Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Bioch Sem 2 Curs
Bioch Sem 2 Curs
Vmax/Km=ct
Daca V=Vmax/2
Vmax/2= Vmax[S]/([S]+Km)
2[S]=S+Km
[S]=Km
Atunci cand viteza instantanee este jumatate din v max de desfasurare a
procesului catalitic, conc substratului=const Micaelis-Menten(Km). Se num
afinitatea enzimei in raport cu substratul si este cu atat mai mare cu cat valoarea
este mai mica si per verso. Deoarece cu cresterea Km este necesara o cantitate
mai mare de substrat pt ca v procesului catalitic sa fie jumatate din v max de
desfasurare a catalizei. Deoarece Km = conc substratului, Km are unitati de
masura mol/L.
Spre deosebire de enzimele michaeliene, enzimele nemichaeliene,
enzimele alosterice prezinta variatia v (activitate enzimatica) in raport cu conc
substratului sub forma unei curbe sigmoidale si nu hiperbola echilatera. In cazul
enzimelor nemichaeliene la conc relativ mici de substrat cresterea v de reactie
este slaba datorita accesului dificil al substratului la nivelul centrului activ.
Odata patrunsa, o molecula de substrat la nivelul centrului activ se produce o
modificare prin deschidere a ghemului statistic care faciliteaza patrunderea
celorlalte molecule de substrat si in acest mod se inregistreaza o crestere
accentuata a v de reactie, iar in final cand intreaga enzima este angrenata sub
forma de complex ES se obt v max de desfasurare a procesului.
In reprezentarea de tip Michaelis-Menten se obtin 2 parametrii
fundamentali cinetici Vmax si Km. Din aceasta cauza s-a trecut la obtinerea unei
ecuatii cu reprezentare liniara prin inversarea ecuatiei Michaelis-Menten.
1/V=(Km+[S])/Vmax[S]
1/V=Km/Vmax * 1/[S] +1/Vmax
Expresia obtinuta este ecuatia Lineweaver-Burk in care inversul vitezei variaza
in raport cu inversul conc substratului dupa o linie/dreapta care nu trece prin
origine. (vezi slide)
Prin linearizarea ec Michaelis-Menten se poate determina f usor parametrul
Vmax prin interceptia cu ordonata y si rsp constanta Michaelis-Menten prin
interceptia cu abscisa ox. (la laborator) Aceasta reprezentare este acceptata ca o
simplificare in caracterizarea proceselor catalitice, deoarece parametrii cinetici
6
fundamentali pot fi determinati fie direct fie indirect rapid. Vmax de desfasurare
a unui proces catalitic este dep de conc enzimei [E] cu care = d.p. prin factorul
k2. Constanta k2 se def ca fiind constanta catalitica si reprez v reactiei catalizate
la conc unitara a enzimei. Vmax=k2[E]
Din aceste considerente k2 constanta de v are unit de masura 1/s, iar inversul
constantei catalitice 1/k2 are unit de masura s si se numeste ciclu catalitic, adica
timpul necesar enzimei pt a cataliza transformarea unui mol de substrat in
produs de reactie dupa care aceasta este capabila sa reia ciclul catalitic. Din
aceste considerente pt un sistem catalitic dat parametrul obt prin raportul dintre
constanta de v k2 si constanta Michaelis-Menten Km este fundamental si trebuie
sa aiba valori cat mai mari.
Km mic = afinitate mare
Km mare = ciclu catalitic mic
Inhibitia
In procesul de inhibare, anumite substante actioneaza prin diminuarea/anihilarea
activitatii catalitice a enzimei.
Inhibitia ireversibila/otravirea:
Compusii actioneaza prin intermediul legaturilor covalente, necovalente f
puternice asupra enzimei.
Disocierea inhibitorului se realizeaza cu greutate/uneori este ireversibila.
= data de sistemele nebiologice:
- metale grele (Hg, Cu, Ag)
- agenti alchilanti
Pesticide organofosforice si carbamice care actioneaza cu hidroxilul serinic din
centrul activ al serinproteazelor (colinesteraza,chimotripsina)
a. Inhibitia ireversibila (otravirea)
Allopurinolul
b. Inhibitia reversibila
Inhibitia competitiva (de asociere exclusiva)
Inhibitorul are structura asemanatoare substratului.
