Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
- studiaz chimia
vieii
1833 Anselme Payen
diastaza (amilaza)
descoper
studiaz
BIOCHIMIA
1.
Structuri
biochimice
celulare
implicate
procesele
microelementele
4. Enzimele
5. Vitaminele
6. Metabolismul oxidativ
7. Metabolismul glucidic
8. Metabolismul proteic
9. Metabolismul lipidic
10. Acizi nucleici
11. Metabolismul hormonal
cu
implicaii
Membrana celular
- membran semipermeabil
- asigur schimburile cu exteriorul celulei
- menine pH-ul celular
- menine compoziia constant a mediului intern i
potenialul electric
Membrana celular
Compoziie
- lipide fosfolipide, colesterol, glicolipide
- proteine vehiculante transport aminoacizi, ioni,
glucoz
- canaliculare canale hidrofile pentru
molecule mici
- receptoare comunicarea ntre celule
- enzimatice au proprieti catalitice
- semnalizatoare markeri individuali
Reticulul endoplasmatic
Lizozomii
- deficit de glucozo-6-fosfat-dehidrogenaz
susceptibilitate crescut a
Peroxizomii
polipeptidelor
Mitocondriile
- 2 membrane lipidice
- membrana extern enzime implicate n CATC, MAO
- membrana intern sisteme de transport
- matricea enzime pentru -oxidarea AG, CATC
- criste oxizomi enzimele lanului respirator
compui macroergici
termocentralele celulelor
Aparatul Golgi
- transform
organism
compuii
- sortarea proteinelor
- oficiu potal celular
sintetizai
Nucleul
ARN,
nucleotide,
Structur molecular
- tetraedru neregulat
- ntre molecule exist legturi de
hidrogen
- este un dipol electric
- disociaz
+
H2O H + HO-
H+ HOK=
H2 O
Rol n organism
- structural n structura celulei,
esuturilor
- biochimic reactant, produs de
reacie
- solvent
- mediu transportor
- lubrifiant
- termoreglator
Sisteme tampon
- ecuaia Henderson-Hasselbach
baza conjugata
pH = pKa + log
acid conjugat
Sisteme tampon
- H2CO3 / HCO3- Na2HPO4 / NaH2PO4
- pretein / proteinat
- hemoglobin / hemoglobinat
- pH normal = 7,4
- variaii fiziologice somn, vrst
Modificri
pH < 7,3 acidoz
alcaloz
pH > 7,42
pH = 7 stare comatoas
com
pH = 7,6-7,8
pH = 6,8 deces
pH = 8 - deces
Sodiu
-142 mEq/L
- distribuia apei n organism i reglarea presiunii
osmotice
- realizarea echilibrului ionic
- transmiterea inpulsului nervos
- contracia muchiului cardiac
Potasiu
- 3,1- 5,1 mEq/L
- funcia neuronilor
- contractilitatea muscular
- respiraia celular
- activitatea cardiac
Calciu
- 4,5- 5,3 mEq/L
- reduce excitabilitatea neuromuscular
- regleaz secreia glandelor endocrine
- coagularea sngelui
- activeaz enzime
- integritatea i permeabilitatea membranei
Fosfor
- 0,78-1,51 mmoli/L
- 75% - hidroxiapatita din oase
- 25% - combinaii organice fosfolipide, nucleotide,
acizi nucleici, compui
macroergici
Magneziu
- 1,5- 2,5 mEq/L
- activator enzimatic
- menine structura ADN, ARN, ribozomi
Fier
- femei 0,8-1,3 mg/L
- brbai 0,9-1,5 mg/L
- structura hemoglobinei, metaloproteinelor
(mioglobin, citocromi)
- grupri prostetice ale enzimelor
- induce sau stimuleaz procesele oxidative
Mangan
- cofactor enzomatic oxidoreductaze,
transferaze, hidrolaze, liaze
- structura SOD
Seleniu
- structura deiodinazei, glutation-peroxidazei
- protecie fa de speciile oxidante
Sulf
- structura tioaminoacizilor, proteinelor
- structura enzimelor citocrom c oxidaza
- structura unor grupe funcionale enzimatice
coenzima A
ENZIME
ENZIME
Structura enzimelor
