Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
1. Concentraia substratului
4. Concentraia enzimei
- inhibitori
1
EFECTORII ENZIMATICI DEFINIIE
Se numesc efectori enzimatici substanele care pot mri sau
micora activitatea catalitic a unei enzime, deci care pot
accelera sau respectiv diminua viteza unei reacii enzimatice.
Efectorii enzimatici pot fi activatori sau inhibitori.
2
EFECTORII ENZIMATICI
1. Activatorii enzimatici
substane nespecifice;
natur anorganic sau organic;
capabili s accelereze viteza unei reacii enzimatice.
3
Tipuri de mecanisme de activare enzimatic
Glutationul redus
(GSH)
4
2. Activarea prin favorizarea legturii dintre enzim i substrat.
Unii ioni metalici pot nlesni formarea complexului ES prin diferite mecanisme:
Exemple:
meninerea substratului n centrul catalitic al enzimei: ionii de magneziu (Mg2+)
n cazul pirofosfatazei, favorizeaz legtura dintre enzim i substrat;
Ali ioni metalici pot fi chiar cofactori enzimatici:
ATP (adenozin trifosfat) aza, fosfotransferazele, fosfohidrolazele
activate de Mg2+;
amilaza (de origine animal) activat de Na+ i anionul clorur, (Cl-);
tirozinaza, ceruloplasmina, citocrom oxidaza activate de Cu2+;
alcool dehidrogenaza, glutamat dehidrogenaza, carboxi-peptidaza,
anhidraza carbonic activate de Zn2+;
enzimele din procesul coagulrii - activate de Ca2+;
citocromii, peroxidaze, catalaza activate de Fe2+ sau Fe3+;
5
3. Activarea prin favorizarea trecerii unor enzime din starea inactiv
(zimogene, proenzime) n forma catalitic activ.
Mecanismul: hidroliza unor legturi peptidice specifice.
Are loc nlturarea unui inhibitor, i demascarea centrului catalitic.
Exemplu:
Proenzimele inactive (digestive) sunt convertite la enzime active prin
proteoliz limitat (pepsina, chimotripsina, tripsina, enzimele coagulrii
sngelui, fibrinolizei)
6
4. Activarea enzimelor cu rol reglator prin adenozin monofosfat ciclic (AMPciclic, AMPc).
Exemplu: Mecanismul de activare enzimatic a protein kinazei A sub aciunea AMPc
Protein kinazele, enzime cu rol n fosforilarea unor protein-enzime din interiorul celulei.
NH2
O
HO P OH N
N
O Protein OH
OH N N kinaze
+ HO P OH O P O + ADP
O OH
HO P O CH2
Rest de serin, treonin O
Protein-enzim
sau tirozin din structura O fosforilat
proteic a unei enzime
OH OH
adenozin trifosfat (ATP)
7
Protein kinazele de tip A, C i G (enzime allosterice) care transfer grupri fosfat
de la molecula de ATP la gruprile OH a unor aminoacizi specifici (serin,
treonin, tirozin), din structura anumitor proteine
NH2
O
HO P OH N
N
O Protein OH
OH N N kinaze
+ HO P OH O P O + ADP
O OH
HO P O CH2
Rest de serin, treonin O
Protein-enzim
sau tirozin din structura O fosforilat
proteic a unei enzime
OH OH Produs de reacie:
adenozin trifosfat (ATP) protein-enzime n stare fosforilat =>
formele active ale acestor enzime !
8
Mecanismul de activare enzimatic a protein kinazei A sub aciunea AMPc
O P O OH
OH OH
OH
adenozin trifosfat (ATP)
3,AMP
5 ciclic
AMP ciclic 9
Enzime allosterice mecanism de aciune
10
Enzima allosteric
Modul de aciune al protein kinazei A i al
reglrii sale allosterice de ctre AMPc
(mesager secundar intracelular)
Fosfodiesterazele
Adenilatciclaza
EFECTORII ENZIMATICI
2. Inhibitorii enzimatici
Inhibiie alosteric
Inhibiie "feed-back"
(retroinhibiie)
Inhibiie ireversibil
I. Dup cinetica reaciei enzimatice Competitiv
Inhibiie reversibil
Necompetitiv
Mixt
(noncompetitiv)
16
INHIBIIA IREVERSIBIL = INACTIVARE
inhibiie NESPECIFIC.
Exemple:
toate enzimele care au n centrul catalitic aminoacizi cu gruparea SH
vor fi inhibai ireversibil de anumii inhibitori.
18
Diizopropil-fluorofosfat (DFP sau DIFP) - compus
organofosforic (pesticid).
Inhib prin fosforilare enzimele care au n centrul activ
serina.
