Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
ENZIME
Enzimele sunt compui macromoleculari de natur proteic, produi i
prezeni numai n organismele vii, cu rol de biocatalizatori ai tuturor
transformrilor biochimice caracteristice metabolismului.
Necesitile plastice i energetice ale organismelor vii sunt acoperite, pe
de o parte, din substanele nutritive, relativ stabile chimic, iar pe de alt parte
de o serie de reacii de ardere la care particip oxigenul. Apariia i evoluia
fiinelor vii organizate a fost nsoit de selecionarea i perfecionarea unor
mecanisme capabile s asigure o vitez mare de desfurare a proceselor
biochimice, n condiii de activitate relativ menajate (soluii apoase, temperaturi
joase, mediu neutru etc.). Aceast problem, a fost rezolvat n decursul
evoluiei, prin apariia catalizatorilor biologici care sunt enzimele.
Enzimele au rol esenial n biosinteza i biodegradarea substanelor din
materia vie. In lipsa enzimelor, majoritatea reaciilor chimice din organism nu sar putea produce i deci nu ar mai exista procese metabolice i nici fenomene
de via.
Bogate n enzime sunt plantulele, frunzele tinere, esuturile meristematice,
seminele n stare de germinaie, fructele. In general, plantele tinere au un
coninut mai ridicat de enzime dect plantele adulte. Activitatea catalitic a
enzimelor din organismele n cretere este mai mare dect a celor din
organismele adulte.
Dup locul unde acioneaz, se pot evidenia:
endoenzime (enzime intracelulare);
exoenzime (enzime extracelulare).
Endoenzimele, acioneaz n celulele n care s-au sintetizat. Ele sunt
lioenzime (legate mai slab n celul) i desmoenzime (legate mai puternic n
celule).
Exoenzimele, dup etapa de formare n celule, sunt eliminate n lichidele
din organism, unde i exercit activitatea catalitic. Astfel, acioneaz de
exemplu, enzimele din lichidele interstiiale, din diferite caviti, din seva
elaborat etc.
Substana asupra creia acioneaz enzimele se numete substrat.
6.1. STRUCTURA CHIMIC GENERAL A ENZIMELOR
Enzimele se pot clasifica, din punct de vedere chimic n dou clase:
enzime monocomponente (holoproteice);
Elemente de biochimie
enzime bicomponente.
a) Enzimele monocomponente (holoproteice, proteine biocatalitice) sunt
constituite numai din proteine. Aciunea lor biocatalitic se datoreaz anumitor
fragmente din catena polipeptidic, care includ grupe funcionale componente
ale catenelor laterale ale aminoacizilor (-OH, -NH2, -SH, -COOH etc.),
constituind centrul activ sau situsul catalitic. Prin acest centru activ enzima
fixeaz substratul (l recunoate) sub forma unui complex enzim-substrat,
simbolizat E-S, i biocatalizeaz transformarea substratului.
Pentru recunoaterea i formarea complexului E-S, geometria centrului
activ trebuie s fie complementar cu cea a substratului. Blocarea sau
inactivarea centrului activ (de exemplu denaturarea proteinei) conduce la
pierderea activitii catalitice a enzimei holoproteice. In schimb, denaturarea
unei pri a proteinei, care nu cuprinde centrul activ, nu modific activitatea
catalitic a enzimei.
b) Enzimele bicomponente (heteroproteice) sunt constituite din:
componenta proteic (apoenzim, apoferment), care determin
specificitatea enzimei (o anumit secven a aminoacizior prin care enzima
recunoate substratul i l fixeaz), este caracterizat prin mas molecular
mare, termolabilitate etc.;
componenta neproteic (prostetic, coenzim, cofactor), care determin
mecanismul i viteza reaciei enzimatice poate fi: o vitamin, un hormon, un
colorant, nucleotide, metale. Ea este caracterizat prin mas molecular mic,
termostabilitate.
n majoritatea cazurilor, aciunea catalitic a enzimelor se manifest
numai n prezena unor substane speciale, denumite cofactori, care se
clasific n trei grupe:
coenzime sau cofermeni specifici, sunt substane organice cu mas
molecular mic, termostabile i care dializeaz uor din soluiile enzimei.
Coenzimele se caracterizeaz prin nsuirea lor de a reaciona reversibil cu
proteina care intr n structura enzimei (apoenzima sau apofermentul);
gruprile prostetice, substane combinate mult mai strns cu apoenzima,
se disociaz greu i, n general, rmn fixate pe o singur apoenzim;
activatorii, denumii uneori i cofactori anorganici, sunt substane
nespecifice (diferite metale, ageni reductori etc.), care mediaz trecerea
enzimei ntr-o stare catalitic activ.
