Explorați Cărți electronice
Categorii
Explorați Cărți audio
Categorii
Explorați Reviste
Categorii
Explorați Documente
Categorii
• Ce sunt enzimele ?
b.descompunerea H 2O 2 catalizată de
Fe3 şi de catalază:
2 H2O2 2 H2O + O2
• clasificarea enzimelor:
Oxido-reductaze
Transferaze
Hidrolaze
Liaze
Ligaze
Izomeraze
4.Enzimele prezintă specificitate de substrat
(selectivitate în alegerea substratului)
• a.Specificitate absolută
enzimele utilizează ca substrat un singur compus chimic:
-ureaza catalizează hidroliza ureei:
-anhidraza carbonică
b.Specificitate relativă de grup
Alcool dehidrogenaza
R CH2 OH R CH O
NAD+ NADH + H+
• Enzima are afinitate mare pentru alcoolul etilic
c.Specificitate relativă largă
CH2-OH CH2-OH
• Glicozidazele O O
OH OH (H, OH)
HO O
OH OH
CH2-OH CH2-OH
HO O O
OH O OH (H, OH)
OH OH
CH2-OH 1
O HOH2C
H
O
2 5
OH 1 H HO
HO O CH2 OH
OH HO H
Proteazele
Pepsinã
• Pepsina NH CH CO NH CH CO
R3 = fenilalaninã, tirozinã
metioninã, leucinã
R2 R3
Tripsinã
• Tripsina
NH CH CO NH CH CO R2 = lizinã, argininã
R2 R3
Chimotripsinã
• Chimotripsina
NH CH CO NH CH CO R2 = Phe, Tyr, Trp
R2 R3
Carboxil esterazele
O
R C
O R1
5.Specificitate stereochimică
• Enzimele disting
-un enantiomer levogir de cel dextrogir;
-un izomer cis de cel trans.
COOH COOH
Lactat dehidrogenaza
HO C H C O
CH3 CH3
NAD+ NADH + H+
Acid L-lactic Acid piruvic
Succinatdehidrogenaza
COOH H COOH
CH2 C
CH2 C
HOOC H
COOH FAD FADH2
Acid succinic Acid fumaric
E + S ES E + Produsi
Centrul activ al enzimelor
• Enzimele sunt macromolecule
S S S S S S
A B C
S S S S
-chimotripsina contine 5 legãturi disulfurice
Substrat
Enzimã Complexul ES
Modelul lacãt cheie
• Clasa serinei
• Tripsina, Chimotripsina, Elastaza, Acetilcolinesteraza
• Clasa cisteinei
• Gliceraldehid 3P-dehidrogenaza, Papaina
• Clasa histidinei
• Glucozo 6-fosfataza, Succinil~CoA sintetaza
• Clasa lizinei
• D-aminoacid oxidaza, Transaldolaza
Triada Asp-His-Ser
Cataliza acido-bazică
• Enzimele conţin grupări funcţionale care pot
acţiona ca donori sau ca acceptori de protoni:
amino, carboxil, sulfhidril, imidazol, hidroxilul
fenolic.
a reactiei (necatalizate)
Stare de tranzitie
(reactie necatalizatã)
Stare de tranzitie
(reactie catalizatã) Energia liberã de activare
Stare initialã a reactiei (catalizate)
Reactanti A + B
Energia totalã
eliberatã Stare finalã
Produsi C + D
Durata reactiei
Formarea stãrii de tranzitie
2.Legătura:
• A B
d[A] d[B]
v v
dt dt
• ecuaţii cinetice
• Viteza de reacţie este proporţională cu
produsul concentraţiilor reactanţilor
• Pentru o reacţie:
A Produşi V = K [A]
Pentru o reacţie:
A+B Produşi V = K [A][B]
activitatea
enzimaticã
%
100
50
20 40 Toptimã 60
temperatura
pH
• pH-uri extreme denaturează enzimele
• Variaţii mici de pH în zona de stabilitate a enzimei
modifică v.
