PROTEINE

PARTEA II-A

Structura secundar, teriar i

cuternar a proteinelor

 Structura secundar - organizarea spatiala a catenei

polipeptidice principale alctuite din atomii participani la
legturile amidice (fara considerarea catenelor laterale)
realizat si stabilizat prin legturi de hidrogen intra- i
intercatenare intre grupele NH si CO ale legturilor peptidice
reprezentat prin doua conformaii (caracteristice proteinelor
fibrilare):
a)elice (- helix)
b)foi pliate sau conformaie (-pleated sheet)
* In plus, conformatie tip colagen

 Conformatia elice
* conformatie elicoidala rezultata prin spiralarea catre
dreapta a catenei polipeptidice; pasul elicei = 5,4; fiecare pas
alcatuit din 3,6 aminoacizi; o spira alcatuita din 4,6 aminoacizi
* conformaie contractat
meninut prin legturi de
hidrogen intracatenare ntre
grupa carbonil a unei legturi
amidice i grupa amino a altei
legturi amidice separate de
prima prin 3 aminoacizi

* radicalii R sunt plasai alternativ deasupra

si sub planurile legaturilor peptidice si
orientati spre exteriorul elicei;
* aminoacizii predominani: Ala, Leu, Ileu,
Phe, Met (catene laterale nepolare)
* Exemplu: -keratinele (bogate n Cys):
coarne, unghii, piele, pr, ln etc.

 Conformatia sau foi pliate (-pleated sheet):

- orientare paralel sau antiparalel
* conformatie ordonata si relaxata, stabilizata prin legaturi
de hidrogen intercatenare - catenele polipeptidice au
conformatie in zig-zag, paralele intre ele
* legaturile de hidrogen se formeaza in numar maxim,
intre grupe C=O si NH din catene diferite

* atomii de carbon purtatori ai

radicalilor sunt amplasati pe
muchia dintre doua planuri
*radicalii aminoacizilor dispusi
alternativ deasupra si sub planul
legaturilor peptidice;
*aminoacizii cei mai frecveni:
glicocolul i alanina

* Exemplu: -keratinele in firul produs de viermii de

matase, in solzii, ghearele si
ciocurile reptilelor si pasarilor

 Conformaia tip colagen

Colagenul - cea mai abundent protein prezent n
vertebrate: in piele, oase, cartilagii, tendoane, cornee, dinti,
vase de singe etc.; confer rezisten i form esuturilor
*conformatie rigida de elice tripla (triplu helix): trei catene
polipeptidice rasucite spre stinga, fiecare catena fiind
nfurat slab, spre dreapta, una n jurul celeilalte; legaturi
de hidrogen intra- si intercatenare

 conine glicocol (~30-35%), prolin (~12%), 4hidroxiprolin (~9%), alanin (~11%); secvenele de
aminoacizi cele mai frecvent ntlnite sunt Gly-Pro-X sau GlyX-Hyp
legaturi de hidrogen realizate in special de catre prolina,
dar i de grupele OH din 4-hidroxiprolina si 5-hidroxilizina

o spira din oricare elice alcatuita din 3 aminoacizi

unitatea de baza = tropocolagen; unitatile de tropocolagen

sunt asezate in sir, cap la coada, ntre ele existnd spatii;
sirurile de tropocolagen sint dispuse in manunchiuri paralele in
care capetele apar in trepte

Alte proteine fibroase

Elastina (st) - in tesutul conjunctiv; participa la
realizarea structurii arterelor si ligamentelor - flexibila si
extensibila dupa toate directiile datorita prezentei
dezmozinei care realizeaz ncruciarea lanturilor
polipeptidice; contine in proportie mare glicina, prolina, lisina
si alanina
Fibrinogenul (dr) - in serul sanguin; rol esential in
procesul de coagulare a singelui

Structura tertiara - aranjamentul spaial al ntregii catene

polipeptidice, inclusiv al catenelor laterale; indic poziia fiecrui
atom
caracteristica proteinelor globulare; un stadiu avansat de
organizare spatiala obinut prin replierea catenelor polipeptidice
ale proteinelor (combinaii ale tipurilor de structuri secundare)

 conformaie mai compact fiind caracterizat de alternana

unor poriuni regulate i rigide cu segmente neorganizate si
flexibile

Legaturile intercatenare ce stabilizeaza structurile tertiare

sunt:
* interactiuni hidrofobe intre radicalii nepolari - atractia
mutuala a gruparilor nepolare => direcionarea radicalilor
hidrofobi din catenele laterale ctre interiorul moleculei,
excluznd moleculele de ap din regiunea intern hidrofoba
astfel formata
* legaturi de hidrogen nepeptidice intre grupe OH si COOH
i peptidice intre diferite segmente
pliate ale moleculei
* interactii ionice (puni de sare)
intre grupari polare NH3+ din
aminoacizi diaminomonocarboxilici
si COO- din aminoacizi
monoaminodicarboxilici
* legaturi covalente: punti de
sulf intre radicalii de cisteina

 structura tertiara - foarte sensibila la actiunea factorilor fizici

si chimici => denaturarea proteinelor i pierderea proprietatilor
biologice

 Structura cuaternara
caracteristica unor proteine cu M > 105 Da, constituite din mai
multe catene polipeptidice (subuniti sau protomeri) =>
oligomeri
* stabilizat prin interactiuni de natura fizic (interaciuni
electrostatice si legaturi de hidrogen) localizate la suprafata
fiecarei catene polipeptidice

Exemplu:
hemoglobina
tetramer alcatuit din 2 catene
si
2catene
;
enzimele
alosterice (v. mai departe)

