1s22s22p63s23p63d104s2

Lyase : enzyme qui catalyse la rupture de diffrentes

liaisons chimiques par des moyens autres que l'hydrolyse
ou l'oxydation, formant ainsi souvent une nouvelle liaison
double ou un nouveau cycle.

Hydrolyse de la liaison peptidique ct C terminal (dans protines,

oligopeptides )
Plusieurs formes distinctes: A,B,C qui diffrent par leur prfrence
pour rsidus terminaux.

Selectivitatea substratului
C=O devine mai electrofil
i crete reactivitatea

Oxoanion stabilizat de Arg 127 i Zn2+

Produi de reacie deplasai prin fixarea apei

Enzime catalizatori ai reaciilor de hidroliz a peptidelor

Reacia

Enzima

Biometalul din
structura
enzimei

Masa
molecular

Hidroliza la
atomul de C din
ultimul rest de
peptid
Hidroliza la
atomul de N din
ultimul rest de
peptid
Hidroliza
dipeptidelor
Hidroliza
peptidelor

Carboxipeptidaza

Zn2+

34600

Aminopeptidaza

Mg2+ (Mn2+)
Zn2+

400000

Dipeptidaza

Zn2+

47200

Proteaza

Ca2+

Zn2+
H+
O-

O H 2O

C
O

O=C
OH
ion hidrogenocarbonat

Structura :

form : elipsoid 40x45x55

Zn2+ - substituit de :
Co2+, Mn2+, Ni2+, Cu2+, Hg2+, Pb2+, Fe2+, Be2+, Mg2+, Ca2+

structur entatic
Inhibitori :

N3-, NC-, CNO-, S2O42-, sulfamide X-SO2-NH2

La pyruvate carboxylase
enzyme mitochondriale qui permet daugmenter le taux doxaloactate

Etapa 1 : * Conversia unei molecul de ap legat ntr-un ion hidroxil

Rolul
de ionului
de zinc
reduceeste
pKa-ul
moleculei
H2O activ
Etapa 2 : ** O
molecul
de dioxid
de :carbon
legat
de centrul
coordinate
Etapa 3 : * Se creeaz o legtur ntre ionul de hidroxil i
dioxidul de carbon.
Etapa 4 : * Ionul hidrogenocarbonat format este eliminat i o alt
molecul de ap se leag de ionul de zinc

Etapele mecanismului :
1)Ionii de zinc sunt capabili de a converti o molecul de ap
legat ntr-un ion hidroxil, de asemenea coordinat la de ionul
metalic. Acest lucru este important pentru mecanism,
deoarece ioni de hidroxil este mai activ dect o molecul de
ap. Rolul ionului de zinc este aici de a reduce pKa-ul
moleculei de ap coordinate.

2) O molecul de dioxid de carbon este legat de centrul activ.

3) Se creeaz o legtur ntre ionul de hidroxil i dioxidul de
carbon.
4) Ionul hidrogenocarbonat format este eliminat i o alt
molecul de ap se leag de ionul de zinc.

Arg 166

Fixare bidentat a substratului la Zn

- orientare determinat
- asociere puternic

Zn1 : Coordinarea gruprii OR activarea substratului pt clivare

Zn2 : coordinarea serinei (Ser) scderea pKa Ser

deprotonare nucleofil

- Atacul serinei deprotonate

- Hidroliza legturii Zn1 - OR
- Zn2 si Ser menin ionul fosfat n centrul activ

- H2O "activat" de Zn1 (deprotonat)

- Atac nucleofil al hidroxidului asupra fosforului

- protonarea Ser
- eliminarea restului fosfat (HPO42-)
- eliberarea centrului activ

Proteine cu degete de Zinc

O serie de 3 degete de zinc ai factorului SP1

Domeniul de legtur la ADN a unui receptor nuclear

Rol cheie n transcripia ADN ARN