- proteine simple
- heteroproteine
(apoenzim)
partea
proteic
apoprotein
specificitate de substrat
- partea neproteic cofactor aciunea
catalitic
metalici)
- nucleoproteine
organic (coenzim),
- anorganic (ioni
Structura enzimelor
Situsuri
- primar - succesiune de aa
catalitic
- secundar orientarea spaial leg.e de H
ENZIME
Denumirea enzimelor
- I - substrat +
-az
(ureaz, glucozidaz)
-az
(oxidaz,
Denumirea enzimelor
- EC 1.1.1.1. alcool dehidrogenaza
EC 1. oxido-reductaz
EC 1.1. acioneaz asupra compuilor cu gr. CHOH
EC 1.1.1. NAD+ sau NADP+ este acceptorul de H
EC 1.1.1.1. NAD+ este acceptorul de H
Denumirea enzimelor
- EC 2.1.1.1. nicotinamid-N-metil transferaza
EC 2. transferaz
EC 2.1. transfer un grup de 1 at. de C
EC 2.1.1. transfer un grup metil
EC 2.1.1.1. donorul este metionina
S-adenozil-L-metionina + nicotinamida
S-adenozil-L-homocisteina + 1-metilnicotinamida
Localizarea enzimelor
- nespecific n toate esuturile
- specific pepsina, tripsina, H. tiroidieni
- la nivel celular membran GGT
- citoplasm glicoliz, sinteza de acizi
grai
- nucleu ADN-giraza, ADN-polimeraza
- lizozomi enzime degradative
- ribozomi sinteza de proteine
- RE sinteza de glicogen, glicoproteine,
CYP 450
mitocondrii
respiraia
fosforilarea oxidativ,
celular,
Proenzime
- zimogeni
- activare prin hidroliz limitat a unui peptid terminal
- ndeprtarea unui oligopeptid din
interiorul moleculei
- metode de activare
- chimic mediul acid pepsinogen
pepsin
- autocatalitic tripsinogen
tripsin
enterokinaza
tripsinogen
- catalitic -
proelastaza
tripsina
tripsina
elastaza
vitamina K
protrombina
anticoagulante
cumarinice
VII, X
fibrinogen
plasminogen
heparina
Activatorul tisular
al plasminogenului
+
urokinaza
streptokinaza
trombina
fibrina insolubila
plasmina
fibrina solubila
Izoenzime
- au aceleai proprieti enzimatice, dar structur
primar uor
difereniat, proprieti cinetice i electroforetice
diferite
- sunt specifice enzimelor cu structur cuaternar
- evideniate n acelai organism
- numerotate n funcie de proprietile electroforetice
1 .... N
- ex. lactatdehidrogenaza LDH1 .... LDH5
lactat dehidrogenaza
CH3-C-COOH + NADH + H+
CH3-CH-COOH + NAD+
O
OH
creatin kinaza
creatina + ATP
Sisteme multiemzimatice
- asociaii enzimatice n cadrul unei ci metabolice
Ex.
complexul
dehidrogenaza
piruvat-dehidrogenaza
piruvat
- lipoilreductaztransacetilaza
- lipoat
Clasificarea enzimelor
- dup sistemul IUBMB
1. Oxidoreductaze
2. Transferaze
3. Hidrolaze
4. Liaze
5. Izomeraze
6. Ligaze
1. Oxido-reductaze
ox1 + red2 red1 + ox2
1. 1. Dehidrogenaze
- H de la grupe funcionale ( -CH2-OH, -CHO, -CH2-NH2),
nucleotide (NADH, NADPH) la substrat n absena
oxigenului
- oxidare anaerob
AHADH
2 + B A + BH2
CH3-CH2-OH + NAD+
H+
CH3-CHO + NADH +
1. 2. Oxidaze
- H de la substrat la oxigen H2O sau H2O2
- oxidare aerob
AH2 + O2 A + H2O
AH2 + O2 A + H2O2
1. 3. Oxigenaze
- introduc atomi de oxigen n molecul
1.3.1. Monooxigenaze (hidroxilaze)
AH + O2 + BH2 A-OH + B + H2O
- CYP 450
- CYP450 (hemoprotein) substratul i O2
- NADPH-CYP450 reductaza
- fosfatidilcolina
RH + O2 + 2H+ + 2e ROH + H2O
1.3.2. Dioxigenaze
A + O2 AO2
CH2-CH-COOH
+ O2
NH2
triptofan
triptofan
dioxigenaza
C-CH2-CH-COOH
O
NH2
NH-CHO
N-formil-kinureina
1. 4. Hidroperoxidaze
- catalaza
H2O2 + H2O2 2 H2O + O2
H2O2 + AH2 2 H2O + A
- superoxid dismutaza (SOD)
-.
