Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
ADN
ARN Proteină
Ciclul celular
Reprezintă o perioadă
scurtă de la formarea
unei celule prin
diviziune până la
diviziunea acesteia.
Fiecare ciclu celular
cuprinde două
perioade dinamic şi
calitativ distincte:
interfaza şi mitoza
Durata ciclului celular
este variabilă în funcţie de specie şi tip celular, ba chiar şi pentru celulel e aceluiaşi
ţesut.
Unele celule în organism se divid foarte rapid, parcurgând întregul ciclu celular în 8
ore, pe când altele se divid rar, cu ciclul celular de 100 zile sau chiar mai mult.
La eucariotele superioare ciclul celular durează 10-25 ore, din care diviziunea
celulară durează o oră.
• Perioada G1 are durata cea mai variabilă, în timp ce
• perioada S este cea mai constantă pentru un anumit tip celular.
•După ce au depăşit perioada G1, timpul necesar perioada S şi G2, deci până la
începutul diviziunii este foarte constant pentru diferite celule.
• De acea s-a introdus noţiunea de punct de restricţie (punct R) pentru momentul
imediat, urmat de sfârşitul perioadei G1, care trebuie depăşit pentru ca celula să
poată parcurge etapele următoare ale ciclului celular .
• Un alt punct de restricţie se află spre sfârşitul perioadei G2. Inhibarea sintezei
proteinelor în această fază împiedică intrarea celulei în mitoză.
•
Reglarea ciclului celular
Există mecanisme şi factori reglatori, ce
controlează trei evenimente cheie ale
ciclului celular:
- iniţierea sintezei ADN este controlată de complexul activator al
perioadei S;
- derularea replicării materialului genetic nuclear este controlat de
alt factor – semnal de întârziere a perioadei mitotice;
- declanşarea procesului mitotic, în care are loc segregarea
materialului genetic, este dirijată de factorul de activare a mitozei
(M-phase promoting factor: MPF).
Factorii de creştere specifici
Factorul de creştere epidermal – EGF Stimulează proliferarea mai multor tipuri celulare
Factori de creştere de tip insulinic – IGF1, IGF2 Stimulează proliferarea adipocitelor şi a
celulelor din ţesutul conjunctiv
Factorul de creştere neuronal – NGF Induce creştere axonală şi viabilitatea neuronilor simpatici şi
senzori
2. Substrate:
- Dezoxinucleozidtrifosfaţii respectivi dATP, dCTP.
dGTP, TTP
- ribonucleozidtrifosfaţii respectivi: ATP, GTP, CTP, UTP
- ionii de Mg++, Mn++, Zn++
2. Substrate:
- Dezoxinucleozidtrifosfaţii respectivi dATP, dCTP. dGTP,
TTP
- ribonucleozidtrifosfaţii respectivi: ATP, GTP, CTP, UTP
- ionii de Mg++, Mn++, Zn++
3. Enzimele şi proteinele specifice
stabilizante .
- Helicaza - desfacerea dublului helix, treptat, pe porţiuni mici.
- Proteinele de stabilizare menţin cele 2 catene separate ca urmare a intervenţiei
- Topoizomeraza I şi II înlătură supertorsiunile ADN, (I – introduce supertorsiuni
negative; II – scindează o leg. fosfodiesterică pe una din catene şi permite celor 2
catene să se rotească una faţă de alta)
- ADN-polimerazele I, II, III sinteza catenei fiice în direcţia 5'→3' .
ADN-polimerazele I- posedă activitate 5'- 3‘ exonucleazică, înlătură
primerul şi-l înlocuieşte cu fragmente de ADN
ADN-polimerazele II rol neclar
ADN-polimerazele III – acţiune polimerazică (5'- 3‘) - sintetizează în
direcţia 5‘- 3' lanţul polidezoxiribonucleotidic, preluînd instrucţii de la ADN-
matriţă,
- Acţiune exonucleazică (3'- 5‘)
- ARN-polimeraza, primază - sintetizează primerul în direcţia 5'- 3‘ .
- ADN -ligazele unesc fragmentele Okasaki de pe catena întîrziată
Procesul biosintezei DNA se
caracterizează prin :
- sediul sintezei ADN este: nucleul – eucariote. Procariote ?
- replicarea este un proces semiconservativ
- se desfăşoară în trei etape : iniţiere, elongare, terminare
- prezenţa praimerului este obligatorie
- replicarea este cuplată cu desfăşurarea ADN parental (necesită
energie)
- replicarea decurge în ambele direcţii cu aceeaşi viteză. Pe catena
întîrziată se sintetizează fragmentele Okazaki.