Acetilcolina
Substrat
Centrul activ
al enzimei
20
Inhibiia colinesterazei sub aciunea compuilor
organofosforici
21
INHIBITORII REVERSIBILI
Caracteristici generale:
kI - constanta de inhibiie
22
INHIBIIA COMPETITIV Caracteristici generale
inhibitorul se fixeaz pe acelai centru catalitic al enzimei;
legtura dintre enzim i inhibitor este de aceeai natur cu cea dintre enzim
i substrat;
Reaciile dintre enzim (E), substrat (S) i inhibitor (I) n cazul inhibiiei competitive
24
MECANISMUL INHIBIIEI COMPETITIVE
kI
E + I EI
[E] [I]
kI =
[EI]
1
i - competitiv
v
Vmax [S]
v=
[I]
fr inhibitor (1 + ) KM + [S]
kI
1
Vmax Ecuaia Lineweaver-Brk va avea forma:
0 1
1 1 1 KM [I] 1 1
-
KM
-
KM
[S]
v
=
Vmax
(1 + ) [S]
+
Vmax
kI
Vmax = constant; 1/Vmax = constant; KM crete 25
Exemplu de INHIBIIE COMPETITIV
-
COO
CH2
CH2 COO -
CH2 COO -
CH2
COO - COO -
COO -
26
INHIBIIA NECOMPETITIV
(UNCOMPETITIVE INHIBITION)
Caracteristici generale:
Formarea complexului activat (ES) are loc normal
Complexul ( ESI ) fiind inactiv, are loc inhibarea reaciei enzimatice, nu se mai pot
forma produi finali de reacie.
Din punct de vedere cinetic, fiecare parametru Vmax i KM este micorat prin acelai
factor, [ I ] care depinde de concentraia inhibitorului i constanta reaciei
[1 ] de inhibiie.
Ki
Acest tip de inhibiie se ntlnete n cazul enzimelor
ce catalizeaz reacii ntre dou substrate. 27
MECANISMUL INHIBIIEI NECOMPETITIVE
Reaciile dintre enzim (E), substrat (S) i inhibitor (I) n cazul inhibiiei necompetitive
28
MECANISMUL INHIBIIEI NECOMPETITIVE
kI
ES + I ESI
Vmax
[I]
. [S]
(1+ )
kI
v=
KM
+ [S]
[I]
1 (1+ )
Vmax kI
[I]
[1 ]
Vmax i KM - micorai prin acelai factor Ki 29
Exemple de inhibiie necompetitic:
anhidraza
carbonic
+
CO2 + H2O HCO3- + H
30
INHIBIIA MIXT (denumit i NONCOMPETITIV)
(NONCOMPETITIVE INHIBITION)
Caracteristici generale:
Inhibitorul se leag n alt centru activ dect substratul (deci se poate lega
de enzim simultan cu substratul)
+S ES
E
ESI E+P
+I EI
31
MECANISMUL INHIBIIEI NONCOMPETITIVE
32
MECANISMUL INHIBIIEI NONCOMPETITIVE
Vmax
[I]
. [S]
(1+ )
kI
v=
KM + [S]
Inhibiie allosteric
35
Inhibiia prin exces de substrat
E+S ES E+P
+S
ESS ES + S
[S]
36
CLASIFICAREA INHIBIIEI ENZIMATICE
Inhibiie alosteric
37
Inhibiia prin analogi structurali ai substratului
Exemple:
COOH
CH2 Inhibitorii de tip competitiv COOH
CH2 ai succinat dehidrogenazei CH2 COOH
COOH (malonat, oxalat, glutarat) COOH COOH
COOH COOH
CH2 F CH
HO C COOH HO C COOH
CH2 CH2
COOH COOH
Inhibiie allosteric
39
Inhibiia prin ageni complexani
Exemple:
Exemple:
- Substanele care pot acetila gruprile NH2 ale lizinei din structura
enzimelor (ex: acidul acetilsalicilic acetileaz unele grupri NH2 din centrul
activ al ciclooxigenazei enzim din metabolismul acidului arahidonic)
41
INHIBIIA ALLOSTERIC
Efectorii allosterici
Acioneaz asupra conformaiei spaiale a enzimelor de tip allosteric
ENZIME ALLOSTERICE
Termenul de allosteriam desemneaz proprietatea caracteristic a
unor enzime de a funciona prin variaii (allo) ale conformaiei
tridimensionale (steriam).
Caracteristici structurale
Sunt proteine complexe cu rol reglator n reaciile metabolice
Sunt formate din subuniti monomere identice (protomeri)
Structura cuaternar reprezint asocierea simetric a protomerilor
componeni
Sunt enzime care se pot combina cu mai multe substrate, avnd mai muli
centri activi
Enzimele allosterice pot adopta n mod reversibil mai multe stri
conformaionale distincte care difer prin:
- Numr de protomeri
- Distribuia protomerilor
- Afinitatea protomerilor pentru efectorii stereospecifici 42
Enzimele allosterice au mai multe
situsuri de legare (cel puin 3 situsuri
catalitice)
- un situs de tip catalitic care realizeaz
transformarea propriu-zis a substratului, Reprezentarea schematic
i care se afl situat pe subunitatea a inhibiiei allosterice
catalitic a enzimei;
- mai multe situs-uri allosterice de care se
pot lega efectorii enzimatici (activatori
sau inhibitori), situai pe subunitatea
reglatoare a enzimei.
