Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
STRUCTURA
PROTEINELOR
Obiectivele:
1.Rolul biochimiei în sistemul de instruire a medicului
2.Particularităţile materiei vii
3. Metodele de studii biochimice
4. Cele mai importante descoperiri ale secolului XX
5. Proteinele, rolul lor biologic
6. Teoria polipeptidică a structurii proteinei
7. Gradele de organizare ale moleculei proteice
a) AA, structura, principiile de clasificare
b) structura primară şi principiul descifrării ei
c) Structura secundară
d) Structura terţiară. Domenile.
e) Structura cuaternară
8) Proteinele fixatoare de Ca
9) Colagenul
10) Clasificarea proteinelor
11) Endotelinele
Biochimia:
pentru prima dată ca termen a fost întrodus
in 1903 de către Carl Neiberg.
“bios” - din greacă înseamnă viaţă
- Legăturile polare
- de hidrogen,
- ionice,
- electrostatice
interacţiuni hidrofobe –
-forţele Van der Waals
Anume organizarea în structură
tridimensională conferă proteinelor
activitate biologică.
Radicalii AA, care posedă rotaţie liberă
interacţionează, catena ciudat se
curbează în diferite locuri.
Radicalii hidrofobi evitând apa se
concentrează în interior pe când
grupele hidrofile se situiază la
suprafaţa moleculei şi interacţionează
cu apa, de aceia molecula gigantă de
proteină se dizolvă bine în apă.
În procesul stabilirii structurii terţiare
se formează centrele de legătură
(active) unde se leagă o anumită
substanţă numită la general ligand.
Ligandul este steric şi electrostatic
complementar CA (de ex. substratul cu
centrul activ al enzimei respective).
În componenţa CA întră radicalii AA
(Tir; Glu; His, etc.) situaţi de regulă
departe unul de altul în lanţ, dar care se
pomenesc învecinaţi în acest centru în
procesul formării conformaţiei
moleculei la interacţiunea cu ligandul.
Domenii:
– reprezintă regiuni
compacte, rigide cu
organizarea terţiară ,
separate între ele de
segmente mai puţin
rigide care permit
mişcarea unui domeniu
în raport cu altul.
- sunt responsabili de
anumite funcţii
- cu structuri şi proprietăţi
similare sunt prezente în
diferite proteine cu roluri
asemănătoare.
- Ex:domeniul de legare a
hemului în molecula Mb,
Hb,citocromilor
Structura cuaternară a proteinelor
Unele proteine sunt alcătuite din mai multe
lanţuri polipeptidice. Fiecare lanţ în parte e
numit protomer sau subunitate. Proteina
integră reprezintă oligomerul şi posedă
structură cuaternară.
Funcţia specifică a unei proteine oligomere se
manifestă numai la nivelul structurii
cuaternare, protomerii separaţi sunt inactivi.
molecula hemoglobinei constă din 4
protomeri
Legăturile ce determină şi
stabilizează structura cuaternară:
legăturile necovalente (de hidrogen, forţele Van
der Waals, electrostatice, forţe hidrofobe etc.).
Cât priveşte legăturile covalente (disulfidice,
pseudopeptidice), ele deasemenea stabilizează
aceste structurii, însă nu determină formarea lor.
Asamblarea protomerilor în structura cuaternară
se realizează între suprafeţele de contact
complementare.
Interacţiunile prin suprafeţe complementare
prezintă fenomenul de cooperare- primele
interacţiuni favorizează formarea celorlalte
Colagenul
cea mai răspândita proteină din organism
(30-35% din cantitatea totală de proteine).
este o proteină extracelulară, fibrilară,
componenta majoră a ţesutului conjuctiv şi
osos.
Rolul:
1. în ţesutul conjuctiv ea oferă rezistenţă,
2. în cel osos constituie carcasa organică a
mineralizării.
Particularităţi structurale:
1. Fiecare al treilea AA din catenă este
prezentat prin glicină (30%)
2. Fiecare al patrulea - prin Pro şi
hidroxiPro (25%)
3. Conţine 10% Ala
4. Conţine hidroxilizină
5. Conţinut redus de Tyr, absenţa Trp şi Cys
Se deosebesc 3 tipuri de lanţuri peptidice: 1, 2, 3.
1 prezintă 5 subtipuri:: 1I, 1II, 1III, 1IV, V.
Prin combinarea lor se formează diverse tipuri de
colagen.
Colagenul:
Structura primară prezintă o catenă
polipeptidică curbată alcătuită din
circa 1000 AA.
Structura secundară reprezintă alfa
catene spiralate răsucite spre stânga
(conţine 3,28 AA per spiră)
alfa spirală cu simetrie elicoidală nu
se poate forma din cauza Pro, OH-
Pro şi Gly
3 alfa catene spiralate, răsucite
împreună sub forma unei spirale
comune formează
tropocolagenul, ce e stabilizată
de interacţiunea resturilor de Pro.