- este bazată pe împachetarea complimentară a bazelor azotate
- catena-fiică este antiparalelă cu catena parentală dar nu identică
după secvenţa nucleotidică
- forta motrică a procesului este hidroliza pirofosfatului
- angajeaza simultan intregul cromozom.
DNA-polimerazele
(III)
Prezintă un complex multienzimatic ce posedă câteva situsuri -
pentru DNA, pentru amorsă, dRTP, exonucleazic şi catalitic.
are activitate polimerazică, preia instrucţia de la matriţă şi necesită
prezenţa amorsei cu OH în 3'liberă cât şi dezoxinucleozidtrifosfaţilor
nu poate iniţia sinteza catenelor de ADN-deaceia este necesar
primerul.
posedă activitate 3'-5'-exonucleazică şi exercită o funcţie de
autocorecţie este încadrată în repararea ADN.
(I):
îndepărtează praimerii prin activitatea sa 5'R3' exonucleazică și
adaugă dRN prin activitatea sa polimerazică
Structura promotorului:
Caseta Pribnow 5’ TATAAT 3’
Caseta 35 5’ TTGACA 3’
Unele gene umane au doi sau mai multi promotori. Prin folosirea lor
alternativa rezulta diferite izoforme ale unei proteine, cu proprietati diferite.
Alegerea promotorilor nu se face la intamplare, ci prin actiunea unor factori
trans-reglatori, dintre care unii specific tisulari. Selectarea promotorilor are
loc, de exemplu, in cazul genei distrofinei, care are cel putin opt promotori.
Patru promotori sunt situati in regiunea 5’ si sunt specifici pentru cortexul
cerebral, cerebel, muschi, limfocite; datorita folosirii unui prim exon diferit,
produc patru izoforme de distrofina, diferite prin capatul N-terminal. Ceilalti
patru promotori sunt intragenici, in structura cadrului de citire; atunci cand
transcriptia incepe la nivelul acestor promotori sunt folositi numai o parte din
exoni, rezultand izoforme mici de distrofina prezente in retina, celulele
Schwann, rinichi.
Elementele cis-reglatoare
sunt secvenţe scurte de ADN ale căror funcţii sunt limitate la o anumită genă; după
fixarea unor factori "trans-reglatori" specifici (factori de transcripţie),aceste secvenţe
permit recunoaşterea genei de către ARN polimerază şi reglează specificitatea n şi
intensitatea transcripţiei, adaptând-o la nevoile celulare . Reamintim că unele
elemente cis-reglatoare au o localizare perfect definită în promotorul genei:
TATA box, CAAT box, GC box; pe aceste secvenţe sefixează factorii de transcripţie
generali care formează, împreună cu ARN polimeraza, complexul de iniţiere a
transcripţiei sau complexul transcripţional bazal
Alte secvenţe (situate mai în amonte) conferă specificitatea tisulară
a expresieigenelor ce le posedă iar secvenţele RE (de la "responsive element”) care
fixează factori transcripţionali inductibili, activaţi în prealabil de către un stimul
extracelular: hormoni, AMPc, ioni etc. Ultimul tip de secvenţe au o localizare
variabilă (în regiunea 5' sau în 3' sau în introni) şi reglează intensitatea transcripţiei;
ele pot fi secvenţe stimulatoare ale transcripţiei (enhancers) sau secvenţe
atenuatoare (silencers).
Factorii de transcripţie se pot
clasifica în cinci grupe.
(1)Factori de transcripţie generali (GTF sau TFII); se asamblează pe
secvenţa TATA;
(2) Factori de transcripţie comuni care se fixează la secvenţele CAAT şi
GC;
(3)Factori de transcripţie inductibili care după ce sunt activaţi de către
stimuli externi se fixează pe secvenţele RE, producând o creştere a
transcripţiei genelor ce posedă RE;
(4) Factori de transcripţie specifici pentru anumite celule (de exemplu Pit-
1, factorul specific glandei hipofize);
(5) Proteine activatoare sau represoare care se fixează pe activatori
(enhancers) sau atenuatori (silencers) şi intensifică sau inhibă
transcripţia genei
Structura factorilor de transcripție: toti conțin două domenii:
-domeniu de activare (care activeaza transcrierea)
-domeniu de fixare Structura factorilor
la ADN; domeniul deo transcripție
de fixare are structura particulara de
aminoacizi ce formeaza un motiv structural; in functie de aceasta, se descriu mai
multe tipuri de FT:
FT
Caracteristica și ex:
• Proteine helix-bucla-helix (helix-loop-helix) la care domeniul de fixare este format din doua α-
helixuri separate printr-o bucla scurta ; acest model structural este prezent la FT care stimuleaza sinteza de
imunoglobuline.
