Ciclo de Krebs y

Bioenergética

BIOQUÍMICA
Año 2013
GLS
 Las 3 Etapas de la Respiración
Oxidación metabólica de sustratos orgánicos

1. Generación de grupo acetilo del ACETIL~CoA, desde

PIRUVATO, ÁCIDOS GRASOS (mitocondria), o AMINOÁCIDOS
(citoplasma/mitocondria).

2. Oxidación de los carbonos del acetilo en el CICLO DE

KREBS(mitocondria).

3. Pasaje de electrones de la oxidación en un segundo paso a

través del sistema de TRANSPORTE DE ELECTRONES para
obtener ATP en la FOSFORILACIÓN OXIDATIVA.
 PROTEÍNAS POLISACÁRIDOS GLICÉRIDOS
1°
Etapa
AMINOÁCIDOS GLUCOSA GLICEROL + AG

2°
Etapa PIRUVATO

ACETIL-CoA

CO2

3° H+
Etapa (NADH, FADH2)
ADP + Pi
Oxidación Fosforilativa
½O2
ATP
H2O
Grupo alimenticio Unidad metabolizada Transformación
convergente

Carbohidratos Glucosa
ENERGÍA en ATP
Grasas (Lípidos) Acidos grasos
Proteínas Aminoácidos
 - O2 - O2
+ O2
Fermentación a Alcohol Fermentación a Lactato en
en levaduras esfuerzos musculares,
eritrocitos, otras células y
algunos microorganismos

Animales, plantas y muchos microorganismos

en condiciones aeróbicas
CICLO DE LOS ACIDOS TRICARBOXILICOS

Papel central en el metabolismo.

Reacciones individuales.
Estequiometría y rendimiento energético.
Regulación.
Transaminaciones, Βeta- Glucólisis, Pentosas-P, Sínt. Ács Nucleicos y
oxidación, Ciclo de Krebs, Transaminaciones regulación de la
Cad. Respiratoria y expresión
Síntesis de ATP

Sínt. y secreción de
Proteínas

Glicosilación
Acilación
1. Nucleolo 6. Golgi 11. Citoplasma
2. Núcleo 7. Citoesqueleto 12. Lisosoma
3. Ribosoma (sínt. Prots.) 8. RELiso 13. Centríolo
Imagen de Magnus Manske
4. Vesícula 9. Mitocondria
5. RER 10. Vacuola
TRENES DE H+ para NADH
CITOPLASMÁTICO
NADH+H+ NAD+
Di-HO-ACETONA-P---------------> GLICEROL-3P FAD+
Glicerol-3P-DH (Citosol) Gli-3-P-DH
(Mitocondrial)
Di-HO-ACETONA-P FADH2
NADH + H+

Malato Oxalacetato  Aspartato Ca++ [200mM] +K+

(+) Acil-S-CoA
(-)
ADP
AA, Malato, ATP
Succinato,
Piruvato Translocasas
NAD+,
NADH, FAD
HS-CoA
Es el final de la glucolisis
Es un punto de inicio para la gluconeogénesis.

En la fermentación es convertido a lactato , etanol, AGV….

Algunos AA se degradan a Piruvato, y a estos les da origen: alanina,
cisteina, glicina, serina, treonina, y triptofano.

Las Enzs que actúan s/ el Piruvato son:

Piruvato Quinasa
Piruvato Descarboxilasa
Piruvato Deshidrogenasa
Lactato Deshidrogenasa
Piruvato Carboxilasa
Piruvato Transaminasas
 Descarboxilación Oxidativa del Piruvato
1) Descarboxilación exergónica y fijación del resto acilo a la TPP-Enz
2) Formación de sulfoester de alta Energía con Lipoato
3) Transtiolación isoergónica del acetilo desde el Lipoato a la HS-CoA

Enzima Cosustrato Sustrato

prostético soluble
Piruvato deshidrogenasa ó E1 TPP = Tiamina
Pir. descarboxilasa pirofosfato
Dihidrolipoil transacetilasa E2 Lipoamida Coenzima A
Dihidrolipoil deshidrogenasa E3 FAD NAD+
CH2 CH2OH
TIAMINA
Otras enzimas con igual mecanismo: H3 C
a)Alfa-cetoglutarato DH, +
S
b)Alfa-cetobutirato DH, CH2 N
N
c)cadena ramificada cetoácido DH
H3C N
Complejo Piruvato deshidrogenasa

H
Piruvato Deshidrogenasa

Fuente de acetil-CoA para el ciclo del ácido cítrico

Cataliza la descarboxilación oxidativa del piruvato.
Se usan 4 Vitaminas diferentes como coenzimas

Piruvato + NAD + + CoA-SH <-> Acetyl~CoA + NADH + CO2

Energéticamente muy favorable ( ΔG = -33.5 kJ/mol) y

esencialmente irreversible in vivo.