Inhibitorul se poate lega la niv centrului activ, oferind o competitie
substratului initial (concentratia este factorul determinant).
Viteza maxima a procesului nu se modifica, se modifica insa constanta
Michaelis-Menten.
Inhibitorul competitiv diminueaza activitatea enzimatica datorita interactiei
in genere, cu aceleasi grupari functionale din centrul catalitic la care se
fixeaza si substratul in cursul reactiei enzimatice.
V nu se modifica, afinitatea enzimei fata de substrat scade in prezenta
=inhibitorului competitiv (Km> Km).
Inhibitia necompetitiva
- Nu mai au structuri asemanatoare substratul cu inhibitorul
- Legarea inhibitorului se realiz la alt niv decat centrul activ
In acest caz, constanta Michaelis-Menten e constanta (nu se modifica fata de
cazul neinhibat), insa se modifica viteza maxima a procesului.
Pt reprezentarea M-M
Alti factori:
- Ioni din mediu
- Detergenti
- Potentialul redox al mediului
- Presiunea
- Radiatiile (UV, X, beta)
(vezi factorii chaotropici de la structura tertiara a proteinelor)
Mecanisme catalitice
Dupa modul de actiune al enzimei asupra substratului se cunosc mai multe
ipoteze.
1. Ipoteza tiparului rigid cheie-broasca
Substratul se potriveste perfect centrului activ enzimatic cu care
interactioneaza asa cum o cheie deschide un lacat/broasca. Se formeaza
complexul E-S si se formeaza unul/mai multe produse de reactie.
2. Ipoteza complexului E-S cu participarea coenzimei
Unele enzime necesita pt a actiona catalitic si prezenta unor coenzime
(cofactori de natura organica).
Se formeaza complexul Enzima-Coenzima-Substrat care determina
ulterior refacerea enzimei si obtinerea coenzimei modificate si rsp a
produsului de reactie.
Ex. La cazul dehidrogenazei necesita coenzime nicotinamidice / flavinice
NAD+
Nicotinamidadenindinucleotidic => NADH
+
NADP
Nicotinamidadenindinucleotidfosfatul=>NADPH
FAD
Flavinadenindinucleotidic => FADH2
FMN
Flavinmononucleotidic => FMNH2
Toate acestea sunt forma oxidata.
3. Ipoteza modificarilor conformationale
Se aplica atunci cand la nivelul centrului activ si la nivelul substratului
exista grupari cu sarcina electrica totala / partiala (polarizate).
Numeroase reactii se produc in cataliza acido-bazica.
Tine cont de taria acidului/bazei implicate.
Grupari functionale:
Carboxil carboxilat
8
Fenol fenoxid
Tiol sulfat
Mecanism prin cataliza covalenta
- Se explica prin aparitia unor legaturi covalente intre enzima si substrat
- Ex. Decarboxilarea acetoacetatului
Alte mecanisme:
- Prin intermediul ionilor metalici
La aceasta cataliza exista 2 aspecte:
- Metaloenzimele contin ioni ai metalelor tranzitionale in constituenta
enzimei
- Enzime metalactivate in prezenta anumitor ioni metalici din gr 1 sau 2
apar procese de favorizare/activare a reactiei enzimatice (ex. Na, K, Ca, Mg)
Enzima multisubstrat
= acea enzima care catalizeaza transformari ale mai multor substraturi
Ex. Oxidoreductaze, transferaze, hidrolaze, izomeraze
In cataliza aceasta exista 2 mecanisme:
- Mecanisme secventiale presupun eliberarea produsilor de reactie dupa ce
enzima a actionat asupra tuturor substraturilor
- Mecanisme ping-pong produsii de reactie apar in timpul desfasurarii
reactiilor dupa actiunea enzimelor specifice
Reglarea activitatii enzimatice
Se realizeaza tinand cont de situatia reala a sistemului biochimic, influentanduse transformarea substratului si concentratia enzimei.
Clase de enzime
1. Oxidoreductaze
- Catalizeaza procese redox (oxidare +reducere) = transfer de electroni/protoni
- De obicei se realizeaza in prezenta unor coenzime
1.1. Dehidrogenaze = oxidoreductaze NAD /FAD dependente
Dehidrogenaze NAD+ si NADP+ dependente = enzime anaerobe
(acceptorul este altul decat forma de O)
Prin restul de nicotinamida, coenzimele NAD+ si NADP+ participa la
procese redox.
