Protocol EPI Info

Leonard Mada
Catedra de Informatica Medicala, UMFT

17 Octombrie 2008

Programul EPI INFO

EPI Info este un program utilizat deseori in prelucrarea datelor medicale.

INTRODUCERE
Acest program se poate utiliza pentru:
achizitionarea si stocarea datelor medicale
prelucrarea ulteriora a acestor date
Programul EPI Info este distribuit liber si poate fi descarat de pe Internet de la
adresa: http://www.cdc.gov/epiinfo/. Nu trebuie sa memorati aceasta adresa, puteti
oricand sa folositi un motor de cautare (de ex. GOOGLE).
EPI Info exista in doua versiuni majore:
i.)
o versiune pentru sistemul de operare MS-DOS cu o interfata grafica
invechita
ii.) si o versiune pentru sistemul de operare MS Windows.
Aceasta ultima versiune are o interfata grafica cu meniuri si ferestre adaptata
timpului actual. Vom folosi aceasta ultima varianta, versiunea EPI Info 3.4.3.
[A nu se confunda cu versiunea veche care este numerotata EPI Info 6.]
Programul EPI Info este folosit des in studii epidemiologice, in special in cele
axate pe boli infectioase. Acest fapt este remarcat si dupa unele functii speciale
ale programului (nu vor fi dezbatute in aceasta lucrare), dar si dupa organizatiile
care au dezvoltat initial acest program: CDC (Centers for Disease Control and
Prevention) din Statele Unite (Epidemiology Program Office) impreuna cu
World Health Organisation (Global Programme on AIDS), organizatii care au
domeniul de activitate axat pe boli infectioase.
Programul este gratuit si toti utilizatorii programului sunt incurajati sa dea copii
si colegilor lor. Organizatia care a dezvoltat acest program nu isi asuma insa
responsabilitatea pentru efectele rezultate din folosirea acestui program.
1

Mod de utilizare
Cum folosim programul?
De obicei il folosim in cadrul studiilor clinice sau epidemiologice.
Care sint pasii unui studiu?
Initial trebuie sa stabilim intrebarea la care studiul nostru trebuie sa raspunda. In
functie de aceasta decidem cum va fi organizat studiul si care sunt datele ce vor
fi colectate.
Cand am decis structura datelor de care avem nevoie, cream baza de date in EPI
Info pentru a putea introduce datele culese. Dar inainte de crearea bazei de date,
cream un chestionar in care se vor introduce ulterior aceste date. Avantajele unui
chestionar sunt introducerea eficienta si in mod structurat a datelor, precum si
existenta unnui mecanism de control al acestor date.
EPI Info cuprinde mai multe programe. Cele 2 programe pe care le vom
prezenta cuprind programul de creare a formularului standardizat (MAKE
VIEW), respectiv programul de introducere propiru zisa a noilor date (ENTER
DATA), urmind ca intr-un curs ulterior sa discutam si celelalte programe si
functii mai avansate ale EPI Info (precum prelucrarea datelor).
Dupa ce ati lansat programul EPI Info 3.4.3 va fi afisat meniul principal din care
pute-ti selecta subprogramul dorit:
EPI

Meniul principal; permite accesul la celelalte componente.

MAKE VIEW
Un procesor pentru grafica si text ce permite crearea
chestionarelor (machetelor de culegere a datelor), dar poate fi utilizat si in
alte scopuri. Facilitatea numita EPIAID ofera ajutor in pregatirea
chestionarelor.
ENTER DATA
Produce fisierele de date pornind de la macheta
pregatita cu EPED si permite introducerea datelor noi. In acelasi timp
permite revizuirea datelor vechi si chiar a formatelor fisierelor dupa ce
datele au fost introduse.

Utilizarea EPI Info

Start Epi Info
Pentru a executa Epi Info sub WINDOWS, alegeti pictograma corespunzatoare
(Epi Info

), sau utilizati meniul START.

Fereastra programului va arata astfel:

Creearea unui nou proiect

Vom incepe prin a creea un nou proiect. Fiecare proiect va contine cel putin un
chestionar si o tabela in care for fi introduse ulterior datele. Prin crearea acestui
chestionar, se specifica si structura bazei de date. [Exercitiu: reamintiti-va care
sunt caracteristicile unei baze de date.]
Din meniul principal, alegeti Programs -> Make View pentru a porni programul
de creeare a chestionarelor. Puteti accesa programul si direct prin apasarea
butonului Make View din fereastra principala.
3

Pentru a creea un nou chestionar (si ca atare un nou proiect), trebuie sa alegem
in fereastra nou deschisa (cu numele de Make/Edit View) comanda New din
meniul File (File -> New).

