Replicación del DNA

Traducción al español por Gustavo

Toledo C., de una PPT de AP.

BIOLOGÍA- 2007-2008
 1953 artículo en Nature
Watson y Crick

BIOLOGÍA-
 Doble hélice: estructura del DNA

“No escapa a nuestro conocimiento que el apareamiento específico que hemos

postulado sugiere inmediatamente un posible mecanismo de copiado del
BIOLOGÍA-
material genético” Watson & Crick
 Direccionalidad del DNA
 Necesitas PO4 nucleótido
enumerar los
Carbonos!
 ¿Qué importa Base N
esto?
5 CH2
¡Esto será O
importante!!
4 ribosa 1

3 2
BIOLOGÍA-
OH
 5
El eje o esqueleto del DNA PO4
 Uniendo el eje del DNA
base
 Se refiere a los 5 CH2

extremos 3 y 5 del O
4 1
DNA C
3 2
 El último Carbono de los O
extremos –O P O

Suena trivial, pero…

O base
esto es 5 CH2
importante!! O
4 1

3 2
OH
BIOLOGÍA- 3
Hebras Anti-paralelas
 Los nucleótidos en el
esqueleto del DNA están
unidos por enlaces entre el
fosfato de un nucleótido y la 5 3
pentosa siguiente entre
los carbonos 3 y 5
 La molécula de DNA tiene
“dirección”
 Hebras complementarias

corren en dirección opuesta

BIOLOGÍA- 3 5
 Enlaces en el DNA
Puentes de
Hidrógeno
5 3

Enlace covalente
Fosfodiéster

3
5

…¿Enlaces fuertes o débiles?

BIOLOGÍA-
¿Cómo encajan los enlaces en el mecanismo de copiado del DNA?
 Pareo de bases en el DNA
 Purinas
 Adenina (A)
 guanina (G)

 Pirimidinas
 timina (T)
 citosina (C)

 Pareo
 A:T
 2 puentes de H
 C:G
 3 puentes de H
BIOLOGÍA-
Copiando el DNA
 Replicación del DNA
 El pareo de bases permite que
cada hebra sirva como un
Molde para una nueva hebra
 Cada Hebra tienen ½ de la
hebra molde y ½ DNA nuevo.
http://bcs.whfreeman.com/phelanphys1e/default.asp#543
081__601928__
http://www.johnkyrk.com/DNAreplication.esp.html

BIOLOGÍA-
 Permítanme
Replicación del DNA presentarles
al equipo
 Un equipo grande de enzimas coordina la
 Replicación

BIOLOGÍA-
Replicación: 1er paso
 Apertura del DNA
 Enzima Helicasa
 Cataliza el desdoble y apertura de la hélice del DNA
 Estabilizada por Proteínas de unión a cadena
simple(Single strand binding protein)
helicasa

BIOLOGÍA- Proteínas de unión a cadena simple Horquilla de Replicación

 Replicación: 2do paso
 Se Construye hebra de
DNA hija
 Se añaden nuevas
bases complementarias
 DNA polimerasa III

Pero…
¿Dónde está la
Se nos olvida
ENERGÍA
DNA algo!
para los enlaces?
Polimerasa III ¿Qué?

BIOLOGÍA-
 Energía para la Replicación
¿De dónde viene la energía para formar los enlaces?
Venimos con
nuestra propia
energía
Recuerdas
al ATP! energía
Energía
¿Hay
¿hay otras
otros
maneras de
nucleótidos
obtener
energéticos?
energía fuera
¡Obvio!
de él?

y dejamos
atrás un
ATP
GTP
CTP
TTP nucleótido! CMP
TMP
GMP
AMP
ADP
BIOLOGÍA- Nucleótido modificado
 Energía para la Replicación
 Los nucleótidos llegan como nucleósidos
 Bases de DNA con P–P–P
 P-P-P = energía para enlaces
 Las bases de DNA arriban con su propia fuente de
energía para formar enlaces
 Enlaces catalizados por enzima: DNA polymerasa III

ATP GTP TTP CTP

BIOLOGÍA-
 5 3

Replicación energía
DNA
 Añadiendo bases Polimerasa III
 Puede sólo enlazar energía
nucleótidos al DNA
extremo 3 de una Polimerasa III
hebra de DNA en energía
DNA
crecimiento
Polimerasa III
 Necesita un nucleótido
de “inicio” para energía DNA
unirse a la hebra en
Polimerasa III
crecimiento en sentido
53
La energía regula 3 5
el proceso
BIOLOGÍA-
5 3 5 Se necesitan Base Ns “primer” 3

energy
sin energía


para enlace
energía
energía

energía
energy

ligasa
energía

energía

BIOLOGÍA-
3 5 3 5
 Okazaki
Hebra Adelantada y retrasada
Límites de la DNA polimerasa III
 Sólo puede añadir nucleótidos
en un grupo 3-OH de una hebra 5

de DNA existente.

