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• Apreciar la biodiversidad de los microorganismos y entender la interacción entre los diferentes grupos
que componen la comunidad.
2. La actividad microbiológica, ósea como afecta la presencia un determinado M.O. al ecosistema
La célula queda atrapada por que la fuerza creada por el láser que empuja hacia abajo los objetos
pequeños (como las células microbianas) y los mantiene en el lugar, cuando el haz de láser se desplaza, las
células atrapadas se mueven junto con él. La célula recogida se introduce entonces en un tubo pequeño
de medio estéril para iniciar su crecimiento como cultivo axénico.
La tecnología de pinzas de láser es especialmente útil para el aislamiento de bacterias de desarrollo lento,
que pueden ser superadas por el desarrollo rápido
de otras poblaciones en los cultivos de enriquecimiento típicos, o para los organismos
presentes en números tan bajos que podrían perderse con los métodos de enriquecimiento a partir de la
dilución.
COLUMNA DE WINOGRADSKY
Se diseñó en 1880 para estudiar M.O. anaeróbicos del suelo, pero representa un sistema útil para tener
una reserva de diversos procariotas a largo plazo.
Se ha utilizado como medio de enriquecimiento para diversos procariotas, tanto aeróbicos como
anaeróbicos.
Permite añadirle cualquier compuesto cuya degradación se desee estudiar, y luego seleccionar los
microorganismos que realizan tal degradación.
El uso de anticuerpos fluorescentes permite la identificación de un determinado M.O. los cuales se unen
específicamente a constituyentes de la superficie celular.
Los anticuerpos pueden hacerse fluorescentes uniéndolos covalentemente a compuestos orgánicos fluorescentes
como rodamina B de fluorescencia roja o isotiocianato de fluoresceína que da una fluorescencia amarilla verdosa.
Esta técnica es muy útil en ecología microbiana, representa uno de los pocos métodos que existe para la
identificación directa de células microbianas en ambientes naturales.
MÉTODO DE TINCIÓN DIRECTA en ella es el propio anticuerpo contra el M.O. que es fluorescente.
En las sondas filogenéticas se utilizan dos formas de marcado: los isótopos radiactivos y las tinciones
fluorescentes.
El método de los isótopos radiactivos emplea sondas marcadas con isotopos radioactivos 35S o 32P, que
se añaden a células fijadas e inmovilizadas, previamente permeabilizadas de modo que penetre a la
célula y se fije a un ribosoma. El marcado de las células se verifica haciendo una autorradiografía
(exposición de una emulsión fotosensible a la radiactividad de los ribosomas.
En la tinción diferencial con sondas genéticas mas colorantes fluorescentes
Para recuento de células pertenecientes a distintos grupos filogenéticos, el colorante filogenético se une
a las moléculas de ARNr 16S, presentes en los ribosomas. (microscopio de fluorescencia).
Para cada uno de los Filums hay una secuencia característica de bases nitrogenadas compartida entre
todos los microorganismos pertenecientes a ese filum. Se hace una sonda molecular que es
complementario al de la muestra y se le pega un colorante fluorescente. La hibridación entre las
distintas sondas y la secuencia de cada organismo permitirá distinguir los diferentes grupos filogenéticos
en la muestra según su coloración
Ejemplo: contraste de fase, teñidas con sonda universal (rARN) Y teñidas con sonda eucariotica
Tinción Filogenética “Fluorescent in situ hybridization (F.I.S.H.)
MÉTODOS MOLECULARES:
Antes del fin de siglo, fueron desarrollados métodos moleculares capaces de estudiar a los microorganismos
de manera más amplia e independiente del cultivo.
La ecología microbiana mediante métodos convencionales (cultivos), había venido documentando una
fracción microbiana muy pequeña, no necesariamente la más relevante en cuanto a número y actividad, útil
sólo para aquellos microorganismos cuyo único “mérito” era el de ser fáciles de cultivar.