Todo el complejo puede inactivarse con
compuestos con arsénico que se unen
a sulfhidrilos (como en dihidrolipoamida)

-O OH HS S
As + -O As
Arsenito OH HS S
R R
HS S
R´-As=O + R´ As
Arsenical
orgánico
HS S
R R
La actividad del complejo Pir-DH es coordinada por la proporción de
Coenzima A acetilada y libre.
Regulación
E2 (componente transacetilasa)
Es inhibida por acetil-CoA y activada por CoA-SH.

En mamíferos, E1 del complejo piruvato dehidrogenasa es susceptible

de modificación covalente. + Fosforilación de Ser en eucariotas
Pir-DH-kinasa (+) y Pir-DH-Fosfatasa (-)

E3 (componente Dihidrolipoamida-DH)
Es inhibida por NADH y activada por NAD+.

La actividad del complejo [NADH]/[NAD] y

es coordinada por
[acetil-CoA]/[CoA]
las relaciones
ATP es un inhibidor alostérico del complejo.
 Acetil-CoA
El enlace tioester posee una
alta energía libre de hidrólisis

Se origina en: Glucosa,

ácidos grasos y
aminoácidos.

Es precursor de: ácidos

grasos, colesterol,
aminoácidos y se oxida
en el Ciclo de KREBS

Aporta los dos C que se

van a oxidar en el ciclo
del ácido cítrico.

Acetil~CoA + H2O  acetato + HS-CoA + H+

∆G°’ = -32,2 kJ/mol
Respiración aerobia y anaerobia
ORIGEN DEL ACETIL~CoA
- Descarboxilación del Piruvato.
- Oxidación de Ácidos Grasos.
- A partir de Aminoácidos
cetogénicos.
 Bicarbonato Piruvato

OTRO DESTINO
DEL PIRUVATO

Piruvato
a
Carboxilasa
 Estrategia General y objetivos del Ciclo del
Acido Cítrico (C. de Krebs)

En cada vuelta se introducen 2

carbonos (Acetil-CoA), y su
equivalente será totalmente
oxidado. Se liberan 2 moléculas de
CO2.
La energía libre de la oxidación se
conserva en forma de coenzimas
reducidas (NADH y FADH2) y GTP.
Los intermediarios se reciclan y
pueden dar AA, AG, Colesterol, Glc,
Porfirinas, oxidar esqueletos de AA.
 Ciclo de Krebs ó de los ácidos
tricarboxílicos
En el ciclo entra una molécula de acetato (dos átomos
de C) salen dos moléculas de CO2 y cuatro pares de
hidrógenos.

1 molécula de glucosa -> 2 de acetato (4 C), que se

degrada en un proceso cíclico.

Una serie de sustancias del ciclo ceden H por pares

(2H) a otra (NAD, FAD) reduciéndola (a NADH, FADH2).
En cierta forma, el proceso equivale a tener átomos de H que se
pueden unir con el O durante la respiración para formar agua.
1 - CITRATO SINTASA
Adición de un grupo acetilo (transportado por HS-CoA) al Oxalacetato = Citrato

2 - ACONITASA
Cambio de un grupo -OH del Citrato de la posición 3 a la 2, dando Isocitrato

3 - ICDH + NAD+:
Deshidrogenación y descarboxilación. Oxidación del -OH del Isocitrato de la posición 2,
debilitación y pérdida del -COO- central, dando Oxalosuccinato (alfa-cetoglutarato)

4 - α-CETOGLUTARATO DH + NAD+:
Deshidrogenación , descarboxilación y síntesis (Similar a reacción de Piruvato-DH)
Por la oxidación se debilita y pierde el –COO- . Ingresa 1 HS-CoA que transporta el Succinato,
central, dando Oxalosuccinato (alfa-cetoglutarato)

5 - SUCCINIL-CoA SINTETASA:
Hidrólisis del Succinil-CoA, c/liberación de suficiente E p/síntesis de GTP

6 - SUCCINATO DH + FAD+:
Oxidación con insaturación del Succinato

7 - FUMARASA + H2O:
Hidratación del Fumarato

8 - MALATO DH + NAD+:
Oxidación del Malato en su grupo alcohol (a carbonilo) reconstituyendo Oxalacetato.
 EC 2.3.3.1.
EC 4.2.1.3.