Creati o baza de date noua in folderul C:\Users\Dim sau D:\Users\Dim. In

dialogul pentru creearea unui fisier nou, introducem numele proiectului, identic
cu numele bazei de date pe care o vom creea ulterior, de exemplu: Boli
infectioase.
Obs: extensia fisierului va fi adaugata automat de catre programul EPI Info

In continuare, programul ne interogheaza pentru a introduce numele noului

formular. Vom alege diaree pentru acest nume (nu sint necesare majuscule).
Formularul corespunde unei tabele in baza de date. Observatie: Nu sunt permise
spatii in numele chestionarului.

Crearea interfetei grafice a formularului

Printr-un click in interiorul ferestrei cu butonul din dreapta al mouse-ului vom
selecta pozitia in care se va afla noul camp. Dupa click se va deschide un nou
dialog in care vom selecta tipul de camp pentru variabila pe care vrem sa o
introducem.

Ne vom concentra initial doar pe jumatatea superioara a ferestrei de dialog:

- exista un camp Question or Prompt in care vom introduce textul sau
intrebarea care va aparea pe formularul propriu zis
- in afara acestui text trebuie sa determinam si tipul variabilei din lista Type
- precum si marimea variabilei, pe care o vom introduce in campul Size
Dupa ce apasam OK, noul camp va fi pozitionat
automat in interiorul formularului final, formular
in care se vor introduce ulterior datele.
Tipuri de variabile: Ce tipuri de variabile sunt
folosite in medicina?
Enumerati exemple de variabile medicale.
In continuare vom discuta tipurile de variabile pe baza unui exemplu.
Problema 1:
Intr-o epidemie de diaree, medicii presupun ca organismul care transmite diareea
provine din apa murdara dintr-un parau invecinat. Cei mai bolnavi par a fi copii,
dar prezenta diareei a fost semnalata si in populatia adulta. Ce date ati colecta
pentru a verifica aceste ipoteze?
5

Solutie
Enuntam initial intrebarile epidemiologice si medicale. Dorim sa aflam daca
exista o relatie cauzala intre apa din parau si diaree. De aceea vom urmari
consumul sau contactul cu aceasta sursa de apa.
In acelasi timp dorim sa verificam, daca diareea este mai severa la copii. Pentru
simplitate presupunem ca numarul de scaune este un indicator fidel al gravitatii
bolii.
Deci, datele pe care dorim sa la urmarim cuprind printre altele: 1.) variabile care
identifica pacientul, 2.) variabile care descriu contactul cu apa si 3.) variabile
care descriu severitatea bolii. Exemple sunt mentionate mai jos:

nume si prenume
data nasterii sau virsta
adresa unde locuiesc / localitatea
sexul
este folosita apa din parau drept apa potabila sau pentru gatit?
au avut copii contact cu apa (de ex se scalda in apa)
adultii au avut contact cu apa (spala rufele in apa)
care este frecventa scaunelor pe zi
numarul de cazuri de diaree in familie (persoane care au dezvoltat boala)
data aparitiei primului caz in familie

Ce tip de variabila ati alege pentru fiecare camp din lista precedenta?
Precum ati observat in lista cu tipuri de variabile, exista variabile tip text, tip
numeric (numar), tip binar (doar 2 valori posibile), tip data calendarisrica,
precum si numeroase alte tipuri utilizate in special pentru scopuri speciale.
Variabile care pot avea doar 2 valori se numesc variabile
binare: acestea pot fi reprezentate ca si o lista din care pot
fi selectate doar 2 valori posibile, sau poate fi de tip
casuta de selectat (pe engleza checkbox), pe care o
selectam prin click pe casuta:
Obs: prin click pe casuta putem selecta sau deselecta repede aceasta valoare.

Solutie:
Tipuri de campuri:
text: numele si prenumele
numerice: varsta si frecventa scaunelor per zi
binare sau checkbox: sexul masculin sau feminin, intrebari cu raspuns
DA/NU
data calendaristica: data nasterii

Dupa ce ati terminat macheta formularului, veti salva noul formular (din meniul
File -> Save).
Ce tip de variabila ati ales pentru varsta? Care sunt valori permise pentru varsta?
Validarea datelor
Varsta este o variabila numerica. Valori permise pentru varsta se afla in
intervalul 0-130 de ani, desi valori peste 100 sint foarte rare. Pentru a minimiza
erorile de introducere a datelor, dorim sa verificam automat varsta introdusa.
Vom permite doar 3 cifre pentru varsta. Formatul numarului se specifica prin
folosirea semnului # pentru fiecare cifra, de exemplu: ### pentru un numar cu 3
cifre sau ##.## pentru a specifica un numar cu 2 zecimale.
7

Exista dezavantaje in aceasta reprezentare a varstei? Ce solutie propuneti?

