Introducere

Software-ul dezvoltat pentru programul EU-HOU a fost proiectat pentru a fi de tip multiutilizator, multlingvistic i pentru a fi folosit la prelucrarea imaginilor din astronomie i analiza acestora n sala de clas. Aspectul su permite adugarea uoar de faciliti noi i practic nu necesit ntreinere de specialitate, fiind orientat ctre utilizator. Software-ul ca resurs pedagogic, are niveluri diferite de utilizare, pentru a fi pus n aplicare n diverse medii(licee, colegii, universiti). Software-ul este distribuit gratuit.

Concepte fundamentale

Interfaa "SalsaJ" conine o bar de meniuri (n partea de sus a ecranului ), o bar de unelte sub aceasta, o bar de stare i o bar de progres n partea de jos a acestuia. Imaginile, histogramele i profilul liniei, sunt afiate n ferestre ce apar succesiv pe ecran. Rezultatele msurtorilor sunt afiate n fereastra Rezultate. Vrem s v reamintim c aceste ferestre sunt de tip Windows i pot fi glisate pe ecran i redimensionate. Histogramele i imaginile obinute prin plotare sunt plasate n ferestre obinuite, de unde pot fi copiate (n clipboard intern), editate, tiprite i salvate.

Bara de instrumente

Bara de instrumente conine instrumente pentru lucrul cu fiierul, selecii, mrire/micorare(zoom) i prelucrarea imaginilor i schimbarea culorii desenului. Facei clic pe orice buton i o descrierea acestui obiect este afiat n bara de stare.

Bara de stare

Bara de stare, atunci cnd cursorul este de peste o imagine, afieaz n pixeli coordonatele i valorile asociate.

Bara de progres Bara de progres, situat n partea dreapt a barei de stare, arat progresul operaiunilor de consumatoare de timp. Ea nu va aprea dac operaiunea necesit timp mai puin de o secund.

Imagini

Aplicaia SalsaJ permite ca mai multe imagini s fie afiate pe ecran la un moment dat de timp. Fereastra active are bara titlu evideniat, ca la orice aplicaie Windows. Toate operaiile vor fi efectuate pe imaginea activ. SalsaJ folosete prelucrarea imaginilor la rezoluie de 8bii, 16-bii i 32-bii (n modul real), dar folosete i tonuri de gri la rezoluie de 8 bii i imagini la 32-bii color. Imaginile pe 8 bii sunt reprezentate prin numere ntregi fr semn, n intervalul de la 0 la 255. Imaginile pe 16 bii utilizeaz numere ntregi fr semn (0 la 65.535) i imaginile pe 32bii(inclusiv tonurile de gri) utilizeaz numerele n virgul mobil. Imaginile pe 16 bii i 32-bii pentru tonuri de gri, nu sunt direct afiate pe monitoarele calculatoarelor, ce pot afia de regul numai 256 nuane de gri. Prin urmare, datele sunt mapate(realizate din buci, ca la ecranele folosite n concertele din stadioane) pe 8 bii n ferestre. Fereastra definete intervalul de valori asociate nuanei de gri ce v-a fi afiat: valori de sub intervalul fereastrei sunt transformate n negru, n timp ce valorile de deasupra intervalului ferestrei sunt de culoare alb. Fereastra este definit de valorile minime i maxime care pot fi modificate folosind Image/Reglare/Luminozitate/Contrast. Seturi de imagini SalsaJ poate afia mai multe imagini de prelucrat separat sau legate temporar ntr-o singur fereastr. Aceste seturi de imagini se mai numesc stive i imaginile din care este construit aceast stiv se mai numesc i felii(slides). Toate feliile ntr-o stiv trebuie s aib aceeai dimensiune i adncime la nivel de bit. O bar mobil ofer abilitatea de a trece de la o felie la alta, iar aplicaia SalsaJ va filtra prin procesare toate feliile dintr-o stiv.

Selecii

Seleciile sunt zone sau linii definite de utilizator n cadrul unei imagini. Doar o singur selecie poate fi activ la un moment dat. Selecia zonelor dintr-o imagine se realizeaz folosind instrumentele rectangular (dreptunghi), ovale (oval), poligonal (polygonal), freehand selection (cu mna liber). Totodat aceast selecie a zonelor poate fi msurat cu Analyze/Measure (Analiza / Msurare), filtrat, umplut (Edit / Fill) sau tras (Edit /Draw). Conturul selecilor este creat folosind instrumente liniare, de segmentare i cu mna liber. Folosii Edit / Draw (Editare/Desenare) pentru a trasa linia cu culoarea curent. Lungimea conturului selectat poate fi msurat folosind Analyze/Measure (Analiza / Msurare). Seleciile pot fi mutate, fcnd clic i glisndu-le. Bara de stare afieaz coordonatele colul din stnga sus ale seleciei (sau marginea de sus a unui dreptunghi de ncadrare pentru selecii non-dreptunghiulare), n timp ce acesta este mutat. Reinei c modificrile din cursor le facei atunci cnd suntei n interiorul zonei selectate. Pentru a muta coninutul seleciei (dreptunghiulara, n alt zon folosii comenziile Editare/Copiere(Edit / Copy (c)), respectiv Editare/Lipire sau (Edit / Paste(v)), i apoi facei clic n cadrul de seleciei i glisai. Utilizai tastele sgeat pentru a orienta selecia la nivel de un pixel n orice direcie. Selecia dreptunghiular poate limea i nlimea acesteia vor fi fi redimensionat cu ajutorul mnerului (handle sau caseta mic), aflat n colul din dreapta jos. Mrimea seleciei poate fi mrit(ntins), iar afiate n bara de stare a aplicaiei. Utilizai tastele sgeat combinate cu apsarea tastei ALT, pentru a mrii selecia dreptunghiular sau oval la un pixel, n orice moment. Pentru a terge o selecie, alegei oricare dintre instrumentele de selecie i facei clic n afara de seleciei sau folosii Edit / Select None (Editare/ Nu selecta un obiect) sau Shift+A. Folosii Edit /Restore Selection(Restaurare Selecie) sau Shift+E pentru a aduce selecia napoi, dup ce a-i ters-o. O selecie poate fi transferat de la fereastr imagine la alta prin activarea fereastrei destinaie i folosind combinaia Edit i apoi Restore Selection. Apsai tasta TAB pentru a activa o serie de ferestre n secven. Seleciile pot fi salvate pe disc folosind File/SaveAs i recuperate folosind File/Open.

Seleciile multiple pot fi salvate prin transferarea din selecii, deschidei imaginea i facei prezint cu instrumentul baghet. Formate de fiiere clic n partea

lor ntr-o fereastr goal, stng a unuia

fie-

care desen folosind un Edit/Draw, i apoi s salvai imaginea rezultat. Pentru a restaura una dintre trasee

n aplicaia SalsaJ se folosesc urmtoarele tipuri de imagini pentru prelucrare cu comanda File-Open: TIFF (necomprimat), GIF, JPEG, BMP i FITS. De asemenea, se pot deschide tabele de cutare i selecii (ROIs). n plus, File/Import ofer acces la pluginuri pentru a deschide fiiere RAW(brut), imagini n format ASCII, i ncrcarea imaginilor prin reea folosind un URL. Pentru a importa un fiier brut, trebuie s tii anumite informaii despre structura, inclusiv dimensiunea imaginii i compensarea datelor imaginii. Ofer suport pentru formatele suplimentare prin descrcarea sau scrierea pluginurilor. Fiiere pot fi salvate n format TIFF, GIF,JPEG, FITS, text delimitat de tabulatori i formate brute.

Plugin-uri Funcionalitatea SalsaJ poate fi extins prin utilizarea de plugin-uri scrise n Java. Pluginul poate aduga suport pentru formate de fiiere noi sau se poate folosii pentru filtrarea sau analiza imaginilor. Plugin-uri aflate n folder de "plugin-uri" SalsaJ vor fi instalate automat n meniul Plugin-uri.

Tabele de cutare

Imaginile n tonuri de gri sunt afiate folosind o culoare din tabelul de cutare care descrie culoarea utiliznd pentru fiecare din acestea din cele 256 de valori posibile la nivel de pixel. Selectai alternativ paleta de culori din Image / Lookup Table. Utilizai Image/Adjust/Brightness/Contrast(Imagine / Reglare / Luminozitate / Contrast) pentru a spori modificarea dinamic a imaginii folosind

cartografierea sau maparea acesteia prin Analyse/Show LUT(Analiz / Afiare LUT) pentru a afia tabelul de cutare a imaginii active.

Instalarea n platforma Windows Aceste note se aplic SalsaJ 1.0, care este distribuit ca un instalator Windows. Pentru a instala i rula SalsaJ, descrcai Windows fiierul zip., extract de directorul SalsaJ,i s lanseze "Setup.exe". Cerine de memorie SalsaJ necesit Windows 95 sau mai trziu. Se ruleaz pe o main cu 64MB, dar eamerge mai bine cu 256MB sau mai mult, n special atunci cnd lucreaz cu imaginimari i / sau stive. Folosii Edit / Options / comanda de memorie pentru a face mai mult de 128MBimplicit la dispoziia SalsaJ. Reinei c setarea "Memory maxim" valoare la mai mult de aproximativ 75% din RAM real poate duce la performane slabe, datorit memoriei virtuale "btaie". Suma maxim de memorie care pot fi alocate este de aproximativ 1,7 GB.

Actualizarea Pentru a face upgrade la ultima versiune de SalsaJ, nlocuii fiierul salsaj.jar n folderulSalsaJ cu una mai nou de la. Despre Installer SalsaJ de instalare Windows este creat folosind generatorul de instalare Inno Setup. Adugarea unui fiier JAR Unele plugin-uri necesit adugarea unui fiier JAR la SalsaJ. n SAlsaJ 1.0, acest lucru se face prin copierea fiierul JAR n folderul plugin-uri sau un subfolder imediat a pluginuri folder, apoi repornirea SalsaJ. Pentru a compila un plugin care utilizeazun fiier JAR, copiai fiierul JAR n folderul Java extensii, SalsaJ \ jre \ lib \ ext.

Comenzi de meniu

Meniul New...

MENIUL noi ... Creeaz o fereastr nou imagine sau stiv. O caset de dialog v permite s specificai titlul imaginii, tipul, dimensiunile si coninutul iniial.

