Universitatea Babe -Bolyai, Cluj-Napoca Facultatea de Biologie i Geologie Decembrie 2011

A Mitochondrial Revelation of Early Human Migrations to the Tibetan Plateau Before and After the Last Glacial Maximum
Zhendong Qin, Yajun Yang, Longli Kang, Shi Yan, Kelly Cho, Xiaoyun Cai, Yan Lu, Hongxiang Zheng, Dongchen Zhu, Dongmei Fei, Shilin Li,1Li Jin, Hui Li*, and The Genographic Consortium

Lazar Andrei, anul I, BM

Introducere
SNPs Single Nucleotide Polymorphisms
Cu ajutorul SNPs-urilor putem determina haplotipurile O colectie de SNP-uri

Secventa complecta a ADNmt

Datorita mostenirii materne a ADNmt putem determina descedentele haplogrupurilor si putem testa existenta unui ceas molecular

OBIECTIV:

Clarificarea perioadei in care au avut loc intrarile populatiilor moderne in Platoul Tibetan

Materiale si metode
Extractia ADN, metoda Silica/GuSCN:  562 de probe de la locuitori anonimi si neinruditi intre ei  32 de probe alese pentru secventializarea intregului ADNmt Amplificarea segmentului hipervariabil I (HVS-I)  amorse folosite: L15974 si H16488 Purificare

Secventializarea a fost efectuata utilizand Kitul BigDye Terminator Cycle sequencing si analizatorul genetic ABI 3130XL

Marcarea SNP-urilor din regiunea codificatoare

Materiale si metode
Secventializarea intregului ADNmt

Ampificarea a 11 fragmente ce se suprapun

 amorsele trebuie sa se potriveasca cu temperaturile de aliniere

Purificarea utilizand Kitul QIAquick

Secventializarea a fost efectuata utilizand Kitul BigDye Terminator Cycle sequencing si analizatorul genetic ABI 3130XL

Marcarea mutatiilor in raport cu rCRS

Rezultate

 MDS plot-ul a aratat un tipar al populatiilor platoului in ceea ce priveste locatia geografica.

 Cele mai multe populatii tibetane locuiesc in partea sudica a platoului si au fost grupate la dreapta cadranului superior.

Rezultate

112 populatii au fost reprezentate grafic folosind primele doua PCs (principal-component analysis)

PCs-acestea reflecta distributia geografica a populatiilor

Afinitatea puternica intre tibetani si populatiile asiatice a fst reflectata de analiza MDS-plot

Rezultate (arbore filogenetic a haplogrupului A)

Rezultate
Median-joining network analysis a haplogrupului nou identificat A10

Network analysis a HVS-I evidentiaza un tipar in forma de stea

Expansiunea populatiei

Estimarea timpului
M62 Vechi si distributie restransa geografic pre-LGM A10, C4d si Mi3b Tibeto-Burman & populatii in care se gasesc tibetani Desi majoritatea metodelor arata vechimea haplogrupurilor A10, C4d si Mi3b nu putem exclude aparenta acestor linii post-LGM. Aceste linii genetice pot fi considerate doar presupuse linii pre-LGM Frecventa redusa

Va multumesc pentru atentie!!!