Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
CATALITICĂ
ENZIME
Mecanisme de reglare a funcţiei proteice
• 1 celulă bacteriană – 250000 proteine diferite, aflate la distanţe f. mici şi
doar câteva molecule de apă
• necesară o reglare foarte strictă a funcţiei proteice
• Unele proteine nu au specificitate mare – pot îndeplinii mai multe funcţii –
depinde de condiţiile de mediu
• Reglarea funcţiei proteice poate fi controlată prin:
– Localizarea produşilor genelor şi/sau a speciilor cu care interacţionează
– Legarea covalentă sau necovalentă a moleculelor de efector (vezi şi
cooperativitatea)
– Cantitatea şi durata de viaţă a proteinei active
Legarea covalentă a efectorilor:
– Fosforilare
– Ataşări covalente de lipide şi glucide
– Metilări la catenele laterale
– Acetilări amino-terminale
– Scindări proteolitice la nivelul lanţului polipeptidic
Controlul cantităţii şi duratei de viaţă
– Cantitatea – la nivel transcripţional
– Durata de viaţă – viteza de degradare
ENZIME
Particularităţi
• Domeniu moderat de temperatură (37°C), pH (7,4) şi presiune (1 atm)
• Mare specificitate, neformând produşi secundari
• Efect net superior al acţiunii catalitice, scăzând energia de activare a
reactanţilor
• În reacţii reversibile, catalizează desfăşurarea reacţiei în ambele
sensuri, în funcţie de concentraţia reactanţilor şi a produşilor de reacţie
Acţiunea :
• formarea unor complexe
tranzitorii de activare, cu
energie foarte mică şi în care
se realizează orientarea
stereospecifică a reactanţilor şi
desfăşurarea reacţiei.
• În majoritatea cazurilor, fixarea
reactanţilor de centrul activ al
enzimei este însoţită de
labilizarea sau ruperea unor ΔGo' = –R T ln Kech
legături din structura
reactanţilor, favorizându-se ΔGo' = –n F ΔE
astfel reacţia.
Eficacitate
Viteza de descompunere a apei oxigenate
în prezenţa a diverşi catalizatori
de exemplu: L-lactat-NAD+-oxidoreductază
4. Liaze: sunt enzime care desfac sau refac molecule, dar în alt mod
decât hidroliza;
• Catalaza
catalaza
H2O2 + H2O2 O2 + 2H2O
• CoenzimaQH2-Cit.c reductaza
coenzima QH2-citocrom C reductaza
coenzima QH2 + 2citCoxidat coenzima Q + 2H+ + 2citCredus
2. Transferaze
• transferă anumite grupări de atomi
(–CH3, –NH2, –PO3H2, etc.) de la un donor pe un acceptor.
• Subîmpărţirea în cadrul clasei se face în funcţie de natura
radicalului transferat: metiltransferaze, aminotransferaze
(transaminaze), etc
alanin - aminotransferaza
alanina + - cetoglutarat piruvat + glutamat
c) Aciltransferazele catalizează transferul radicalilor acil. Transportorul
este Coenzima A, activată de ATP, care formează ca intermediar
acilcoenzima A, unde radicalul acil este legat de atomul de sulf al
CoA.
• Aciltransferazele sunt active în special în metabolismul lipidic;
• un rol important îl joacă acetil-coenzima A (CH3–CO~S–CoA).
glicerol-3-fosfat-aciltransferaza
acil-CoA + glicerol-3-P acilglicerol-3-P + CoA
d) Fosfotransferazele, numite şi kinaze, transferă un rest –PO3H2 de pe
un nucleotid trifosfat (ATP, UTP, GTP) pe un acceptor, care poate fi
monozaharid, un acid sau un alcool.
hexokinaza
glucoza + ATP glucoză - 6 - P + ADP
3. Hidrolaze
• catalizează acele reacţii în care, cu intervenţia apei se desfac
legături de tip ester, eter, amidă, anhidridă, etc.
• Subgrupa - funcţie de tipul legăturii pe care o desfac,
• Denumirea derivă fie de la numele legăturii (esteraze, anhidraze), fie
de la cel al substratului asupra căruia acţionează (glicozidaze,
lipaze, proteaze).
Anhidraza
CO2 + H 2O H 2C O3 H + + H CO3–
carbonică
5. Izomeraze
Catalizează transformările reciproce ale tuturor tipurilor de izomeri şi se
grupează în patru subclase. Exemplu:
• Modificări funcţionale, de exemplu cetoză ↔ aldoză:
glutaminsintetaza
glutamat + NH3 + ATP glutamina + ADP + Pi
Specificitatea enzimelor
GRUP PROSTETIC
• derivaţi ai vitaminelor B1 – tiamin-pirofosfat, B6 – piridoxal-fosfat,
biotină, dar şi componente diferite ca hemul şi ionii metalici.
• sunt legate covalent sau ionic (şi coordinativ, eventual) la nivelul
centrului catalitic şi nu pot fi detaşate de enzimă.
• Ionii metalici sunt cofactori la peste 2/3 din totalul enzimelor şi
intervin în funcţia catalitică a acestora astfel:
– participă la legarea substraturilor sau/şi a cofactorilor enzimatici.
De exemplu, pentru acţiunea creatinkinazei, adevăratul substrat
de reacţie este Mg2+–ATP
– stabilizează conformaţia activă a enzimei
– acţionează în procesul catalitic ca acizi Lewis sau facilitează
cataliza electrofilă
– participă nemijlocit ca şi substrat în reacţii de oxido - reducere,
unde ionul metalic furnizează electroni
His - 95
- H OH
O O
N N
O H
-2
Glu -165 OPO3
• grupările acidice sau bazice din catena laterală a aminoacizilor din situsul
activ pot servi ca agenţi de transfer de proton. La pH fiziologic, forma
protonată a His este cel mai puternic acid, ca formă de bază conjugată
cea mai puternică bază.