Numele este titlul care vor fi utilizate pentru ferestre. Tip este tipul de imagine: 8-bittonuri de gri, tonuri de gri 16-bit (nesemnat), 32bit (float) tonuri de gri sau de culoareRGB. Umple cu (alb, negru, rampa, sau Clipboard Cuprins) specific modul n careimaginea este iniializat. Limea i nlimea specifica dimensiunile imaginii n pixeli.Limea i nlimea sunt ignorate dac Umplere cu este setat la Clipboard Contents.Setai Slices la o valoare mai mare dect o pentru a crea o stiv. Deschis ... Citete o imagine i l afieaz ntr-o fereastr separat. Fiierele trebuie s fie n format TIFF (necomprimat), GIF, JPEG, DICOM, BMP, PGM sau format FITS. De asemenea, se deschide SalsaJ i NIH Image lookup tabele (cu extensia "UTT.").Formate de fiiere suplimentare care sunt susinute prin intermediul plugin-uri instalaten submeniul Import. Exemplu: Imaginile TIFF pot fi de 1-bit, 8-bii, 16 bii (nesemnat), 32-bit (reale) sau de culoareRGB. Dosarul trebuie s fie necomprimate. FITS (Imagine flexibil sistem de transport), imaginea este format adoptate de ctrecomunitatea astronomic pentru schimbul de date i stocarea arhivelor. UtilizareaImage / Afiare Info pentru a afia antetul FITS. Informaii despre FITS este disponibilde la http://fits.gsfc.nasa.gov. Import Acest submeniu listeaz plugin-uri instalate imaginea de achiziie. Secven imagine ... Deschide o secven de imagini ntr-un folder ca o stiv. Imaginile trebuie s fie toatede aceeai mrime i tip. Ele

pot fi n TIFF, JPEG, DICOM, BMP, GIF, sau FITSformat PGM. Exist dou casete de dialog: una pentru a selecta dosarul i una pentru a specifica opiuni. n caseta de dialog n primul rnd, selectai una dintre imaginile dindosar i facei clic pe "Open". Utilizai al doilea (mai jos) pentru a specifica careimaginile din dosar pentru a deschide i / sau s aib imaginile convertite la 8-bii sau reduse n dimensiune. Utilizai cmpul Numr de imagini pentru a specifica modul n care multe imaginipentru a deschide. Incepand stabilit pe imagine pentru a n pentru a ncepe cuimaginea n-lea n dosarul. Set de incrementare la "2" pentru a deschide orice alt imagine, la "3" pentru a citi fiecare a treia imagine, etc Introducei un ir de caracteren cmpul Nume fiier Conine i SalsaJ va deschide doar fiierele ale cror numeconine acel ir. Verificarea Conversia la 8bit tonuri de gri reduce cerinele dememorie cu 50% pentru imagini de 16 bii i de 75% pentru 32bii i imagini RGB.Verificarea Open jumtate Dimensiune reduce cerinele de memorie de 75%.Dimensiunea (widthxheightxdepth) din stiva care va fi creat este afiat n partea de josdin caseta de dialog.

UTT ... Deschide o imagine NIH tabel de cutare, sau un crud tabel de cutare. Fiierul UTTprime trebuie s fie 768 bytes i conine 256 rosu, 256 albastru i 256 verdea. Dacnu este deschis imagine, o imagine ramp 256x32 este creat pentru a afia UTT.Tabele de cutare cu nume de fiiere care se termin n ". LUT" poate fi, de asemenea, deschis folosind File / Open. Text imagine ... Deschide un fiier text delimitat prin tab-ca o imagine reala pe 32 de bii. Limeaimaginii i nlimea sunt determinate prin scanarea dosar i de numrare a numruluide cuvinte i linii. Utilizarea Image / Mese de cutare / Inverseaz LUT pentru a afiacorect fiierele text importate din NIH Image. Pentru fiiere text cu valori ntregi nu maimare de 255, utilizai Image/Type/8-bits pentru a converti la 8bii. nainte de conversie,dezactiva "Scale Cnd Conversia" n Edit / Options / Diverse pentru a preveni imaginide la a fi scalate la 0-255.

Fiier text ... Deschide un fiier text. Facei clic dreapta (comanda-clic pe un Mac), ntr-o fereastr de text pentru a activa un meniu pop-up cu Salvare ca, Cut, Copy, Paste i selectai toate comenzile. Cele mai multe fiiere text poate fi, de asemenea, deschis folosindFile / Open. URL-ul ... Descarc i afieaz o TIFF, JPEG, DICOM, BMP, GIF sau imaginea FITS specificatde un URL. Iat cteva adrese URL de exemplu: pentru a ncrca o imagine jpg, dinNebuloasa Orion doar s tastai: http://en.wikipedia.org/wiki/File:Orion_Nebula_-_Hubble_2006_mosaic_18000.jpg Este posibil s se conecteze la imagini observator virtual. De exemplu, dac dorii s preluai Nebuloasa Orion, introducei: http://archive.stsci.edu/cgi-bin/dss_search?v=poss2ukstu_red&r=05+36+00&d=05+23+28.0&e=J2000&h=15.0&w=15.0&f=gif&c=none&fov=NONE&v3= n cazul n care r = ascensiune dreapta d = declinatie a obiectului

Prime ... Utilizai aceast comand pentru a importa imagini care nu sunt ntr-un format de fiier suportate direct de SalsaJ. Vei avea nevoie s tie anumite informaii despre structura de fiiere imagine, inclusiv dimensiunea imaginii, i offset la nceputul datelor de imagine.

Utilizai meniul pop-up n partea de sus a casetei de dialog pentru a specifica tipul deimagine. Exist nou opiuni: 8-bit unsigned integer 16-bit semnat ntreg (convertit la nesemnate prin adugarea 32768) 16-bit unsigned integer 32 de bii, semnat ntreg (convertit la float) 32-bit floating-point 24-bit RGB de culoare (intercalate) 24-bit RGB de culoare (plane) 32-bit color ARGB 1-bit Bitmap (convertite la 8-bit) Interleaved imagini RGB au pixeli stocate contiguously (rgbrgbrgb. ..) ntr-un plansingur imagine. Planar imagini RGB au date rou, verde i albastru imagini stocaten avioane separate , proba de 8 bii. SalsaJ salveaz imaginile RGB (att TIFF iprime), n format intercalat. Limea imaginii este numrul de pixeli n fiecare rnd de date imaginii i nlimeImage este numrul de rnduri n imagine. Offset pentru prima imagine este numrulde octei n fiier nainte de primul octet de date imagini. Numrul de imagini este numrul de imagini stocate n fiier. Dac aceast valoare este mai mare dect numrul real de imagini care rezult stiva va primi trunchiate ladimensiunea real. Gap ntre imagini este numrul de octei de la sfritul de o imagine la nceputulurmtoarei. Setai aceast valoare la latime x inaltime x bytes-per-

pixel xn pentru asri peste imagini n pentru fiecare imagine citi. Verificai Black este zero n cazul n pixeli de culoare neagr sunt reprezentate prinnumere care sunt mai mici dect numerele utilizate pentru pixeli albi. n cazul n careimaginile arata ca negativele fotografice, schimbarea acest domeniu ar trebui srezolve problema. Little Endian Byte Order va necesita probabil s fie verificate atunci cnd importul de 16 bii sau imagini de 32-bit tonuri de gri de la maini de little-endian, cum ar fi PC-uri bazate pe Intel. Verificai Open Toate SalsaJ i va importa toate imaginile din dosar ca o stiv.Imaginile trebuie s fie toate de aceeai mrime i tip. Inchide nchide fereastra imaginii n prezent active. n cazul n care imaginea sa schimbat, vei fi ntrebat dac dorii s salvai modificrile. Salva Salveaz imaginea activ sau stiva. Pentru a salva doar o zon selectat, a crea o selecie dreptunghiular i de a folosi Image / comanda Duplicate. Salvare ca Utilizai acest submeniu pentru a salva imaginea activ n TIFF, JPEG, GIF sau FITS, sau "crud" format. Poate fi, de asemenea, folosite pentru a salva rezultatele de msurare, tabele de cutare, selecii, i de selecie coordonatele XY. FITS ... Salveaz imaginea activ n format FITS. Informaiile din antet este creat cu informaii al imaginii originale. Tiff ... Salveaz imaginea active sau stiv n format TIFF. TIFF este format numai (altele dect "prime"), care suporta toate tipurile de date SalsaJ i singurul format care salveaz de calibrare spaiale i densitate. Gif ... Salveaz imaginea activ n GIFformat. Imaginea trebuie s fie de 8-bii n profunzime.Dac nu este, se converti la culori pe 8 bii utiliznd Image/Type/8-bit color sau n tonuri de gri pe 8 bii utiliznd Image/Type/8-bit. Jpeg ... Salveaz imaginea activ n format JPEG. Folosii Edit / Options / Calitate JPEG pentru a specifica nivelul de compresie JPEG (0-100). Valorile mai mici produce fiiere mai mici, dar de

calitate mai srace. valori mai mari produce fiiere mai mari, dar de calitate mai bun. Atentie: formatul JPEG foloseste compresia lossy care poate duce la artefacte. Acest format nu trebuie utilizat dac avei de gnd s fac msurtori pe imagine sau de a face o prelucrare ulterioar. ZIP ... Salveaz imaginea active sau stiva ca un fiier TIFF n interiorul unui comprimat arhiv ZIP. Prime de date ... Salveaz imaginea active sau stiva ca date brute pixel fr un antet. imagini de 16 bii sunt salvate ca pantaloni scuri nesemnat. 16 bii i imagini float sunt salvate folosind pentru bigendian byte.

Text imagine ... Salveaz imaginea activ ca un fisier de calcul tabelar compatibil text delimitat de tabulatori. Secven imagine ... Salveaz toate feliile din active stiva ca separate TIFF, JPEG, GIF sau fiiere prime. AVI ... Salveaz activ stiva ca un fisier AVI necomprimat. Utilizatorii de Windows pot folosi VirtualDub pentru a deschide fiiere necomprimate AVI i resalvai ca un AVI comprimat. Utilizatorii Macintosh pot folosi QuickTime Movie programului Player pentru a deschide fiiere necomprimate AVI i, cu versiunea Pro, resalvai n format comprimat QuickTime. UTT ... Salveaz imaginea activ de tabel de cutare ntr-un fiier. Fiierul 768 byte este format din 256 de valori rou, 256 de valori verde i albastru 256 de valori. Msurtori ... Exporturile coninutul "Rezultate" fereastr ca un fiier text delimitat de tabulatori. Selecie ... Salveaz curent limit de selecie zon ntr-un fiier. Folosii File / Open pentru a restabili selecie. Coordonate xy ... Exporturile XY coordonatele selectarea liniei sau limita aria de selectie ca o coloan doi, fiier text delimitat de tabulatori. Coordonatele de selecii linie dreptunghiulare, ovale i drepte nu pot fi exportate. Utilizai Calea Writer plug-in plugin-ul pentru a memora coordonatele distanate uniform la intervale de pixel. Reveni nlocuiete imagine activ cu ultima versiune salvat. Aceasta este o comand rapid pentru a nchide fereastra fr a salva, i apoi re-deschidere. Comanda n prezent nu funcioneaz cu

stive. Page Setup ... Caseta de dialog Page Setup v permite s controlai dimensiunea produciei tiprite, plus alte opiuni de imprimare.

