Sunteți pe pagina 1din 20

CORONAVIRUS

-PANDEMIA CARE VA SCHIMBA-


LUMEA

PROIECT REALIZAT DE CRETU


ALEX
CUPRIN
S
I. Introducere
II. Taxonomie
III. Morfologia virionului,proteine structurale
IV. Ciclul de replicare al virusului si asamblarea: -Receptorii celulari si intrarea
-Interactiunile in timpul asamblarii
-Impachetarea genomului in capsida
V. Sinteza ARN:-Replicarea si transcrierea
-Recombinarea ARN
-Complexul replicaza
INTRODUCER
E
Coronavirusurile reprezinta o subfamilie (Orthocoronavirinae) de ribovirusuri anvelopate,raspandite intr-o vasta gama de
mamifere si pasari,cauzand in principiu afectiuni respiratorii si digestive.Coronavirusurile prezinta in functie de gen o
specificitate pentru gazda iar cea mai distinctiva trasatura a acestei familii virale este dimensiunea genomului,fiind cel mai
mare dintre toate virusurile ARN si inclusiv cele cu ARN segmentat (virusurile gripale A,B,C).

SCURTA ISTORIE
Coronavirusurile au fost descoperite pentru prima dată în anii 1930, când s-a demonstrat că o infecție respiratorie acută a
puilor de gaina a fost cauzată de virusul infecțios al bronșitei (IBV). În anii 1940, alte două coronavirusuri animale,
virusul hepatitei de șoarece (MHV) și virusul gastroenteritei transmisibile (TGEV) au fost izolate. Coronavirusurile umane
au fost descoperite în anii 1960. Cele mai vechi studiate au fost de la pacienți umani cu răceală comună, care mai târziu au
fost numiți coronavirusul uman 229E și coronavirusul uman OC43. Alte coronavirusuri umane au fost identificate de
atunci, inclusiv SARS-CoV în 2003, HCoV NL63 în 2004, HKU1 în 2005, MERS-CoV în 2012 și SARS-CoV-2 în 2019.
Cele mai multe dintre acestea au implicat infecții grave ale tractului respirator.
SARS-CoV-2 văzute la microscopul electronic cu
spicule pe învelişul extern cu aspect de coroană solară
TAXONOMIE
Coronavirusurile sunt clasificate în prezent ca fiind unul dintre cele două genuri din familia coronaviridae.Totusi, este
probabil ca , precum și celălalt gen din coronaviridae, torovirusurile, să li se acorde fiecăruia statutul taxonomic al
familiei în viitorul apropiat.Prin urmare, pe parcursul acestui proiect, coronavirusurile se considera ca o familie.Atât
coronavirusurile, cât și torovirusurile, în plus față de alte două familii, arteriviridae și roniviridae, au fost grupate
împreună în ordinea nidovirales.Acest nivel mai ridicat de organizare recunoaște o legătură între aceste familii care le
pozitioneaza în afară de alte ribovirusuri de tip IV (clasificare Baltimore). Cele mai importante caracteristici pe care
toate nidovirusurile le au în comun sunt:-expresia genelor prin transcrierea unui set de ARN-uri subgenomice 3’-
nested;
-expresia poliproteinei REPLICASE prin procedeul de frameshifting ribozomal;
activități enzimatice unice în rândul produselor proteice ‘‘replicase’’;
-o anvelopa-membranara
-o proteină transmembranara politopica in virion.
Prima dintre aceste calități oferă numele ordinului, care derivă din nido-ul latin pentru cuib.In contrast cu proprietatile
comune, familiile de nidovirus diferă una de alta în moduri distincte, cel mai evident prin numărul, tipurile, și
dimensiunile proteinelor structurale în virionii lor și în morgologia nucleocapsidelor.
Subfamilia coronavirinae conține patru genuri și peste 300 de specii:
1. Alfacoronavirusurile infectează liliecii, porcii, pisicile, câinii și omul (rinofaringite cauzate de
coronavirusurile umane 229E și NL63).
2. Betacoronavirusurile circulă în principal la lilieci, dar unele afectează și bovinele, caii, porcii,
câinii, șoarecii, șobolanii, aricii și alte mamifere. Două specii provoacă rinofaringite la om
(coronavirusurile umane HKU1 și OC43), iar alte două specii provoacă sindroame respiratorii
foarte severe la om: coronavirusul sindromului respirator din orientul mijlociu (MERS-
Cov),coronavirusul sindromului respirator acut sever din asia (SARS-cov),alaturi de SARS-Cov-
19,de interes in prezent.
3. Gamacoronavirusurile sunt în principal virusuri aviare, dar infectează și delfinul
4. Deltacoronavirusurile sunt în principal virusuri aviare, dar pot infecta și porcul.
• INFOGRAFIC CE ILUSTREAZĂ
DIFERENȚELE ȘI ASEMĂNĂRILE DINTRE
NOUL CORONAVIRUS WUHAN ȘI
CELELALTE DOUĂ CORONAVIRUSURI
CARE AU CONDUS LA UN NUMĂR RIDICAT
DE CAZURI ÎN TRECUT – MERS ȘI SARS.
MORFOLOGIA VIRIONULUI
Coronavirusurile sunt aproximativ sferice și moderat pleomorfe.Au fost de
obicei raportate specii de virioni avand diametre medii de 80-120 nm, dar
dimensiuni extreme mici (50 nm) și mari (200 nm) sunt ocazional precizate
în literatura mai veche. Vârfurile de suprafață (peplomere) ale acestor
virusuri,descri ca fiind în formă de pară sau în formă de petală,proiectează
aproximativ 17-20 nm de la suprafața virionului, având o bază subțire care se
umflă la o lățime de aproximativ 10 nm la extremitatea distală.
Pentru unele coronavirusuri un al doilea set de proiecții,de 5–10-nm lungime,
formează o proeminenta sub vârfurile majore. Aceste structuri mai scurte sunt
cunoscute sub numele de proteina hemaglutinin-esteraza (HE) care se găsește
într-un subset la Betacoronavirusuri..

