CELULELE ANIMALE Avantajele clonării în celule animale
• Celulele mamaliene sunt cele mai utilizate gazde pentru transferul
de ADN de interes • Permit producerea de proteine recombinate, inclusiv proteine umane, care prezintă prelucrările post-translaționale normale • In prezent există tehnologii bine puse la punct de cultivare a celulelor mamaliene în sisteme optimizate în vederea sintetizării unor compuși extrem de utili mai ales pentru terapie: anticorpi, hormoni, factori de creștere, citokine sau vaccinuri. • Există o serie de vectori de clonare/exprimare eficienți atât pentru celule mamaliene cât și pentru alte tiprui de celule animale, de ex. celule de insecte (sistemul de exprimare de la baculovirusuri) • Cercetările de până acum au avut drept țintă nu numai transferul de gene în celule aflate în cultură in vitro ci și în celule in vivo, sistem a cărui aplicație principală se referă la terapia genică (introducerea de ADN în celulele unui organism în vederea tratării unei boli). Metode de transfer în celule animale • Pentru transferul de gene în celulele animale sunt utilizate în principal celulele somatice din care, în condiții normale nu pot fi regenerate organisme transgenice. • Transformarea celulelor germinale la un organism animal necesită transferul genelor în celule pluripotente sau totipotente, așa cum este cazul celulei ou, a embrionilor timpurii, a celulelor germinale izolate sau a gameților. In mod excepțional, transformarea liniei germinale se poate realiza fie prin transferul de gene în celule din culturi in vitro, derivate de la celule pluripotente, așa cum este cazul celulelor stem embrionare de la șoarece (celule de tip „ES”), fie prin transferul nucleului unor celule somatice în ovule enucleate. – Celulele stem au fost descoperite în 1950, în măduva osoasă – În 1970 au fost descoperite celulele stem embrionare la șoarece – În 1998 au fost evidențiate și izolate celulele stem embrionare la om – După 2000 – teste privind convertirea in vitro o celulelor stem în diferite categorii celulare de interes Celulele stem – Există în anumite țesuturi alături de celulele specializate – Nu sunt diferențiate și se pot divide nelimitat formând alte celule stem – Se pot diferenția în funcție de anumite condiții de mediu Celule stem pot fi: – Totipotente – se formează după primele diviziuni ale celulei ou (stadiul de 8 celule) și pot regenera un organism întreg – Stem pluripotente = celule stem embrionare – pot forma orice tip celular – Stem multipotente – celule adulte capabile de a produce mai multe tipuri de celule diferențiate – Stem unipotente – pot forma un singur tip de celule (ex.spermatogoniile formează doar spermatozoizi) Celule stem pluripotente In prezent sunt disponibile numeroase linii celulare mamaliene ce pot fi folosite în studii de genetică moleculară, majoritatea putând fi obținute, de exemplu, de la American Type Culture Collection (ATCC) ce deține peste 4000 linii celulare de la mai mult de 150 specii diferite: MDCK (din rinichi de câine,1958) CHO (hamster; epiteliu ovarian;1957); CV-1/COS (maimuță; rinichi; 1964); HeLa (om; carcinom cervical;1951) LNCaP (om; tumoră de prostată; 1977) MCF7 (om; tumoră mamară;1973). • Linia de celule HeLa este un tip de linie celulară umană ”nemuritoare” utilizată în scopul cercetării științifice. • Provine din celule tumorale cervicale prelevate la 8 febr. 1951 de la o pacientă pe nume Henrietta Lacks (care a murit de cancer în oct.1951) • Reprezintă prima linie celulară umană obținută și menținută cu succes in vitro care a fost ulterior utilizată în numeroase studii de interes medical - Fiind celule tumorale, celulele HeLa se pot divide de un număr nelimitat de ori, în condiții de laborator, atâta timp cât sunt asigurate condițiile optime de mediu - In prezent există numeroase linii de celule HeLa dar toate sunt descendente din linia celulară inițiată în anul 1951 Utilizare • Celulele HeLa au fost utilizate de către Jonas Salk pentru testarea primului vaccin antipoliomielită în anii 1950 • Celulele Hela au reprezentat