Scar valori mai puin de 100% a reduce dimensiunea de imaginile imprimate i valorimai mare de 100% creterea dimensiunilor. 100% corespunde la 72 de pixeli perinch, cu privire la dimensiunea ecranului unzoomed a imaginii. dimensiunea imaginiitiprite este determinat de valoarea Scale i limea i nlimea imaginii n pixeli.Calibrare spaial este ignorat. Verificai Draw frontier s aib SalsaJ imprima o frontier late de un pixel negru n jurul imaginii. Verificai Centrul de pagin i imaginea va fi imprimat n centrul paginiin locul n colul din stnga sus. Verificai Print Titlul s aib titlul a imaginii imprimate n partea de sus a paginii. Imprimare ... Imprim imagine activ. dimensiunea imaginii tiprite va fi n mod normal, mai putindimensiunea sa de pe ecran (unzoomed). Utilizai caseta de dialog Page Setup pentru a crete a micora dimensiunea imaginilor imprimate. Imagini mai mare dect paginasunt scalate pentru a se potrivi. Prsi Ieiri SalsaJ. Dac nu ai memorat nici imagini, vi se va solicita s fac acest lucru.Putei iei, de asemenea, fcnd clic pe butonul de nchidere din bara de titlu a ferestrei SalsaJ lui.

MENIUL Editare Anula Inverseaz efectul de editare a imaginilor cele mai recente sau operaia de filtrare.Reinei c operaiunile pe stive ntregul nu poate fi inversat prin Anulare. Tiat

Copii coninutul seleciei imaginii curente la clipboard interne i-l umple cu culoarea defundal curent.

Copie Copii coninutul seleciei imaginii curente la clipboard interne. Dac nu exist nici oselecie, copiaz imaginea ntregului activ. Cantitatea de date imaginii copiate esteafiat n bara de stare. Cut, Copy si Paste de imagini de la alte aplicaii este n prezentnu sunt acceptate. Selectai opiunea Umplere cu Clipboard n File / New dialog pentrua crea o fereastr nou din coninutul clipboard interne SalsaJ lui.

Past Insereaz coninutul din clipboard interne n imagine activ. Imaginea lipit este selectat automat, permindu-i s fie trt cu mouse-ul. Facei clic n afara seleciei de a reziliapasta. Selectai Editare / Anulare pentru a abandona operaiunea de past. Past de Control ... Dup o Lipire, utilizai Lipire meniul Control pop-up pentru a controla modul n careimaginea n curs de lipit este transferat la imaginea destinaie.

Cu excepia pentru "Blend" i "transparent", Paste Control moduri de transfer suntaceleai ca cele enumerate n descrierea procesului / Imagine Calculator. "Blend"mod de funcionare este acelai ca Image Calculator "mediu" modul. n "transparent"modul, pixeli albi sunt transpar ente i toi pixelii celelalte sunt copiate neschimbate."transparent" modul funcioneaz numai cu 8-bii i imagini RGB. Clar terge coninutul de selecie la culoarea de fundal curent (n mod normal, alb).backspace (sau terge) Cheia este o comand rapid la

ndemn pentru aceastcomand. Clar afara terge afara zonei de selecie imaginea curent la culoarea de fundal. Completai Umple selecia curent cu culoarea de prim-plan curent. Culoarea prim-plan estestabilit cu ajutorul instrumentului Dropper a "ridica" o culoare nou dintr-o imagine.Alt-clic cu orice alt instrument, cu excepia lupa, pentru a comuta temporar lainstrumentul Dropper. Culorile pot fi "ridicate" de la Image / fereastra Culori utiliznd orice instrument. Instrumentul Pictograma setter n bara de instrumente este redactat nculoarea prim-plan i cadru n jurul este tras, n culoarea de fundal. Remiz Subliniaz selecia curent folosind culoarea prim-plan curent i limea de linie."Culori" fereastr, a deschis cu Image / comanda Culori, ofer o palet de culoridesen. Culorile pot fi "culese" de la "Culori" fereastra fr a fi nevoie pentru a comutala instrumentul Dropper. Folosii Edit / Options / linia de comanda Latime, saudubluclic pe instrumentul freeline, pentru a modifica limea liniei.

Inversa Creeaz o imagine inversat, similar cu un negativ fotografic, a ntregii imagini sau de selecie. Selecie comenzile din acest submeniu a crea, terge sau modifica selecii. Selectai Toate Creeaz o selectie dreptunghiulara, care are aceeai dimensiune ca imagine. Selectai Nici unul Dezactiveaz selecia din imagine activ. Restaurare de selecie Restabilete selecie anterior n poziia iniial. O selecie este salvat atunci cnd: tergere selecie fcnd clic pe din afara de ea Desenai o nou selecie De-a activa imagine care conine de selecie nchidei imagine care conine de selecie Deschidei o nou selecie folosind File / New Utilizai o comand care terge sau modific selecie Putei transfera o selecie de la o imagine la

alta prin activarea imaginii cu selecie,activarea imaginea de destinaie, apoi apsai shifte (tastatur scurtatura pentru Restore Selection).

Fit Spline Dedicat pentru o curb spline cubi la un poligon sau selecie polilinie. Opiuni Utilizai comenzi din acest submeniu pentru a schimba diverse SalsaJ setrile de utilizator preferin. Lime linie ... Afieaz o caset de dialog care permite limea de linii generate de comanda Drawpentru a fi schimbat.

Calitate JPEG ... Utilizai acest dialog pentru a specifica utilizarea nivelul de comprimare de File / SaveAs / comanda Jpeg. Care solicit un grad mai mare de compresie (o valoare mai mic) se va produce fiiere mai mici, dar calitatea imaginii mai srace. Fonturi ... Deschide o fereastr mic cu meniuri pop-up trei pentru specificarea tip,

mrime istil de font utilizat de instrumentul textul. Profil Plot Opiuni ... Utilizai acest dialog pentru a controla modul n

care parcelele generate de Analiza /Plot profil sunt afiate. Plot Lime i nlime traseaz specifica dimensiunea de complot n pixeli. Dac fixeScala Yaxa este verificat, gama de axa y este fix i specificate Y Min Max i valorileY sunt folosite, n caz contrar, parcelele sunt scalate bazeaz pe valorile minime i maxime gri. Verificai Nu salva X-Valori de a avea "Lista", "Save" i "Copiere" nferestre complot profil afia sau a salva numai y-valorile. Verificai Auto-aproape de a avea ferestre profil complot nchise automat atunci cnd "List", "Save" sau "Copy", seface clic pe. Verificai vertical Profil de a genera parcele rnd medie de zonedreptunghiulare n loc de parcele coloana medie implicit.

Diverse ... Afieaz o caset de dialog care conine opiuni diverse.

mprii de valoare zero specific valoarea utilizat atunci cnd Procesul / ImagineCalculator detecteaz o divizare prin zero, n timp ce mprirea o imagine pe 32 debii real de ctre un alt. implicit este infinit. n plus fa de valorile numerice, "infinit"(infinitul pozitiv sau negativ), "Max" (cea mai mare valoare pozitiv) i "Nan" (Nu-unnumr-) pot fi introduse ca Divide de zero valoarea Value. Bifai Use Pointer Cursor i SalsaJ va folosi un cursor sgeat n loc de cruce implicit care este uneori dificil de a vedea pe imaginile n tonuri de gri n zonele deluminozitate mediu. Aceast opiune poate fi de asemenea folosite pentru a ocoli un bug la Windows n cazul n care cursorul text este uneori utilizat n locul de crosshair.Reinei c SalsaJ trebuie s fie repornit atunci cnd ruleaz v1.33l i mai devreme. Verificai Ascunde "Procesul de Stack?" De dialog pentru a suprima caseta de dialogcare cere "Procesul de toate felii xx?" (numai felie curente vor fi prelucrate). Verificai antialiased text s aib instrumentul text a crea text netezite i pentru textul afiat n ferestrele histogram i ferestrele complot care urmeaz s fie atenuate.Necesit Java 1.2 sau mai trziu. Verificai Debug Mode pentru a permite afiarea de mesaje de depanare n "Jurnal"fereastra. nchidei "Log" pentru a afia fereastra dezactiva de mesaje de depanare.

Repeat Command Repeat the last command.

Meniul Imagine Tip> Utilizai acest submeniu pentru a determina tipul de imagine activ sau s-lconverteasc la un alt tip. Pentru mai multe informatii despre tipurile de imaginibitmap, consulta acest link. 8-bit Convertete n tonuri de gri pe 8 bii. imagine activ trebuie s fie tonuri de gri 16-bit,32bit tonuri de gri, 8-bit color sau de culoare RGB. SalsaJ convertete 16-bit i 32-bit imagini de la 8-bii prin scalare liniar din min-maxla 0 la 255, unde min i Max sunt dou valori afiate n imagine / Reglare /Luminozitate / Contrast instrument. Image / Afiare Info afieaz aceste d

ou valorica "gam de afiare". Reinei c aceast scalare nu se face n cazul n care "ScaleCnd Conversia" nu este verificat n Edit / Options / Diverse. Cu stive, toate feliilesu nt scalate la 8-bii folosind min i Max din trana afiate n prezent. Imaginile RGB sunt convertite n tonuri de gri cu ajutorul formulei gri = 0.299red 0.5870.114 verde albastru sau gri formula = (rou + verde + alba stru) / 3 n cazul n care"neponderat RGB la tonuri de gri de conversie" este verificat n Edit / Options /conversii. 16-bit Convertete n tonuri de gri nesemnate 16-bit. imagine activ trebuie s fie de 8-bittonuri de gri sau tonuri de gri pe 32 de bii. 32-bit Convertete a semnat tonuri de gri 32-bit floating-point. imagine activ trebuie s fie de 8bit tonuri de gri sau tonuri de gri 16-bit. 8-bit color Convertete la culori pe 8 bii indexate utiliznd Heckbert de cuantificare median tiatalgoritm de culoare. O caset de dialog permite numrul de culori (2-256) s fiespecificate. imagine activ trebuie s fie de culoare RGB. RGB Culoare Convertete la 32-bit color RGB. imagine activ trebuie s fie n tonuri de gri, 8bitcolor, sau un RGB (rosu, verde, albastru) sau HSB (nuan, saturaie i luminozitate)stiv. RGB Stack Convertete la a 3-felie (rosu, verde, albastru) stiv. imagine activ trebuie s fie de culoare RGB. HSB Stack Convertete la a 3-felie (nuan, saturaie i luminozitate) stiv. imagine activ trebuie s fie RGB color. O incercare de a efectua o conversie neacceptat provoac o caset de dialog pentru a fi afiat care listeaz conversiile posibile. * indic faptul c ambele imagini unic istive pot fi convertite.