[[Cis-Aconitato]

EC 1.1.1.37.
EC 1.1.1.41/42.

E1- 1.2.4.2.
EC 4.2.1.2. E1- 2.3.1.12.
E1- 1.6.4.3.

EC 6.2.1.4.
EC 1.3.99.1.
Moléculas:

Simétrica

Asimétricas
(quiral)
 Glucosa + 2 Ácido pirúvico +
Balance 2ATP + 2ADP +
4ADP + 4ATP +
2Pi + 2NADH + 2H+ +
2NAD+ 2 H2O

2 Piruvatos + 2 Ácetil~S-CoA +
2 HS-CoA + 2CO2 +
2 NAD + 2NADH + 2H+ +
 180 g (1 mol) Glucosa son oxidados por 192 g (6 moles)
de oxígeno y se forman 264 g (6 moles) de CO2

Glucosa + Oxígeno => Dióxido de Carbono + Agua + Energía

o bien,
C6H12O6 + 6O2=> 6CO2 + 6H2O
G = -686 kcal/mol
Formación de ATP en la Glucólisis, descarboxilación oxidativa del Piruvato, Ciclo
de Krebs y Sistema acoplado de Cadena Respiratoria-Fosforilación Oxidativa.

Sustratos Productos *ATP

Glucosa Glc-6-P -1ATP -1
Fructosa-6-P Fru-1,6-diP -1ATP -1
2 Gliceraldehidos-1,3-diP 2 1,3-diP-Gliceratos 2NADH 3,5
2 1,3-diP-Gliceratos 2 3-P-Gliceratos 2 ATP 2
2 PEP 2 Piruvatos 2 ATP 2
2 Piruvatos 2 Acetil-CoA 2 NADH 5
2 Isocitratos 2 α-Cetoglutaratos 2 NADH 5
2 α-Cetoglutaratos 2 Succinil-CoA 2 NADH 5
2 Succinil-CoA 2 Succinatos 2 ATP (2 GTP) 2
2 Succinatos 2 Fumaratos 2 FADH2 3
2 Malatos 2 Oxaloacetatos 2 NADH 5
TOTAL 30-32

Calculando según: 2,5 ATP por NADH y 1,5 ATP por FADH2.
La metabolización de la Glc libera E que es
capturada en moléculas de ATP

2 ATP

36-38 ATP
(ó 30-32)
La velocidad de la Glucólisis y la del Ciclo de Krebs (que consume Acetil-
CoA) están integrados (bajo condiciones normales) por:

a) Inhibición por altos niveles

de ATP y NADH
(componentes comunes de
ambas vías); y
b) Por la concentración de
Citrato (producido en Krebs
que inhibe la
Fosfofructoquinasa de la
Glucólisis)

Se metaboliza tanta Glc

requiera el Ciclo de Krebs
 Carácter Anfibólico del Ciclo del Acido Cítrico
Algunos intermediarios del ciclo son precursores y/o derivados de otros compuestos
Retiro de
intermediarios
hacia vías
anabólicas

Reposición
anaplerótica de
intermediarios
agotados.

Las reacciones de
transaminación y
desaminación de AA son
reversibles, por lo que su
dirección varía en función
de la demanda metabólica.

Tips del Ciclo de Krebs
– biosintético
– ahorro de energía
• Remoción de intermediarios
– puede saturarse.
• Única vía enzimática saturable
– azúcares
– ácidos grasos
En la respiración
aeróbica se conserva
aprox. el 42 % de la
energía de la glucosa
en forma de ATP.
288 Kcal * mol-1 (1205
KJ* mol-1 )
Es una reacción
fuertemente
exergónica, con una
energía libre ( G°)
negativa. Se puede
calcular el rendimiento
de la siguiente forma:
288/ 686 x 100= 42 %.
TERMODINAMICA Y
BIOENERGÉTICA
Bioenergética: leyes de la termodinámica

-Estudia las transformaciones de

energía que tienen lugar en la célula.

-Naturaleza y función de los procesos

químicos en los que se transforma la
energía en seres vivos.
 CÉLULAS
Necesitan de energía p/sus actividades
(desarrollo, crecimiento, renovación de estructuras,
síntesis de moléculas, etc).
Según la fuente de carbonos:
 Autótrofos: Pueden utilizar el CO2 como fuente de C (bacterias, vegetales).
 Heterótrofos: obtienen C de moléculas orgánicas complejas (animales,
microorganismos).

