Biologa Molecular

Desde los comienzos

Gregor Mendel Experiments in plant hybridization (1865)
Caracteres individuales son determinados por factores discretos
Experimentos con alberjas Genes vienen en parejas Los genes no se mezclan Dominancia Herencia gentica es transmitida de acuerdo con leyes

Legitimacin de los genes

Robert Hooke (1665) Theodor Schwann Carl Correns, Hugo Vries, Erich von TschermakSeysenegg (1900) Walter Flemming (1882) Meiosis Mitosis

Fundamentos Bioqumicos de la Clula

Materia
Todo lo que tiene masa y ocupa un lugar en el espacio. A nivel macro es definida por sus propiedades fsicas y qumicas.

tomo
Unidad estructural bsica de un elemento. Ejemplo: un alambre de Cu est compuesto por millones de tomos ordenados de una forma determinada

 118 elementos tomos de los elementos reaccionan entre s Compuestos resultantes con caractersticas fsicas y qumicas diferentes a las de los tomos que los conforman

Interacciones
Intramoleculares: Intermoleculares:

Enlace qumico

fuerza de atraccin entre dos tomos de un compuesto. fuerza de repulsin

Electrones de valencia
Electrones del ltimo nivel de energa:

Reacciones qumicas
Permiten ganar, perder o compartir electrones para alcanzar el nivel ms estable de energa

A+B
reaccionantes

C
productos

Principales tipos de enlaces

Inicos y covalentes. Enlace inico: envuelve la transferencia de uno o ms electrones de un tomo al otro tomo que participa en la formacin de un compuesto.

Enlace inico

Slidos
Cristalinos con estructura repetida regularmente (NaCl)

Enlace inico
tomos de elementos con baja energa de ionizacin y baja afinidad electrnica tienden a formar iones positivos. tomos con alta energa de ionizacin y alta afinidad electrnica tienden a formar iones negativos.

 Los iones positivos y negativos se mantienen juntos por atracciones electrostticas. Reacciones entre los elementos representativos metlicos y no metlicos tienden a resultar en enlaces inicos. E=k x Q1Q2/ d (la energa del enlace inico depende de las cargas)

Electronegatividad
Medida de la habilidad de un tomo para atraer electrones en un enlace qumico. La diferencia en elctronegatividad se calcula restando el valor del elemento menos electronegativo del ms electronegativo.

Electronegatividad en la tabla peridica

Enlaces covalentes
Enlaces qumicos basados en compartir (no en transferir) electrones. Son comunes entre los elementos no metlicos. Tienden a formarse entre tomos con tendencias similares a ganar o perder electrones. Se forman molculas verdaderas. Las molculas no se unen a las otras y se pueden mover fcilmente (lquidos y gases a T ambiente).

Enlace covalente no polar (apolar)

Electrones del enlace estn compartidos de forma equitativa entre los tomos. Atomos iguales:
con la misma afinidad por electrones.

Enlace covalente polar

Electrones compartidos en forma no equitativa Un extremo del enlace es ms rico en electrones que el otro La igualdad con que se comparten los electrones depende de la electronegatividad de los tomos que participan en el enlace.

H-F

Interacciones dbiles
Puente de hidrgeno:
Interacciones electrostticas entre tomos de hidrgeno y los pares de electrones no compartidos de tomos electronegativos.

Fuerza de enlace:
Ms dbiles que los enlaces covalentes. Se requieren 45kcal/mol para romper un puente de hidrgeno entre molculas de agua.

 Funciones: Los puentes de hidrgeno ayudan a mantener la estabilidad de las estructuras tridimensionales de los cidos nucleicos y protenas. Clases: Intra o intermoleculares. Cualquier molcula con la capacidad de formar puentes de hidrgeno, establece estas interacciones con el agua.

Harvey Lodish Arnold Berk Paul Matsudaira Chris A. Kaiser Monty Krieger Matthew P. Scott Lawrence Zipursky James Darnell

Molecular Cell Biology

Fifth Edition

Chapter 1: Life Begins with Cells

Copyright 2004 by W. H. Freeman & Company

Metabolismo:

David L. Nelson and Michael M. Cox Lehninger Principles of Biochemistry Fourth Edition

Molculas constitutivas de las clulas

Macromolculas:
protenas, cidos nucleicos, carbohidratos y lpidos.

Molculas pequeas:
agua, compuestos orgnicos simples, iones, mono y oligosacridos.

Constituyentes celulares claves:

RNA

Agua
75% de la masa celular es agua. En las clulas vivas la mayora de las reacciones qumicas ocurren en ambiente acuoso. Es una molcula polar que exhibe un momento dipolar. Al ser dipolo interacta con iones cargados.

Disociacin del agua

Las molculas de agua se disocian reversiblemente en [H+] y [OH-].
H2O 2H2O Kw= [H+]

[OH-] [OH-] +

[H3O+]

[H3O+] [OH-]= 10-14 mol2/L2

Equilibrio cido-base
Electrolitos fuertes: se disocian totalmente en agua. Electrolitos dbiles: se disocian parcialmente en agua. Bronsted-Lowry: un cido dona protones una base acepta electrones HA <=> H+ + A-, B+ H+ <=> B H+

Los amino cidos tienen un centro asimtrico

Protenas
Polmeros de amino cidos. Sntesis ribosoma20 aa. Sntesis extraribosomal.

Enlace peptdico

Estructura primaria

Estructura secundaria

Interacciones dbiles

Estructura terciaria

Niveles de organizacin de las protenas

Grupo prosttico

Denaturacin de las protenas

Funciones de las protenas

Catlisis. Transporte y almacenamiento. Elementos estructurales de la piel y huesos, el citoesqueleto. Inmunidad. Regulacin hormonal. Control de la expresin gentica.