Experimental, transformarea NAD+ in NADH se poate urmari spectral in
domeniul UV: se urmareste fie scaderea in timp a semnalului la 260 nm, fie
formarea in timp a lui NADH la 340 nm (vezi slide).
Dozarea GOT principiul reactiei
9
1.2.
1.3. Transelectronaze
- Catalizeaza procese redox cu schimb de electroni
= importante in catena respiratorie (ex. Citocromul)
Cit (Fe2+) 1e<=> Cit (Fe3+) +1eHb (Fe2+) <=> MetHb(Fe3+)
1.4. Oxidaze
- Catalizeaza reactii folosind ca substrat O-ul sau peroxizii
Ex. Peroxidaze si catalaze (vezi slide)
Peroxidaze: H2O2 + 2H+ +2e- => 2H20
Catalaze: H2O2 + H2O2 => 2H20 + O2
Se clasifica in:
- Monooxigenaze
- Dioxigenaze (vezi slide)
2. Transferaze
- Catalizeaza reactii de transfer de grupari functionale de pe un substrat pe
altul
Ex. Aminotransferaze (TGO, TGP), metiltransferaze, fosfotransferaze,
aciltransferaze
(vezi slide)
GOT = glutamatoxalilacetattransaminaza / AST/ASAT = aspartattransaminaza
GPT = glutamatpiruvattransaminaza / ALT/ ALAT alaniltransaminaza
Glicoziltransferaze
Monozaharid + ATP => Monozaharid-P + ADP
Monozaharid-P +UTP => Monozaharid-UDP + PPi
Monozaharid-UDP + Monozaharid => diglicerid + UDP
10
(vezi slide)
3. Hidrolazele
Esterazele =o subclasa a hidrolazelor si au capacitatea de a cataliza
scindarea hidrolitica a legaturii esterice, cu eliberarea acidului si alcoolului
corespunzator.
Lipaze (vezi slide)
Fosfoesteraze:
- Fosfomonesteraze (vezi slide)
o Fosfataza alcalina (vezi slide)
o Fosfataza acida (vezi slide)
- Fosfodiesteraze
Glicozidaze
Amilaze
Hialuronidaze
Peptidaze
TEHNICI IMUNOCHIMICE
Def. Presupun identificarea uneia / a ambelor specii imune din probe biologice
cu rol in diagnostic. Tehnicile acestea se pot folosi si in protectia mediului si in
analiza de alimente.
Specii imunochimice
Antigen (Ag)
Anticorpi
Haptene
IgG
IgA
IgM nu poate traversa bariera placentara
IgD
11
IgE
Haptena- mici molecule organice
Anticorpi monoclonali / policlonali
Recunoasterea antigenului
Interactiile antigen-anticorp
- necov
- reversibile
- specifice
- exoterme
METODE IMUNOCHIMICE
Se clasifica in fctie de modul de analiza al interactiei Ag Ac in:
- tehnici directe
- tehnici indirecte (folosesc makeri)
(vezi slide)
Tehnici directe
Imunodifuzia
= metoda de evidentiere a uneia / a ambelor specii imune dupa o prealabila
difuzie printr-un gel
Imunodifuzia simpla (radiala, Mancini) Ids
- presupune migrarea doar a uneia dintre speciile imune printr-un gel, cea de-a
2-a fiind deja incorporata in acesta.
(vezi caiet) (vezi slide)
Imunodifuzia dubla
- presupune migrarea ambelor specii imune din gel
- daca speciile sunt specifice apare interactia Ag-Ac materializata prin
linii/arcuri de precipitare
- are avantajul ca poate exprima relatiile intre care se afla antigene vecine.
Exista 3 variante de intersectie a antigenelor vecine.
Aceste tehnici de Id dureaza 24-48 h.
Contraimunoelectroforeza
Def. se aplica pt specii imune incarcate electric / care au posibilitatea de
derivatizare prin introducerea unor grupari functionale incarcate electric. (vezi
caiet + slide)
- metoda are avantajul unui timp de lucru mai scurt decat in cazul tehnicilor de
imunodifuzie de ordinul zecilor de minute.