Este greu de precizat o demarcaie clar ntre cele trei grupe de cofactori,
clasificai dup natura i raportul lor fa de apoenzim. Multe dintre coenzime
i grupri prostetice sunt de fapt derivai ai vitaminelor hidrosolubile. O mare
parte dintre coenzime i grupri prostetice identificate n componena unor
enzime sunt nucleotide sau derivai ai acestora. Dei n cazul enzimelor
bicomponente, componenta care particip efectiv la realizarea procesului
Elemente de biochimie
Elemente de biochimie
ES
EP ;
EP
P+E
k1
k -1
ES
k2
k -2
PE
k3
k -3
P+E
Elemente de biochimie
k1
ES
k2
P+E
k-1
Elemente de biochimie
v max [S]
K M [S]
Elemente de biochimie
v
mol/s
Temperatura optim
40
Temperatura 0C
v
mol/s
Interval de pH optim
pH
Fig. 6.2. Influena valorii pH asupra activitii
enzimatice
Elemente de biochimie
este cuprins ntre 1,4-1,5; pH-ul optim al tripsinei din pancreas ntre 7,8-8,7;
al amilazei din mal ntre 4,7-5,2 etc. Majoritatea enzimelor vegetale au un
pH optim cuprins ntre 5,3-7,6. n afara limitelor de pH stabilite, enzimele
devin inactive. Valori prea mari ale pH-ului (alcalinitate mrit) sau prea mici
(aciditate mrit), afecteaz activitatea enzimatic prin denaturarea prii
proteice sau perturbarea echilibrelor de disociere ale grupelor funcionale
ale centrului activ al enzimei, ca i modificarea geometriei centrilor activi.
Valoarea pH-ului optim este influenat de temperatur, de ionii din soluie,
de natura i de concentraia substratului, de originea enzimei, de factorii
biologici etc.
e) Influena activatorilor enzimatici
Activatorii sunt compui chimici care mresc activitatea enzimelor (intervin
n mecanismul aciunii enzimatice), fie prin stimularea direct a acestora, fie
prin ndeprtarea unor inhibitori din sistem. Activatorii se clasific dup efectul
produs n:
Activatori care acioneaz prin deblocarea centrilor activi din molecula
enzimelor. Unele enzime, denumite proenzime, sunt secretate sub form
inactiv, cu gruprile active blocate (mascate) de polipeptide sau de alte
substane. Proenzimele se transform n enzime active sub influena unor
enzime kinaze, care ndeprteaz substanele inhibitoare.
Activatori care acioneaz asupra enzimei prin nlturarea din sistem a
unor inhibitori ai enzimei. Substanele, adugate unei soluii enzimatice pentru
protejarea enzimei mpotriva factorilor care o inactiveaz sau o denatureaz,
se numesc protectori. De exemplu, proteinele activeaz ureaza prin captarea
ionilor inhibitori din sistem (de exemplu, ionul cianur (CN ) nltur efectul
inhibitor al Cu2+ asupra ureeazei, prin formarea cianurii complexe de cupru,
stabil).
Activatori care sunt componente ale enzimelor sau care stimuleaz
direct activitatea acestora. Sunt activatori specifici pentru anumite enzime o
serie de cationi metalici i anioni, astfel, fosforilaza este activat de Mg 2+,
fosfoglucomutaza de Mg2+, i de Mn2+, fosfataza de Ca2+ i de Mn2+, amilaza
salivar este activ numai n prezena ionilor de clor, proteazele vegetale sunt
activate de glutationul redus etc.
f) Inhibitori ai enzimelor
Inhibitorii sunt substane care acionnd asupra enzimelor, influeneaz
negativ desfurarea activitii enzimatice pn la anularea ei, reversibil sau
ireversibil.
Studiul inhibitorilor furnizeaz informaii utile asupra specificitii de
substrat, tipului de grupe funcionale i mecanismului de aciune enzimatic.
Elemente de biochimie
10
Elemente de biochimie
Moscova, 1961).
Sistemul de clasificare i numerotare a enzimelor, precum i noua
nomenclatur sistematic se bazeaz pe reacia chimic catalizat de enzim,
unicul criteriu care permite deosebirea enzimelor ntre ele. n acest sistem
enzimele sunt mprite n clase, dup tipul reaciei catalizate, iar acestea sunt
mprite n subclase care definesc mai exact caracterul reaciei enzimatice
respective. Numele fiecrei enzime se definete printr-un termen alctuit din
trei pri:
denumirea substratului asupra cruia acioneaz enzima;
denumirea tipului de reacie catalizat de enzim;
sufixul aza.
De exemplu, enzima care catalizeaz dehidrogenarea acidului lactic se
numete lactatdehidrogenaza, cea care catalizeaz decarboxilarea acidului
piruvic se numete piruvatdecarboxilaza. Denumirea transferazelor se
formeaz din prefixul trans, numele substratului i sufixul aza (transaminaze,
transmetilaze, transfosfataze etc.).
Conform acestui sistem zecimal de clasificare, fiecare enzim este
caracterizat printr-un cod format din patru cifre.
Enzimele cunoscute n prezent sunt grupate n 6 clase principale:
1. Oxidoreductaze
2. Transferaze
3. Hidrolaze
4. Liaze
5. Izomeraze
6. Ligaze (Sintetaze).
Prima cifr precizeaz clasa din care face parte enzima.
A doua cifr a codului definete subclasa, furniznd informaii asupra
tipului de grup funcional, respectiv asupra tipului de legtur chimic
implicat n reacie.