CÉLULA ANIMAL
Energía química para realizar trabajo proviene de
la oxidación de sustancias incorporadas como
alimentos (carbohidratos, grasas).
 Metabolismo:
suma de las reacciones químicas que ocurren en la célula
(organizadas en series de reacciones catalizadas) =

“rutas metabólicas”

Fase de Fase de
degradación síntesis

ATP NADPH+H+
Catabolismo: ADP NADP+
Anabolismo:
Las moléculas moléculas pequeñas
nutrientes se convierten reaccionan para convertirse
en otras mas pequeñas en otras más grandes y
y simples. complejas.
 En una transformación química,
gralmente se rompen enlaces y el
contenido de energía (E) de las
moléculas aumenta o disminuye (G
aumenta o disminuye).

“Moneda” de intercambio de Energía

en los procesos biológicos = ATP
 Beta-Oxidación y
A Krebs
n
a
l NADH, NADPH y
o
g FADH2
í son los principales
a
s
transportadores de
electrones, ya que sufren
N oxidaciones y/o
a
t
reducciones reversibles.
u
r Sus reducciones,
a
l
permiten la conservación
e de la Energía Libre que se
s produce en la oxidación
de los sustratos
 DEFINICIONES
 ENERGÍA: Es la “capacidad para producir un
trabajo”.

 SISTEMA: “ toda porción del universo que se

somete a estudio”

 MEDIO: “es lo que rodea al sistema”

 UNIVERSO = SISTEMA + MEDIO

 EQUILIBRIO
QUÍMICO Keq = [C][D] / [A][B]

 Para cada reacción química, el valor de la Keq es

característico a una Tº dada.

 Si Keq >1, la reacción se encuentra desplazada

hacia

 Si Keq <1, la reacción se encuentra desplazada

hacia

 si Keq =1, la reacción se encuentra en Equilibrio y

no hay desplazamiento neto. En seres vivos las
reacciones se desplazan del equilibrio.
PRINCIPIOS DE LA TERMODINÁMICA
 PRIMER PRINCIPIO:
“ LA ENERGÍA TOTAL DEL UNIVERSO
PERMANECE CONSTANTE”
Equivale a decir: la energía del universo no se
crea ni se destruye, permanece invariante. Solo
se transforma.

 SEGUNDO PRINCIPIO:
“ LA ENTROPÍA DEL UNIVERSO
AUMENTA”
Equivale a decir que el grado de desorden en el
universo aumenta.
 DEFINICIONES

 ENTALPÍA (H): es la energía en forma de

calor, liberada o consumida en un sistema a ,T
y P constantes.

 ENTROPÍA (S): energía no degradada, no

utilizada para realizar trabajo.

 ENERGÍA LIBRE (G): Representa la energía

intercambiada en una reacción química. Es la
energía disponible para realizar trabajo.
 Dirección de una reacción
A una temperatura dada la espontaneidad de una reacción dependerá del balance entre
dos tendencias, pudiendo determinarse relacionando las propiedades termodinámicas
de entalpia (∆H) y entropía (∆S).

∆H = está en relación a la energía requerida para romper enlaces químicos (tendencia

a formar los enlaces más fuertes posible).

∆S = está relacionado con el grado de dispersión de la materia y la energía (tendencia

a dispersarse, al mayor desorden).

De acuerdo a la termodinámica, la dirección preferencial para una reacción está

determinada por el compromiso entre las tendencias hacia enlaces más fuertes y mayor
desorden.

Se dice, entonces, que la diferencia entre ∆H y T∆S equivale a una cierta cantidad de
energía útil para hacer trabajo, la que se denomina como energía libre y se simboliza
con la letra G. Esta propiedad del sistema se conoce comúnmente como la energía libre
de Gibbs.
 CAMBIOS DE ENERGÍA LIBRE EN
LAS REACCIONES QUÍMICAS
 Fundamentalmente sólo hay dos razones por la que ocurre
una reacción química:
(1) la tendencia a lograr el mínimo de energía
(2) la tendencia a lograr el máximo desorden

 Medir el contenido de energía de un sistema es muy difícil,

generalmente se mide el cambio de energía entre dos
estados.
 La variación de energía (G) para ir de A hacia B es:
GBA = GB - GA
1
Para ir de B hacia A:
A B
GAB = GA – GB = - GBA

 Matemáticamente: 2
G = H -TS
 CAMBIOS DE ENERGÍA LIBRE EN
LAS REACCIONES QUÍMICAS

Gº es la variación de Energía Libre en

condiciones estándar (Tº= 298ºK,[ ] = 1M,P = 1atm)

Gº’ es la variación de energía libre estándar a

un pH próximo al fisiológico (pH = 7)

R = 1,987 cal/mol grado

 PROCESO EXOTÉRMICO: es aquel que
transcurre con liberación de calor al medio.