- metoda este calitativa si semicantitativa
12
Imunoelectroforeza
- presupune mai multe tipuri de analiza combinate :
a. modelul Grabar (vezi laborator) presupune 2 etape: electroforeza
(electromigrarea uneia dintre speciile imune) si imunodifuzia dubla , a
speciilor separate anterior fata de antispeciile corespunzatoare
Electromigrarea: Se alege experimental un pH mai mare decat toate pctele
izoelectrice ale proteinelor. Daca gelul = de Agar, acesta are impuritati care
in curent electric continuu se ionizeaza pozitiv si determina deplasarea
acestora impreuna cu sistemul tampon si beta, gamma globulinele catre polul
negativ, contrar sarcinii electrice. Fenomenul se numeste electroendoosmoza.
Daca gelul nu are impuritati, electroendoosmoza nu mai are loc.
Imunodifuza dubla a speciilor separate fata de antispeciile antiser.
- metoda este calitativa si semicantitativa (persoane specializate pot analiza
intensitatile arcurilor de precipitare fata de seruri normale / standard.
b. tip rachete se aplica atunci cand antigenul este incarcat electric negativ, iar
anticorpul se afla incorporat in gel.
Metoda este si cantitativa, deoarece inaltimea rachetei de precipitare = d.p. cu
concentratia de antigen din godeu. (vezi slide + caiet)
c. bidimensionala presupune 2 etape de electromigrare pe directii
perpendiculare. Se aplica pt amestecuri complexe de antigene.
Obs: in a 2-a etapa de electromigrare, in gel se afla inclus si
anticorpul/anticorpii. Metoda este calitativa si cantitativa.
-
Metode indirecte
necesita existenta unui marker legat chimic de una din speciile imune.
Markerii pot fi:
radioizotopi -tehnica RIA
fluorocromi - FIA
enzime EIA
particule magnetice
Radioimunodetectiile RIA
Folosesc ca marker substante active/radioizotopi 125 I, 3H (tritiu), 14C, 32P,
35
S. Se aplica cu succes pt detectii de substante aflate in urme (concentratii f
mici ex. hormoni, vitamine, compusi poluanti) => metoda este f sensibila.
Metoda prez dezavantaje, deoarece necesita conditii experimentale
speciale, personal inalt calificat.
Specificitate dintr-un amestec recunosc cv anume
Sensibilitate se poate merge cu limita de detectie cat mai jos , la urme de
substanta.
13
VITAMINE. COENZIME
Vitamine
Dpdv al solubilitatii se clasifica in 2 clase:
- vitamine hidrosolubile
- liposolubile
Toate vitaminele hidrosolubile cu exceptia vit C (ac ascorbic) prez caracteristici
specific coenzimelor.
De inv surse, modalitate de actiune, cant mai mare, mai mica in org, daca
are coenzima, unde participa aceasta. Fara cantitati mg.
Vitaminele manifesta un spectru larg de actiune, in concentratii mici prez
urmatoarele caracteristici generale:
- factorii alimentari absolut necesari
- manifesta influenta hotaratoare in procesele metabolice
- factori de reglare a functiilor celulare
- lipsa din alimentatie det aparitia unor disfunctii
15
HORMONI
= moleculele semnal apartinatoare sistemului hormonal.
- actioneaza in cantitati mici
(vezi slide)
- prez receptori care sunt localizati diferit in fctie de natura hormonului
Hormonii hidrosolubili prez receptori la suprafata celulei.
Hormonii liposolubili prez receptori in interiorul celulei.
O celula poate receptiona unul / mai multi hormoni, determinand raspunsuri
identice / diferite.
Un hormon poate actiona si determina modificari si raspunsuri celulare diferite.
- influenteaza cresteri, diferentieri + alte functii.
In functie de locul de biosinteza si locul de actiune, hormonii se clasifica in 3
clase:
- hormoni autocrini
- paracrini
- endocrini
Hormonii autocrini
= biosintetizati de o anumita celula si actioneaza asupra celulei care le-a indus
biosinteza. (vezi slide)
Hormonii paracrini
17
20
Osmoza
Daca se considera o membrana semipermeabila care desparte 2 compartimente:
- unul cu solventul pur
- altul cu solutia unui solut in solvent
(vezi slide)
Conform potentialului chimic, apa in compartimentul 1 datorita concentratiei
mai mari decat in compartim 2, va tinde sa compenseze concentratia din
compartim 2 prin transfer pana cand se atinge un echlibru.