subiectul a peste 60.000 lucrări stiintifice până în anul 20009 • Celulele HeLa au fost folosite pentru studii legate de modul în care virusuri animale (de ex. Parvovirusul de la câini sau pisici) infectează celulele umane • Celulele HeLa au fost utilizate pentru studii legate de exprimarea unor gene de la papilomavirus E2 precum și de inducerea apoptozei în celulele tumorale ca urmare a infectării cu anumite virusuri , cercetări cu impact în dezvoltarea unor tratamente antitumorale în cazul tumorilor rezistente la radioteratie și chimioterapie • Au fost utilizate în studii legate de impactul unor hormoni steroizi (estradiol, estrogen) și a receptorilor pentru estrogeni în fenomenul de proliferare tumorală Utilizare • Celulele HeLa au fost folosite în studii legate de efectul unor compuși chimici, naturali sau de sinteză, asupra proliferării tumorale în vederea realizării unor noi produse cu efect antitumoral • Celulele HeLa au fost utilizate în scopul definirii unor markeri tumorali și în stabilirea unor metode de diagnosticare • Celulele HeLa proliferează anormal de rapid, chiar comparativ cu alte tipuri de celule tumorale. Ele posedă un sistem telomerazic activ în timpul diviziunii celulare, care previne scurtarea telomerelor, celulele nefiind supuse îmbătrânirii (senescenței) și nici apoptozei. • La începutul anului 2013, structura genomului celulelor Hela a fost comunicată de către un grup de cercetători germani coordonați de Lars Steinmetz. • Genomul celulelor Hela, la fel ca și cel al altor celule tumorale, prezintă o serie de particularități legate, în primul rând, de erori reparate anormal și de prezența uneia sau a mai multor copii suplimentare a unor cromosomi. • Echipa condusă de Steinmetz a confirmat că celulele HeLa conțin o versiune suplimentară a majorității cromosomilor, cu până la cinci copii în cazul unora dintre cromozomi. La numeroase gene s-a observat fenomenul de duplicație, rezultând 4-6 copii în loc de două cât este normal. De asemenea, segmente de dimensiuni mari din cromosomul 11 precum și din alți cromosomi prezintă rearanjamente, ceea ce alterează drastic exprimarea genelor. • Datorită duplicațiilor, peste 2000 de gene din genomul acestor celule sunt exprimate la niveluri cu mult mai ridicate decât în cazul celulelor umane normale Metode de transfer a genelor Transferul de gene în celulele animale se poate realiza pe patru căi: - transfer direct al ADN prin metoda transfecției fizice; - transfecția mediată chimic prin care celulele preiau ADN prin endocitoză; - introducerea ADN de interes împachetat în interiorul unui virus (transducție); - introducerea ADN de interes aflat în interiorul unei bacterii cu ajutorul vectorilor de tip navetă („shuttle”). Două dintre metode implică mecanisme biologice (utilizarea virusurilor sau a bacteriilor ca agenți de „livrare” a ADN de interes) în timp ce celelalte două nu implică agenți biologici, iar pentru a le deosebi de procesul de infecție (virală sau bacteriană), termenul folosit pentru a le desemna este cel de transfecție. Reprezentarea schematică a modalităților de introducere a ADN de interes în interiorul unei celule animale: 1. transfecția fizică 2. transfecția mediată chimic prin care celulele preiau ADN prin endocitoză 3. introducerea ADN de interes împachetat în interiorul unui virus (transducție) 4. introducerea ADN de interes aflat în interiorul unei bacterii Cel mai frecvent, pentru transferul direct al ADN în celulele animale se utilizează: - metoda microinjectării - electrotransformarea - metoda biolistică - utilizarea lipozomilor drept cărăuşi ai materialului genetic de transferat (lipozomii reprezintă structuri veziculare, formate din molecule lipidice de tip fosfatidilcolină, sfingomieline, fosfatidil-etanolamine, prin agitarea sau ultrasonicarea soluţiilor respective) - incubarea celulelor + ADN în dextran (polimer de natură glucidică la care au fost cuplate anumite grupări chimice active (DEAE). - precipitarea ADN cu cationi bivalenţi (Ca2+, Mg2+) care determină o pătrundere mai rapidă a