Reglare> Acest submeniu conine comenzi care a regla luminozitatea / contrastul, niveluri de prag i dimensiunea imaginii. Luminozitate / Contrast ... Utilizai acest instrument interactiv pentru a modifica luminozitatea i contrastulimaginii active. Cu 8-bii imagini, luminozitatea i contrastul sunt modificate prin actualizarea imaginii uite-up mas (UTT), astfel nct valorile pixelilor suntneschimbate. Cu 16-bii i imagini 32bit, afiajul este actualizat prin schimbarea de cartografiere de la valorile pixelilor pentru a afia valorile de 8 bii, valorile astfel pixelpixel sunt, de asemenea, neschimbate. Luminozitatea i contrastul de imagini RGBsunt schimbate prin modificarea valorilor pixelilor. (Pentru mai multe informaii despretipurile de imagini bitmap, consulta acest link) Comunicat de pres Shift-c pentru a deschide fereastra de B & C mod rapid i uor.n cazul n care acesta este deja deschis, acesta este activat.

Graficul linie la partea de sus a ferestrei, care ne suprapus pe histograma imaginii,arat modul n care valorile pixelilor sunt mapate la 8-bii (0-255) valorile deafiaj.dou numere sub parcel sunt minime i maxime valorile afiate pixel. Acestedou valori definesc gam de afiare, sau "fereastr". SalsaJ afiseaza imagini devalori liniar pixel de cartografiere n gam de afiare pentru a afia valori n intervalul 0-255. Pixeli cu o valoare mai mic dect minimul sunt afiate ca negre i cele cu o valoare mai mare dect suma maxim sunt afiate ca albe. Exist patru slidere. Minim i maxim de control limitele inferioare i superioare degam de afiare. Creteri sau scderi Luminozitate luminozitatea imaginii prinmutarea gam de afiare. Contrast crete sau scade contrastul de diferite limeagam de afiare. restrns gama de display, mai mare contrastul. Facei clic pe Auto, i SalsaJ va optimizeaz n mod automat luminozitatea icontrastul bazate pe o analiz a histogramei imaginii. Creai o selecie, i ntreaga imagine va fi optimizat pe baza unei analize de selecie. Optimizarea se face prin care s permit un procent mic de pixeli din imagine pentru a deveni saturate (afiat canegru sau alb). Fiecare clic suplimentar pe Auto crete numrul de pixeli saturate i, prin urmare suma de optimizare. Facei clic pe Reiniializare pentru a restabili setrile de luminozitate i contrastoriginal. Domeniul de afiare este setat la ntreaga gam valoarea pixel al imaginii.

Facei clic pe Setai pentru a intra n valorile minime i maxime afia gam ntr-o caset de dialog. A setMinAndMax () apel macro este generat n cazul n carecomanda se execut recorder.

Facei clic pe Apply pentru a aplica actuale de cartografiere gama de funcie pentru aafia datele pixelilor. Dac exist o selecie, numai n pixeli de selecie suntmodificate. Aceast opiune n prezent, funcioneaz numai cu imagini de 8 biti si stivei stive cu RGB. Aceasta este doar B & C opiune care modific datele pixelilor dei magini non-RGB. Prag ... Utilizai acest instrument interactiv pentru a seta valorile inferioare i superioarepragului, segmentarea imaginea n caracteristicile de interes i de fond. Pixeli culuminozitate valori mai mare sau egal cu pragul inferior i mai mic sau egal cupragul de sus sunt afiate n rou (de exemplu 1 cu dosarul "Elephant.fits"). DacPeste / Sub este selectat n meniul pop-up, pixelii cu valori de luminozitate mai mare sau egal cu pragul de sus sunt afiate n verde i mai mic sau egal cu pragul inferiorn albastru (de exemplu 3). n cazul n care Useanalyse / Msur (cu "Limita la prag "nanaliza / Set Msurtorile verificate) pentru a msura agregat de caracteristicile selectate. Folosii analiza / analiza Particulele pentru a msura caracteristici individual.Utilizai instrumentul bagheta de a contura o featurepixels singur cu valori luminozitatemai mare sau egal cu pragul de sus i mai mic

sau egal cu pragul inferior suntafiate n verde. Exemplul 1:

example 2 :

example 3 :

Utilizai cursorul de sus pentru a ajusta valoarea pragului minim i unul mai mic pentrua ajusta maxim. inei apsat tasta Alt n jos n timp ce ajustarea minime pentru a muta o fereastr thresholding fix-latime ntreaga gam de valori gri. Butonul Auto seteaz automat nivelurile de prag bazeaz pe o analiz a histogramei aimaginii curente sau de selecie. Aplicai seturi thresholded pixeli la negru i toatecelelalte pixeli la alb. Reset dezactivea z thresholding i actualiza histograma. B & Wtrece la un modul n care caracteristici sunt afiate cu negru i alb, n fundal (de exemplu 2). Facei clic pe Set (nu apare) pentru a introduce noi niveluri prag ntr-ocaset de dialog. Dimensiune ...

Baremele imagine activ sau de selecie pentru o lime i nlime specificate n

pixeli. Verificai Constrngere Aspect Ratio pentru a crea o imagine cu limea specificat iau SalsaJ ajustai nlimea de a menine raportul de aspect original. Verificaiinterpoleaz de a utiliza interpolare biliniar. Lime nou set la 0 pentru a crea o imagine cu nlimea specificat i au SalsaJ ajusta limea de a menine raportul deaspect original. Arat Info ... Deschide o fereastr de text care conine informaii despre imagine activ. Pentruimagini DICOM i se potrivete, de asemenea, afieaz informaii despre fiier antet.Utilizai meniul popup (clic-dreapta n fereastra de informaii) pentru a salva informaiilentr-un fiier text sau copiai-l n clipboard sistem.

our> Conversia Stack la RGB Convertete un 2 sau 3-felie stiv ntr-o imagine RGB. stiv trebuie s fie de 8-bii sau16-

bit tonuri de gri.

RGB Split Separate an RGB image into 3 images in 8-bit or 16-bit grayscale.

RGB Merge.... Merge 3 imagini la o imagine RGB. Imaginile trebuie s fie 8 bii sau 16-bit tonuri de gri. De fapt, este un instrument opus de RGB Split. Deschide o fereastr mic cu meniuri pop-up trei pentru specificarea 3 imagini.

Stacks> This submenu contains commands that work with stacks.

Adauga Slice Introduce o felie goal dup ce felie afiat n prezent. inei apsat tasta ALT pentru a aduga felie nainte felie curent.

tergei Slice terge felie afiat n prezent. Next Slice Afieaz felie care urmeaz felia afiat n prezent. Ca o comand rapid, apsai ">"cheie. Anterioare Slice Afieaz felie care precede felia afiat n prezent. Ca o comand rapid, apsai pe"<" cheie. Set Slice ... Afieaz o felie specificat. Utilizatorul trebuie s introduc un numr felie mai

maresau egal cu unul i mai mic

sau egal cu numrul de felii n stiv. Convert Images to Stack Creates a new stack consisting of all images currently displayed in separate windows. The images must all be the same type and size.

Convert Stack to Images Convertete felii n actualul stiva de ferestre imagine separat. Asigurai-Montage Produce o singur imagine care conine imagini de la o stiva afiate ntr-un formatgril. Acest lucru poate fi util pentru comparaii vizuale de o serie de imagini stocatentr-o stiv. O caset de dialog v permite s specificai nivelul de mrire la careimaginile sunt copiate, i pentru a selecta aspectul grilei rezultate.

Start Animation Anim activ stiv, prin afiarea n mod repetat felii sale (cadre) n ordine. Utilizai Stop Animaie, sau facei clic cu mouse-ul, pentru a opri. Utilizai Animaie caseta de dialog Opiuni pentru a specifica viteza de animaie. Mai mult de o stiv pot fi animate la un moment dat. Ca o comand rapid, apsai "=" cheie pentru a ncepe animaie. Show Animation Stop Animaie Animaie nceteaz de active stivei. Opiuni de animaie ... Utilizai acest dialog pentru a seta viteza de animaie n cadre pe secund sau pentru a permite "oscillating" animation.

Crop Crops the image or stack based on the current rectangular selection.

Duplicate Creates a new window containing a copy of the active image or rectangular selection. Hold the alt key down to skip the dialog box.

Scale... Resizes the image or selection horizontally and/or vertically by scale factors entered into a dialog box. Check Interpolate to scale using bilinear interpolation. Use integer scale factors (2, 3, 5, etc.) for the best looking results, particularly with graphics and text. With scale factors less then 1.0, smoothing the source image prior to scaling may produce better looking results.

Lookup Tables> This submenu contains a selection of colour lookup tables that can be applied to grayscale images to produce false-colour images. More than 100 additional lookup tables are available at rsb.info.nih.gov/ij/download/luts/. For example :

init "LUT Green" "LUT Spectrum"

"LUT Blue" Afieaz un teren de imagine activ de tabel de cutare. tabel de cutare, sau tabelul de culori, descrie culoarea care este afiat pentru fiecare dintre cei 256 de valori posibile pixel. Pentru imagini de 16 bii i

32, intervalul de valori afiate pixel este mapat la 0-255. Reinei c imaginile color RGB nu

utilizeaz un tabel de cutare. Inverseaz curent tabel de cutare. Pentru 8-bii imagini, valoarea (v) din fiecare intrare n tabel se nlocuiete cu 255-v. Cu LUTs inversat, pixeli cu o valoare de zero sunt de culoare alb i pixeli, cu o valoare de 255 sunt negre. Spre deosebire de Editare / comanda Invert, valorile pixeli nu sunt modificate, doar modul n care imaginea este afiat pe ecran.