O2 + O2. + 2 H+
SOD
H2O2 + O2
2. Transferaze
A + BC AB + C
2. 1. Aminotransferaze
R1-CH-COOH R2-C-COOH
+
O
NH2
R1-C-COOH R -CH-COOH
+ 2
O
NH2
TGO
acid aspartic + acid -cetoglutaric
(AST,
acetat + acid
glutamic
ASAT)
TGP
acid glutamic + acid piruvic
(ALT, ALAT)
cetoglutaric
+ -alanina
oxal-
acid -
2. 2. Kinaze
-glucoza + ATP
hexokinaz
e
ADP
I, II, III, IV
glucozo-6-fosfat +
2. 3. Glicoziltransferaze
glu-UDP + -(glu)n-1-
hexozil
transferaz
a
glicogen + UDP
2. 4. Metiltransferaze
S-adenozil-metionina + dopamina
COMT
3-metoxi-tiramina + Sadenozil-homocisteina
glicina +
3. Hidrolaze
AB + H2O A-OH + BH
-
-NH-CH-CO-NH-CH-CO- + H2O
R1
proteaza
R2
lipaz
trigliceride + H2O
a
glicerol + acizi grai
tripsin
a
-NH-CH-COOH + H2N-CH-COR2
R1
4. Liaze
- catalizeaz eliminarea din molecule CO2, H2O, NH3
4. 1. Decarboxilaze
piruvat
CH3-C-COOH
decarboxilaza
O
CH3-CHO + CO
2
4. 2. Dehidraze
acid cis-
5. Izomeraze
-
5.
catalizeaz
structurali
1.
transformarea
izomerilor
optici
Epimeraze
(racemaze)
L-serina
serin
racemaza
D-serina
5. 2. Mutaze
glu-6-fosfat
1-fosfat
fosfogluco
mutaza
glu-
sau
6. Ligaze (sintetaze)
- C-C; C-N; C-S; C-O
acid oxal-acetic
Acetil-CoA +
E+S
Centrul activ al
enzimei
ES
E+P
Modelul Fischer
(clasic)
Specificitatea
enzimelor
- de reacie enzima catalizeaz un singur tip de
reacie
- lactat-dehidrogenaza, glucozo-6-fosfataza
- excepie enzime piridoxalfosfat
dependente (transaminare,
decarboxilare,
aldolizare)
alcool metilic
etilenglicol
acetaldehida
ADH
ADH
aldehida formica
aldehida glioxilica
Cinetica enzimatic
k1
k2
ES
k3
E + P
mol
Influena pH-ului
- pH optim acid (pepsina, enzime lizozomale), neutru,
bazic (tripsina,
chimotripsina)
-modificarea pH-ului
- modificarea
funcionale
gradului
de
ionizare
grupelor
k [E] =
[P] / t
[E] = [P] /
kt
[E] ~
[P]
E + S
k1
k2
Influena
substratului
ES
k3
concentraiei
E + P
v1 = k1 [E] [S]
v2 = k2 [ES]
v0 = k3 [ES]
v1 = v2 + v0
KM
KM =
[E] [S]
[ES]
[E] = [ET]
[ES]
[E] [S]
KM =
KM =
[ES]
vo = vmax
[S]
KM + [S]
ecuaia MichaelisMenten
vo = k [ET] [S]
3 K + [S]
M
vmax = k3 [ET]
[ES] =
[ET] [S]
KM + [S]
v0 = k 3
[ES]
vo = vmax
vo ~
vmax
vmax
vo =
2
[S]
KM
vo ~
[S]
Ecuaia LineweaverBurk
KM
+ v
v =v
.
max
max [S]
1
mai
multe
E+A+BE+C+D
Mecanisme
1. tip ping-pong
E + A EA E + C
+
EB E +
B
D
ex.
reaciile
transaminare
E-CHO + AA1-NH2
E-CH2-NH2
de
CHO
CH2-NH2
AA1-NH2
+ CA2
CA1
CH2-NH2
CA2
CHO
AA2-NH2
CA1
E-CHO + AA2-NH2
2. tip secvenial
2.a. ordonat
E + A EA +
B
2.b. aleatoriu
E + A EA
E + B EB
EAB
EAB
ECD
-C
ED
-D
- C ED - D
ECD
- D EC - C
Inhibiia enzimatic
- reversibil
uncompetitiv
- ireversibil
competitiv,
necompetitiv,
1. Inhibiia competitiv
- substratul i inhibitorul se fixeaz pe centrul
activ
E + S ES E +
P
E + I EI
- condiii
succinat dehidrogenaza
acid fumaric
acid malonic
acid malic
acid oxalic
reacii reversibile
R-O-PO3H2
fosfataza
alcalin
H3PO4
R-OH +
2. Inhibiia
necompetitiv
- S i I se fixeaz pe centri diferii
+S
E
ES +I
E+P
+I
+S
EI
ESI
3. Inhibiia
uncompetitiv
E + S
ES
+
I
ESI
4. Inhibiia ireversibil
E + I
EI
- ex. - ageni alchilani
- compui organofosforici
- ageni anticoagulani
- 1-antitripsina
-lactamice
peniciline,
- anticanceroase - metotrexat
- diuretice inhibitoare ale anhidrazei carbonice
- antiinflamatoare COX1 (AAS), COX2
- antihipertensive IEC (captopril)
- antidepresive IMAO (fenelzina)
antiglaucomatoase,
anticolinesterazice
- hipocolesterolemiante
(simvastatin)
miastenia
grav
I-HMG-CoA-reductaza
Legare covalent
- activitatea enzimei este controlat prin fixarea sau
ndeprtarea unor
grupe de atomi
- ex. - fosforilare
defosforilare
kina
+
-ATP
ADP
E-OH
E-O-PO3H+2
za
fosfat
H
-H2O
3PO4 aza
- metilare demetilare
- acetilare deacetilare
- adenilare deadenilare
- proteoliz parial tripsinogen tripsin
Enzime alosterice
- interaciune necovalent cu liganzi n centri diferii de
centrul activ
- catalizeaz reacii dintr-o cale metabolic
- conin 2 centri activator, inhibitor
- nu respect ecuaia Michaelis-Menten
- interaciunile cu liganzii
- homotrope
- heterotrope 2 tipuri K KM se modific, vmax
constant
- V - KM constant, vmax se
modific
b. secvenial
activi analitici
dozarea medicamentelor
dozarea compuilor endogeni: glucoza, uree, acid uric
dozarea unor compui exogeni alcool
tehnica ELISA
geni terapeutici
streptokinaza, urokinaza
reptilase (Bothrops atrox, Bothrops jararaca)
hialuronidaza
asparaginaza
enzime proteolitice tripsina, chimotripsina
3. Indicatori paraclinici
- AST, ALT - cresc n infecii virale hepatice, ALT
persist mai mult
- infarct miocardic crete AST
- distrofie muscular crete AST
- CPK (CK) - crete copii, afeciuni musculare,
hipertermia malign
- CK2 i CK3 crescute - afeciuni
miocardice, transplant
- CK1 crescut - leziuni cerebrale,
neurochirurgie
- fosfataza alcalin - crete - obstrucia cilor biliare,
afeciuni ale oaselor
Coenzime
hem B
hem A
hem C
Fe3+
- hem L - lactoperoxidaz
- hem M - mieloperoxidaz
Coenzima
(ubiquinona)
Q
O
H3CO
CH3
H3CO
(CH2-CH=C-CH2)10-H
CH3
- descoperit n 1957
- surse - endogen - sintetizat n organism din tirozin i
acetil-CoA
- exogen alimente (macrou, hering, inim de
porc) ( 14-32%)
- localizare - membrana mitocondrial, RE, peroxizomi,
lizozomi
O
H3CO
CH3
H3CO
cancer,
FMN
FAD
H3CO
citocromi
2H+
2Fe2+
H3CO
2Fe3+
OH
CH3
OH
boli
Acidul
lipoic
S
(CH2)4-COOH
+ R-CHO
(CH2)4-COOH
SH
S-CO-R
+ CoA-SH
FADH2
FAD
(CH2)4-COOH
SH
SH
- aciltransferaza, piruvat-dehidrogenaza
CoA-S~CO-R
Tetrahidrobiopt
erina
H 2N
HN
tirozina
fenilalanina
O2
H
N
N
H
O
TH-biopterina
CH3
CH-CH-CH3
OH OH
H 2O
H2 N
N
N
O
H
N
N
CH3
CH-CH-CH3
OH OH
DH-biopterina
NADP+
NADPH + H+
- fenilalanin-4-hidroxilaza
- tratamentul fenilcetonuriei (Sapropterin)
S-adenozilmetionina
NH2
N
CH3
HOOC-CH-CH2-CH2-S-CH2
NH2
N
N
O
OH OH
- metiltransferaze
- sinteza poliaminelor: spermina i spermidina
noradrenalin
adrenalin
ATP
NH2
N
N
N
O- O- O-
CH2-O-P-O-P-O-P-OO
O O O
OH OH
Vitamine
- liposolubile A, D, E, K
- hidrosolubile
pantotenic), B6, B7
B 1,
B 2,
B3 (niacina),
B5 (acid
Vitamina A
H3C
CH3
CH2-OH
H3C
CH3
CHO
CH3
retinal (all-trans retinal)
retinol
H3C
CH3
H3C
CH3
CH3
COOH
H3C
CH3
CHO
11-cis-retinal
CH3
acid retinoic
- derivat poliizoprenic
- lichid uleios, insolubil n ap, solubil n solveni
organici
- UV fluorescen verzuie
- 1917 - descoperit, 1947 - sintetizat
beta-caroten
retinilesteri
oxidare
mucoasa
intestinala
retinol
+ H2O
+ acid palmitic
acid stearic
retinilesteri
acizi grasi
chilomicroni
+ H2O
ficat
retinol
+ RBP
retinol-RBP
depozitare
celule
fixare
pe receptori
(CRBP, CRABP)
efecte
biologice
contraceptiv
e
H3C
H3C
CH3
H3C
CH3
CH3
beta-caroten
caroten-dioxigenaza
H3C
CH3
- abs. 3035%
CHO
CH3
retinal (all-trans retinal)
H3C
CH3
CH2-OH
H3C
CH3
retinol
CH3
COOH
CH3
acid retinoic
Efecte biologice
- necesar zilnic 1 mg retinol, 6 mg -caroten (sex,
vrst, starea fiziol.)
- retinol, acid retinoic creterea i diferenierea celulelor
(RAR, RXR)
- meninerea integritii epiteliului
impuls
nervos
- vedere
rodopsina
lumina
opsina
ntuneric
all-trans retinal
11-cis-retinol
Hipervitaminoza A
- niveluri plasmatice = 10 x necesarul zilnic
- intoxicaia acut dureri abdominale, greuri, vom,
cefalee, ameeli,
descuamarea pielii
- intoxicaia cronic dureri osoase, articulare, cderea
prului, uscciune i
fisuri ale buzelor, anorexie,
hipertensiune
intracranian benign,
hepatomegalie
- exces de caroten colorarea tegumentelor n galben
- risc de malformaii la derivaii de sintez