 PROCESO ENDOTÉRMICO: el que transcurre

tomando calor del medio.

 PROCESO EXERGÓNICO: libera energía.

(ESPONTANEO)

 PROCESO ENDERGÓNICO: absorbe energía.

(NO ESPONTANEO)
 E libre ó E de Gibbs (G)
Función más importante en Bioquímica
Proceso real o factible = cambio de E libre de Gibbs negativo (-G)

G = Gfinal – Ginicial
G < 0 (FACTIBLE y EXERGÓNICO)

G = 0 (ISOERGÓNICO-en equilibrio)

G > 0 (NO FACTIBLE y ENDERGÓNICO)

REACCIONES CON:
-G = son exergónicas y espontáneas a derecha

+G = endergónicas e inviables a derecha – pero pueden ser

viables por acoplamiento energético con
las exergónicas
COMPUESTOS DE
ALTA ENERGÍA
Compuestos c/Patos ∆G° de hidrólisis, en kJ/mol
Fosfoenolpiruvato (-61.9)
1,3-bifosfoglicerato (-49.3)
Fosfocreatina (-43.0)
ATP (-30.5)
ADP (-30.5)
Glucosa-1-fosfáto (-20.9)
Glucosa-6-fosfáto (-13.8)
 Es el compuesto de alta energía
de mayor importancia en la
ATP
célula.

 El ATP a pH fisiológico se
encuentra como ATP4-. Las 4
cargas negativas se encuentran
próximas y originan tensiones
intramoleculares que
desaparecen al hidrolizarse en
ADP+Pi o AMP+PPi.

 Además los productos de la

hidrólisis se solvatan mejor y se
estabilizan por resonancia
contribuyendo a disminuir G y
desplazando la reacción hacia
 Transferencia de energía en el metabolismo
celular
• P (grupos fosfato) = conservación y transferencia de E

• 1,3-Bis-P-Glicerato y 2P-PEP ceden E al ADP->ATP

• Creatín-P y Arginín-P = reservas de E p/cederla al

ATP (en tejidos con mayores requerimientos temporales
como el músculo)

• Fosforilación oxidativa: transforma ADP en ATP (c/E

liberada por oxidación de coenzimas reducidas)
 Desde el punto de vista energético, una reacción con un
G positivo no podría ocurrir a no ser que exista un
aporte de energía que la haga posible.

 Dicho aporte, lo proveen compuestos de alto contenido

energético, que se caracterizan por tener enlaces que al
romperse liberan una alta cantidad de energía. Este
proceso se llama acoplamiento.

 MOLECULAS DE ALTA ENERGIA : ATP, Acetil-CoA,

Creatina Fosfato, Fosfoenol Piruvato, por ejemplo.
 Las Enzimas pueden combinar
reacciones exergónicas con
endergónicas para resultar en una
reacción acoplada que en conjunto es
exergónica (reacción espontánea).
 REACCIONES ENERGÉTICAMENTE
ACOPLADAS

 Una reacción altamente exergónica puede hacer

que otra endergónica ocurra si ambas se
acoplan.

nombre Gº’(kcal/mol)

ATP ADP + P -7,3

ADP AMP + P -7,7
AMP adenosina + P -3,4
“Los valores de Gº de reacciones secuenciales son aditivos”

Este principio explica por que una reacción

termodinámicamente desfavorable puede ocurrir, si se
acopla a otra reacción que sea exergónica, a través
de un intermediario común

GLUCOSA + ATP  GLUCOSA-6-P + ADP

∆G°’ = -7,3 + 3,3 = -4,0 Kcal/mol

 ACTIVACION
 Es la unión de moléculas biológicas de modo tal
que, la ruptura de ese enlace químico formado,
tiene un G <0

Ejs:
1)
A + COENZIMA A-COENZIMA
A-COENZIMA + B AB + COENZIMA G<0

2)
FOSFORILACION
Estructura química de la Acetil CoA. El
grupo acetilo aparece a la izquierda de la
figura, unido al azufre (S)

ADENOSINA
ÁCIDO PANTOTÉNICO
CISTEÍNA
 LaCoenzima A es un transportador de grupos
acilo.
 Algrupo sulfhidrilo terminal, se unen los
grupos acilo mediante un enlace tioester.
 Lahidrólisis de un tioester es muy favorable
termodinámicamente, lo que hace que esta
molécula tenga un alto potencial de
transferencia de grupos acilo.
 LaCoA es un “transportador de acilos
activado” igual que el ATP es “un
transportador de P activado”.