Meniul Operatii

Operations Menu Image Calculator Single Image Operator Rotate Translation Calculator imagine ... Efectueaz operaiuni aritmetice i logice ntre dou imagini selectate din meniurilepopup. Image1 sau ambele Image1 i Image2 poate fi stive. Dac ambele sunt stive,ele trebuie s aib acelai numr de felii. Image1 Image2 i trebuie s fie acelai tip de date, dar nu

trebuie s fie de aceeai dimensiune. Putei selecta una din cele 8 operatori din Operation: meniu pop-up. Verificai Creai o nou fereastr i o nou imagine sau stiva vor fi create s dein rezultat. n caz contrar, rezultatul operaiei nlocuiete unora sau a tuturor Image1. Cu 32bit (float)imagini, pixeli care rezult din divizare prin zero sunt setate la valoarea cea mai mareposibil (3.4e38). Aceast valoare poate fi redefinit n Edit / Options / Diverse / mpriide v aloare zero. AND img1= img1 AND img2 OR img1 = img1 OR img2 XOR img1 = img1 XOR img2 Min img1 = min(img1,img2) Max img1 = max(img1,img2) Average img1 = (img1+img2)/2 Difference img1 = |img1-img2| Copy img1 = img2 Some examples with two images:

result with "AND":

result with "OR":

result with "XOR":

result with "Difference":

Operatorii singur imagine> Comenzile din acest submeniu se adauga (scdere, nmulire, etc), o constant pentrufiecare pixel din imaginea activ sau de selecie. n cazul n care rezultatul revarsvaloarea / underflows intervalul legal de tipul de date al imaginii, valoarea este resetatla maxim / valoarea minim. Cu stive, seleciile sunt ignorate i funcionareaspecificate s e face pe toate feliile din stiv. Adugai ... Adaug o constant a imaginii. Cu 8-bii imagini, rezultate mai mari dect 255 suntstabilite la 255. Cu imagini 16-bit semnat, rezultate mai mari

dect 65535 suntstabilite la 65.535. Scdere ... Scade o constant din imagine. Cu 8-bii i imagini 16-bit, rezultate mai puin de 0sunt setate la 0. Multiply ... Multiplic imaginea de constanta specificat real. Cu 8-bii imagini, rezultate mai mari dect 255 sunt stabilite la 255. Cu imagini 16-bit semnat, rezultate mai mari dect65535 sunt stabilite la 65.535. Divide ... mparte imaginea de constanta specificat real. ncercrile de a diviza de zero vor fiignorate. I ... Are un nivel de bit i a imaginii i specificate binar constant. Sau ... Are un SAU la nivel de bit a imaginii i constant specificate binar. XOR ... Are un XOR pe bii a imaginii i specificate binar constant. Min ... Pixeli din imagine, cu o valoare mai mic dect cea specificat constant se nlocuiesc cu constanta. Max ... Pixeli din imagine, cu o valoare mai mare dect cea specificat constant se nlocuiesc cu constanta. Gamma ... Aplic funcia f (p) = (p/255) gamma * ^ 255 la fiecare pixel (p) n imagine sau de selecie, n cazul n care <0.1 = gamma <= 5.0. Pentru imagini RGB, aceast funcie seaplic pentru toate canalele de culoare trei. Pentru imagini de 16 bii, min imaginea iMax sunt folosite pentru scalarea n loc de 255. Jurnal ... Pentru 8-bii imagini, se aplic funcia f (p) = log (p) 255/log * (255) pentru fiecare pixel(p) n imagine sau de selecie. Pentru imagini RGB, aceast funcie se aplic pentru toate canalele de culoare trei. Pentru imagini de 16 bii, min imaginea i Max suntfolosite pentru scalarea n loc de 255. Pentru imagini float, nu scalarea se face. Pentrua calcula log10 a imaginii, nmulii rezultatul acestei operaiuni de 0.4343 (1/log (10). Reciproc

Genereaz reciproc a imaginii active sau de selecie. Funcioneaz numai cu imaginifloat pe 32 de bii.

Rotire> Acest submeniu conine comenzi care se rotesc imagine activ sau stiva. Aici original imagine:

Flip Vertical Turns the image or selection upside down.

Flip Horizontal Replaces the image or selection with a mirror image of the original.

Rotate 90 Degrees Right Rotates the entire image or stack clockwise 90 degrees.

Rotate 90 Degrees Left Rotates the entire image or stack counter-clockwise 90 degrees.

Arbitrar ... Utilizai acest dialog pentru a roti imaginea active sau sensul acelor de ceasornic de selecie anumit numr de grade. Verificai interpoleaz de a

utiliza interpolarebiliniar.

Translation> Translate the active image or stack.The values of translation on X and Y are specified in the popup menus.

Meniul Analiza

Msur Bazate pe tipul de selecie, calculeaz i afieaz oricare zona statistici, linia delungimi i unghiuri. Statisticile Zon sunt calculate n cazul n care nu exist nici oselecie sau dac o subregiune a imaginii a fost selected using one of the four tools in the tool bar. Calculeaz lungimea liniei i unghiul n cazul n care o selecie linie a fost creat folosind una dintre cele trei instrumente de selecie linie . Examples :

Pentru a exporta msurtorile ca un fiier text delimitat de tabulatori, selectai File /Save As / Msurtorile din bara de meniu SalsaJ sau File / Save As din "Rezultate"fereastra bara de meniu. Copie msurtorile n clipboard prin selectarea Edit / CopyToate de la "rezultate" bara de meniu fereastr. Avei posibilitatea s salvai, de asemenea, msurtori prin clickdreapta n fereastra Rezultate i selectnd Save Assau copia toate din meniul pop-up. Limea coloanelor n "Rezultatele" Fereastra poate fi reglat prin clic pe i trgndlinii verticale care separa titlurile de coloan. Clar Rezultate terge tabelul de rezultate i reseteaz contorul de msurare. Fotometrie Fotometrie este determinarea fluxului de lumina emis de o stea. Se calculeaz princorectarea valorilor integrat al pixeli cu valoarea de fundal cerul. Aceast valoarepoate fi legate de selectarea intensitatea stea aa cum se arat. Facei clic o datpentru a selecta o subregiune a imaginii n cazul n

care fotometrie va fi aplicat. Exemplu:

Clar Fotometrie Rezultate terge tabelul de rezultate i revine contra msurare. Fotometrie Setri

Set Scala ... Utilizai acest dialog pentru a defini scara spaial a imaginii active astfel nctrezultatele msurtorilor pot fi prezentate n uniti calibrate, cum ar fi milimetri. nainte de a utiliza aceast comand, utilizai instrumentul de selecie linie dreapt pentru a face o selecie linie care corespunde la distan cunoscut. Apoi, aduce Set de dialogScalare, introducei distana cunoscute i unitatea de msur, apoi facei clic pe

OK.SalsaJ vor fi completate automat n domeniul Distan n pixeli pe lungimea selectarea

liniei. Set Distana n pixeli la zero pentru a reveni la msurtori pixel. Setarea Lime / nlime Raportul la o valoare, altele

dect 1.0 permite suport pentrudiferite scale orizontale i verticale spaiale, de exemplu, 100 pix eli / cm orizontal i 95pixeli / cm vertical. Pentru a seta raportul de aspect al pixelilor, msura limea inlimea (n pixeli) a unui obiect digitizat cu un raport de cunoscut aspect 1:1. Introducei limea msurat (n pixeli) n Distana n pixeli. Introducei limea cunoscutn Cunoscut distan. Apoi se calculeaz raportul de aspect prin mprirea limea denlimea i introduceil n Pixel Aspect Ratio. Cnd Global este verificat, scara definite n acest dialog este folosit pentru toateimaginile n loc de doar imaginea activ. Dou exemple de modul de utilizare Set comanda dimensiuni sunt disponibile:

Area Measurements (PDF) and DNA Contour Length Measurement. Histogram Calculeaz i afieaz o histogram a distribuiei valorilor de gri n imagine activ saude selecie. axa x reprezint valorile posibile gri i axa y arat numrul de pixeli gsitepentru fiecare valoare gri. numrul total de pixeli este de asemenea calculat i afiat,precum i valoarea medie gri, modal, minim i maximUtilizai butoan ele Salvare sau Copiere pentru a salva datele histogramei. Click peConectare pentru a afia o versiune log-scalate a histogramei. Numrul din dreaptaValoare:, care se schimb pe msur ce deplasai cursorul, este egal cu valoareacorespunztoare n tonuri de gri la poziia curent a cursorului axa x i Count: estenumrul de pixeli care au aceast valoare. Cu imagini RGB, histograma este calculat prin conversia fiecare pixel n tonuri de gricu

ajutorul formulei gri = 0.299red 0.587 0.114 verde albastru sau gri formula = (rou +verde + albastru) / 3. Cu imagini de 16 bii, intervalul de valori ntre gri i valorile MinMax este mprit n 256 containere.

Plot Profil Afieaz un grafic bi-dimensional a intensitilor de pixeli de-a lungul unei linii n cadrul imaginii. Axa x reprezint distana de-a lungul liniei i axa y este intensitatea depixel.

Suprafa teren Afieaz un grafic tridimensional a intensitilor de pixeli ntr-o imagine color n tonuri de gri sau pseudo. Creeaz un teanc de parcele n cazul n care sursa este o stiv.Unele parcele poate fi mbuntit prin

ajustarea contrastul imaginii surs sau ouniformizare. Atunci cnd plotting o stiv, nchidere complot stiva fereastra se va abort the plotting process.

Schimbarea Numrul de probe pentru a ajusta numrul de profile utilizate pentru a genera intriga. Verificai Draw carcase de a avea contur fiecare profil trase n negru. Verificai Shade pentru a genera un complot umbrit. Terenul va fi color, dac imagineasurs folosete o culoare UTT. Verificai Draw Axa de a avea treiaxe trase i etichetate. Context dac Sursa este mai uoare esteverificat, zone mai uoare n imaginea surs reprezint altitudini mici (vai), in timp ce zonele mai ntunecate din imaginea sursreprezint creteri mai mari (valori de vrf). Dac CompletaiTeren de fundal cu Black este verificat, Terenul este ntocmit cu unfundal negru.

Spectrului de frecvene radio ... Afieaz o spectrul de frecvene radio ca un grafic bidimensional.Fiierul deschis folosind caseta de dialog trebuie s fie n formatFITS. Axa x reprezint viteza de la deschidere, dar poate fischimbat n canal, frecvena sau lungimea de und folosindbutonul SetScale.

Fit a baseline (a polynomial of order 1 to 4) to the line-free parts of spectrum using the Baseline button.

Use the following dialog to specify two intervals and the order of the baseline. Check display zero line in blue to display the x- axis in blue.

Subtract the baseline using Subtract Baseline button.

Fit a Gaussian profile to a spectral line using the Gaussian fit button.

Utilizai acest dialog pentru a specifica intervalul de potrivire.Valorile de amplitudine, centru i limea pot fi specificate pentrunceperea iteraie. Rez ultatele numerice sunt afiate n fereastragaussian potrivi rezultate; valorile pot fi copiate i lipite ntr-ofoaie de calcul.

Optical Spectrum... Deschide un spectru optic ca o imagine pe 32 de bii, a spectrului de frecvene trebuie s fie fiier text. Formatul trebuie s conindoar dou coloane, prima linie a fiecrei coloane trebuie s fieunitar a fiecruia dintre ele. Limea imaginii este determinatprin scanarea dosar i de numrare a numrului de linii, nlimease stabilete la 100 pixeli.

Using a horizontal plot profile, the x-axis represents the values of the first column and the y-axis the values of the second column.

Instrumente Acest submeniu asigur accesul la diverse plugin-uri analiza imaginii. Salvai coordonate xy ... Scrie un fiier text coordonatele XY i valoarea pixelului de toi pixelii nonfundal n imagine activ. Pentru imagini n tonuri de gri,scrie trei valori pe linie (x, y, i valoarea), separate prin spatii.Pentru imagini RGB, scrie cinci valori pe linie (x, y, rou, verde ialbastru). Montarea curba ... Construct i afia ntr-o fereastr nou curba interpola de punctecu un fiier text care conine aceste coordonate XY. Exemple:

ROI Manager The ROI (Region of Interest) Manager is a tool for working with multiple area selections.