Proteine globulare

 Caracteristici generale:
forma sferica sau ovala
conformatia este mult mai complexa decit a proteinelor
fibroase
au activitate biologica specifica: enzime; rol in apararea
organismelor impotriva bolilor (imunoglobuline), transporta
diverse substante ca oxigen, acizi grasi, lipide, hormoni,
medicamente, xenobiotice etc.
exemple:
- albumine
- globuline

Albuminele
origine vegetala si animala; cele de origine animala sint
raspindite in citoplasma si in lichidele biologice (spre ex.
plasma sanguina); in lapte, oua etc.
in compozitia lor intra toti aminoacizii cu exceptia
glicocolului
albuminele plasmatice cca 60% din proteinele
plasmatice

Globulinele
serumglobulinele - cca 36%
din proteinele plasmatice; mai
multe tipuri: , ,
si globulinele sint
sintetizate in ficat si ajuta la
transportul lipidelor si al
vitaminelor liposolubile; sint
produse in tesuturile limfatice si
functioneaza ca anticorpi de
imunitate

Cromoproteine porfirinice : mioglobina si hemoglobina

componenta prostetica este hemul, derivat substituit al
porfinei

Porfina

Hemul
* alcatuit dintr-o molecula de protoporfirina substituit
cu radicali metil, vinil, propionil; in centru se afla Fe2+
* fierul este legat de atomii de azot pirolici prin doua
legaturi covalente si doua coordinative (coplanare si
perpendiculare doua pe celelalte doua)
H 2C

CH

CH3
CH

H 3C
N
N

2+

Fe

N
CH3

H 3C

_
OOC

CH2

CH2

H 2C
H 2C

Hem

CH2

_
COO

H
N

* asamblarea hemului cu globina:

O
C

CH

H 2C

- atomul de fier se leaga direct de un

radical de histidina din molecula globinei
printr-o legatura coordinativa si indirect
de un alt rest de histidina prin
intermediul unei molecule de apa care
formeaza o legatura coordinativa cu
fierul si o legatura de hidrogen cu
histidina
- intre gruparile COO- ale substituentilor
din hem si grupele NH3+ din aminoacizii
bazici (lisina) ai globinei - legaturi ionice
- intre radicalii vinil si metil ai hemului si
radicalii nepolari din catenele unor
aminoacizi
ai
globinei
(triptofan,
fenilalanina) - forte van der Waals

NH
N

H 2C
CH

CH3

H 3C

CH CH2
N

2+

Fe

N
CH3

H 3C
H 2C

OOC

N
H

CH

COO

NH3
CH2

CH2
CH2

H 2C

NH3
N

CH2

CH2

CH

CH

C
O

 Mioglobina
cromoproteina de culoare rosie din muschi
rol de a stoca si difuza oxigenul in tesutul muscular
componenta proteica
formata dintr-un singur
lant polipeptidic alcatuit
din 153 aminoacizi; 75%
din catena este -helix
(8 segmente de elice
unite prin portiuni
neelicoidale constituite
din Pro, Ser si Ile)

 o structura compacta in care catenele laterale

nepolare ale aminoacizilor sint orientate spre interior;
hemul este plasat intr-un buzunar captusit cu resturi de
aminoacizi nepolari - fixat prin forte hidrofobe; singurele
resturi polare din interiorul moleculei sint doua resturi de
histidina legate coordinativ de ionul de fier din centrul
hemului
afinitatea mioglobinei
pentru oxigen - cca 6 ori
mai mare decit cea a
hemoglobinei => complex
disociabil
MbO2
Mb + O2

 Hemoglobina - cromoproteina de culoare rosie din hematii

rol de a transporta O2 de la plamini la tesuturi (oxihemoglobina) si CO2 de la tesuturi la plamani (carbohemoglobina)

 componenta proteica (globina) formata din 4

protomeri: 2 unitati (141 aminoacizi) si 2 unitati (146
aminoacizi); fiecare protomer are atasat un hem

H
N

Combinatia hemoglobinei
cu oxigenul oxihemoglobina

O
CH

H2C
NH

[Hb]4

4O2

fixarea
oxigenului la
prin legatura
Fe2+,
prin
moleculei de
Fe2+ era legat
de histidina
globinei)

[HbO2]4

H2C

reversibila a
hemoglobina coordinativa cu
indepartarea
apa (prin care
de al doilea rest
din molecula

CH3

CH
H3C

CH CH2
N

2+

Fe

N
N
CH3

H3C
H2C
H2C

OOC

O2

CH2
CH2
COO

 Combinatia hemoglobinei cu dioxidul de carbon =

carbohemoglobina
fixarea dioxidului de carbon la hemoglobina covalent, la o grupa amino libera a globinei => compus
disociabil de tip carbamat
Hb

NH2 +

CO2

_
Hb NH COO

H+

 Combinatia hemoglobinei cu monoxidul de carbon

carboxihemoglobina
rezulta prin legarea coordinativa a monoxidului de
carbon de catre hemoglobina
compus toxic, putin
disociabil, blocheaza functia
respiratorie a hemoglobinei
=> intoxicatii sau asfixie
(cnd 50% din hemoglobina
este blocata sub forma de
carboxihemoglobina)

 Derivati ai hemului continind Fe3+

hemine = compusi in care hemul contine ionul Fe3+; nu au
capacitatea de a lega O2:
*clorhemina sau hemina (Cl-) hemoglobina +Ac OH+NaCl, t
*hematina (OH-)
* combinatia hematinei cu globina = methemoglobina <= prin
oxidarea Fe2+ din hemoglobina cu MnO4, ClO4, nitrobenzen;
apare in urina si singe in intoxicatiile cu nitrobenzen sau alti
oxidanti