acestuia în celule Gene marker de selecție pentru celulele animale (gene care codifică sinteza unui produs ce permite celulelor transformate să supraviețuiască pe un mediu selectiv): – gena pentru aminoglicozid-fosfotransferaza (aph) (agentul de selecţie este antibioticul G418 care inhibă sinteza proteinelor); – gena pentru dihidrofolat-reductaza (dhr), care conferă rezistenţa la metotrexat; – gena pentru higromicin-fosfotransferaza (hpt), care determină rezistenţa la higromicina B; – gena pentru timidin-kinaza (implicată în sinteza timidin- trifosfaților = TTP), care determină rezistenţa la aminopterin (un agent inhibitor al sintezei purinei) etc. Incorporarea stabilă a genelor exogene în genomul celulelor supuse transfecţiei este un fenomen extrem de rar (0,1%- 1%), exprimarea acestora se poate menţine câteva zile după transfer, după care dispare. Acest fenomen a primit denumirea de "exprimare temporară (tranzitorie)", el putând fi utilizat pentru a evidenţia eficienţa transferului (nu şi a integrării genei respective). GENE MARKER DE REFERINȚĂ („reporter genes”) (gene care codifică un anumit produs ce poate fi detectat ușor, calitativ și cantitativ, folosind metode colorimetrice, fluorometrice sau teste chemiluminiscente etc):
Gena lacZ de la E.coli codifică sinteza enzimei β-
galactozidaza care hidrolizează β-D-galatopiranozidele de tipul lactozei sau a unor analogi. Activitatea enzimei β- galactozidaza poate fi determinată in vitro spectrofotometric utilizând un substrat cromogen (ONPG = O-nitrofenil-β-D- galactopiranozid care formează, sub acțiunea enzimei un compus de culoare galbenă) sau histochimic prin utilizarea substratului cromogen X-gal care determină, sub acțiunea enzimei, apariția unui compus de culoare albastră). Dezvantajul acestei gene raportor este că activitatea genei exogene poate fi mascată de activitatea unei gene endogene pe care o conțin numeroase tipuri de celule mamaliene. Gena lux ce codifică enzima luciferaza identificată inițial la licurici (Photinus pyralis) care catalizează oxidarea luciferinei într-o reacție ce necesită oxigen, ATP și ioni de magneziu: în prezența substratului în exces are loc emiterea de lumină iar intensitatea semnalului poate fi determinată cu ajutorul unui luminometru. Sistemul luciferazic este mult mai sensibil decât cel reprezentat de gena lacZ, putând fi aplicat la numeroase gazde animale. Gena gfp codifică sinteza proteinei GFP („green fluorescence protein” = proteina cu fluorescență verde) identificată mai întâi la meduza Aequoria victoria, iar începând cu anul 1994 a început să fie utilizată ca marker de selecție pentru celulele animale (la Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster, linii celulare mamaliene). Modificarea genei s-a realizat astfel că proteinele derivate manifestă o fluorescență diferită față de cea inițială: CFP = „cyan fluorescent protein” (fluorescență albastră), YFP = „yellow fluorescent protein” (fluorescență galbenă). Vectori de clonare pentru celulele animale Vectorii de clonare pentru celulele animale trebuie să conţină, în principiu, patru tipuri de componente: – secvenţe derivate din plasmide bacteriene care să le permită multiplicarea şi selecţia în celule bacteriene gazdă (E.coli); – elemente genetice eucariote care să controleze iniţierea transcrierii: secvenţa promotor, de terminare şi, eventual, secvenţe activator ("enhancer"); – secvenţe de poliadenilare a ARNm (în cazul în care nu toţi vectorii conţin introni care să asigure prelucrarea ARNm precursor); – gene marker ce permit selecţia celulelor animale ce conţin vectorul recombinat. Primii vectori de clonare pentru celula animală au derivat de la virusul SV40 (virusul simian 40 sau virusul vacuolizant, care determină transformarea tumorală a celulelor infectate). Genomul virusului SV40: o moleculă de ADNdc circular ce conţine mai multe gene: - gena T (codifică sinteza antigenului T şi asigură capacitatea transformantă a virusului); - gena t codifică pentru sinteza unui antigen minor (t); - gena VP1 (codifică sinteza proteinei