Facei clic pe Adugare pentru a aduga curent ROI la lista.Facei clic pe tergere pentru a terge ROIs selectat din lista.Facei clic pe Open pentru a deschide un fiier ROI i adugai-lla lista. Toate Facei clic pe Open pentru a deschide toatefiierele ROI ntr-un folder i adugai-le la lista. Facei clic peSalvare pentru a salva ROIs selectat ca fiiere. Facei clic peMsur pentru msur ROIs selectat. Cu o stiva, o caset de dialog permite utilizatorului s

aleag ntre msurare toateimaginile n stiv sau numai felie curent. Facei clic pe Drawpentru a desena conturul ROIs selectat folosind culoarea prim-plan curent i limea de linie. Facei clic pe Umplere pentru a umple ROIs selectat cu culoarea prim-plan curent. Facei clic nimagine / fereastra de culori pentru a seta culoarea primplan.Folosii Editare / Opiuni / Line Width a seta limea liniei.

Scale Bar... Display a scale bar on the image. This bar show the width in pixels.

Calibration Bar Creates an RGB copy of the current image and displays a labeled calibration bar on it.

Modificare locaie pentru a muta bara de calibrare. Dac existo selecie, barul este iniial ntocmit la selecie. Schimbaculoarea umplere pentru a regla culoarea bara de fundal. Labelschimba culoarea pentru a regla culoarea textului. Schimbareanumr de etichete pentru a ajusta numrul total al valorilorafiate. Schimbarea zecimale pentru a ajusta numrul dezecimale prezente n etichete. Schimb dimensiunea fontuluipentru a ajusta dimensiunea etichete "font. Schimbarea factorul de zoom la scara ntregii bara de calibrare. Dac Bold Text esteverificat, etichetele sunt trase aldine.

Calibra ... Utilizai aceast caset de dialog pentru a calibra o imagine laun set de standarde de densitate, de standardele de exempluizotopul radioactiv sau o calibrat optic comprimat pas densitate.nainte de a utiliza aceast comand, analiza utilizarea /rezultate clare pentru a reseta contorul de msurare i de a folosi unul dintre instrumentele de selecie i analiza / Msurpentru a nregistra valoarea medie a fiecrui gri a standardelor.Exist un exemplu care arat modul de a calibra la un pascomprimat optic de densitate. Cnd ai terminat de efectuarea msurtorilor, analiza selectai /Calibrai pentru a afia caseta de dialog Calibrare. Pentru acalibra imaginea, introducei valorile standard cunoscut n coloana din dreapta, selectai o metod de montare curb dinmeniul pop-up, introducei unitatea de msur, i facei clic pe OK. SalsaJ va afia apoi funcia de calibrare. n cazul n care funcia de calibrare nu este satisfctoare, aducecaseta de dialog Calibrate din nou i selectai o metod curbdiferit montare.

Rodbard este de patru parametru general se potrivi funcieicurba propus de David Rodbard la NIH. Forma ecuatiei este: y = d + (a - d) / (1 + (x / c) ^ b) Selectarea necalibrat DO din meniul pop-up cauzele SalsaJpentru a converti valorile gri a densitii optice necalibrat valoriutiliznd funcia Necalibrat OD = log10 (255 / PixelValue) Nu avei nevoie pentru a msura standardele DO sau introduceivalori cunoscute DO pentru a activa aceast caracteristic.

Meniul Plugin-uri Introducere Plugin-uri i macrocomenzile sunt module de ncrcare cod care extind capabilitile de SalsaJ. Plugin-uri sunt scrise n limbajul de programare Java i compilate. Fiiere de clas.Macrocomenzi, scris n limba lui SalsaJ macro-Java cum ar fi, sunt stocate n fiiere. Txt. Plugin-uri alerga mai repede i sunt mai flexibile, dar macro-uri sunt mai uor s scrie i depanare.Plugin-uri i macro-uri n folderul plugin-uri, cu o subliniere n numele lor, sunt enumerate n partea de jos din acest meniu.Plugin-uri i macro-uri n subfoldere plugin-uri sunt enumerate n submeniuri. Utilizarea comenzilor rapide / Creare comand rapid pentru a asocia o comand rapid de la tastatur un plugin sau un macro. Utilizai comanda Record pentru a nregistra o serie de comenzi i s le transforme ntr-un macro. Utilizai comanda New pentru a crea o macrocomand nou sau plug-in i Editare pentru a efectua modificri la unul deja existent. Mai mult de 100 de plugin-uri sunt disponibile pe site-ul Web ImageJ precum i mai mult de 80 de macro-uri. Un tutorial pentru scriitori plugin este disponibil la http://mtd.fh-hagenberg.at/depot/imaging/imagej/.Informaii despre macro-uri sunt disponibile pe site-ul ImageJ Web. Plugin-uri interne Cele mai multe comenzi n SalsaJ sunt puse n aplicare ca plugin-uri, dar aceste plugin-uri interne sunt situate n fiierul salsaj.jar, nu n dosarul plugin-uri. salsaj.jar conine, de asemenea, proprieti de fiier (IJ_Props.txt) care SalsaJ utilizeaz pentru a instala plugin-uri interne n meniuri. Un fiier JAR (Java Archive) este formatat la fel ca un fiier ZIP, astfel nct s putei utiliza un utilitar ZIP s se uite la coninutul de salsaj.jar. Putei converti intern plug-in pentru un utilizator plugin prin copierea surs n folderul plugin-uri, adugnd o linie de subliniere la numele fiierului i numele clasei, i schimbarea declaraia pachet pentru o declaraie de import. De exemplu, pentru a schimba RoiManager (analiza /

Tools / Manager ROI) pentru un utilizator de plugin: 1. Copie ij / plugin / cadru / RoiManager.java la folderul plugin-uri. 2. Schimba numele fiierului la Roi_Manager.java. 3. Open Roi_Manager.java folosind plugin-uri / Editare i schimba toate instantele (4) din "RoiManager" la "Roi_Manager". 4. Schimba prima linie de la "ij.plugin.frame pachet;" la "ij.plugin.frame import .*;". 5. Pornete nou plugin utiliznd editorul lui File / compila si rula comanda. Nu va fi un nou Roi comand Manager din meniul Plugin-uri urmtoarea dat cnd repornii SalsaJJ. Locaia Schimbarea Directory plugin-uri "Plugins.dir" proprietate specifica locatia de mam de director plugin-uri. Aceast proprietate poate fi setat fie din linia de comanda sau din cadrul unui program Java care ncepe SalsaJ.De exemplu, dac rulai SalsaJ cu comanda java-Dplugins.dir = / Utilizatori / Wayne-cp ij.ImageJ ij.jar se va uita pentru dosarul n plugin-uri / Utilizatori / Wayne / directorul. Aceast proprietate poate fi, de asemenea, stabilite ntr-un program care lanseaz SalsaJ: System.getProperties () setProperty ("plugins.dir", "/ utilizatori / Wayne").; noi ImageJ (null); Macrocomenzi> Acest submeniu conine comenzi pentru instalarea, rularea i nregistrarea macro-uri, precum i orice comenzi macro adugat de plugin-uri / Macro / Install. Macrocomenzile coninute ntr-un fiier numit "StartupMacros.txt", n dosarul macrocomenzile, sunt adugate automat la acest submeniu SalsaJ atunci cnd pornete. Instalai ... Adaug una sau mai multe macro-uri coninute ntr-un fiier la partea de jos a acestui submeniu. Pentru a instala un set de macro-uri, i n acelai timp, vizualizai codul sursa acestora, deschidei fiierul macro cu File / Open i utilizarea editorului Macrocomenzi / Install comanda Macros. Macrocomenzi n fiierul ImageJ / macro / StartupMacros.txt sunt instalate automat cnd SalsaJ pornete. Run ... Sarcini i execut o macrocomand fr ao deschide n editor SalsaJ. Pentru a executa o macrocomand, i n acelai timp, opinia codul su surs, deschidei-l cu File / Open i utilizarea editorului File / Run comanda Macro. Record ... Deschide recorder comanda SalsaJ. Pentru a crea o macrocomand, deschidei recorder,

utilizai una sau mai multe comenzi SalsaJ, apoi facei clic pe "Create". Cnd nregistratorul este deschis, fiecare comand de meniu cnd utilizai genereaz o executa macro () funcie de apel. A alerga (), funcia are una sau dou argumente ir. Primul este numele comenzii. Argument opional al doilea conine caseta de dialog parametri. Creai un oval dreptunghiular, sau selectarea liniei i recorder va genera un makeRectangle (), makeOval () sau makeLine () funcia de apel. Facei clic pe "Auto" sau "Set" n imagine / Reglare / Preliminar de fereastr pentru a genera un setThresold () de apel, i pe "Reset" pentru a genera un resetThresold () de apel. Selectai o imagine din meniul Window pentru a genera un selectWindow () de apel. Facei clic n imagine / color / color Alegere fereastr pentru a genera setForegroundcolour () i setBackgroundcolour () apeluri. Comenzi rapide> Acest submeniu conine comenzi pentru crearea de comenzi rapide de la tastatur i pentru instalarea i eliminarea plugin-uri. Creare comand rapid ... Atribuie o scurttur de taste la o comand de meniu SalsaJ i liste de comenzi rapide n submeniu Comenzi rapide.

Selectai comanda din meniul pop-up i introducei comanda rapid n cmpul de text. O comand rapid poate fi o liter micsau majuscul sau "F1" prin "F12". Folosii Pluginuri / Utilities /Comenzi rapide Lista pentru a obine o list de comenzi rapidecare sunt deja utilizate. Instalarea Plugin ... Instaleaz un plugin ntr-un submeniu specificate de utilizator.Pluginuri cu o showAbout () metod sunt, de asemenea, adaug automat la Ajutor / Despre Plugins submeniu.

Utilizai meniul pop-up pentru a selecta prima i a doua plugin-ulpentru a selecta submeniul este de a instalat inch comandtrebuie s fie diferite de la orice comand existente SalsaJ.Shortcut (opional) trebuie s fie o singur liter sau "F1" prin"F12". Argument (opional) este ir care va trecut la plugin-ul demetoda de a alerga. Eliminare ... Elimin comenzi adugate la submeniul Comenzi rapide de pe Creare comenzi rapide. Asemenea, se elimin comenzi deadugat Instalarea Plugin si indeparteaza pluginuri instalate nmeniul Plugin-uri. Meniurile nu sunt actualizate pn

la SalsaJeste repornit. Utilites> Panou de control ... Aceast comand deschide o fereastr care conine comenziSalsaJ ntr-o structur de arbore ierarhic. Facei clic pe un nodfrunz de a lansa comanda corespunztoare SalsaJ (sau plugin).Dubluclic pe un nod ramur (folder) pentru a extinde sau a restrnge-l. Facei clic i tragei pe un nod ramur (folder) pentru a afia urmaii si ntro separat (copil) fereastr. ntr-o fereastrcopil, facei clic pe "Show Parent" pentru a redeschide fereastraprinte. Panoul de control a fost contribuit la proiect imageJ deCezar M. Tigaret.

