spaţiu şi timp;
stare staţionară - diferiţi parametri ating valori constante, dar
care totuşi sunt diferite de acelea din alte zone ale sistemului;
stare de neechilibru staţionar - parametrii variază de la un
multe criterii:
a)după mărimea variaţiei parametrilor de stare:
- procese elementare – cu o variaţie foarte mică a parametrilor de
stare;
- procese finite – cel puţin unul dintre parametrii de stare suferă o
variaţie relativ mare;
b)după natura stărilor intermediare:
- procese cvasistatice – au loc cu viteză foarte mică astfel, încât
orice stare intermediară se poate considera o stare de echilibru;
- procese necvasistatice – decurg cu viteză mare, iar stările
intermediare sunt diferite de stările de echilibru.
c)după sensul procesului:
- procese reversibile - dacă se schimbă sensul de variaţie al
parametrilor de stare, sistemul trece prin aceleaşi stări
intermediare ca în procesul direct;
- procese ireversibile - procesele a căror revenire în starea iniţială
se face obligatoriu prin cu totul alte stări intermediare ca în
procesul direct.
d) după parametrul de stare care rămâne constant:
- proces izoterm - cu T = const., ecuaţia procesului fiind: pV =
const.;
- proces izocor - cu V = const., ecuaţia procesului fiind: p/T =
const.;
- proces izobar - cu p = const., ecuaţia procesului fiind: V/T =
const.;
- proces adiabatic - nu există schimb de căldură cu mediul
înconjurător (Q=0), ecuaţia procesului fiind: pV = const. ( -
coeficient adiabatic);
-proces politrop - energia schimbată este constantă.
e) după distincţia între stările finale şi iniţiale:
- procese închise (ciclice) - starea finală şi cea iniţială coincid;
- procese deschise - starea finală şi cea iniţială nu coincid.
Tipuri de procese termodinamice reprezentate în coordonate Clapeyron (p,V)
sunt schiţate în figura 1.1.
L Q T
1 2 1 2 (1.7)
Q1 Q1 T1
Q 2 T2
0 (1.8)
Q1 T1
desfăşoară spontan
endergonice - dacă duc la creşterea entalpiei libere.
dQ
(1.26) dS e
T
dS (1.33)
T
dt
(2.1)
unde q1, q2 sunt sarcinile electrice, r distanţa dintre particule, iar
este permitivitatea mediului.
2.1. Structura moleculară
Se consideră un ansamblu de
doi atomi aflaţi la distanţa r
unul de altul, când forţele
dintre aceştia pot fi
predominant de atracţie sau
de repulsie, sau în ansamblul
lor să se compenseze reciproc.
In figura 2.1. este reprezentată
variaţia cu distanţa a energiei
potenţiale datorată forţelor
intramoleculare.
Energia potenţială datorată:
forţelor de atracţie este negativă
forţelor de respingere este pozitivă.
Energia potenţială totală este rezultanta celor două energii (linia punctată).
Există diferite situaţii:
distanţa dintre cei doi atomi este mare, practic forţele interatomice sunt nule,
iar energia ansamblului este dată de suma energiei fiecărui atom
cu scăderea distanţei încep să se manifeste forţele de atracţie şi de respingere,
şi cum variaţia acestora este diferită, la o anumită distanţă, r0, cele două devin
egale în modul.
Această configuraţie corespunde energiei potenţiale minime a
ansamblului de atomi, respectiv stării stabile în care cei doi atomi
formează o moleculă.
Dacă molecula primeşte o energie mai mare decât energia potenţială minimă
Wmin, egală cu energia gropii de potenţial, ea se desface în atomii constituenţi
care se deplasează separat cu viteze determinate de surplusul de energie.
Energia minimă necesară desfacerii moleculei se numeşte energie de
legătură Wleg, deci:
Wleg = - Wmin (2.2)
Concluzie: stabilitatea moleculei se datorează forţelor interatomice (intra
moleculare) şi corespunde energiei potenţiale minime.
2.1.2. Dipoli electrici
O proprietate importantă a moleculelor este distribuţia spaţială a sarcinilor
electrice, care explică unele interacţiuni moleculare şi comportarea
moleculelor în câmpurile de forţe externe.