Proteine cu degete de zinc (zinc finger), in care aminoacizii se dispun in spatiu sub forma unor
degete de manusa, la baza carora se fixeaza un ion de zinc (Zn 2+) (cel mai frecvent de cisteina sau histidina) ;
acestea se intalnesc in structura FT ai promotorului genelor menajere; Ex: H.glucocorticoizi
Deoarece aceste secvente sunt situate adesea la distante foarte mari, in amonte sau in aval de situsul de initiere,
se presupune ca activatorul fixat pe secventa intensificatoare interactioneaza cu o componenta a complexului bazal
de transcriptie, formand o bucla de ADN care apropie cele doua secvente.
Factorii de transcripţie generali
(GTF)
se asamblează pe TATA box într-o ordine
secvenţială pentru a forma
complexul transcripţional bazal
care fixează, poziţionează şiactivează
ARN polimeraza II (de aceea se mai
numesc TF II)
Primul se fixează TF IID, un complex
multiproteic) care se leaga la TATA
prin proteina TBP;apoi se fixează în
ordine: TFIIA,TDIIB,TFIIF/ARN
polimeraza, TFIIE şi TFIIH.
Unii din aceşti factori au şi alte
activităţi: de helicază, de protein-
kinaze, asemănătoare ciclinelor, de
reparare a ADN (TFIIH).
Celulele dispun de proteine - enzime:
a) Inductibile, a căror concentraţie depinde de prezenţa
sau absenţa din mediu a unui compus - inductor. De
obicei aceste enzime sunt implicate în căi catabolice.
R R
Aminoacil RNAt
Biosinteza decurge în 3 etape:
Iniţierea, elongarea, terminarea
FI2
Iniţierea:
FI3
- subunitatea 30S formează complex 30S
cu FI-3- apoi se leagă ARNm cu
codonul AUG plasat în situsul P
- se agaugă FI-1- fmet-ARNt şi GTP
se leagă de FI-2 şi se uneşte la P 50S A
complexul format de subunitatea
30S. După hidroliza GTP la GDP FI1
şi P şi eliberarea factorilor de
iniţiere se formează complexul de
iniţiere.
- Complexul de iniţiere se combină
cu subunitatea 50S formînd
ribozomul integru, funcţional
activ 70S .
-
Elongarea
Decurge în 3 etape :1 fixarea noului
Aminoacil ARNt
complexul: aminoacil-ARNt, factorul de FE-G
elongare T (FE-Tu) şi GTP.
se fixează pe situsul A, după ce are
loc hidroliza GTP la GDP care se 30S
eliberează împreună cu FE-T.
2. formarea P 50S A
legăturii peptidice.
Enzima peptidil-transferaza catalizează
formarea legăturii peptidice între doi FE-Tu
AA din situsul A şi P.Peptida rămîne
ataşată de RNAt de pe situsul A.
3. translocaţia E-PT
ribozomul se deplasează la
următorul codon de pe ARNm şi
peptidilARNt trece de pe situsul A pe FE-Tu
P
această etapă necesită factorul de
elongare G (FE-G) şi GTP (necesar
pentru realizarea modificărilor
conformaţionale care deplasează
ribozomul).
Particularități la eucariote
EF1A ( EF-Tu) este responsabil de selectarea și fixarea aminoacil-
tRNA la situsul A al ribozomului.
EF2 ( EF-G) este responsabil de translocația peptidil-tRNAdin
situsul A pe situsul P de pe ribozom.
Terminarea
este semnalată de unul din cei trei codoni stop.
după ce ultimul rest de aminoacid (C terminal) a
fost adăugat la lantul polipeptidic, el este
covalent ataşat cu grupa sa COOH de ARNt în
situsul A.
desprinderea necesită prezenţa factorilor de
desprindere RI ,R2, R3, care transferă peptide
pe situsul P.
rup legătura esterică dintre ARNt şi polipeptidă
desprind ARNm, ARNt şi disociază ribozoma în
două subunităti.
Necesarul energetic la formarea
fiecărei legături proteice
- două legături macroergice se folosesc la
activarea fiecărui AA
- o legătură macroergică- la fixarea AA
ARNt la situsul A
- o legătură- la translocare
Obiectivele:
1. Compoziţia şi structura ribozomilor la pro- şi eucariote.
2. Bazele biochimice ale codului genetic. Proprietăţile lui.
3. Biosinteza proteinelor la procariote. Etapele:
a) activarea aminoacizilor;
b) translaţia – iniţierea; elongarea; terminarea;
1. Particularităţile biosintezei proteinelor la eucariote – factorii translaţiei şi
modificările post-translaţionale ale proteinelor sintetizate. Folding-ul proteinelor
sintetizate.