Monitor de memorie ... Afieaz un grafic continuu actualizata de utilizare a memorieiSalsaJ lui, care poate fi util pentru detectarea scurgerilor de memorie. n mod ideal, ar trebui s fie n msur s deschid unmai multe imagini, s le proceseze, nchideile, i cantitatea dememorie utilizat va fi la fel ca atunci cnd ai nceput. Fcnd clicpe bara de stare SalsaJ lui, care forele colector rula Java de gunoi, poate ajuta revendica memorie neutilizate. Porniimonitorul de memorie cu tasta ALT n jos s-l folosii o fereastra640x480 care simuleaz modul n care un cadru Grabber pluginar

funciona. Captur de ecran Copiaz ecranul la o imagine RGB i afieaz c imaginea-o fereastr nou. Apsnd de control-shift-g va captura de ecran n timp ce o caseta de dialog modal este activ n cazul n care se bazeaz pe dialog clasa GenericDialog SalsaJ lui. Noi ... Deschide o fereastr care conine un text nou prototip (ca sursa de cod Java) pentru una din cele trei tipuri de plugin-uri susinute de SalsaJ. PlugIn: Deschide, captura sau genereaza imagini.Implementeaza interfata PlugIn. Prototipul afieaz "Hello world!" n fereastra SalsaJ. Un alt exemplu este Pasul Maker plugin-ul de la http://rsb.info.nih.gov/ij/plugins/steps.html.

PlugInFilter: Procese imagine activ. Implementeaza interfata PlugInFilter. Prototipul inverseaz imaginea active de dou ori.Un alt exemplu este Inverter Image plugin-ul de la http://rsb.info.nih.gov/ij/plugins/inverter.html. PlugInFrame: Afieaz o fereastr care conine nonimage controale, cum ar fi butoane si slidere. Extinde clasa PlugInFrame. Prototipul se deschide o fereastr care conine o zon de text. Un alt exemplu este Demo IP plugin-ul de la http://rsb.info.nih.gov/ij/plugins/ip-demo.html. Fereastra de text creat de aceast comand are dou meniuri: File i Edit. Utilizarea compila si rula din meniul File pentru a compila i rula plugin-ul. Meniul Editare nu conine Cut / Copy / Paste, dar comenzi rapide de la tastatur pentru aceste funcii pot fi utilizate. Reinei c numele care le alegei pentru plugin-ul trebuie s includ cel puin o subliniere. Editare ... Deschide o fereastr de text care v permite s editai, compila si rula plugin-uri. Ca de Compilare i comanda Run, se impune ca SalsaJ fi difuzate pe un Java Virtual Machine, care include compilatorul javac. Compila si rula ... Compileaz i ruleaz un plugin. Cere ca SalsaJ fi difuzate pe un Java Virtual Machine, care include compilatorul javac. Javac este inclus cu versiunile Windows si Linux de SalsaJ care vin la pachet cu un runtime Java. De asemenea, este inclus cu Mac OS X Java. Utilizatorii de Sun's Java 2 SDK (Software Development Kit) pentru Windows, Linux si Solaris trebuie s adauge tools.jar la linia de comand care ruleaza SalsaJ. Aici este o linie de comand Windows exemplu pentru rularea SalsaJ folosind Java 2 SDK (aka JDK): java-mx100m-CP salsaj.jar; C: \ ij.ImageJ jdk1.4 \ lib \ tools.jar Aceasta presupune Java 2 SDK este instalat n C: \ jdk1.4. Pe un sistem Unix, comanda ar arata ceva de genul: java-mx100m-CP salsaj.jar: \ usr \ local ij.ImageJ \ jdk1.4 \ lib \ tools.jar The-MX100 opiuni precizeaz c SalsaJ pot utiliza pn la 100 MB de RAM. Pentru a evita memorie virtual btaie, aceast valoare nu ar trebui s fie setat la mai mult de 2 / 3 din RAM disponibile (de exemplu-mx170m pe o main de 256MB). Pe Windows, avei posibilitatea s creai o comand rapid dublu-clickable care utilizeaz Java 2 pentru a rula SalsaJ: 1. Click-dreapta pe desktop i selectai Scurttur New-> din meniu 2. Introducei javaw-mx100m-CP salsaj.jar; C: \ ij.ImageJ jdk1.4 \ lib \ tools.jar ca "linia de comand"; facei clic pe "Next"

3. Introducei un nume pentru comanda rapid (de exemplu, "SalsaJ"); facei clic pe "Finish" 4. Facei clic dreapta pe comanda rapid nou creat i selectai Proprieti din meniul 5. Facei clic pe fila Comand rapid 6. Introducei calea ctre folderul SalsaJ (n mod normal C: \ SalsaJ) n "Start n"; facei clic pe "OK" "Javaw" este o variant de comanda java care ruleaza aplicatii Java, fr o fereastr DOS.

MENIUL Fereastra Acest meniu conine dou comenzi, plus o list de ferestre deschise SalsaJ. Imaginea n prezent activ nu vor avea un marcaj de verificare n dreptul numelui su. Pentru a activa o fereastr, trage n jos acest meniu i selectai fereastra de nume. SalsaJ [enter] Apsai tasta Enter pentru a aduce fereastra SalsaJ n fa. Pune spatele [tab] Afieaz imaginea urmtoare deschis. apsai n mod repetat tasta tabulator pentru a parcurge toate imaginile deschise. Home SalsaJ software Tools Manual

File/New... File/Open... File/Save File/Save As/Fits... File/Print... Edit/Clear Edit/Undo Image/Adjust/Brightness/Contrast... Analyse/Photometry

Analyse/Photometry Settings Analyse/Clear Photometry Results Help/Online Docs...

Instrumente de aria de selectie Utilizai aceste instrumente pentru a crea selectii domeniu carevor fi operate pe separat de restul imaginii. Coninutul de oselecie zon pot fi copiate n clipboard interne, eliminat (la alb),umplut cu culoarea desenul curent, a subliniat (folosind Edit /Draw), filtrate, sau msurat. Utilizai tasta Backspace ca o comand rapid pentru Edit / Clear. Folosii Imagine / culoripentru a seta culoarea de desen. Dublu click pe orice instrument de linie pentru a modifica limea liniei utilizate de Edit / Draw.Utilizai tastele sgeat pentru a "nudge" o selectie un pixel la un moment dat n orice direcie. Rectangle La crearea de selecie, tragei cu trecerea cheie n jos pentru aconstrnge la un ptrat. Folosii mic se "descurca" n colul din dreapta jos pentru a redimensiona. Utilizai tastele sgeat cutasta ALT a avut loc n jos pentru a modifica limea sau nlimeaun pixel la un moment dat. Ca o selecie este creat sauredimensionate, amplasarea, limea i nlimea sunt afiate nbara de stare. Oval Creeaz o selecie eliptic. Apsat tasta ALT n jos forele de selecie s fie circular. Utilizai tastele sgeat cu tasta ALTapsat pentru a schimba limea sau nlimea. Ca de selecieeste creat sau redimensionate, limea i nlimea sunt afiate nbara de stare. Polygon Creeaz neregulate selecii form definit printr-o serie desegmente de linie. Pentru a crea selecie, facei clic pe n mod repetat cu mouse-ul pentru a crea segmente de linie. Cnd ai terminat, facei clic n caseta de mici, de la punctul de plecare(sau dubluclick), i SalsaJ atrage automat ultimul segment. Freehand The freehand tool lets you create irregularly shaped selections by dragging with the mouse. Isovaluated Selection Tool Creeaz o selecie prin urmrirea obiecte de culoare uniformsau obiecte thresholded. Pentru

a urmri un obiect, fie facei clicn interiorul aproape de marginea din dreapta, n afara sau la stnga a obiectului. Pentru a vizualiza ceea ce se ntmpl, imaginati-va o broasca testoasa care ncepe deplasarea spre dreapta de unde facei clic n cutarea pentru o margine. Dup cese gsete n marginea, l urmeaz pn la revenirea la punctul de plecare. Reinei c instrumentul bagheta nu poate urmri fiabilunele obiecte, mai ales unul linii de pixel, cu excepia cazului n care sunt thresholded (evideniate n rou), folosind Image /Reglare / Prag instrument.

Line Selection Tools Utilizai aceste instrumente pentru a crea linia de selecii. Folosiianaliza / Msur pentru a calcula durata de o selecie linie.Folosii Editare / Draw pentru a desena linia permanent pe imagine. Modificarea culorii desen fcnd clic n imagine /fereastra de culori. Dublu click pe orice instrument de linie pentru a specifica limea liniei. Utilizai tastele sgeat pentru a"nudge" o selecie linie de un pixel la un moment dat. Straight Line Utilizai acest instrument pentru a crea o selecie linie dreapt.Apsat tasta ALT forele jos linia care urmeaz s fie orizontalesau verticale. Pentru a calibra spaial o imagine, a crea o selecielinie corespunde la o distan cunoscut (de exemplu, 10mm),apoi introducei aceast distan n analiza / caseta de dialog Setare Scale. Plugins / Egal Arrow va ntocmi o sgeat bazat pe o selecie linie dreapt. Segmented Line Create a segmented line selection by repeatedly clicking with the mouse. Each click will define a new line segment. Double-click when finished. Freehand Line Select this tool and drag with the mouse to create a freehand line selection. Angle Creai o selecie unghi, fcnd clic de trei ori cu mouse-ul. Primultwocreate prima linie dreapt a unghiului i ultimul creeaz de-al doilea. Valoarea unghiului este afiat n timpul de construcie nbara de stare. Point Selection Tool Utilizai acest instrument pentru a crea un punct de selecie ipentru a afia coordonatele i valoarea ntr-o fereastr nou.Facei clic o dat pentru a

crea o selecie singur punct. Clicpentru a aduga mai multe puncte. Alt-clic pe un punct sltergei. Dublu-clic pe pictograma instrumentului punctul de aafia urmtoarele caseta de dialog de configurare.

Text Tool Utilizai acest instrument pentru a aduga text la imagini. Se creeaz o selectie dreptunghiulara in care conin una sau mai multe linii de text. Utilizai tastatura pentru a aduga caractere latextul i tasta Backspace pentru a terge caractere. FolosiiEditare / Draw pentru a desena permanent textul de pe imagine.Folosii Edit / Options / Fonts, sau dublu-clic pe instrumentul text,pentru a specifica font, dimensiune i stil. Magnifying Glass Click pe imagine cu acest instrument pentru a mri inch Alt-clic(sau clic-dreapta) pentru a micora. mrire curent este afiat nbara de titlu a imaginii. Dublu-clic pe pictograma lup de a revenila 100% (1:1) mrire. Exist 20 de nivele posibile mrire: 3.1,4.2, 6.3, 8.3, 12.5, 16.7, 25, 33.3, 50, 75, 100, 200, 300, 400,600, 800 , 1200, 1600, 2400 si 3200 la sut. Atunci cnd zoom in,apsai tasta Shift pentru a preveni fereastra de a fi extins.