44
Inhibiia de tip feed-back (retroinhibiia)
Reprezint un caz special de inhibiie allosteric
Const n inhibiia activitii primei enzime de ctre produsul final al
lanului metabolic din care face parte:
E1 E2 E3 E4 E5
A B C D E F
-
Acumularea excesiv de produs final F n celule, determin printr-un mecanism allosteric,
inhibiia enzimei E1 care catalizeaz transformarea substanei A n substana B.
Exemplu: Hemul acumulat (n procesul de biosintez a hemoglobinei)
i poate inhiba propria biosintez.
47
Exemplu de inducie a activitii enzimatice, la Escherichia coli
Gen
reglatoare Promotor Operator Gene structurale
ARN
polimeraz
ADN
ARNm
Polipeptid
Protein
represoare
Lactoza
Prezena unui
inductor n
mediu -Galactozidaz Permeaz Transacetilaz
48
Exemplu de inhibiie prin produs final biosinteza triptofanului
E1 E2 E3 E4 E5
Absena triptofanului (Trp) n celul induce sinteza enzimelor implicate n cile sale de biosintez (E1...E5)
50
CLASIFICAREA ENZIMELOR
CONFORM COMISIEI DE ENZIMOLOGIE (EC)
EC : 1 Oxidoreductaze
EC : 2 Transferaze
EC : 3 Hidrolaze
EC : 4 Liaze
EC : 5 Izomeraze
EC : 6 Ligaze
51
Clasa 1
OXIDOREDUCTAZE EC: 1
52
OXIDOREDUCTAZE - Definiie i caracteristici generale
Catalizeaz procesele celulare de oxidoreducere, procese ce se desfoar
prin transport de hidrogen, electroni i oxigen de la un substrat donor la
acceptor.
DH2 + A D + AH2
Denumirea sistematic:
53
Oxidaze sau oxigenaze = catalizeaz scoaterea hidrogenului de pe un substrat (DH2)
utiliznd oxigenul ca acceptor.
Produi de reacie: apa (H2O) sau peroxidul de hidrogen (H2O2).
DH2 O2 DH2 O2
(Red)
Oxidaze Oxidaze
(Oxigenaze) (Oxigenaze)
D H2O D H2 O2
(Ox)
unde DH substrat donor de hidrogen; AH2 cosubstrat donor de hidrogen; D-OH este
substrat hidroxilat 54
Transportori de hidrogen
55
COENZIME TRANSPORTOARE DE
HIDROGEN
COENZIME NICOTINICE (COENZIME PIRIDINICE)
NH2
O
C
Nicotinamid N NADP+
N
NH2 posed o
+
N N grupare
N
O O fosforil n
Adenin
5' 5' plus, legat de
2' 3'
CH2 O P O P O CH2 C2 al restului
1' OH OH 4' O de riboz
OH OH
4' 1' legat de
O 3' 2' adenin
NAD+
esterificat cu
OH OH
H3PO4
NADP+
OPO3H2 56
O NH2
C Nicotinamid Adenin
NH2 N
+ N
N
O O N N
5'
5'
2' 3' O CH2
CH2 O P O P
1' OH OH 4' O
OH OH
4' 1'
O 3' 2' esterificat cu
H3PO4
NAD+
OH OH
NADP+
OPO3H2
57
Cofactori cu structur flavinic- transportori de hidrogen.
1'CH2
fosfat
2'CH OH Ribitil
3'CH OH
6,7 dimetil, 9 ribitil
4'CH OH
OH izoaloxazin = RIBOFLAVIN
5'CH2 O P OH (vitamina B2)
O
Riboflavin -
fosfat
58
Structura flavin adenindinucleotidului (FAD)
O
N Nucleul
H3C 5 4
6
10
3 NH
izoaloxazin
7 2
8 9
H3C N N O
1
CH2 Adenin
CH OH NH 2
N
CH OH N
CH OH OH
N N
OH
CH2 O P O P O CH2
O
O O
OH OH
OH OH
O CH3
H3 C O 6 2 CH2 CH C CH2 H
1
n
H3 C O 5
4 3 CH n = 6 pentru ubichinonele de la levuri
3
n = 8 sau 9 pentru ubichinonele de la microorganisme
O
n = 10 pentru ubichinonele de la animale si om
2-decaprenil--5,6-dimetoxi-3-metil-1,4-bezochinona
61
Acidul lipoic (acid tioctic) STRUCTUR CHIMIC
S S
Acid -lipoic
H2 O
5 3
8
C 6
CH2 CH2 C
1
H2C CH OH
CH2 CH2
4 2
S S
Acid lipoic
62