Metabolismul nucleotidelor pirimidinice

In structura acizilor nucleici avem baze purinice si pirimidinice.

Sinteza lor se face pe baza nucleului purinic, care se sintetizeaza in cursul sintezei bazelor
nucleotidice. Sinteza porneste de la un nucleu pirimidinic preexistent, care pe parcursul
sintezei se ataseaza molecule de riboza 5 fosfat furnizata de 5- riboza 1-

Cauta sinteza inelului purinic si pirimidinic

Sursele de atomi de carbon si de azot pentru sinteza inelului primidinic sunt asemanatoare cu
celea pt sinteza nucleului purinic , si anume glutamina acidul aspartic si CO2.

Prima reactie in sinteza bazelor pirimidinice este sinteza carbamil fosfatului din glutamina si
CO2, enzima fiind glutamin fosfat sinteetaza 2, produsul final fiind UTP-ul, prin feed-back in
hiper actiunea carbamil fosfatazei-2. Carbamil fosfataza 1 intervine in ciclul ureei.

In urmatoarea reactie are loc sinteza acidului orotic. Urmeaza reactia prin care nucleul
pirimidinic este inchis hidrolitic, enzima fiind dihidro-orataza. Sub actiunea unei dehidrogenaze
specific, nucleul este oxidat la acid orotic

Care este primul intermediary in sinteza nucleului pirimidinic  acidul orotic

Reactia de formare a nucleului pirimidinic cand se formeaza OMP, nucleotidul orotidin 5

monofosfat. Cu nucleul pirimidinic format, urmeaza o serie de substituiri rezultand in final cele
trei baze pirimidinice. OMP, care este nucleotidul pirimidinic initial, este convertit in uridin
monofosfat –(UMP), sub actiunea OMP decarboxilazei.

Care este primul nucleotide pirimidinic care se sintetizeaza din OMP?--> UMP-ul

Enzima este o decarboxilaza OMP.

Ceilalti doi, respectiv, UMP si UTP, se formeaza prin fosforilari succesive. Intervin doua enzime,
o transferaza specifica si o decarboxilaza specifica cuprinsa sub denumirea de UMP sintaza,
care reprezinta un domeniu catalitic a unui singur lant polipeptidic, deci un lant polipeptidic
are doua actiuni polipeptidice, o modalitaate de a grabi sinteza bazeolr pirimidinice. In deficitul
genetic a acestor enzime, apare o boala rara numita aciduria orotica, cand apare o secretie
abundenta de acid orotic in urina.

Ceilalti doi componente a bazelor pirimidinice resectiv CTP si TMP se formeaza cu pornire de la
UTP, citidin trifosfat, avand donator de grupare amino glutamina, iar sinteza TMP, TDP, si TTP
porneste tot de la UMP, tot sub actiuena unei sintetaze specifice, dar donatorul gruparii metil
este metil tetrahidrofolatul (THF).

Care dintre cele trei base pirimidinice au in structura lor gruparea metil si cine est e
donatorul acestor grupari?

Cine doneaza gruparea amino pentru sinteza CTP-lui? Glutamina

Care este primul nucleotid care se sintetizeaza?

In catabolismul bazelor pirimidinice, produsii finali de reactie sunt amoniacul si bioxidul de

carbon.

La bazele purinice, produsul final a fost acidul uric.

Metabolismul acizilor nucleici.

Prima componenta sunt bazele purinice si pirimidinice. Pentru bazele purinice, care sunt
presente atat in structura acizilor dezoxiribonucleici, cat si in structura acizilor ribonucleici,
sunt respectiv: citidina, timina, fara uracil; adenina, guanina, uracil.

Ce resulta din unirea bazelor purinice si pirimidinice si o riboza sau dezoxiriboza ?

Nucleozid.

Legatura se face de tip N-glicozidic intre hidroxilul din pozitia 1 a ribozei sau dezoxiribozei si
azotul din pozitia 9 a bazelor purinice respecti pozitia 1 a bazelor pirimidinice.