Schema coronavirusului cu setul sau proteic de


baza (Fig1)
PROTEINA SPIKE (S)
(PEPLOMERE)
Peplosul virusului este alcatuit din 3 mari componente proteice.Cea mai proeminenta dintre acestea este
glicoproteina S (numită formal E2), care mediază atașamentul receptorilor și fuziunea dintre membrana
virala și membrana celulara a gazdei. Proteina S este o proteină transmembranară foarte mare, cu o
topografie N-exo C-endo, care se adună în trimeri pentru a forma vârfurile distinctive de suprafață ale
coronavirusurilor.Proteina S este introdusă în reticulul endoplasmic (ER) printr-o peptidă de semnal,
aminoterminală. Ectodomeniul reprezintă cea mai mare parte a moleculei,fiind insotit de un segment mic
carboxiterminal (de 71 sau mai puțin din totalul de 1162–1452 reziduuri) care constituie domeniul
transmembranar și endodomeniu.
Monomerii proteinei S, înainte de glicozilare,au o masa de 128–160 kDa, dar masele moleculare ale
formelor glicozilate ale monomerilor de lungime completă se încadrează în intervalul 150–200 kDa.
Molecula S este, prin urmare, foarte glicozilat, iar această modificare este exclusiv N-linkate.
Proteina spike (S). În dreapta este o hartă liniară a proteinei, denotând
portiunile amino-terminale (S1) și carboxy-terminale (S2) ale
moleculei.Vârful de săgeată marchează locul de clivaj pentru acele
proteine S care sunt despicate de proteazele celulare. Peptida de semnal
și regiunile domeniilor de legare a receptorilor mapate (RBD) sunt
prezentate în S1. Regiunile repetarilor heptad (HR1 și HR2), peptida de
fuziune putativa (F), domeniul transmembranar și endodomeniu sunt
indicate în S2. În stânga este un model pentru un trimer de proteine S