Si es posible alguna solución para enfrentar los problemas generados por la contaminación ambiental de
agua y suelo, el biodeterioro de materiales y patrimonio artístico, la búsqueda de nuevas moléculas y
enzimas, etc., esto sólo será posible a través del entendimiento de la estructura poblacional y función de las
comunidades microbianas y para ello se ha vuelto imperativo el uso del enorme potencial metodológico
proveniente de la biología molecular
Los análisis filogenéticos de las comunidades microbianas han demostrado en casi todos los casos la
existencia de M.O. que no habían sido detectados previamente por métodos de cultivos.
También se pueden utilizar sondas en tareas de seguimiento de M.O. en determinados hábitats.
Es una excelente metodología que sólo permite la detección, enumeración o localización filogenética
de los M.O. en una muestra pero no da cuenta de su actividad.
3.- La ADN polimerasa alarga los iniciadores usando las bandas diana como moldes.
4.- Después de un período de incubación adecuado, se calienta de nuevo la mezcla para separar las
cadenas. Luego se enfría la mezcla para permitir que los iniciadores se hibriden con las regiones
complementarias del ADN recién sintetizado, y se repite el proceso
USO DE RADIOISÓTOPOS PARA MEDIR ACTIVIDAD MICROBIANA EN LA NATURALEZA
El uso de isótopos estables es una alternativa para identificar o medir procesos
microbianos específicos de los microorganismos en muestras complejas.
Microelectrodos: Los ecólogos microbianos usan microelectrodos de cristal para estudiar
la actividad de los M.O. en sus microambientes. Se usan en estudios de campo y los más
conocidos son pH, O2, N2O y sulfihídrico.
Microelectrodos en Ambientes Acuáticos: para el estudio del Fitoplancton (algas
flotantes), Algas bénticas (unidas al fondo).
*Se han usado para el estudio de la fotosíntesis y las transformaciones que se dan en los
tapetes microbianos de las zonas costeras y las fuentes termales (comunidades
estratificadas)
COMUNIDADES Y ECOSISTEMAS MICROBIANOS
Nicho : Es un termino más amplio que hábitat, ya que incluye a los microorganismos, su hábitat
físico, las condiciones de crecimiento físicas -químicas y como influyen los M.O. en el cambio de
estos (desempeñan una función).
Las poblaciones compiten para ocupar los nichos disponibles, aquellas que logran mantenerse
desempeñan un papel funcional que contribuye al mantenimiento de esa comunidad.
Las asociaciones naturales de dos o más especies que actúan como una comunidad,
beneficiándose cada uno de ellos de la actividad de los demás, coexistiendo
espacialmente y cooperando con la supervivencia de todos ellos, es lo que se denomina
“consorcio”.
MICROAMBIENTE
Es donde el M.O. vive y lleva acabo su metabolismo dentro de un hábitat. Estos microambientes
son heterogéneos, ya que las condiciones físico-químicas pueden variar drásticamente.
Por ejemplo en una partícula de suelo de 6 mm pueden existir varios microambientes
diferentes, tanto físicos como químicos y pueden coexistir distintos tipos fisiológicos de M.Os.
Los anaerobios podrían ser activos en el centro de la partícula de tierra, los microaerofílicos mas
cercanos a la superficie y los aeróbicos obligados podrían metabolizar a los 0.2 a 0.3 mm
externos de la partícula.
Anaeróbicos
Aerobios
Microaerofilos
ESTRUCTURA DE LAS COMUNIDADES
Hay medidas importantes que usan los ecólogos para describir la composición de una
comunidad: la riqueza y la diversidad de especies.
Riqueza de especies:
La riqueza de especies es el número de especies diferentes en una comunidad particular.
Si encontráramos 30 especies en una comunidad y 300 en otra, la segunda tendría una riqueza
de especies mucho mayor que la primera.
Diversidad de especies:
Es una función tanto del número de especies diferentes
(riqueza de especies) como de sus abundancias relativas
(uniformidad de especies)
Ejemplo: Una reserva de caza con un antílope y una
cebra en comparación a otra reserva con un antílope y
diez cebras tienen misma riqueza pero uniformidad de
especies diferentes.