Dupa adaugarea unei molecule de acid fosforic rezulta nucleotidele. La inceput

mononucleotid, apoi inca o molecula de Pi. Dinucleotid, si apii trinucleotid, respectiv ATP, GTP,
UTP, TTP si CTP.

Aceste nucleotid trifosfati intra in structura lanturilor polinucleotidice din structura

nucleoproteinelor. Daca in cazul proteinelor legatura intre aminoacizi pentru formarea
lanturilor polipeptidice este legatura de tip peptidic. In cazul acizilor nucleici legatura intre
nucleotide pentru a forma lanturi polinucleotidice este legatura 3,5- difosfoesterica.

Acizii nucleici, dupa pentoza care o au in structura lor se impart in acizi dezoxiribonucleici,
carea u ca pentoza dezoxiriboza si acizi ribonucleici carea u ca si pentoza riboza.

Acizii nucleici, respectiv acidul dezoxiribonucleic, se gaseste in nucleul celular, respectiv in

cromozomi si este purtatorul imformatiei genetice, informatie care se gaseste stocata la nivelul
ADN-ului, in formatiuni de cate trei nucleotide, respectiv in genele structura cromozomilor.
Acizii ribonucleici se sintetizeaza tot la nivelul nucleului, dar ei se mai pot sintetiza si in
mitocondrii si la nivelul ribozomilor.

Structura acizilor dezoxiribonucleici –ADN.

Initial a fost imaginata ca fiind formata din doua lanturi polinucleotidice infasurata comparand
structura s acu o scara in spirala. Adenina si guanina sunt bazele purinice din structura ADN-
ului, iar citozina si timina sunt bazele pirimidinice.

Intotdeauna suma bazelor pirimidince este egala cu a bazelor purinice.

Notiunea de baza complementara ne arata ca intotdeauna in structura acizilor

dezoxiribonucleici, adeninei din structura unui lant polinucleotidic: A-T si G-C
Intre bazele complementare se formeaza legaturi de H cate doua intre A=T si cate trei legaturi
intre C_=G.

Comparatia cu scara in spirala se refera la faptul ca acidul fosforic si dezoxiriboza formeaza

balustrada scarii care se gaseste de o parte si ceealalta a scarii iar tretele sunt bazele azótate
complementare si legatura de H dintre ele.

Legatura intre dezoxiriboza din structura ADN-ului si respectiv riboza din structura ARN-ului
este de tip 3-5, adica intre hidroxilul din pozittia 3 si acidul fosforic din pozitia 5 a bazei
adiacente,. Intotdeauna sinteza catenelor complementare se face in directia 5-3. Cele doua
catene complementare sunt antiparalele astfel ca la capatul fiecarui acid dezoxiribonuclei vom
gasi o extremitate 5 si o extremitate 3.

Sinteza acidul dezoxiribonuclei ADN

Se face prin procesul de replicare semiconservativa , in sensul ca cele doua catene din
structura unei molecule de ADN se despart si pentru fiecare catena se sintetizeaza o catena
complementara pe baza bazelor complementare, adica daca pe o catena a ramas adenina, pe
catena complemtentara se ataseaza T, si asa mai departe.

Catenele complementare care se sintetizeaza antiparalel.

In procesul de replicare semiconservativa dintr-o molecula mama formata din doua catene
polinucleotidice resulta doua molecule fice care respecta Fidel structura moleculei mama,
precum si functiile ei. Fiecare molecula fica au cate o catena conservata din ADN-ul mamei.

Replicarea semiconservativa incepe in lungul moleculei polinucleotidiceprin aparitia unor

focale de despiralare.

Procesul de replicare semiconservativa necesita energie precum si un sistem enzimatic foarte

bine aranjat functional. A fost imaginat ca un túnel enzimatic in care patrunde la un capat al
tunelului ADN-ul mama, iar i interiorul tunelului are loc despiralarea, mentinerea indepartata
a catenelor spiralate, precum si sinteza catenelor complementare, astfle ca la celalalt capat al
tunelului resulta cele doua celule fice de ADN cu aceasi structura si aceasi functie ca si celula
mama.

Sinteza lanturilor complementare se face intotdeauna in directia 3-5.