Validare avansta: vom introduce o conditie de validare care permite introducerea
doar a unei valori intre 0 si 133. Vom folosi comanda Check Code din Meniul
View (View -> Check code). Fereastra care se deschide contine 3 zone de lucru:
- in stanga o zona cu anumite comenzi specifice (vor fi afisate dupa
selectarea variabilei)
- in partea de sus, zona in care selectam operatia de validare
- si zona inferioara in care se editeaza codul de validare
Din lista Choose field alegem campul de pe formular care trebuie validat, in
cazul curent acesta este Varsta. Dorim ca regula de validare sa fie testata dupa ce
a fost introdusa o valoare, in consecinta selectam optiunea After din lista de
optiuni Before or After.

In continuare vom stabili regula de validare. Dupa selectarea variabilei Varsta, in

aria functionala din stanga ferestrei vor fi afisate comenzile specifice de
validare. Selectam comanda IF care testeaza o conditie (in limba engleza IF =
daca). Scopul validarii este sa atentionam persoana care introduce datele, ca a
fost introdusa o valoare neplauzibila pentru Varsta. In acelasi timp dorim sa
prevenim salvarea acestor valori eronate, si ca atare vom restrictiona iesirea din
acest camp.
Se deschide automat o noua fereastra in care vom introduce:
- din lista de variabile selectam Varsta
- aceasta variabila va fi automat copiata si in campul If condition
- completam campul If condition cu: Varsta > 133
- daca Varsta este mai mare de 133 ani, atunci vor fi executate comenzile
din portiunea THEN a ferestrei
8

introducem in cimpul THEN valoarea 1 (vom schimba aceasta valoare

intr-o etapa ulterioare, punand instructiunile propriu zise) si apasati OK
in portiunea inferioara a ferestrei apar urmatoarele comenzi:
IF Varsta > 133 THEN
1
END

dorim sa afisam un mesaj de atentionare daca s-a introdus o valoare

eronata: stergeti numarul 1, si selectati comanda Dialog
se va afisa o noua fereastra, in care precizam titlul mesajului (de ex.
Eroare Varsta si textul detaliat al mesajului de atentionare)

selectati comanda nou afisata si cu CUT/PASTE mutati aceasta comanda

in interiorul conditiei de validare
la sfirsitul acestei operatii, instructiunile vor arata astfel:
IF Varsta > 133 THEN
DIALOG "Ati introdus o valoare gresita pentru Varsta" TITLETEXT="Eroare Varsta"
END

in continuare dorim sa prevenim parasirea campului, daca valoarea nu a

fost corectata
selectati comanda Goto iar in dialogul care se deschide, selectati
variabila Varsta
mutati noua instructiune in interiorul conditiei, dupa comanda DIALOG
IF Varsta > 133 THEN
DIALOG "Ati introdus o valoare gresita pentru Varsta" TITLETEXT="Eroare Varsta"
GOTO Varsta
END

Salvati conditiile de validare (buton SAVE) si iesiti din programul Check code
printr-un click pe butonul OK.
Introducerea datelor
Dupa salvarea formularului, putem trece la introducerea
propriu zisa a datelor. In meniul File selectam Enter
Dataiar in dialogul nou afisat vom face click pe OK.

Se va dechide noul formular pe care l-ati creat si puteti incepe introducerea unui
set de date.
Problema 2:
Introduceti 5 seturi complete de date, dupa care salvati noua baza de date.
Incercati sa introduceti o varsta de 150 ani. Dupa introducerea celor 5
inregistrari, reveniti la prima inregistrare si schimbati varsta introduceti 8 ani.
Incercati sa salvati, iar apoi sa introduceti inca o inregistrare noua (a sasea
inregistrare). Stergeti ultima inregistrare.
10

Introduceti inca 2 inregistrari, una dintre ele avind varsta de 8 ani, apoi cautati
persoanele cu varsta de 8 ani si afisati toate aceste persoane. In prezenta cadrului
didactic veti selecta una din aceste persoane si veti corecta numele.
Timpul ramas este acordat discutarii tipurilor de studii clinice.
CONCLUZII
In decursul acestei ore v-ati familiarizat cu etapele unui studiu epidemiologic si
cu programul EPI Info pentru MS Windows:
- ati creat un chestionar in care pot fi introduse date
- ati invatat tipuri de campuri/variabile
- ati validat varsta
- ati creat o noua baza de date si ati introdus 5 seturi de valori in baza de
date.

11