parte dos melhoristas.
 A seleção em estágios iniciais de desenvolvimento possui grande aplicabilidade
em espécies perenes, com período juvenil longo, e em casos onde a expressão da
característica só ocorre na fase final do ciclo da espécie, a exemplo de
características de interesse para agroindústria em grãos de soja.
Seleção genômica ampla

 A seleção genômica ampla pode ser definida como a seleção simultânea de


centenas ou milhares de marcadores, os quais cobrem o genoma de uma
maneira densa, de forma que todos os genes de um caráter quantitativo estejam
em desequilíbrio de ligação com pelo menos uma parte dos marcadores.
 Esses marcadores em desequilíbrio de ligação com os QTLs, tanto de grandes
quanto de pequenos efeitos, explicarão quase a totalidade da variação genética
de um caráter quantitativo.
Predição de desempenho de híbridos simples

 Produção e avaliação de híbridos a partir do cruzamento de linhagens é uma


estratégia muito utilizada em programas de melhoramento genético de plantas
alógamas.
 No caso de híbridos simples, a predição é baseada na habilidade da linhagem
genitora em transmitir uma performance desejada para a progênie híbrida.
Análise de homogeneidade genética de sementes

 Cultivares de espécies autógamas, assim como as linhagens envolvidas na


obtenção de híbridos de espécies alógamas, devem possuir elevado nível de
homogeneidade.
 Marcadores moleculares podem ser utilizados para avaliar essa homogeneidade
genética com altíssima precisão.
Análise de pureza genética de sementes e mistura varietal

 Sementes de uma cultivar ou variedade podem apresentar características


fenotípicas semelhantes, mas serem genotipicamente diferentes.
 Dentro desse contexto, o uso de marcadores moleculares assume grande
importância. Além da avaliação da pureza genética, marcadores moleculares
podem ser utilizados em processos de purificação da cultivar ou linhagem.
Análise de identidade genética ou fingerprinting

 Cada material genético (acessos em bancos de germoplasma, linhagem, híbrido,


matriz, variedade, cultivar, organismos geneticamente modificados etc.) possui
uma sequência de nucleotídeos que compõem o seu DNA.
 A análise de fingerprinting de DNA é uma ferramenta poderosa para a
identificação desses erros e tem sido utilizada em vários trabalhos.
Caracterização e proteção de cultivares

 Entre as várias aplicações dos marcadores moleculares no pós-melhoramento, a


caracterização molecular de variedades e cultivares e sua utilização na proteção
da propriedade intelectual, ou do direito do obtentor merecem destaque.
 Para que os direitos autorais dos obtentores dessas variedades e cultivares
possam ser respeitados, legislações específicas são criadas, em diversos países.
 Nesse contexto, o uso de marcadores moleculares pode assumir grande
importância, uma vez que podem distinguir com facilidade as cultivares, mesmo
quando elas possuem a mesma genealogia.
Considerações finais

 Considerando todas as aplicações discutidas em diferentes etapas, desde a coleta


de germoplasma até a caracterização molecular de variedades melhoradas, é
difícil imaginar uma cultura ou um programa de pesquisa ou desenvolvimento
tecnológico envolvendo germoplasma e (ou) melhoramento genético que não
possa ser beneficiado com o uso de tal tecnologia em algumas situações.
 É adequado supor que, em vez de substituição, haverá, na verdade, uma
integração cada vez mais intensiva entre as avaliações fenotípicas e os
marcadores moleculares.
Referências

 Biotecnologia: estado da arte e aplicações na agropecuária / editores técnicos:


Fábio Gelape Faleiro, Solange Rocha Monteiro de Andrade. – Planaltina, DF :
Embrapa Cerrados, 2011. 730 p. : il.

S-ar putea să vă placă și