principale din structura învelişului viral); - genele VP2 şi VP3 (codifică sinteza proteinelor minore din structura învelişului viral). După infecţie, genomul viral se integrează în genomul celulei gazdă, determinând transformarea tumorală a acesteia. Multiplicarea SV40 în diferite gazde mamaliene (șoarece, maimuță, om) Vectorii de clonare derivaţi de la acest virus s-au obţinut prin înlocuirea unor gene virale (inclusiv a celor de tumorigeneză) cu gene străine (dimensiunea ADN străin fiind de maximum 2300 pb), rezultând un virus defectiv, incapabil de multiplicare şi formarea unui virus matur. Dacă infecţia cu virus defectiv se face simultan cu o altă unitate de replicare, care conţine genele ce-i lipsesc virusului (virus ajutător = „helper”), are loc formarea de particule virale recombinante. În general, vectorii derivaţi de la SV40 au originea replicării virale, regiunea implicată în "splicing" şi poliadenilare, precum şi genele pentru ARNm timpuriu. 2. Vectori specifici pentru celulele animale derivaţi de la retrovirusuri. Acestea sunt virusuri cu genom ARN care infectează celulele mamaliene în care, după infecţie şi după reverstranscrierea ARN viral la o moleculă de ADN complementară genomului viral (ADNc), se integrează în genomul celulei gazdă, devenind provirus. Provirusul determină producerea de ARN viral, transcrierea începând de la nivelul unui promotor puternic, localizat în afara regiunii codificatoare din genomul viral, la nivelul unor secvenţe terminale lungi repetate (LTR = “long terminal repeats”). ARN sintetizat funcţionează atât ca ARNm, utilizat pentru sinteza proteinelor virale, cât şi ca ARN viral genomic. Genomul viral mai conţine, pe lângă cele două LTR situate la extremităţile genomului viral, o secvenţă necesară încapsidării (Ψ), precum şi trei gene ce codifică o serie de proteine virale: gag (codifică sinteza proteinelor din miezul intern al virusului); pol (codifică sinteza mai multor enzime virale, inclusiv a reverstranscriptazei); env (codifică sinteza proteinelor din învelişul viral). Reprezentarea schematică a unui vector retroviral şi a modului său de utilizare pentru clonare.
LTR = secvenţe marginale repetate;
bla = genă marker de selecție pentru E.coli; oriE = originea replicării în E.coli; neo = marker de selecție pentru celulele animale transfectate; promotor CMV = promotor puternic ce asigură exprimarea genei clonate (a insertului); psi = secvențe retrovirale esențiale Vector de clonare ce conține atât elemente genetice derivate de la SV40 cat și de la un lentivirus. Vectori de exprimare pentru celulele mamaliene Producerea de proteine heterologe de către celulele mamaliene constituie una dintre direcţiile majore de studiere a rolului fiziologic al unor proteine sau a modificărilor post-translaţionale ale acestora. Vectorii de exprimare trebuie să conțină elemente genetice implicate în controlul exprimării genelor de interes: - promotorul - secvența de poliadenilare (poly A) - secvența enhancer - intron (pentru stabilizarea genei clonate și prelucrarea corectă a ARNm corespunzător) - markeri de selecție - MCS Promotorul constituie secvența fără de care transcrierea eficientă nu se poate realiza. In prezent, cei mai utilizați promotori pentru studiile de exprimare a genelor în culturi celulare sau în animale transgenice pot fi grupați în mai multe categorii, în funcție de modul de funcționare: - promotori minimali (promotorul alcool dehidrogenazei de la Drosophila, promotorul genei pentru timidin kinaza de la virusul heres simplex) - promotori constitutivi puternici (promotorul timpuriu de la citomegalovirus, secvența enhancer/promotor de la virusul SV40), promotori specifici pentru anumite tipuri de celule (promotorul proteinei acide din lapte, promotorul tirozin kinazei specifice limfocitelor) - promotori reglabili (inductibili)(Secvența LTR enhancer/ promotor de la virusul tumoral mamar de la șoarece, promotorul genei pentru proteina de șoc termic de la Drosophila). De exemplu, în laboratoarele Promega au fost obţinute trei categorii de