2. Reglarea biosintezei proteinelor la procariote și eucariote. Inhibitorii translaţiei
(tetraciclina, cloramfenicolul, eritromicina, streptomicina, toxina difeterică). Rolul medical.
3. Polimorfismul proteinelor (variantele hemoglobinei, grupele sangvine).
4. Bazele biochimice ale patologiilor ereditare. Metode biochimice de diagnostic.
Modificările posttraducere
includ:
- îndepărtarea restului formil la procariote şi a metioninei la
eucariote;
- formarea hidroxiprolinei şi hidroxilizinei
- acetilarea capatului N – terminal
- metilarea lizinei, argininei
- fosforilarea hidroxiaminoacizilor
- carboxilarea glutamatului
- iodurarea resturilor de tirozină
- glicolizarea resturilor de lizină
- excizia unor secvente polipeptidice
- formarea puntilor disulfidice
- ataşarea unor substituenţi neproteici (hemul)
- uridilarea
- ribozilarea
Reglarea sintezei proteinelor
la eucariote
Atât la nivelul transcripţiei cât şi la nivelul translaţiei
Reglarea hormonală (cortizol- sinteza E
gluconeogenezei; estrogenii, androgenii, vitamina D –
sinteză de proteine specifice)
Reglarea exspresiei genetice prin moleculele proteice
legate de ADN (histonele) – sinteza ARN pe ADN e
inhibată prin adaosul de histone
Reglarea proteinei la nivelul translaţiei – e posibilă prin
acţiunea factorilor proteici, care contribuie iniţierea,
elongarea, terminarea.
Reglatrea expresiei la nivel de translație
Ex: prin fosforilarea la eukariote
a factorulu ide translație, eIF-2
varîabilă „V".
şi una
constantă „C"
Secvenţa de AA în porţiunea variabilă este diferită
pentru fiecare anticorp. Lanţurile sunt unite între ele prin
legături disulfidice.
Genele ce corespund porţiunilor „V" şi „C“ ale unui
anumit tip de lanţ uşor sunt foarte apropiate în ADN al
imunocitelor care produc acest tip de lanţ uşor, dar se
găsesc departe una de alta în ADN al celulelor ce
produc alte tipuride anticorpi.
De aici reiese, că în imunocit se selectează un anumit
segment de ADN, ce codifică porţiunea variabilă a unui
anumit lant uşor, care se transferă prin transpoziţie în
vecinătatea secvenţei codificatoare a porţiunii constante
a lantului uşor. Deci ADN ce codifică sectoarele „V" ale
lanţurilor „H" şi "L" constă din cîteva gene de tip diferit
care-şi pot schimba locurile proprii şi asocia cu formarea
imenselor combinaţii.
Sinteza Anticorpilor
Fiecare dintre milioanele de anticorpi produşi
leagă unul dintre milioanele de antigene
posibile. Este greu de crezut că organismul are
în patrimoniul său genetic cîte o genă pentru
fiecare anticorp pe care-l produce întrucât
aceasta ar presupune o supradimensionare a
genomului eucariot.
Gradul de diversificare în obţinerea lanţurilor „H" şi „L"
este crescut prin faptul că o porţiune variabilă este
rezultatul asamblării a 3 regiuni. Deci ADN ce
determină porţiunea variabilă a anticorpului este
constituită din:
1. Porţiunea variabilă (V) constituită din - 400 de gene.
2. Porţiunea de diversitate (D) ce cuprinde -12 gene
3. Portiunea de articulare sau jonciune ţ(J) - 4 gene
Asamblarea acestor gene în diferite combinaţii permite
construirea a 20000 de sectoare V - fapt ce asigură
extrema varietate a anticorpilor.
Grupele de sânge
sunt diferențiate datorită prezenței unor antigene
notate cu A si B pe suprafața eritrocitelor și a
unor anticorpi în plasmă notati cu α și β.
Pe baza prezenței antigenelor și anticorpilor se
diferențiază cele patru grupe de sânge - OI, AII,
BIII, ABIV.
- Antigenele nu trebuie să între în contact direct
cu anticorpii de acelasi tip (A cu α, respectiv B cu
β) deoarece se produce aglutinizarea și liza
hematiilor.
Grupele sangvine
Nomenclaturi ale grupelor
sangvine
O I nu are α și β
A II A β
B III B α
AB IV A și B nu are
Ingineria genetică