Moleculele, care din punct de vedere electric sunt neutre, pot avea o
structură spaţială simetrică sau una asimetrică, în care centrul de greutate
al sarcinilor pozitive (nucleele) nu coincide cu centrul de greutate al
sarcinilor negative (electronii), ele fiind despărţite spaţial (Fig.2.2.).
unde q este sarcina iar d distanţa dintre centrele de greutate ale sarcinilor
electrice.
Exemple de molecule ce se comportă ca un dipol permanent sunt apa,
amoniacul gazos, cetonele, esterii, aminele primare, urea etc.
dipol indus
dipol instantaneu
Exită unele molecule unde repartiţia asimetrică a sarcinilor electrice
rezultă datorită mişcării norului electronic, obţinându-se un dipol
instantaneu, a cărui orientare variază în timp, având un moment dipolar
doar într-un interval de timp foarte scurt.
Observaţie: majoritatea moleculelor de natură biologică sunt molecule
de tip dipol.
Fig.2.2. Dipoli electrici: (a) permanent, (b) indus, (c) instantaneu
.
2.2. Legături intramoleculare şi intermoleculare
Modul cum se formează o moleculă din atomi individuali se reflectă în
legătura chimică intramoleculară. Există trei tipuri de legături
fundamentale:
legătura ionică;
legătura covalentă;
legătura metalică.
Moleculele, la rândul lor, pot să interacţioneze între ele, formând
legături intermoleculare şi rezultând macromolecule. Aceste legături
sunt:
legătura van der Waals,
legătura (puntea) de hidrogen.
Din punct de vedere energetic, legăturile intramoleculare sunt mai
puternice, astfel legătura ionică şi cea covalentă au energia de legătură
de ordinul 10 – 102 kcal/mol. In schimb, legăturile intermoleculare sunt
mai slabe, dar au rol esenţial în menţinerea structurii materiei vii şi a
dinamicii ei.
Concluzie: la baza oricărei legături stau interacţiunile fizice, exprimate
prin diferite tipuri de forţe, lucru valabil şi pentru legăturile ce formează
moleculele biologice.
2.2.1. Legătura ionică
Acest tip de legătură se realizează de ioni, care sunt atomi sau
grupe de atomi ce au sarcini pozitive sau negative.
Legăturile ionice sunt interacţiuni electrostatice, care se supun legii
lui Coulomb (relaţia 2.1).
Din punct de vedere electric, compuşii ionici sunt neutri, suma
sarcinilor pozitive fiind egală cu suma sarcinilor negative.
Factorii importanţi care determină realizarea acestui tip de legătură
chimică sunt:
energia de ionizare - egală cu energia ce se consumă pentru
1
(2.5) M 1 2
2
(2.6) 1
M 1 2
2
unde 1 şi 2 sunt funcţiile de undă ale celor doi orbitali atomici, iar
coeficientul 1/√2 se numeşte factor de normare. Funcţia corespunde
orbitalului de legătură, stare în care atomii se atrag, iar orbitalului de
antilegătură, în care atomii se resping.
Legătură covalentă rezultată din contopirea celor doi orbitali s ai
hidrogenului este denumită legătură (sigma).
Legătura , este mai obişnuit tip de legătură covalentă de doi
electroni, poate să apară şi între alţi atomi decât cei de hidrogen.
Legăturile pot proveni şi din întrepătrunderea unui orbital s cu un
orbital p, sau din doi orbitali p.
Forţele van der Waals apar datorită unor deformări ale orbitalilor
atomici sau moleculari.
Se manifestă fie între molecule, fie între părţi ale unor molecule
mari.
Sunt forţe de natură electrică mai slabe, intensitatea energetică este
mai mică decât în cazul legăturilor ionice şi covalente, fiind de
ordinul 1-2 kcal/mol.
Sub denumirea de forţe van der Waals sunt cuprinse mai multe
tipuri de interacţiuni între ioni, atomi sau dipoli nelegaţi
Forţe de dispersie cuantice (London) - sunt forţe de atracţie
între molecule nepolare (He, H2, CH4 etc), ele sunt nedirijate şi
apar datorită unor interacţiuni mecanic-cuantice între atomii unor
molecule diferite (F 1/r7 )
Forţe ion – dipol şi dipoli – dipoli: se manifestă între ioni şi
molecule polare (dipoli permanenţi), precum şi între doi dipoli
pemane (F 1/r4 )
Forţele van der Waals pot să explice o serie de
fenomene: hidraterea ionilor, existenţa stării lichide şi a
proprietăţilor ei (vâscozitate, coeficientul de tensiune
superficială, temperatura de fierbere, densitate, călduri
latente)
Această interacţiune este importantă pentru stabilirea
conformaţiilor macromoleculelor şi are un rol esenţial în
procesele biochimice din sistemele vii, în special în
structurile tranzitorii ale moleculelor din complexele
celulare, cum sunt: sinteza proteinelor în ribozom,
acţiunea catalitică a enzimelor, influenţa reglatoare a
ADN-ului etc.