Con respecto a los microorganismos: Las interrelaciones entre las poblaciones de una
comunidad, así como las adaptaciones dentro de las diferentes poblaciones, contribuyen a la
estabilidad ecológica de la comunidad.
Algunas interrelaciones entre poblaciones microbianas son asociaciones débiles, en los que
una de ellas puede remplazar a otra, otras son asociaciones fuertes, en los que una población
no puede desplazar a ninguna otra.
𝑑𝑋 1
Donde: . = tasa específica de aumento poblacional
𝑑𝑡 𝑋
r= tasa per cápita de aumento de la población
K= capacidad de carga del medio
X= densidad poblacional (bien número de individuos o bien biomasa
• Inversamente, organismos con valores altos de “K” son mejores competidores en comunidades de
elevada tasa poblacional, prevaleciendo en condiciones masificadas
y dedican una pequeña porción de sus recursos a la reproducción.
Estrategia “r” Estrategia “K”
Alta tasa de reproducción Baja tasa de reproducción
Baja Biomasa Alta biomasa
Ciclos biológicos cortos Ciclos biológicos largos (longevos)
Colonizan rápidamente medios inestables Asentados en ambientes maduros
No cuentan con mecanismos para limitar Poseen mecanismos para limitar su
su reproducción a la capacidad de reproducción y ajustaría a la capacidad
sustentación o de carga de su hábitat. de sustentación o de carga de hábitat
• En cambio la sucesión Alogénica se da cuando son factores ambientales como los estacionales, los
que alteran el hábitat.
Sucesión Primaria:
Si el hábitat no ha sido previamente colonizado con anterioridad (ambiente virgen) Ejem: el tracto
gastrointestinal de un animal recién nacido (organismos pioneros)
Otro ejemplo: ocurre en las dunas, nuevas islas, etc. Este tipo de proceso puede durar miles de años.
Organismos secundarios: Son poblaciones mejor adaptadas al hábitat que ya fue colonizado y
alterado, desplazando a los organismos pioneros.
A medida que este hábitat sufre cambios adicionales, los invasores secundarios también son
desplazados.
La sucesión finaliza cuando se llega a un conjunto de poblaciones relativamente estables, Comunidad Climax
Sucesión autotrófica-heterotrófica:
Cuando la producción bruta (P) supera la tasa de respiración de la comunidad (R) y se acumula
materia orgánica.
La sucesión autotrófica: se da cuando P/R es inicialmente mayor que 1. Siempre que P sea
superior a R, la biomasa se acumulará durante la sucesión autotrófica. A medida que la tasa P/R
se acerca a 1 se da una sucesión hacia una comunidad estable.
EJEMPLOS
• Se da en ambientes que carecen de materia orgánica cuando existe un suministro ilimitado de
energía solar, se da en comunidades pioneras jóvenes, como las que se forman sobre las nuevas
rocas volcánicas
• Un ambiente mineral como la roca desnuda, los organismos fotosintéticos pioneros, tienen
necesidades nutricionales mínimas y un alto grado de tolerancia a las condiciones ambientales
adversas.
• La capacidad de utilizar nitrógeno atmosférico es una ventaja, las cianobacterias terrestres y los
líquenes son un buen ejemplo de pioneros en este tipo de ambientes.
*El proceso comienza con la llegada de organismos autótrofos que generaran la posibilidad de
establecimiento de otros organismos, incluso heterótrofos. Este proceso puede durar de días a años.
Fotoautotrofos fosfogliceraldehido
Al contrario de lo que ocurre en la sucesión autotrófica, la materia orgánica desaparecerá cuando P/R sea menor
que 1, porque el consumo superará la producción.
Generalmente, la sucesión heterotrófica es temporal, ya que culmina con la extinción de la comunidad
al agotarse la fuente de energía almacenada.