Scrolling Tool Allows you to scroll through an image that is larger than its window. When using other tools (except the text tool), you can temporarily switch to this tool by holding down the space bar. Colour Picker Sets the foreground drawing colour by "picking up" colours from images. The colour of this tool's icon changes to match the drawing colour. colours can "picked up" from the Image/colours window using any tool. Alt-click in the Image/colours window to change the background colour. Double-click on this tool to display the Image/colours window. he icon for this tool is drawn in the current foreground colour and the frame around it is drawn in the current background colour.

Virtual Observatories SalsaJ 2 offers a new possibility: the use of amazing astronomical images, in colour. These images have been taken by the astronomers of the European Southern Observatory ESO, and can be used freely. Here is a list of the available images with some explanations.

Alma telescope at Chajnantor: Artist rendering of the Atacama Large Millimeter/submillimeter Array (ALMA), in an extended configuration. Centaurus A black Hole: This galaxy is a most interesting object for the present attempts to understand active galaxies. It is being investigated by means of observations in all spectral regions, from radio via infrared and optical wavelengths to X- and gamma-rays. On images obtained at optical wavelengths, thick dust layers almost completely obscure the galaxy's centre. This structure was first reported by Sir John Herschel in 1847. Until 1949, NGC 5128 was thought to be a strange object in the Milky Way, but it was then identified as a powerful radio galaxy and designated Centaurus A. The core of Centaurus A is the smallest known extragalactic radio source, only 10 light-days across. A jet of high-energy particles from this centre is observed in radio and X-ray images. The core probably contains a supermassive black hole with a mass of about 100 million solar masses. Chandra deep field with many galaxies: observations were made over a period of 40 hours and constitute the deepest image ever taken from the ground in the U-band. The image shows galaxies that are 1 billion times fainter than can be seen by the unaided eye. Christmas Tree NGC2264: This colour image of the region known as NGC 2264 an area of sky that includes the sparkling blue baubles of the Christmas Tree star cluster and the Cone Nebula was created from data taken through four different filters (B, V, R and H-alpha)

with the Wide Field Imager at ESO's La Silla Observatory, 2400 m high in the Atacama Desert of Chile in the foothills of the Andes. The image shows a region of space about 30 light-years across. Crab Nebula M1:This photo shows a three colour composite of the well-known Crab Nebula (also known as Messier 1). It is the remnant of a supernova explosion at a distance of about 6,000 light-years, observed almost 1,000 years ago, in the year 1054. It contains a neutron star near its center that spins 30 times per second around its axis. In this picture, the green light is predominantly produced by hydrogen emission from material ejected by the star that exploded. The blue light is predominantly emitted by very high-energy ("relativistic") electrons that spiral in a large-scale magnetic field (so-called syncrotron emission). It is believed that these electrons are continuously accelerated and ejected by the rapidly spinning neutron star at the centre of the nebula and which is the remnant core of the exploded star. This pulsar has been identified with the lower/right of the two close stars near the geometric center of the nebula, immediately left of the small arc-like feature. Dumbbell Nebula: The Dumbbell Nebula - also known as Messier 27 or NGC 6853 - is a typical planetary nebula and is located in the constellation Vulpecula (The Fox). The distance is rather uncertain, but is believed to be around 1,200 light-years. It was first described by the French astronomer and comet hunter Charles Messier who found it in 1764 and included it as no. 27 in his famous list of extended sky objects [2] .Despite its class, the Dumbbell Nebula has nothing to do with planets. It consists of very rarified gas that has been ejected from the hot central star (well visible on this photo), now in one of the last evolutionary stages. The gas atoms in the nebula are excited (heated) by the intense ultraviolet radiation from this star and emit strongly at specific wavelengths. Eagle Nebula: Messier 16 (M16), also known as the Eagle Nebula, is located in the southern constellation of Serpens (the Snake). The wide-field view of M16 shows that there is much happening in the region. The first impression one gets is of an enormous number of stars. Those which are blue in the infrared image are either members of the young NGC 6611 cluster whose massive stars are concentrated in the upper right (north west) part of the field or foreground stars which happen to lie along the line of sight towards M16.Most of the stars are fainter and more yellow. They are ordinary stars behind M16, along the line of sight through the galactic bulge, and are seen through the molecular clouds out of which NGC 6611 formed. Some very red stars are also seen : these are either very young and embedded in gas and dust clouds, or just brighter stars in the background shining through them. Eta Carinae: This new image of the luminous blue variable Eta Carinae was taken with the NACO near-infrared adaptive optics instrument on ESO's Very Large Telescope, yielding an

incredible amount of detail. The images clearly shows a bipolar structure as well as the jets coming out from the central star. Flame Nebula: This image, the first to be released publicly from VISTA, the worlds largest survey telescope, shows the spectacular star-forming region known as the Flame Nebula, or NGC 2024, in the constellation of Orion (the Hunter) and its surroundings. In views of this evocative object in visible light the core of the nebula is completely hidden behind obscuring dust, but in this VISTA view, taken in infrared light, the cluster of very young stars at the objects heart is revealed. The wide-field VISTA view also includes the glow of the reflection nebula NGC 2023, just below centre, and the ghostly outline of the Horsehead Nebula (Barnard 33) towards the lower right. The bright bluish star towards the right is one of the three bright stars forming the Belt of Orion. Galactic Center: The central parts of our Galaxy, the Milky Way, as observed in the near-infrared with the NACO instrument on ESO's Very Large Telescope. By following the motions of the most central stars over more than 16 years, astronomers were able to determine the mass of the supermassive black hole that lurks there. Helix Nebula: This colour-composite image of the Helix Nebula (NGC 7293) was created from images obtained using the the Wide Field Imager (WFI), an astronomical camera attached to the 2.2-metre Max-Planck Society/ESO telescope at the La Silla observatory in Chile. The blue-green glow in the centre of the Helix comes from oxygen atoms shining under effects of the intense ultraviolet radiation of the 120 000 degree Celsius central star and the hot gas. Further out from the star and beyond the ring of knots, the red colour from hydrogen and nitrogen is more prominent. A careful look at the central part of this object reveals not only the knots, but also many remote galaxies seen right through the thinly spread glowing gas. Horsehead Nebula: A reproduction of a composite colour image of the Horsehead Nebula and its immediate surroundings. Jewel Box cluster NGC4755: The FORS1 instrument on the ESO Very Large Telescope (VLT) at ESOs Paranal Observatory was used to take this exquisitely sharp close up view of the colourful Jewel Box cluster, NGC 4755. Milky Way: This magnificent 360-degree panoramic image, covering the entire southern and northern celestial sphere, reveals the cosmic landscape that surrounds our tiny blue planet. This gorgeous starscape serves as the first of three extremely high-resolution images featured in the GigaGalaxy Zoom project, launched by ESO within the framework of the International Year of Astronomy 2009 (IYA2009). The plane of our Milky Way Galaxy, which we see edge-on from our perspective on Earth, cuts a luminous swath across the image. The projection used in GigaGalaxy Zoom place the viewer in front of our Galaxy with the Galactic Plane running

horizontally through the image almost as if we were looking at the Milky Way from the outside. From this vantage point, the general components of our spiral galaxy come clearly into view, including its disc, marbled with both dark and glowing nebulae, which harbours bright, young stars, as well as the Galaxys central bulge and its satellite galaxies. As filming extended over several months, objects from the Solar System came and went through the star fields, with bright planets such as Venus and Jupiter. New planetary system Gliese 581 Omega Centauri Orion Nebula Pair of Galaxies NGC1532 Pluto artiste view Sombrero Galaxy Spiral Galaxy Messier 83 Spiral Galaxy NGC1232 Spiral Galaxy NGC253 Spiral Galaxy NGC300 Spiral Galaxy NGC4945 Starburst Region NGC3603 Star R Coronae Australis Stellar cluster NGC2467 Stellar Nursery The Moon Trifid Nebula VLT Paranal platform VLT Paranal with laser

Keyboard Shortcuts Command New Open Open Sh ortcut N O Shif Description Creates a new image or stack Opens a TIFF, GIF, JPEG, BMP, DICOM or FITS Opens "Blobs" example image

Samples Close Save Revert Print Undo Cut Copy Paste Clear Select All Select None Restore Selection Fill Draw Invert Adjust Contrast Adjust Threshold Show Info Next Slice Previous Slice

t-B W S R P Z X C V bac kspace A Shif t-A Shif t-E F D Shif t-I Shif t-C Shif t-T I > < Closes the active window Saves active image in Tiff format Revert to saved version of image Print active image Reverses the effect of the last operation Copy image to clipboard and clear selection Copy image to clipboard Paste clipboard selection into active image Erases selection to background color Select entire image Delete selection

Restores ROI Fills selection in foreground color Draw selection Invert image or selection

Adjust brightness and contrast

Adjust threshold levels Displays information about active image Advance to next stack slice Backup up to previous stack slice

Start Animation Duplicate Scale Smooth

= Shif t-D E Shif t-S Shif t-F Shif t-R M

Starts/stops stack animation

Duplicates active image or selection Scale image or selection 3x3 unweighted smoothing

Find Edges Repeat Command Measure

Performs Sobel edge detection

Repeats previous command Displays statistics about active image or selection Displays a histogram of the active window or selection Displays density profile plot of current selection Brings ImageJ window to front Switches to next image window

Histogram Plot Profile ImageJ Put Behind

H K ent er tab

Alt Key Modifications Image/Adjust/Threshold: Adjusting Min also adjusts Max Image/Stacks/Add Slice: Insert before current slice Image/Stacks/Next Slice: Skip nine slices Image/Stacks/Previous Slice: Skip nine slices Image/Duplicate: Don't show dialog Image/Colors: Alt-click to "pick up" background color Process/Equalize: Do classic histogram equalization Process/Subtract Background: Show background image Analyse/Plot Profile: For rectangular selections, generate row average plots Analyse/Tools/Analyse Line Graph: Show intermediate image Plugins/Utilities/ImageJ Properties: List all Java properties

Plugins/Utilities/Monitor Memory: Simulate 640x480 frame grabber Any User Plugin: Load using new class loader Space Bar Modifications Any Tool: Temporarily switch to the "hand" (scrolling) tool Moving through a stack: Automatically adjust min/max display values Arrow Keys Use the arrow keys to move selection outlines one pixel at a time. Resize rectangular and oval selections by holding down the the alt (option) and while using the arrow keys.