2.2.5. Legătura de hidrogen
Legătura de hidrogen sau puntea de hidrogen este de natură
electrostatică, fiind o formă specială a interacţiunii dipol-dipol, dar
mai puternică decât legătura van der Waals, având o energie de
legătură cuprinsă între 4-7 kcal/mol.
Se formează între atomul H legat covalent de un atom puternic
electronegativ ca O sau N şi un al doilea atom tot cu
electronegativitate ridicată.
Este specifică apei, căreia îi conferă o structură în echilibru dinamic
în care aceste punţi de hidrogen se rup şi se formează permanent.
Astfel se pot explica agregatele moleculare şi proprietăţile speciale
ale apei
Punţile de hidrogen au un rol important în stabilirea structurilor
spaţiale ale biopolimerilor şi în formarea dublei elice între două
lanţuri complementare de ADN.
2.2.6. Interacţiunea hidrofobă
După interacţiunea cu molecula de apă, unele substanţe imersate se
încadrează în două tipuri sau grupări moleculare:
hidrofile - care interacţionează cu apa. La dizolvarea lor se degajă
o cantitate mare de energie (G 0). Din categoria acestor
substanţe fac parte electroliţii şi diferite grupări polare ale unor
molecule, chiar dacă gruparea este legată de un rest molecular cu
caracter apolar.
hidrofobe - care nu interacţionează cu apa. Energia eliberată la
dizolvare nu este suficientă pentru desfacerea structurii
supramoleculare a apei. Astfel de substanţe sunt: hidrocarburile
saturate, catenele hidrocarburice din acizii graşi etc.
Caracterul hidrofob al unor substanţe este evaluat prin variaţia
energiei libere Gibbs, în cazul dizolvării lor într-un solvent apolar,
respectiv polar, care este pozitivă (G 0).
Dacă moleculele au o parte hidrofobă şi una hidrofilă, când sunt
introduse în apă, îşi orientează părţile hidrofile spre apă iar cele
hidrofobe se grupează.
2.3. Structura materiei vii
Substanţele care alcătuiesc materia vie sunt alcătuite din aceleaşi
elemente constitutive ca şi ale materiei nevii cu structuri şi
proprietăţi ce se supun legilor fizicii şi chimice.
Dar substanţele din structura sistemelor vii (bioelementele) se
supun unor reguli fundamentale care guvernează natura, funcţiile şi
interacţiunile specifice numai biomoleculelor, ceea ce le conferă
proprietăţi specifice deosebite de cele ale materiei inerte, cum ar fi
metabolism, autoreproducere, creştere, dezvoltare, mişcare,
autoreglare, reînoire etc.
Din punct de vedere al naturii şi structurii moleculare, materia vie ce
intră în componenţa biosistemelor este alcătuită din:
Microioni - care sunt ioni de dimensiuni foarte mici (Na+, K+, Cl-
,H+, Ca2+, Mg2+, OH- etc).
Micromolecule - anoganice sau organice, neutre sau disociate, cu
mase moleculare cuprinse între 100 Da şi 500 Da (apa, aminoacizii,
mononucleotidele, monozaharidele, acizii graşi, glicerina etc)
Macromolecule sau polimeri - rezultate prin repetarea unui grup
de atomi, numit monomer. Dacă se repetă acelaşi monomer se
formează un homopolimer, iar dacă monomerii sunt diferiţi se
obţine un heteropolimer
Principalele tipuri de unităţi monomerice sunt aminoacizii,
n
RT n m i (3.2)
p t p 1 p 2 .... p n p i
i 1 V i 1 i
unde V este volumul total al amestecului.
In cazul gazelor reale, în afară de mişcarea de translaţie,
moleculele prezintă mişcări de rotaţie şi de vibraţie a atomilor din
moleculă.
Energia internă,U, a unui gaz real reprezintă suma energiilor
tuturor acestor mişcări şi a energiei potenţiale de interacţiune a
moleculelor.