Numerosas
Por ejemplo, las
comunidades
comunidades
microbianas que
microbianas que
intervienen en
crecen sobre un
procesos de
tronco caído, de-
descomposición
saparecen tras la
muestran una
descomposición
sucesión
total de dicho
heterotrófica
tronco.
temporal
Una sucesión heterotrófica puede conducir a una comunidad estable si existe un aporte continuado
de materia orgánica alóctona, es decir, materia orgánica de procedencia externa.
Los pioneros de una sucesión heterotrófica necesitan tener sobre todo tasas elevadas de metabolismo y de crecimiento
para controlar la posible entrada de invasores secundarios
Ejem: partículas detríticas que entran en los hábitat
acuáticos, son principalmente tejidos de hojas muertas, de
raíces, de tallos, mezclados con pequeñas cantidades de
desechos de otros orígenes.
Esta ley dice la producción total de biomasa de cualquier organismo está determinada por el
nutriente cuya concentración sea la mínima, en relación con lo que requiere el organismo.
Para crecer los microorganismos requieren:
*Todo ecosistema puede tener carencia o limitación de algún nutriente o factor nutricional.
La presencia y la abundancia de organismos en un ambiente están determinadas no solo por los nutrientes
sino también por fctores fisicoquímicos: Tº, Potencial redox, pH entre otros.
Ley de la tolerancia de Shelford (1913)
Describe la forma en que esas variables abióticas controlan la abundancia de organismos en un ecosistema.
El éxito de una población en un ambiente depende de que estas se hallen dentro del margen de tolerancia
del organismo, si excede del mínimo o del máximo, dicho organismo no prosperará.
Ejem: - Los microorganismo psicrófilos no pueden crecer en ecosistemas con elevadas Temperaturas
- Los anaeróbios estrictos no soportan altas pressiones de oxigeno.
- O halófilos estrictos no se desarrollan.
Casi todos los determinantes ambientales registran el promedio que prevalece en una muestra grande, pero
no consideran la existencia de los microhábitats donde los microorganismos viven realmente.
Ejemplo la cavidad oral, a menudo considerada un ambiente aeróbico por el continuo paso de aire. Sin
embargo hay anaerobios estrictos que viven y crecen en determinados microhábitats anaeróbicos dentro de
la cavidad oral.
La no disponibilidad también puede darse si el compuesto químico está en una forma inadecuada.
Ejem: - El nitrógeno disponible como gas en casi todos los ecosistemas no usados por la mayoría de los
microorganismos (se comporta como factor limitante).
- El fosfato no esta disponible en ambientes donde el pH y las concentraciones de cationes bivalentes son elevados.
- El hierro en s u form a oxidada (Fe3+) es insoluble y por tanto, inasequible para los microorganismos.
*Un margen ancho o estrecho de tolerancia a un determinante ambiental se describe mediante los
prefijos euri - o esteno - respectivamente.
Un microorganismo Eurihalino tolera fluctuaciones amplias de concentraciones salinas, propias de estuarios y rios
sometidos a mareas.
Por el contrario , un microorganismo Estenohalino se ve confinado a un hábitat ya sea de agua continental o de
agua marina.
*La preferencia por un determinante particular se expresa mediante el sufijo - fil o , como en halófilo o
Termófilo.
Los microorganismos con márgenes de tolerancia amplios ( euri-) se desarrollan en gran variedad de hábitat.
Los de tolerancia estrecha o de margen muy limitado (esteno-), solo crecen en algunos ambientes especiales.
Bien los psicrófilos o termófilos estenotermales, sólo crecen en ambientes que permanentemente están en
ambientes o frios o calientes, y no prosperan en ambientes donde la Temperatura fluctúa dentro de un
margen mesofílico.