Pepsina Fosfataza
alcalinã
[E]
• [S] = constantă, v este proporţională cu
cantitatea de enzimă
activitatea
enzimaticã
%
concentratia enzimei
Ecuaţia Michaelis Menten
K1 K3
E+S ES E + Produs
K2
vmax
saturatie
vmax
2
KM concentratia substratului
• La echilibru
• v1 = v 2 + v 3
• K1[E][S] = K2[ES] + K3[ES]
• K1[E][S] = [ES](K2 + K3)
KM
• KM este o măsură a afinităţii dintre E şi S
(afinităţile enzimelor pentru substraturile lor sunt
cu atât mai mari cu cât valorile KM sunt mai mici).
[E ][S] K 2 K 3
KM
[ES] K1
Ecuaţia Michaelis - Menten
• Ecuaţia de viteză a reacţiilor enzimatice cu un singur
substrat sau ecuaţia lui Michaelis-Menten, a cărei
reprezentare grafică vo = f([S]) este un arc de hiperbolă.
Vmax .[S]
v
0 K [S]
M
Panta = KM/Vmax
1/Vmax
- 1/KM 0 1/[S]
Inhibiţia activităţii enzimelor
• scăderea activităţii catalitice a enzimei în prezenţa
unui compus chimic denumit inhibitor
activitatea
enzimaticã + Ic
1/V
vmax
saturatie
vmax + Ic
1/Vmax
2
CH2 C
HOOC H
COOH FAD FADH2
Acid succinic Acid fumaric
Sulfanilamida
• Folat sintetaza, la bacterii este păcălită şi sintetizează un
intermediar cu sulfanilamidă în locul acidului para-amino-
benzoic care nu se poate transforma în acid folic.
• Cum acidul folic este indispensabil bacteriilor, acestea
mor.
NH2 NH2
H2 N N N CH2
R H
H2N N N
H R=H aminopterinã
R= -CH3 metotrexat
Inhibiţia reversibilă
necompetitivă
• Substratul şi inhibitorul necompetitiv (In) nu sunt analogi
structurali, nu au dimensiuni comparabile.
• Se modifica Vmax
• KM nu se modifică în prezenţa inhibitorului.
activitatea
enzimaticã
1/v
vmax + Ic
v`max + Ic
1/v`max
vmax / 2
v`max / 2 1/vmax
vmax / 2
KM concentratia substratului
• Enzimele care dau curbe v=f([s]) sigmoide
sunt denumite alosterice.
• Liganzii fixaţi pot să fie de acelaşi fel (de ex.
substratul să fie fixat în ambele locuri ale
unui dimer) sau diferiţi;
activitatea vmax
enzimaticã 100
%
3 1 2
50
KM [S]
• După natura centrelor alosterice şi a liganzilor
pentru aceste centre, efectele alosterice sunt:
• Enzimele alosterice:
-reglează etape cheie din căile metabolice;
ireversibile, cu Go < 0
• –cantitatea de enzimă;
• –eficienţa enzimelor
Reglarea cantităţii de enzimă
• prin dinamica proceselor de biosinteză
şi de degradare
•
Ks
Aminoacizi Proteine
Kd
• Enzimele constitutive: Ks = Kd.
• Catalizează procese fundamentale pentru
existenţa celulei.
• Se găsesc în celule în cantităţi relativ
constante.
• Ele nu suferă fluctuaţii mari în raport cu
factorii de mediu.
• Enzimele inductibile: Ks > Kd
E1 E2 E3
A B C P
• Hexokinaza:
-prezentă în toate ţesuturile extrahepatice,
-are afinitate mare pentru glucoza (KM = 0,15 mM)
-ţesuturile preiau glucoza din sânge la orice valoare
a glicemiei
• Glucokinaza:
-prezentă numai în ficat
-are afinitate mică pentru glucoza (KM = 10 mM)
- este activă după ingestia de glucide
• Reglarea activităţii enzimelor alosterice prin produsul final
(inhibiţie de tip feed back)
E1 E2 E3
A B C D Produsi
E3 D P1
E1 E2
A B C
E4 E P2
Reglarea covalentă
• Apare la organismele superioare şi presupune:
• Fosforilările:
-sunt catalizate de kinaze (reglate hormonal,
interconvertibile fosfo-defosfo);
-sunt ireversibile;
-necesită ATP
• Defosforilările:
-sunt ireversibile;
-se fac hidrolitic în prezenţa unor fosfataze;
-fosfatazele sunt supuse unui control hormonal.