vectori de exprimare constitutivă a genelor clonate în celulele mamaliene: seria de vectori pSI, seria pCI şi seria pCI-neo. Diferenţa majoră dintre vectorii de tip pSI şi cei pCI constă în tipul de regiune enhancer/promotor ce controlează exprimarea genei inserate. Vectorul pGFP-C1 produs de laboratoarele Clontech este un vector de exprimare de tip navetă (se multiplică şi funcţionează atât în E.coli cât şi în celule animale (mamaliene). Vectorul conţine: - gena de rezistenţă la kanamicină sub controlul a doi promotori: promotorul genei pentru rezistenţa la ampicilină îi asigură exprimarea în celulele bacteriene (care devin rezistente la kanamicină), iar promotorul SV40 îi asigură exprimarea în celulele eucariote; - asigură exprimarea genelor străine clonate la nivelul MCS localizat la extremitatea 3’ genei gfp, asigurând sintezei unei proteine de fuziune - secvența polyA - exprimarea genei gfp este controlată de un promotor derivat de la virusul CMV Vectori de clonare pentru alte categorii de celule animale
Domeniile de aplicare a tehnologiei ADN
recombinant s-au extins şi în cazul altor tipuri de organisme animale care au putea fi utilizate drept gazde pentru producerea de compuşi de interes. Acesta este cazul celulelor de insecte la care s-au înregistrat progrese importante în ceea ce priveşte cultivarea „in vitro” şi obţinerea de vectori de clonare specifici. Astfel, este cunoscut faptul că celulele de insecte sunt sensibile la acţiunea unei categorii speciale de virusuri ce au primit denumirea de baculovirusuri. Baculovirusurile au un genom ADN, circular de dimensiuni mari (90-180 kb), la nivelul căruia au fost identificate mai multe gene ce codifică funcțiile virale, inclusiv sinteza unui compus specific ce se acumulează în celulele de insecte infectate (proteina polihedrină). Exprimarea acestei gene este controlată de un promotor puternic, care a fost utilizat pentru clonarea de gene de interes în vectori derivați de la asemenea virusuri. Cel mai studiat sistem este cel de la Autographa californica: infecţia virală la insecte determină formarea unor incluziuni celulare specifice, citoplasmatice sau nucleare, cu aspect poliedric sau granular, de natură proteică (polihedrina). Incluziunile celulare pot conţine unul sau mai mulţi virioni; ele sunt liberate prin liza celulelor şi pot contamina frunzele plantelor cu care se hrănesc larvele altor insecte. Incluziunile protejează virionii de căldură şi de acţiunea altor agenţi chimici; atunci când sunt ingerate de larve şi ajung în tubul digestiv al acestora, ele se dizolvă şi eliberează virionii care infectează celulele intestinului insectei. Au fost obţinuţi „in vitro” vectori plasmidiali incapabili de a se multiplica în celulele de insecte, dar care conţin secvenţele repetitive ale genomului viral, precum şi elementele reglatoare ale genei pentru polihedrină (promotorul şi secvenţa de terminare), la nivelul cărora se introduc fragmentele de ADN de interes. Baculovirusurile, ca și vectorii derivați de la acestea, pot infecta atât insectele cât și linii celulare menținute in vitro (așa cum sunt liniile Sf21 sau Sf9). Co-transfecţia celulelor de insecte cu vectorul ce conţine fragmentele de ADN de studiat împreună cu ADN viral (de baculovirus) de tip sălbatic determină introducerea în genomul baculovirusului, prin recombinare (pe baza omologiei secvenţelor terminale şi a celor reglatoare din vector şi din virus) a ADN de interes, înlocuindu-se în acest fel gena pentru polihedrină. Baculovirusurile recombinate astfel realizate pot fi utilizate atât pentru obţinerea unor cantităţi mari de proteine în celulele eucariote cât şi pentru controlul invaziilor de insecte Prin utilizarea unor vectori de exprimare derivați de la baculovirusuri, utilizând ca marker gena gfp, în diferite laboratoare s-a reușit introducerea stabilă a unor gene în specii variate de insecte. Acesta este cazul la Bombyx mori (viermele de mătase) la care s-a reușit transferul și exprimarea genei gfp atât în larve cât și la nivelul coconilor (gogoșilor de mătase)