Enzimas

Lpidos
Estructura
Simples Acidos Grasos Saturados e Insaturados Digliceridos y Trigliceridos Ceras Complejos Fosfolpidos Esfingolpidos Glucolpidos Derivados del Isopreno Esteroides

LIPIDOS
Funcin
Almacenamiento de Energa Estructura Membranas Transporte Mantenimiento Lpidos sricos Proteccin Fro Fsica Hormonas Almacenamiento de Vitaminas Antioxidante Crecimiento celular Hormonas Coagulacin Metabolismo de Calcio y Fosfato

cidos grasos:
CH3(CH2)nCOOH

Esteres:

O CH3(CH2)nCOC (CH2)n CH3

cidos Grasos

cido esterico y Olico

Triglicridos

cido fosfatdico

Alcoholes involucrados en la formacin de lpidos

Fosfolpidos

Lpidos de membrana
cidos grasos
sintetizados en el citoplasma a partir de acetilCoA

Fosfogliceridos
sintetizados en fase citoslica del retculo endoplsmico

Esfingolpidos
sintetizados en Golgi

Composicin de las membranas

Plasmalgenos
Fosfogliceridos
Un cido graso esterificado con glicerol Un hidrocarburo eterificado con glicerol

Constituyen cerca del 20% del contenido total de los fosfoglicridos humanos Particularmente abundantes en el cerebro y corazn

Glucosil cerebrsidos + ganglisidos glicolpidos

Efecto del colesterol

Curvatura:

Fosfolipasas:

Rafts: microdominios ricos en colesterol, esfingolpidos y ciertas protenas de membrana

Bicapa Fosfolipdica

Membranas Biolgicas

Membranas

CARBOHIDRATOS
Compuestos polihidroxilados con grupo funcional Aldehdo o Cetona
3 a 7 tomos de Carbono Carbonos asimtricos Configuracin D y L

Monosacrido, Disacrido, Polisacridos Estructura lineal y cclica Enlace Glicosdico Funcin: Almacenamiento de Energa Estructura y soporte

Monosacridos

Clasificacin de Carbohidratos

Carbono Asimtrico

Hemiacetales y Hemicetales

Glucosa

Fructosa

Sacarosa

Lactosa

Maltosa

Celulosa

Carbohidratos en la Dieta

Carbohidratos Funciones

Carbohidratos de Superficie

Dogma central de la biologia molecular

cidos nucleicos:DNA y RNA

Polmeros de deoxi o ribo-nucletidos
polinucletidos oligonucletidos.

DNA

RNA

Nucletido

Bases nitrogenadas

PENTOSAS

Importancia DNA

Organizacin del DNA:

Cromatina: o complejo de DNA

y protenas o localizacin: ncleo de las clulas eucariticas nucleoide eubacterias y archaeas

Composicin de la cromatina
DNA (1/3) Histonas (1/3) Protenas no histonas (1/30) RNA:
resultado de procesos de transcripcin. no es componente estructural de la

cromatina

Protenas no histnicas
Cromatina de una clula diploide

contiene un rango variado de stas (200- 2,000,000). Diversas:

estructurales, factores de transcripcin,

polimerasas, motoras, etc. composicin es variable, cuanti y cualitativamente, en clulas de diferentes tejidos y organismos.

Protenas Estructurales

Histonas
Descubiertas en 1884 Caractersticas
tamao pequeo alto contenido de aminocidos bsicos (Lys, Arg) Conservadas evolutivamente Especialmente H3 y H4

Clasificacin
H1, H2A, H2B, H3 y H4. H1 posee isoformas: H1o y H5

Tienen bastante homologa en los seres

vivos donde se han estudiado.

Constituyen el 50% de las protenas

celulares.

Son sintetizadas durante la fase S del

ciclo celular.

H2A, H2B, H3 y H4, forman el corazn

de los nucleosomas.

Cromosomas
Piezas separadas de cromatina, que se comportan como unidades durante la divisin celular.

Cromosoma bacteriano
Generalmente nico y circular
algunas bacterias tienen cromosomas circulares mltiples (Vibrio cholerae, Brucella melitensis). algunas bacterias tienen cromosomas lineares y plsmidos lineares (Borrelia, Streptomyces, etc).

Cromosoma bacteriano
DNA asociaciado con protenas
diferentes grados de compactacin.

Se ha reportado:
la presencia de protenas asociadas al DNA tipo histonas protenas diferentes (telomerasas, factores de transcripcin)

Presencia de telmeros en los cromosomas lineares.

Compactacin del cromosoma bacteriano

Estructura secundaria

Gen
Secuencia de DNA necesaria para que se transcriba un RNA. Puede ser:
fragmento continuo de DNA fragmento discontinuo de DNA resultado de procesos de recombinacin del DNA (linfocitos B y T).

Genes

Splicing alternativo

Genes recombinados
Se originan por recombinacin de segmentos del DNA. Ejemplo:
genes que producen las cadenas de pptidos que conforman las inmunoglobulinas y los receptores de las clulas T,

Recombinacin VJ

Estructura de los genes

Cdigo gentico
Cdigo: sistema de smbolos que equipara informacin en un lenguaje con informacin en otro lenguaje

DECIFRANDO EL CODIGO GENETICO

Marshall Niremberg, Heinrich Matthaei

Har Gobind Khorana

Marshall Niremberg y Philip Leder

MARCO DE LECTURA

MARCO DE LECTURA

Caractersticas del Cdigo Gentico

Universal Codones:61 codifican para aa, 3 de terminacin (UAA, UAG, UGA), 1 de iniciacin (AUG / GUG). Es degenerado

Codones poco comunes