FACTORES FÍSICO-QUÍMICOS DEL MEDIO
El ambiente afecta las actividades de los microorganismos a través de factores físicos, químicos y
biológicos.
a) Temperatura
El cambio en la actividad enzimática causado por un aumento de 10ºC se conoce como cociente de
temperatura a 10ºC, o valor de Q10. En general, las enzimas poseen valores de Q 10 cercanos a 2; esto
es, un aumento en la temperatura de 10ºC dentro del margen de tolerancia de las enzimas que dobla
la actividad.
Aunque las reacciones biocataliticas son más rápidas a temperaturas elevadas que a temperaturas
mesofílicas, la velocidad de crecimiento (tiempo de generación) de los microorganismos termófilos
suelen ser considerablemente más baja que en los mesófilos.
Como sucede con otros factores ambientales extremos, los microorganismos suelen tolerar mejor la
radiación ionizante que los macroorganismos.
Ejem: Es necesario añadir biocidas incluso al agua de refrigeración de los reactores nucleares, ya que
las elevadas radiaciones ionizantes no impiden la proliferación microbiana.
Las endosporas bacterianas son muy resistentes a las radiaciones gamma; son necesarios d e 0,3-0,4
millones de rads (Mrads) para q e muera un 90% mientras una decima parte de dicha dosis produce el
mismo % de muerte en la mayoría de vegetativas.
Sin embargo, las células vegetativas de Deinococcus radiodurans presentan una elevada resistencia a
las radiaciones, tolerando hasta 1Mrad sin ninguna reducción en el recuento de viables.
Algunas de ellas sobreviven incluso a 3 Mrads.
• Pero esta no presenta una rara sustancia protectora, sino que está dotada de mecanismos
extremadamente eficientes de reparación del DNA.
• Pero por que la selección de dicha resistencia? Si nuestro planeta no está expuesto de manera
natural a radiaciones ionizantes muy intensas.
Radiación ultravioleta. es demasiado energética para la fotosíntesis y resulta destructiva para los
Microorganismos. Mayor poder bactericida (260nm) coincide con la absorción máxima del DNA por lo
que causa deterior en este (Microbicida).
Actúa produciendo dímeros de timina en el ADN, provocando errores en la transcripción. Pero el daño
en el DNA puede repararse enzimáticamente por escisión de las porciones afectadas, pero requiere
tiempo.
La radiación solar también está formada también por Luz visible que posee un efecto reactivador del
ADN. En la naturaleza, los microorganismos están expuestos a radiación UV pero en combinación con
altas intensidades de luz visible. Se entiende por tanto que se haya producido esta adaptación.
PRESIÓN
Presión hidrostática: es la que ejerce el peso de una columna de agua. Una columna de agua de 10m
en un área de 1cm2 pesa 1 kg (1 litro de agua pesa 1 kg ) y ejerce aproximadamente 1 atm de presión.
Por tanto, esta aumenta aproximadamente 1 atm por cada 10 m de profundidad. A nivel del mar la
presión atmosférica es de 1 atm, la presión a 10m es aproximadamente 2atm.
*Para estudiar el crecimiento y el metabolismo de los microorganismos a alta presión hidrostática se
presurizan tubos de cultivo en cilindros mediante una prensa hidráulica.
Una presión hidrostática estacionaria entre 1-400 atm produce escaso o ningún efecto en el
crecimiento y metabolismo de la mayoría de los microorganismos.
Una presión hidrostática más elevada suele inhibir o frenar el crecimiento de organismos terrestres o
de aguas superficiales, pero no el de los organismos barotolerantes de las profundidades marinas, que
pueden estar expuestos a presiones de hasta 1000atm .
.
SALINIDAD
Los Halófilos: Además de afectar a la presión osmótica, la concentración elevada de sal suele
desnaturalizar proteínas y deshidratación de la célula
Halófilos moderados: suelen ser bacterias marinas (ejem: Vibrio fischeri) que viven en 3.5% de NaCl,
y que ven inhibido su crecimiento a concentraciones mayores o menores de sales con una aw
equivalente a la de agua de mar, así como concentraciones determinadas de iones Na+.