Cifra a treia precizeaz subdiviziunile din cadrul unei subclase (de
exemplu, natura unei grupe funcionale transferate, natura acceptorului etc.).
Cifra a patra din cod reprezint numrul de ordine al enzimei n
subdiviziunea din interiorul subclasei. De exemplu: enzima ATP: D-fructozo-6fosfotransferaza, are cifrul 2.7.1.4. dup care se identific drept o transferaz
(2, clasa 2), care transfer reziduul fosfat (cifra 7, subclasa 7), la gruparea
alcoolic (cifra1, subdiviziunea 1 a subclasei 7) i are numrul de ordine 4.
Pentru unele dintre enzime se pstreaz denumirile vechi, conferite
nainte de stabilirea noii nomenclaturi (pepsina, tripsina, papaina, emulsina,
chimozina etc.).
Elemente de biochimie
11
12
Elemente de biochimie
pirofosforic i adenin.
NADP-ul are n plus fa de NAD un rest de acid fosforic la atomul C 2 al
ribozei legate de adenin.
O
NH2
C NH2
N
CH2 O P P O CH2
+2H
-2H
O
NAD+
NH2
C NH2
N
CH2 O P P O CH2
O
NADH
H2
substrat
donor
forma
redus
NADH +
coenzima
forma
redus
NAD+
coenzima
forma
oxidat
H+
S'
substrat
acceptor
forma
oxidat
substrat
donor
forma
oxidat
NADH
H+
coenzima
forma
redus
NAD+ +
coenzima
forma
oxidat
S'
H2
substrat
acceptor
forma
redus
Elemente de biochimie
13
H2
C
H2
C
+2 H+ + 2 e-
NAD+
- 2H - 2 e-
NADH + H+
N + H+
NAD + ATP
NADP + ADP
14
Elemente de biochimie
O
H3C
H3C
NH
N
CH2
HC OH
HC OH
HC OH O
H2C O
P OH
OH
H3C
NH2
N
NH
N
CH2
CH
CH2
HC OH
HC OH
HC OH
HC OH
HC OH O
H2C O
H3C
H3C
H
N
NH2
N
NH
N
H
N
N
CH
+ 2H
HC OH
HC OH
- 2H
HC OH
HC OH
HC OH O
HC
P O P O CH2
OH
H2C O
OH
HC
P O P O CH2
OH
OH
FADH2
coenzima
forma
redus
O2
substrat
acceptor
H2
FAD
coenzima
forma
oxidat
substrat
donor
forma
oxidat
FADH2
coenzima
forma
redus
FAD + H2O2
coenzima
forma
oxidat
catalaza
H2O + 1/2 O2
Elemente de biochimie
15
azot N1 i N10. Forma oxidat a flavinenzimelor este colorat, iar forma redus
este incolor.
O
H3C
H3C
O
NH
+2 H
O
-2 H
H3C
H
N
H3C
NH
N
H
Dintre flavinenzimele cu FAD se pot meniona: xantinoxidaza, Daminoacidoxidaza, succindehidrogenaza, glucozoxidaza, aldehidoxidaza etc.
Glucozoxidaza acioneaz asupra substratului glucoz, pe care o
oxideaz la acid gluconic:
RCOOH + FADH + H+
RCH=O + FAD
FADH + H+ + O2
FAD + H2O + O2
Aldehidoxidaza acioneaz asupra acetaldehidei, pe care o oxideaz la
acid acetic:
CH3CH=O + FAD + H2O
CH3COOH + FADH + H+
FADH + H+ + O2
FAD + H2O + O2
6.5.1.2. Transelectronaze
Transelectronazele sunt enzime care catalizeaz reacii de oxidoreducere care decurg prin transfer de electroni de pe un donor pe un acceptor.
Dac donorul este:
Oxigenul, enzimele sunt transelectronaze aerobe;
Nu este oxigenul, enzimele sunt transelectronaze anaerobe.
Transelectronazele sunt reprezentate prin cromoproteidele citocromi,
constituii dintr-o parte proteic (apoenzima cu caracter bazic) i o coenzim
cu structur feriporfirinic (citocromul propriu-zis).
Transportul de electroni se realizeaz prin modificarea cifrei de oxidare a
fierului:
Fe
2+
-e
+e
Fe
3+
16
Elemente de biochimie
AOOH
sau
A + O2
AO2
H2O + SO + A
sau
AH2 + 1/2 O2
A + H2O
Reaciile au loc n prezena unui donor de hidrogen (AH2) care poate fi:
NADH + H+, NADPH + H+, FADH2 etc. Cele mai importante dintre enzimele
hidroxilaze sunt: fenilalaninhidroxilaza, lizinhidroxilaza, steroidhidroxilaza etc.
c) Oxidazele transportoare de electroni conin n molecul ioni metalici
(Cu, Fe) i catalizeaz reacia de oxidare a substratului cu ajutorul oxigenului
atomic foarte reactiv.
Enzimele care conin atomi de cupru se numesc cuproxidaze, cele care
conin atomi de fier se numesc feroxidaze. Dintre cuproxidaze fac parte
Elemente de biochimie
17
2 H2O + A
AO + H2O
H2O + 1/2 O2