SUS.Structura moleculara 3D a
peplomerului cu ajutorul caruia SARS-
2-CoV patrunde in celulele umane
PROTEINA MEMBRANARA (M)
Glicoproteina M (denumită formal E1) este cel mai abundent constituent a coronavirusurilor și dă anvelopei
forma caracteristica. Polipeptida M preglicozilată variază în dimensiuni cuprinse între 25 și 30 kda (221–262
aminoacizi), dar mai multe forme glicozilate cu masă moleculară mai mare sunt adesea observate cu tehnica
SDS-PAGE.
M este o proteină cu membrană multispanning, cu un mic domeniu NH2-terminal situat la exteriorul
virionului sau intracelular,în lumenul reticulului endoplasmatic. Ectodomeniul este urmat de trei segmente
transmembranare și apoi segmentul C-terminal care cuprinde astfel cea mai mare parte a moleculei. Acest din
urmă domeniu este situat în interiorul virionului sau pe fața citoplasmică a membranelor intracelulare.
Proteinele M din cadrul fiecărui grup coronavirus sunt moderat bine conservate, dar sunt destul de divergente
în cele trei grupuri. Regiunea proteinei M care prezintă cea mai bun stadiu de conservare dintre toate
coronavirusurile este un segment de aproximativ 25 de aminoacizi care cuprind sfârșitul celui de-al treilea
domeniu transmembranar și începutul endodomeniului; o parte din acest segment păstrează chiar o urma
omoloaga cu specia inrudita torovirus.
Ectodomeniul, care este partea cea mai puțin
conservată a proteinei M, este glicozilat. Pentru
majoritatea betacoronavirusurilor,glicozilarea este
O-linkata (carbohidratul se leaga de oxigenul
catenelor laterale ale serinei,treoninei)deși două
excepții de la acest model sunt tulpina MHV 2 și
SARSCoV, ambele având proteine M cu
carbohidrați N-linkati
PROTEINA DE INVELIS
(E)
Proteina E (numită formal sM) este o mică polipeptidă, variind între 8,4 și 12 Kda (76–109 aminoacizi),
care este doar un constituent minor al virionilor. Datorită dimensiunii sale mici și cantității
limitate,proteina E a fost recunoscută ca o componentă a virusului mult mai târziu decât au fost celelalte
proteine structurale, mai întâi în IBV și apoi în TGEV și MHV.Rolul ei a fost, de asemenea, umbrită de
faptul că, în unele coronavirusuri, regiunea de codificare pentru proteina E apare ca cadru de citire
deschis în aval (ORF) într-un ARN bi- sau tricistronic și, prin urmare, trebuie să fie exprimată printr-un
mecanism translațional nestandardizat. În ciuda naturii sale enigmatice, cercetările efectuate până în
prezent au fost în măsură să propună trei roluri pentru proteina CoV E. Interacțiunea dintre cozile
citoplasmatice ale proteinelor M și E determină producția de VLP, sugerând că E participă la (1)
asamblare virală.Domeniul transmembranar hidrofobic al proteinei E, de asemenea,este crucial pentru
(2) eliberarea virionilor. În cele din urmă,proteina E SARS-CoV este implicat în (3) patogeneza
virusului.
PROTEINA NUCLEOCAPSIDICA (N)
Spre deosebire de celelalte proteine structurale majore, N (care variază de la 43 la 50 kDa) este singura
proteină care funcționează în primul rând pentru a se lega de ARN-ul coronavirusului,alcatuind
nucleocapsida specifica cu simetrie helicoidala. Deși N este în mare măsură implicat în procesele legate
de genomul viral, este, de asemenea, implicat în alte aspecte ale ciclului de replicare cov și răspunsul
celular gazdă la infecția virală.Localizarea proteinei N in regiunea Golgi-ergastoplasma(ER) a propus o
funcție în asamblare și expulzia noilor virusuri. Cu toate acestea, s-a demonstrat că expresia tranzitorie a
proteinei N crește substanțial producția de particule echi-virale (VLP) în unele CoV, sugerând că este
posibil să nu fie necesară pentru formarea anvelopei, ci pentru formarea completă a virionului în
schimb.