3 5
3
5
3 5 5
3

Hebra retrasada
Horquilla de ligasa
Replicación
3
5
Hebra adelantada

Hebra retrasada
3
5

3
DNA polimerasa III
 Fragmentos de Okazaki
 Unidos por ligasa Hebra adelantada
BIOLOGÍA-
 Enzima “soldadora de puntos”  Síntesis continua
 Horquilla y burbujas de Replicación
3 5

5 3

DNA Polimerasa III

Hebra adelantada
5
3 3 5
5 5
5 3 3
Hebra retrasada

3 5
5
3 Hebra retrasada Hebra adelantada Horquilla de replica
5
3 creciente5
5 Horquilla de replicación
creciente 5
Hebra adelantada 3
Hebra retrasada
3
5
5 5

BIOLOGÍA-
Inicio de síntesis de DNA : RNA primers
Límites de la DNA Polimerasa III
 Puede sólo construir sobre el
extremo 3 de una hebra de DNA 5
existente. 3
3 5
5
3
3 5

3 primasa
5 Horquilla de replicación DNA Polimerasa III
creciente
RNA 5

RNA primer 3
 Formado por la primasa
 Sirve como cebador
(iniciador) de la secuencia
BIOLOGÍA-
para la DNA Polimerasa III
Reemplazo de los RNA primers con DNA
DNA Polimerasa I
 remueve secciones del RNA DNA Polimerasa I
primer y los reemplaza con 5

nucleótidos de DNA. 3

3
5 ligasa
Horquilla de replicación
3
creciente
5

RNA 5

3
Pero la DNA Polimerasa I
todavía puede sólo construir
sobre el extremo 3 de una
hebra de DNA existente.
BIOLOGÍA-
 ¡Houston, tenemos
un problema!
Erosión del cromosoma
Todas las DNA Polimerasas
pueden sólo añadir en el DNA Polimerasa I
extremo 3 de una hebra de 5

DNA existente. 3

3
5
Horquilla de replicación
3
creciente DNA Polimerasa III
5

RNA 5
Pérdida de bases en el
extremo 5 en cada Replicación 3

 Los cromosomas se acortan con cada

Replicación
BIOLOGÍA-
 ¿Limita el N° de divisiones celulares?
Telómeros
Secuencias no codificantes en el extremo de
los cromosomas = Capucha protectora
 Limita a ~50 divisiones celulares 5

3

3
5
Horquilla de replicación
3 telomerasa
creciente
5

5

Telomerasa
TTAAGGG TTAAGGG 3
 enzima que actúa en los extremos: Telómeros
 Puede añadir bases de DNA en el extremo 5
 Diferentes niveles de actividad en differentes células
BIOLOGÍA-
 Alta en células madres y cancerosas -- ¿Por qué?
 Horquilla de replicación creciente
DNA
Polimerasa III Hebra retrasada
DNA
Polimerasa I
3’
Fragmentosde primasa
Okazaki 5’
5’ ligasa
SSB
3’ 5’
3’ helicasa

DNA
Polimerasa III
5’ Hebra adelantada
3’
Dirección de Replicación
BIOLOGÍA-
SSB = single-strand binding proteins= Prot. de unión a cadenas simples
 DNA Polimerasas
 DNA Polimerasa III
 1000 bases/segundos! Roger Kornberg
2006 (DPII)
 principal Constructor de DNA

 DNA Polimerasa I
 20 bases/segundos
 edita, repara y remueve primers

DNA Polimerasa III Arthur Kornberg

enzima 1959

BIOLOGÍA-
 Edición y corrección de DNA
 1000 bases/segundo =
¡Un lote de errores
“tipográficos”!
 DNA Polimerasa I
 Corrige errores
 Repara bases malpareadas
 Remueve bases anormales
 repara daños a través de la
toda tu hermosa vida
 Reduce la tasa de error de
1 en 10.000 a
1 en 100 millones de bases

BIOLOGÍA-
 ¡Rápido y preciso!
 A E. coli le toma <1 hora para copiar los
5 millones de pares de bases de su único
cromosoma
 Se divide para formar 2 células hijas
idénticas
 Células humanas copian sus 3 mil millones
de bases y se dividen en células hijas en
sólo unas pocas horas
 Extremadamente preciso
 solo ~1 error por 100 millones de bases

BIOLOGÍA- ~30 errores por ciclo celular

 ¿A qué se parece realmente?

BIOLOGÍA-
 ¿Qué les parece?
Un abrazo, GAToledo

BIOLOGÍA- Esta Animación es muy buena 2011

http://www.wiley.com/college/pratt/0471393878/student/animations/dna_replication/index.html