*Dunaliella, alga unicelular halófila de color verde que carece de pared celular, incorpora altas
concentraciones intracelulares de glicerol para el equilibrio osmótico.
Muchos hongos son acidotolerantes, algunos hongos toleran pH alcalinos de hasta 9,0 pero su pH
óptimo está cercano al valor neutro.
flujo Otros
continuado: tranquilos:
como en los como los
La convección
ríos Tienen una estanque
térmica, la
mayor
transpiración
capacidad de
por
mezcla
evaporación y
(movimiento
O por las O estáticos la lixiviación
de mezcla)
turbulencias como el desplazan los
como en el suelo materiales
mar
En algunos ecosistemas los materiales se mueven por difusión.
Ejem: La difusión aumenta por diferencia de convección térmica/ En la atmosfera, la difusión de los gases aumenta
por convección a lo largo del gradiente de Tº, produciéndose un ascenso de los gases más cálidos y un descenso de
los más frios.
- En los ecosistemas terrestres, la difusión de materiales depende de la porosidad (poros= espacios
intersticiales)Porosidad se refiere al número y volumen de poros.
La tasa de intercambio de materiales entre los poros y el medio externo afecta la velocidad de difusión y la
disponibilidad de materiales esenciales para el crecimiento y actividad de los microorganismos.
ADSORCIÓN:
Cuando la DBO es alta, los microorganismos suelen utilizar buena parte del oxigeno disuelto para
degradar la materia orgánica, se produce así un agotamiento de oxigeno que causa la muerte de
algunos organismos que, como los peces, necesitan O2 para vivir.
*Copiótrofos Viven en ambientes ricos en materia org. (indicadores de estos amb)
Crecimiento óptimo a concentraciones de 50.000 mg/L
*Oligotrofas Viven en ambientes pobres “
Crecimiento optimo alrededor de 50-100mg/L de concentración de sustrato
Ejem: Los géneros Stella y Labris simetría radiada (strellas de mar). poliprostecadas son frecuentes
en aguas naturales y en suelos. Sin embargo, se han aislado muy pocas veces debido a su crecimiento
lento y a su prefencia por concentraciones bajas de sustrato .
• Precipitación extracelular.
• Formación de complejos extracelulares
• Impermeabilidad al transporte de metales a través de la membrana celular o reducción de dicho
transporte y compartimentación y detoxificación intracelulares
Ejem: Una respuesta muy extendida al estrés por metales pesados es la síntesis de “ metalotioneinas
compuestos químicos que se unen a un metal. Son proteínas que al unirse por ejemplo al zinc,
cadmio, cadmio y cobre, los vuelven inocuos.
POTENCIAL REDOX
La capacidad de un organismo para llevar a cabo esas reacciones depende del estado de
oxidación-reducción del ambiente.
- Algunos microorganismos solo pueden estar activos en ambientes oxidados y otros solamente
pueden vivir en ambientes reducidos.
- El potencial Redox se mide em milivoltios (mV).
- Cualquier ambiente que acepta electrones de un electrodo normal de hidrogeno es una célula que
se define por tener potencial redox positivo;
- Cualquier ambiente que dona electrones se dice que tiene potencial redox negativo.
- Los microorganismos aerobios estrictos necesitan para crecer valores redox positivos mientras que
los anaerobios estrictos frecuentemente requieren valores redox negativos. Los anaerobios
facultativos operan en un amplio margen de valores de potencial redox
FUERZA MAGNÉTICA
Algunas bacterias muestran magnetotaxia, motilidad dirigida por un campo geomagnético.
Estos contienen curpos de inclusión densos com aproximadamente um 4% de hierro em peso, el
hierro magnético está em forma de magnetita o de Greigita, y se encuentran em los “Magnetosomas”.
Estos permiten a las células orientarse en los campos magnéticos y desplazarse por medio de flagelos
hacia los polos magnéticos.
Incluso en cultivo puro algunas bacterias resultan atraídas hacia el polo norte y otras hacia el polo sur.