In organismele vii există o serie de procese biologice care se supun
legilor transformărilor simple în gaze. Exemplu: procesul de
respiraţie aeriană are loc la presiuni mici (1 atm), motiv pentru care
este valabilă legea transformării izoterme.
Cele două componente ale ventilaţiei pulmonare: inspiraţia şi
expiraţia, se produc prin variaţia cavităţii toracice, fiind posibile
datorită elasticităţii toracelui şi a pulmonilor. Conform legii Boyle-
Mariotte la:
mărirea volumului cavităţii toracice are loc o scădere a
presiunii aerului sub valoarea aerului atmosferic, ceea ce
determină procesul de inspiraţie.
micşorarea volumului creşte presiunea din plămâni, aerul
Starea gazoasă
lichid-lichid (L-L)
lichid-solid (L-S)
solid-gaz (S-G)
de unde
= Ep / S (5.3)
Deci, coeficientul de tensiune superficială reprezintă lucrul mecanic
efectuat împotriva forţelor de tensiune superficială, pentru mărirea
suprafeţei libere a lichidului cu o unitate.
depinde de natura fazelor aflate în contact şi scade cu creşterea
temperaturii, deoarece prin creşterea agitaţiei termice forţele
intermoleculare scad.
In Tabelul 5.1. sunt prezentate valori ale coeficientului de tensiune
superficială şi ale presiunii moleculare pentru unele lichide la diferite
temperaturi, la interfaţa lichid-aer.
Curgerea unui fluid real are loc în straturi foarte subţiri, moleculele
din acelaşi strat având aceeaşi viteză, în timp ce cele din straturile
adiacente, viteze diferite.
Intre moleculele straturilor vecine, dar şi între moleculele aceluiaşi
strat, se exercită forţe de interacţiune de tip van der Waals, care se
opun deplasării relative a moleculelor, determinând apariţia unei
frecări interne, numită vâscozitate.
Forţele de frecare internă, numite forţe de vâscozitate (Fv), rezultă
ca urmare a transportului de impuls de către moleculele lichidului de
la un strat la altul.
Forţele de vâscozitate sunt
orientate tangenţial la suprafaţa
straturilor şi în sens opus vitezei
stratului respectiv (Fig.6.1).
Forţa de vâscozitate pentru o
curgere laminară, când straturile de
lichid rămân paralele, este dată de
legea lui Newton:
(6.1) dv
F S
dx
unde: - coeficientul de vâscozitate
dinamică, S - aria comună a celor
două straturi şi dv/dx - gradientul
de viteză, perpendicular pe direcţia
de curgere.
Semnificaţia fizică a coeficientului de vâscozitate dinamică: forţa de
frecare dintre două straturi cu secţiunea egală cu unitatea pentru un
gradient de viteză egal cu unitatea.
Unităţi de măsură: []SI = Nsm-2 =Poiseuille, iar ca unitate tolerată
în CGS se utilizează []CGS = dynscm-2 = 1P (poise).
Tinând cont de densitatea () a lichidului se introduce o nouă
mărime numită coeficient de vâscozitate cinematică (),
definit:
= / (6.2)
. v .r (6.6)
Re
S-a văzut că pentru condiţii date (lichid şi tub) există o viteză de
curgere critică (vc), peste care curgerea devine turbulentă, viteză
care este corespunzătoare unui număr Reynolds critic, a cărui
valoare este Rcre = 1000.
In funcţie de această valoare există regimurile de curgere:
R 1000 - curgere laminară;
e
1000 R 2000 - curgere nestabilă;
e
R 2000 curgere turbulentă.
e
Cantitativ, fenomenul de difuzie este descris de cele două legi ale lui
Fick. Prima se referă la viteza de transport, iar cea de a doua la
viteza de variaţie a concentraţiei.
Prima lege a lui Fick: cantitatea de substanţă ce difuzează normal
printr-o suprafaţă S în unitatea de timp este proporţională cu
gradientul de densitate, adică:
dm d (6.15)
DS
dt dx
unde D – coeficient de difuzie, se măsoară în SI în m2/s; -
densitatea moleculelor difuzate.
Dacă se ţine cont de legătura dintre densitate şi concentraţia
molară CM, expresia matematică a primei legi a lui Fick devine:
d dC M
JC DS (6.17)
dt dx
kT
D (6.18)
6r
In Tabelul 6.2. sunt prezentate valori ale coeficientului de difuzie
pentru diferite molecule proteice de interes biologic.