Tropocolagenul este subunitatea
structurală a colagenului.
Colagenul:
Structura cuaternară: aşezarea
subunităţilor de tropocolagen
sub formă de trepte, fiecare
moleculă fiind deplasată cu ¼
din lungime faţă de moleculele
vecine.
Monomerii sunt legaţi stabil
prin legături covalente
încrucişate inter şi
intramoleculare, care le conferă
microfibrilelor rezistenţă
mecanică. Prin asocierea
microfibrilelor se formează
fibrilele, iar din ele - fibra de
colagen.
Colagenul este proteina care
activ fixează ionii de Ca2+.
Clasificarea contemporană a
proteinelor
Savanţii M.Levitt şi C.Chiothia (1970) examinînd structura
proteinelor le-au divizat în 5 clase (fiecare clasă diferă după
prezenţa şi poziţia α-spiralei şi β-structurii)
1. Proteine ce conţin 100% α-elice, formînd o
structură globulară;
2. Proteine ce conţin β-structură şi, de regulă,
sunt alcătuite din două straturi antiparalele sau
situate în forme “butoiaşe”;
3. Proteine ce conţin atît α cît şi β componente;
4. Proteine ce înglobează α/ β segmente alternate
în structura secundară, formînd structura
terţiară cu centrul β şi încercuite de α-spirale;
5. Proteine neorganizate cu structura secundară
evidenţiată nesemnificativ.
După dinamica domeniilor
structurale
1. Proteine cu domenii rigide, imobile, dure,
unite prin segmente mari, flexibile, ce le
permit fluctuaţii în diapazon larg;
2. Proteine cu domenii rigide, dure, unite prin
porţiuni mici, denumite “balama” cu o
circulaţie mai redusă;
3. Proteine unde domeniile au roluri diverse –
folosesc flexibilitatea pentru asigurarea unor
funcţii.
Proteinele simple (holoproteine)
Histonele -localizate în nucleu, conţin AA bazici pînă la
30% (Arg, Liz). Au sarcina pozitivă, sunt legate
electrostatic cu AN.
Rolul: reglarea metabolică a activităţii genomului, funcţie
structurală
- Albuminele şi globulinele – principalele P plasmatice.
Raportul albumine/globuline e constant: 1,5/ 2,3.
Albuminele – masă moleculară mică, PI 4,7, sarcină
negativă, solubile în apă.
Rolul: determină presiunea oncotică, participă la
transportul substanţelor.
Globulinele - masă moleculară mai mare ca
albuminele, au caracter acid (PI – 6 -7,3), conţin în
cantitate mare Glu, se dizolvă în soluţii saline slabe, dar
nu în apă.
Rolul imunologic: sintetizează anticorpi.
Proteinele simple (holoproteine)
Protaminele – au masă moleculară mică, caracter
alcalin (Arg şi Liz) dar nu conţin Trh, Tir şi Fen, sunt
solubile în apă, se dizolvă în soluţii diluate de acizi şi
baze. Se găsesc în cantităţi mari în celule germinale
naturale ale peştilor: salmina (lapţii somnului),
scumbrina (scumbrie).
Prolaminele – (gliadine), se găsesc în boabele
cerealelor, au un conţinut mare de Glu(20-25%) şi Pro
(10-15%), dar mic de AA diaminomonocarboxilici:
zeina (porumb); gliadina (grîu), hordeina (orz).
Glutelinele sunt de natură vegetală (se găsesc în bobul
cerealelor), sunt insolubile în apă, dar solubile în soluţii
acide şi alcaline diluate, sunt bogate în Glu şi Liz.
Proteinele conjugate
(Proteide):
1. Nucleoproteine
2. Cromoproteine
3. Fosfoproteine
4. Lipoproteine
5. Metaloproteine
6. Glicoproteine
Nucleoproteinele
compuse din proteine şi acizi
nucleici. Componenţa proteică o
alcătuiesc histonele, bogate în Arg şi
Liz.
Rol: stocarea, transmiterea şi
exprimarea informaţiei genetice,
biosinteza proteinelor, diviziunea
celulară.
Cromoproteinele – compuse din
proteină şi partea neproteică
colorată.
1. - cromoproteide porfirinice
2. - cromoproteide neporfirinice
Reprezentanţii: clorofila, hemoproteidele
(Hb), sistemul de citocromi, catalaza,
peroxidaza.
Rolul:
1. participă în fotosinteză
2. transportul oxigenului şi CO2
3. reacţiile de oxido-reducere
4. senzaţiile de lumină şi culoare
Fosfoproteinele: proteine +
acidul fosforic (legate prin legături
esterice- de hidroxiaminoacizi Ser,
Tre )
Reprezentanţi: cazeinogenul (proteina
laptelui), vitelina, vitelenina (din
gălbenuşul de ou), ihtulina (din icre de
peşte).
Rolul: