INSTITUTUL PASTEUR CENTRUL DE CERCETARE DEZVOLTARE DIAGNOSTIC SI CONTROLUL CALITATII LABORATORUL DE BIOLOGIE MOLECULARA ANALIZE PCR

PCR amplificare PCR clasica mPCR amplificare PCR multiamorsa (multiprimer / multiplex, in aceeasi reactie sunt puse in evidenta mai multe gene, astfel ca sunt evidentiati mai multi factori de virulenta sau pot fi identificati mai multi agenti infectiosi) RT-PCR amplificare PCR clasica cu etapa de revers-transcriptie (cazul virusurilor ARN de exemplu) rPCR amplificare PCR in timp real calitativa qPCR amplificare PCR in timp real cantitativa rPCR-Tq (sau Tq-rPCR) amplificare PCR in timp real cu sonde Taqman (sonde de confirmare a ampliconului obtinut in reactie, inalt specifice); de obicei, reactie calitativa mrPCR-Tq amplificare PCR in timp real multiamorsa (multiprimer / multiplex) cu sonde Taqman RAPD (random amplified polymorphic DNA) amprenta genetica obtinuta prin PCR marker epidemiologic util in discriminarea tulpinilor sau organismelor sau marker privind stabilitatea unei tulpini / unui organism, cand este aplicata pe probe prelevate din diverse pasaje ale organismelor studiate (similar testelor de paternitate). VNTR (Variable number tandem repeat) alt tip de amprenta genetica, utila in discriminarea tulpinilor, dar spre deosebire de RAPD, care este aplicabila oricarui organism, VNTR este specifica pentru fiecare specie bacteriana.

Specificare / specie animala Suine

Agent infectios App

Analiza Tipizarea tulpinilor de Actinobacillus pleuropneumoniae (pe baza evidentierii genelor apx I, II, III, IV) Tipizarea tulpinilor de Escherichia coli - stabilirea si discriminarea patotipurilor ETEC (enterotoxigene) / VTEC (verotoxigene), pe baza evidentierii genelor enterotoxinei termolabile LT si ale verotoxinelor de tip 2

Cod test 4903

Metoda PCR

Specimene (Probe biologice) Tulpini / colonii izolate de Actinobacillus pleuropneumoniae. Tulpini / colonii izolate de Escherichia coli.

Pret per proba (lei) 14 5 probe probe 414.9 125

Suine

ETEC/VTEC

4905

mPCR

414.9

125

Specificare / specie animala

Agent infectios

Analiza VT2-SLT2 / asociata bolii edemelor VT2v-VT2e Detectia Mycoplasma hyopneumoniae Detectia M. hyopneumoniae / M. hyorhinis / M. floculare Detectia de adenovirus porcin tip 4 (PAV4)

Cod test

Metoda

Specimene (Probe biologice)

Pret per proba (lei) 14 5 probe probe 414.9 414.9 414.9 125 125 125

Suine Suine Suine

Mh Mh+Mh+Mf PAV4

4906 4907 4908

PCR mPCR PCR

Suine

PAV4+PRV

Detectia adenovirusului porcin tip 4 si al virusului bolii Aujeszky

4910

mPCR

Suine

PCV1

Detectia circovirusului porcin tip 1 (PCV1)

4911

PCR

Suine

PCV2

Detectia circovirusului porcin de tip 2 (PCV2) prin PCR clasic

4912

PCR

Pulmon, splina, limfonod, rinichi, tp. nazale Pulmon, splina, limfonod, rinichi, tp. nazale 0.5 ml sange integral pe EDTA sau ACD; 0.5 ml materii fecale; 0.5 ml tesut proaspat sau congelat sau fixat; tampoane nazale; tampoane fecale (rectale). 0.5 ml sange integral pe EDTA sau ACD; 0.5 ml materii fecale; 0.5 ml tesut proaspat sau congelat sau fixat; tampoane nazale; tampoane fecale (rectale). sange (pe EDTA): 0.5 ml, saliva: 2 ml, tampoane orale, probe de organ (pulmon, limfonod), sperma: 0.5 ml, tampoane sange, materii fecale, amprente organ (tampoane) sange (pe EDTA): 0.5 ml, saliva: 2 ml, tampoane orale, probe de organ (pulmon, limfonod), sperma: 0.5 ml,

414.9

125

414.9

125

414.9

125

Specificare / specie animala

Agent infectios

Analiza

Cod test

Metoda

Specimene (Probe biologice) tampoane sange, materii fecale, amprente organ (tampoane) sange (pe EDTA): 0.5 ml, saliva: 2 ml, tampoane orale, probe de organ (pulmon, limfonod), sperma: 0.5 ml, tampoane sange, materii fecale, amprente organ (tampoane) Continut intestinal / amprenta (tampoane), materii fecale 0.5 ml sange integral pe EDTA sau ACD; 0.5 ml materii fecale; 0.5 ml tesut proaspat sau congelat sau fixat; tampoane nazale; tampoane fecale (rectale). 0.5 ml sange integral pe EDTA sau ACD; 0.5 ml materii fecale; 0.5 ml tesut proaspat sau congelat sau fixat; tampoane nazale; tampoane fecale (rectale); 2 ml saliva:, tampoane orale, probe de organ (pulmon, limfonod), sperma: 0.5 ml; tampoane sange. 0.5 ml sange integral pe

Pret per proba (lei) 14 5 probe probe

Suine

PCV2+PPV

Detectia virusului PCV2 virusului parvo porcin

si

4913

mPCR

414.9

125

Suine Suine

PEV PPV

Detectia (PEV) Detectia (PPV)

enterovirusului parvovirusului

porcin porcin

4914 4915

RT-PCR PCR

414.9 414.9

125 125

Suine

PPV+PCV2

Detectia parvovirusului porcin si a circovirusului porcin tip 2

4916

mPCR

414.9

125

Suine

PPV+PRV

Detectia virusurilor parvo si bolii

4917

mPCR

414.9

125

Specificare / specie animala

Agent infectios Aujeszky

Analiza

Cod test

Metoda

Specimene (Probe biologice) EDTA sau ACD; 0.5 ml materii fecale; 0.5 ml tesut proaspat sau congelat sau fixat; tampoane nazale; tampoane fecale (rectale); 2 ml saliva:, tampoane orale, probe de organ (pulmon, limfonod), sperma: 0.5 ml; tampoane sange. ser sanguin (0.5 ml), saliva: 2 ml, probe de organ (pulmon, limfonod), sperma: 1 ml, tampoane sange, tampoane nazale, culturi celulare, amprente organ (tampoane) 0.5 ml sange integral pe EDTA sau ACD Tampoane nazale, pulmon, sange 0.5 ml sange integral pe EDTA sau ACD; 0.5 ml materii fecale; 0.5 ml tesut proaspat, sau congelat sau fixat; tampoane nazale; tampoane rectale (fecale). Probe / amprente de organ: pulmon, ficat, splina, limfonod, cord, continut intestinal.

Pret per proba (lei) 14 5 probe probe

Suine

PRRSV

Detectia virusului sindromului respirator si reproductiv porcin (PRRSV)

4826

RT-PCR

414.9

125

Suine Suine Suine

PRV SIV TGEV

Detectia virusului bolii Aujeszky (gD) Detectia virusului influenzei suine (SIV) Detectia virusului gastro-enteritei transmisibile a porcului (TGEV)

4918 4919 4920

PCR RT-PCR / rPCR rPCR

414.9 414.9 414.9

125 125 125

Specificare / specie animala Pasari

Agent infectios

Analiza

Cod test 4925

Metoda PCR / rPCR

Specimene (Probe biologice) Probe / amprente de organ (trahee, pulmon, corneti nazali); secretii / excretii nazale, bucale, faringiene (prelevate pe tampoane) Tulpini / colonii izolate de Escherichia coli. Noduli / tesut cu leziuni specifice. Cruste. Mucoase faringiana / laringiana. Tampoane de pe leziuni / aparat respirator / tampon oral / pene? Tampoane faringiene / traheale / cloacale. Trahee. Pulmon. Rinichi. Tonsile cecale. Lichid alantoidian / oua embrionate. Folicul plumifer (varf pana, Umbiculus inferior). Sange (depozit limfocitar). Tesut tumoral. Cruste / formatiuni nodulare. Splina. Creier. Plex nervos / nerv sciatic. Probe / amprente organ: pulmon, trahee, saci aerieni, narine / sinusuri (MG, MS); articulatii (membrane

AMPV (TRT Detectia si discriminarea tipurilor / ART) de metapneumovirus aviar (virusul rinotraheitei infectioase aviare)

Pret per proba (lei) 14 5 probe probe 414.9 125

Pasari

APEC

Pasari

APV / DV

Stabilirea patotipului APEC la tulpinile de E.coli (genele iss+ompA+fimH) Detectia virusului Avipox (virusului diftero-variolei) prin evidentierea genei dck (citidin kinaza)

4926

mPCR

414.9 414.9

125 125

4927

rPCR

Pasari

IBV

Detectia / tipizarea virusului bronsitei infectioase aviare (IBV) (tipuri Qx / Mass / It 02)

4929

rPCR

414.9

125

Pasari

MDV

Detectia virusului Marek

4930

PCR

414.9

125

Pasari

MG+MS

Detectia prezentei tulpinilor de Mycoplasma gallisepticum si M.synoviae

4931

mPCR

414.9

125

Specificare / specie animala

Agent infectios

Analiza

Cod test

Metoda

Specimene (Probe biologice) sinoviale, MS); sac vitelin (MG, MS). Tampoane traheale. Probe / amprente organ: pulmon, trahee, saci aerieni, narine. Tampoane traheale. Tampoane oro-faringiene. Trahee. Pulmon. Creier. Proventricul. Tonsile cecale. Amprente organ (tampoane). Probe / amprente de organ (cord, creier, ficat, pulmon, saci aerieni, trahee, sinusuri infra-orbitale, vertebre toracale, articulatii).Oua embrionate. Tulpini / colonii izolate Mycoplasma spp. 0.5 ml lapte. Tulpini / colonii izolate de enterobacteriacee.

Pret per proba (lei) 14 5 probe probe 414.9 414.9 125 125

Pasari

Mm+Mi

Mycoplasma iowae

meleagridis

si M.

4932

Pasari

NDV (APMV1)

Detectia virusului bolii de Newcastle pe baza evidentierii genei F (neuraminidaza)

4933

RT-PCR

Pasari

ORT

Detectia rinotracheale.

Ornithobacterium

4934

PCR

414.9

125

Ovine, caprine Multispecii

Ma

Identificarea Mycoplasma agalactiae pe baza genei uvrC.

4935

PCR

414.9 414.9

125 125

Multispecii

Multispecii

QacD / floR / Detectia genelor de rezistenta la b-lac / int I sarurile de amoniu cuaternar, a genei de rezistenta la florfenicol, a genei de rezistenta la betalactamine, a integronilor de clasa I. Ba Caracterizarea tulpinilor de Bacillus anthracis pe baza evidentierii genelor sap / cap / pag Bspp Detectia tulpinilor de Brucella spp pe baza secventei omp25

4936

PCR

4937

PCR

Tulpini / colonii izolate de Bacillus anthracis Tulpini / colonii izolate de Brucella spp. 0.5 ml sange pe

414.9 414.9

125 125

4938

PCR (rPCR)

Specificare / specie animala

Agent infectios

Analiza

Cod test

Metoda

Specimene (Probe biologice) EDTA sau ACD. 0.5 ml lapte. Tulpini / colonii izolate de Pasteurella spp.

Pret per proba (lei) 14 5 probe probe 414.9 125

Multispecii

Pm

Multispecii

Tg

Caracterizarea / tipizarea tulpinilor de Pasteurella multocida prin detectia genelor tbpA (achizitia de fier), serB (rezistenta la complement) si toxA (toxina dermonecrotica, specifica tulpinilor de origine porcina) Detectia Toxoplasma gondii

4941

PCR / mPCR

4943

PCR

Multispecii

Ts/Tp/ Tb/Tn CPV2

Caine

Identificarea Trichinella spiralis / T. pseudospiralis / T. britovi / T. nativa Detectia / identificarea parvovirusului canin tip 2, subtip clasic si variant

4945

mPCR

Creier, limba, muschi (spate / file), cord, sange integral pe EDTA Larve post digestie artificiala

414.9 414.9 414.9

125 125 125

4947

rPCR-Tq

Bovine suine Bovine Amprente genetice

/ BVDV IBRV -

Detectia virusului diareei virale bovine tip 1 si tip 2 Detectia virusului rinotraheitei infectioase bovine Determinarea amprentelor genice ale tulpinilor microbiene / probelor de material genic eucariot prin RAPD / Testul PCR RAPD (amprente ADN prin amplificare

4948 4949 4951

rPCR PCR PCR RAPD

Probe / amprente de organ: pulmon, cord, creier, splina, limfonod, bila, continut intestinal. Materii fecale, tampoane rectale (fecale). Probe / amprente de organ (limfonod, splina, pulmon). Probe / amprente de organ (limfonod, splina, pulmon). Tulpini bacteriene / virale / paraziti / vaccinuri / etc. Linii celulare. Produsi de amplificare / digestie enzimatica. Plasmide.

414.9 414.9 414.9

125 125 125

Specificare / specie animala Amprente genetice 12.07.2013 Ef

Agent infectios

Analiza arbitrara) Discriminarea genetica a tulpinilor de Enterococcus faecium pe baza polimorfismului locilor VNTR

Cod test

Metoda

Specimene (Probe biologice)

Pret per proba (lei) 14 5 probe probe 414.9 125

4952

PCR

Tulpini / colonii izolate de Enterococcus faecium.

Dr. Virgilia Popa, PhD Cercetator stiintific gr.I