D D
Proteina Proteina
10-11( m2 /s) 10-11( m2 /s)
Mioglobina (bou) 11,3 Serrumglobina (om) 4,0
Hemoglobina (cal) 6,3 Lisosima (om) 11,2
Hemoglobina (om) 6,9 Ureaza (om) 3,5
Serrumalbumina (cal) 6,1 Pepsina (porc) 9,0
Serrumalbumina (om) 5,9 Insulina (bou) 7,5
Dm (6.21)
P
unde Dm este coeficientul de difuzie al membranei.
Permeabilitatea în SI se măsoară m/s.
Sensul fizic al permeabilităţii este: viteza de pătrundere a
diferitelor substanţe prin membrană în condiţii de concentraţii
date, fiind determinată de structura membranei, iar pentru
aceeaşi membrană de tipul particulei difuzante.
Deci, permeabilitatea trebuie determinată pentru fiecare sistem
difuzant în parte.
Din punct de vedere al permeabilităţii, membranele pot fi clasificate
în următoarele categorii:
membrană impermeabilă – nu permite traversarea ei nici de
solvent şi nici de solvit;
membrană permebilă – este permeabilă atât pentru solvent cât şi
pentru solvit;
membrană selectiv permeabilă – este permeabilă numai pentru
anumiţi solvenţi şi solviţi. La rândul ei se clasifică în:
membrană semipermeabilă – permeabilă numai pentru solvenţi;
membrană ireciproc permeabilă – are permeabilitate diferită
pentru cele două sensuri ale aceluiaşi solvit.
(6.22)
C
DmS
t
sau
(6.23)
P.S.C
t
Dacă membrana desparte medii apoase,
atunci permeabilitatea ei este determinată de
coeficientul de partiţie solvent/apă, definit ca
raportul dintre solubilitatea substanţei în
solvent şi cea în apă.
6.2.2.2. Difuzia ionilor
C1
W W2 W1 nF V2 V1 RT . lg 0 (6.28)
C2
deci:
RT C 1
V2 V1 lg (6.29)
nF C 2
Relaţia (6.29) este valabilă pentru fiecare ion în parte. Pentru
exemplu considerat, unde valenţa lui K+ este n =1, iar a lui Cl- este
n=-1, se obţine:
V1 V2
RT K
lg
1
şi
F K 2
(6.30)
V1 V2
RT Cl
lg
1
(6.31)
rezultă: F Cl 2
K
1
Cl
2 (6.32)
K
2 Cl
1
expresie ce reprezintă echilibru Donnan.
v Difuzia gazelor
Echilibrul Donnan(în se special
referă laOraportul
2, CO2, concentraţiilor
N2) apare în ionilor
procesele de
perfect
respiraţieprin
difuzibili a animalelor
membrană.şi plantelor, în procesul de fotosinteză, în
schimburile
Deci, de gaze
existenţa la nivel tisular
unei diferenţe sau/şi celular.
de potenţial electric determină apariţia
v unei diferenţeschimburile
La plante, de concentraţie a ionului.
gazoase se realizează prin intermediul
S-a constatat,
frunzelor, carecăauproblema se poate
suprafaţa pune şifoarte
de contact în sensmare.
invers.Celulele
Astfel,
dacă se poateşimenţine
protozoarelor constantă
metazoarelor o diferenţă
inferioare de concentraţie
realizează schimbul dea gaze
unui
ion,
prin aceasta
difuzie ladetermină apariţia unei
nivelul învelişului diferenţe
întregului corp.de potenţial.
v La organismele evoluate schimburile gazoase au loc prin intermediul
6.2.3.specializate,
unor structuri Rolul difuziei
cumîn sistemele
sunt: plămâni,biologice
bronhii, trahee, care
au suprafeţe de contact mari. De exemplu, la om suprafaţa
alveolelor
Difuzia pulmonare
joacă este foarteînmare
un rol important lumea(60-120 m2) în
vie, fiind comparaţie
prezentă atât cu
în
interiorul biosistemelor, cât şi în interacţiunile acestora cu mediul
suprafaţa corpului.
exterior.
Organismele vii au organe specializate pentru schimburile prin
q In concluzie, difuzia este un fenomen de transport prezent în
difuzie.
organismele vii până la nivel celular, asigurând schimbul de
Schimburi de substanţă se realizează prin intermediul membranelor
substanţă necesar funcţionării biosistemelor.
biologice.
6.3. Osmoza