• Unele enzime sunt active în forma fosforilată (glicogen
fosforilaza implicată în catabolismul glicogenului), altele
sunt active în forma defosfo (glicogen sintetaza implicată în
proces anabolic).
• Acest tip de activare este, de multe ori, etapa finală într-o
cascadă de evenimente declanşate de legarea unui hormon la
o membrană celulară.
ATP ADP
proteinkinaze
fosfataze
Pi H 2O
Reglarea covalentă prin
proteoliză
• Proenzimele (zimogenii) sunt forme
inactive produse la locul de sinteză,
activarea acestora urmând să se facă la
locul de acţiune.
• Transformarea
HCl
• pepsinogen pepsina
(- segment terminal (44 aminoacizi) cu
caracter bazic)
• Transformarea
Tripsinogen tripsină
enteropeptidază (enterokinază)
Enteropeptidazã Chimotripsinã
Procarboxipeptidaza A
Tripsinã
Carboxipeptidaza A
Procarboxipeptidaza B
Carboxipeptidaza B
• Enzimele coagulării şi fibrinolizei.
Factor tisular
Plasminogen Plasminã
• –antitrombina III
• –1 antiproteaza (denumită şi 1 antitripsina)
• –inhibitorul pancreatic al tripsinei
• –inhibitorul proteinei C (proteina C este o serin
protează plasmatică dependentă de vitamina K,
activată de trombină, care transformă factorii activi
VIIIa şi Va ai coagulării în forme inactive).
• Antitrombina III:
-prezentă în plasmă;
• –pH izoelectric
• –mobilitate electroforetică
• –masa moleculară
• Izoenzimele se diferenţiază şi prin însuşirile
lor catalitice:
Lactat dehidrogenaza
H3 C CH COOH H3 C C COOH
OH O
Acid L-lactic Acid piruvic
NAD+ NADH + H+
Izoenzimele LDH au afinităţi diferite pentru
piruvat (sau lactat):
• H4 şi H3M sunt caracteristice inimii
- H4 are cea mai mica afinitate pentru piruvat (îl
transformă greu în lactat).
Ore
Infarct
Complexe multienzimatice
• Asamblări de proteine într-un complex, cu
scopul de a creşte eficienţa globală a
procesului.
• Rolul lor:
• –cataliza coordonată a unei succesiuni de
reacţii;
• –minimalizarea unor reacţii secundare.
• Subclase:
• Dehidrogenazele catalizează transferul de
hidrogen de la substrat (SH2) pe o coenzimă
redox (NAD+; NADP+; FMN; FAD):
CH CH + O2 CH O + O CH
• Monooxigenazele încorporează numai un atom de
oxigen în substrat, celalalt atom al dioxigenului este
redus la apă.
Multe monooxigenaze sunt hidroxilaze care implică
participarea sistemului redox: NADP+ - (NADPH +
H+)
• Subclase:
Aminotransferaze (transaminaze) catalizează transferul
unei grupări amino între un amino şi un cetoacid.
Coenzima participantă este piridoxal fosfatul.
Subclase
• Esterazele care pot fi:
–carboxilesteraze (cu substrat R-COOR’)
–tiolesteraze (cu substrat R-CO -SR’)
–fosfomonoesteraze (substrat R-O-PO 3H2)
• Glicozidaze
• Peptidaze
Liazele
H COOH COOH
C Fumaraza HC OH
+ H2O
C CH2
HOOC H
COOH
Acid fumaric Acid malic
• Sintazele catalizează legarea a două molecule fără
implicarea ATP aminolevulinat sintaza)
Izomerazele
• catalizează reacţii de izomerizare:
L-Alanina D-Alanina
• Epimerazele schimbă configuraţia unui singur
atom de carbon asimetric
D-Glucozã D-Galactozã
COOH COOH
mutazã
HC OH HC OPO3 H2
H2 C OPO3 H2 H2 C OH