• Alţi acizi: SH – Cis, OH – Tyr, ε-amino-Lis, iar baze – bazele conjugate ale
formelor acide
Cataliza covalentă
• are loc prin atacul nucleofil sau electrofil al unor resturi de
aminoacizi din centrul activ al enzimei asupra substratului, rezultând
o legătură covalentă a enzimei cu substratul
Exemplu: adenil-deaminaza
NH2 OH
H2O H2N OH
NH3 N
N N N
N HN
N N
N N N N
Riboză
Riboză Riboză
E ES1 EP2
ES1S2 EP1P2
E ES2 EP1
S1 P2
P1
S2
Mecanism ping-pong
S1 P1 S2 P2
- cetoglutarat
CH2 NH2 CH2 NH2
CHO CHO
Glu E E
E E - cetoglutarat
Glu
k +1 k +2 k +3
E + S ES EP E + P
k -1 k -2 k -3
• La începutul reacţiei nu există P şi se poate spune că complexul
[EP] se disociază mai repede decât se formează din EP, deci K3 >
K2. Ca urmare, reacţia ce limitează viteza de formare a lui P este
reacţia a doua caracterizată prin k+2
k +1 k +2
E + S ES E + P
k -1
Vmax
KM [S]
k -1 k 1
1
v0
1 1 1 KM
v 0 Vmax [S] Vmax
panta = KM / vmax
1
Vmax
1
1 [S]
KM
Factori implicaţi în cinetica enzimatică
Influenţa conc. de enzimă
• Viteza de reacţie creşte direct
proporţional cu concentraţia enzimei
• În condiţiile în care toată cantitatea de
enzimă se găseşte sub forma (ES),
viteza reacţiei rămâne constantă
Influenţa temperaturii
• Creşterea vitezei este limitată de
temperatura la care începe ruperea
legăturilor slabe, hidrofobe şi de
hidrogen, ce menţin conformaţia
enzimei şi care produce denaturarea
enzimei şi pierderea proprietăţilor
catalitice
Influenţa pH-ului
• Sarcina electrică a moleculei
de enzimă este dependentă de
concentraţia ionilor de
hidrogen din ambianţă.
• Pe de altă parte, sarcina
electrică a proteinei - enzimă
influenţează activitatea ei;
• cele mai multe enzime au un
pH - optim de activitate
caracteristic (la care efectul
catalitic este maxim).
• pH-ul optim suferă influenţe:
- felul substratului,
- concentraţia substratului,
- concentraţia unor săruri
- temperatură.
Activatori enzimatici
• determină stimularea activităţii enzimatice, acţiune numită activare.
• poate fi directă - stimulare nemijlocită a enzimei sau
• indirectă - prin suspendarea unui efect inhibitor.
• Activarea prin ioni: Mg2+, Mn2+, Zn2+, Co2+, Cl- (amilazei salivare)
1
V'max
1
Vmax 1
1 [S]
KM
Inhibitori incompetitiv
- se leagă de complexul [ES].
- raportul KM/Vmax va rămâne neschimbat,
- o dreaptă paralelă cu cea a reacţiei neinhibate.
- KM creşte iar Vmax scade
- gradul de inhibiţie depinde de concentraţia inhibitorului
k+1 k+2
E + S ES E + P
k-1 1
V reacţie inhibată
kIS kIS
1
Vmax 1
1 1 [S]
K'M KM
Inhibitori ireversibili
• substanţe ce se fixează de enzimă prin legături covalente ireversibile.
• duce la blocarea activităţii enzimei.
• Inhibitorii se pot lega fie la nivelul centrului activ, fie în alt loc.
Exemple
- Compuşii cu mercur sau iodoacetaţii reacţionează cu grupările SH
ale resturilor de cisteină libere din centrul catalitic activ;
- dietilpirocarbonatul reacţionează cu histidina din centrul activ.
Un caz particular este al metalo-enzimelor, la care blocarea ionului metalic
duce la inhibiţia enzimei: Mg2+ este blocat de EDTA.
Reglarea alosterică
• substanţe numite efectori.
• au în general o masă mică,
• nu seamănă cu substratul sau produsul de reacţie
• se ataşează de enzimă în altă zonă decât centrul catalitic activ.
• Ataşarea efectorului de enzimă induce modificări ale conformaţiei
acesteia, ce cuprind şi centrul catalitic activ, modificând astfel
afinitatea enzimei pentru substrat.
• În funcţie de efectul asupra activităţii catalitice, efectorii sunt pozitivi
sau negativi.
• Enzimele reglate în acest fel se numesc enzime alosterice.
Feed-back negativ (retroreglare alosterică)
S1 S2 S3 ...... Sn P
Din punct de vedere cinetic, există 2 clase de enzime reglate
alosteric:
• Enzime din clasa K, la care efectorul alosteric afectează resturile
de aminoacizi din situsurile de legătură, în urma căruia se modifică
KM, Vmax rămânând la aceeaşi valoare.
• Enzime din clasa V la care modificările din situsurile catalitice
afectează valoarea lui Vmax, în timp ce KM rămâne nemodificat.
glucozoxidaza
glucoza + O2 gluconolactona + H2O2
peroxidaza
H2O2 + o - tolidina complex albastru + H2O
Tehnica ELISA
Ag + Ac-E → Ag – AcE