Prin trecerea apei din compartim cu conc apoasa mare, in compartim cu conc
apoasa mica, nivelul lichidului din compartim 2 va tinde sa creasca usor si astfel
la nivelul acestui compartiment apare o presiune hidrostatica superioara
compartimentului 1, iar presiunea se numeste presiune osmotica = valoarea
presiunii aplicata compartimentului unde se gaseste solutia pt a opri fluxul de
apa prin membrana dinspre compartimentul cu apa pura inspre compartimentul
cu solutie.
= conc solutului [X] RT
Daca conc [X] molara se defineste ca fiind nr de particule pe unitatea de volum
[X] = n/V , atunci pV=nRT. Bazat pe p osmotica la niv biosistemelor se desf
numeroase procese fiziologice :
- preluarea apei si mineralelor
- reabsorbtia apei din lumenul renal
- permeabilitatea membranara
Dependent de p osmotica a unui sistem, intalnim sisteme:
- izotone
- hipotone
- hipertone
Daca se gasesc in contact 2 sisteme in care presiunile osmotice sunt diferite, la
nivelul membranelor se realizeaza schimb de apa (osmoza) pana cand cele 2
presiuni se egaleaza. Cele mai cunoscute situatii de acest tip se intalnesc in cazul
eritrocitelor care poseda membrane celulare deosebit de friabile (rezistenta
mecanica slaba).
Atunci cand un eritrocit este introdus intr-un sistem hiperton (cu p mare),
apa din interiorul eritrocitului va trece in mediu, volumul eritrocitului va scadea,
producandu-se fenomenul de ratatinare / de zbarcire.
Per verso, daca eritrocitul este introdus intr-un mediu hipotonic, apa din
mediu va patrunde in eritrocit, va tinde sa-i creasca volumul acestuia si datorita
rezistentei mecanice slabe, membrana eritrocitara se lizeaza/ se rupe, se prod
fenomenul de hemoliza. Daca oricare alta celula se gaseste intr-un mediu
hipoton, se produc aceleasi fenomene, care sunt descrise de plasmoliza,
deosebirea de hemoliza constand in faptul ca, membranele tuturor celorlalte
celule prezinta rezistenta mecanica mai mare si nu se lizeaza, isi maresc doar
volumul. Din aceste motive, in organismele vii se introduc lichidele intotdeauna
25
Dializa-hemoliza
Dializa se aseamana cu osmoza, deosebirea dintre cele 2 fenomene se refera la
faptul ca in dializa prin membrane pot patrunde si pot fi transferate alaturi de
moleculele de apa si moleculele unor soluti de dim mici (mai mici decat
ochiurile de retea ale membranei).
Hemodializa se aplica sistemului sanguin care in raport cu o membrana
semipermeabila schimba cu mediul molecule de apa si moleculele unor
metaboliti de dimensiuni mici care nu mai pot fi filtrati la nivel renal,
fenomenele intalnindu-se in bolile renale cronice. Hemodializa se realizeaza in
special pt eliminarea moleculelor de uree, care se biosintetizeaza la nivel hepatic
din azotul aminic si care este produs de excretie cu caracteristici toxice limitate
comparativ cu amoniacul NH3 / alti derivati ai N-ului. Cu toate acestea, prin
tendinta de crestere a cocentratiei circulante a ureei se pot produce unele procese
secundare care pot induce dezvoltarea unor fenomene toxice in prima faza si
care in final devin incompatibile cu viata. In aceste cazuri, avand in vedere
faptul ca sangele este o suspensie apoasa a elementelor figurate intr-o solutie
omogena de substante organice, anorganice si macromoleculare, se poate realiza
eliminarea prin hemodializa a ureei, prin efectuarea unui bypass intre sistemul
arterial si venos. (vezi slide)
Se utilizeaza ca membrane semipermeabile saci de dializa prin interm carora
circula sangele arterial, care in acest mod elibereaza in solutia de dializa, unde
este introdus sacul de dializa, ureea excedentara, circuitul fiind continuat prin
revenirea in organismul uman a sangelui dializat la nivelul circuitului venos.
Operatia de curatire a sangelui este extensiva in timp, cateva ore, si se realizeaza
prin scaderea concentratiei sanguine in uree, cuplata cu cresterea concentratiei
ureei in lichidul de dializa. Pt o indepartare cat mai avansata a metabolitului din
26
27