ADN polimeraza I, II si III, intervin in replicarea semiconservativa a ADN-ului. In replicarea ADN-

ului si formareacelor doua catene complementare enzimele care intervin pe langa cele trei
polimeraze, mai sunt helicazele, care se chinuie sa desfaca cele doua catene ale ADN-ului.
Energia o da ADN-ului. Regiunile despiralate, au tendinta de respiralare. Topoizomerazele
impiedica acest proces. Sinteza noilor catene complementare se face intotdeauna in directia 5-
3, dar citirea secventelor nucleotidice se face in directia 3-5. Catenele complementare se
sintetizeaza sub forma unor fragmente de ADN numite fragmante Okazaki, care se unesc
ulterior rezultand catena complementara. Pentru sinteza catenei complementare e nevoie de
presenta unui primer format dintr-un fragment de ARN, un fragment scurt, dublu catenar
sintetizat pe matrita de ADN monocatenara. Elongarea lantului polinucleotidic este catalizata
de polimeraza III.

In faza finala are loc procesul de eliminare a fractiunii primer de ARN mesagera astfel ca resulta
in final catena complementara cu cea rezultata in celula mamei.

Sinteza acizilor ribonucleici

Daca acizii dezoxiribonucleici au o structura bicatenara, acizii ribonucleici au portiuni

monocatenare care alterneaza cu notiuni bicatenare. Cei trei acizi ribonucleici mai importante
sunt: ARNm, ARNtransport si ARNr.

Sinteza celor trei tipuri de acizi ribonucleici, respectiv mesageri, ribozomali si de trensprot are
loc la nivelul nucleului pe matricea ADN-ului, dar numai pe o catena, dcei, sinteza celor trei
acizi ribonucleici este o sinteza monocatenara pe o catena a ADN-ului.

ARNm si celalalte doua au bazele complementare purinice ca si ADN-ul iar cele pirimidinice, in
loc de timina, are uracil.

ARNm preia informatia genetica de la ADN-ul nuclear la nivelul unor formatiuni numite codoni
formati din cate 3 nucleotide. Fiecare codon fiind responsabil de aminoacizii dictati de catre
ADN din structura lantului polipeptidic.

ARNm, in timpul sintezei de proteine, se interpune intre cele doua fragmente ale ribozomului
precum banda de scris de la o masina de scris, dupa comanda prin codon a aminoacidului ce
urmeaza in sinteza proteica, ARNm face o deplasare spre dreapta cu 3 nucleotide in dreptul
situsului A aparand un nou codon care comanda un alt aminoacid.

ARNt sau solubil a fost cel mai bine studiat si a fost comparat cu o frunza de trifoi presata. Are
o extremitate 3 formata din 4 nucleotide monocatenare si o extremitate 5.

Cele trei portiuni sub forma de frunza de trifoi au o structura monocatenara, formate primele
doua din cate 7 nucleotizi, iar a treia portiune monocatenara e formata din 8-12 nucleotizi.

Cu aceste portiuni monocatenare, ARNt se fixeazza cu cei trei nucleotizi care formaeaza
anticodonul ( a doua portiune monocatenara) fixandu-se de codonul din structura ARNm.

Cea de a treia portiune monocatenara se fixeaza de enzima specifica din faza initiala a sintezei
proteice. ARNt, dupa ce primeste mesajul de la codonul ARNm cauta aminoacidul in
citoplasma, il fixeaza si il transporta la ARNm.

Al treilea ARN este acidul ribonucleic ribozomal, care intra in structura ribozomilor avand rol sa
dirijeze ARNtinspre ARNm in procesul de sinteza a proteinelor.

Intotdeauna, impulsurile pentru sinteza de proteine pornesc de la ADN prin ARNm, prin
citoplasma, unde la nivelul ribozomilor are loc sinteza de proteine.

O data cu descoperirea retrovirusilor, respectiv ale revers transcriptazei, s-a dovedit ca

impulsul genetic poate porni de la ARN la ADN asa cum se intampla la sida si tumori.
in ultima perioada s-au gasit trabsmiteri de impulsuri genetice intre moleculele de ARN.