Sunteți pe pagina 1din 1

Lucru individual 4 (din 03.10.

2019)

1. Identificați secvența
ACACTTTCTTCTGACATAACAGTGTTCACTAGCAACCTCAAACAGACACCATGGTGCATCTGACTCCTGA
GGAGAAGACTGCTGTCAATGCCCTGTGGGGCAAAGTGAACGTGGATGCAGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGC
AGATTACTGGTGGTCTACCCTTGGACCCAGAGGTTCTTTGAGTCCTTTGGGGATCTGTCCTCTCCTGATG
CTGTTATGGGCAACCCTAAGGTGAAGGCTCATGGCAAGAAGGTGCTAGGTGCCTTTAGTGATGGCCTGGC
TCACCTGGACAACCTCAAGGGCACTTTTTCTCAGCTGAGTGAGCTGCACTGTGACAAGCTGCACGTGGAT
CCTGAGAACTTCAGGCTCTTGGGCAATGTGCTGGTGTGTGTGCTGGCCCGCAACTTTGGCAAGGAATTCA
CCCCACAAATGCAGGCTGCCTATCAGAAGGTGGTGGCTGGTGTGGCTAATGCCCTGGCTCACAAGTACCA
TTGAGATCCTGGACTGTTTCCTGATAACCATAAGAAGACCCTATTTCCCTAGATTCTATTTTCTGAACTT
GGGAACACAATGCCTACTTCAAGGGTATGGCTTCTGCCTAATAAAGAATGTTCAGCTCAA

2. Selectati familia omoloagă pentru secvența identificată, astfel ca să fie incluse secvențele
provenite din următorii taxoni:
Homo sapiens
Pan troglodytes
Gorilla gorilla
Pan paniscus
Nomascus leucogenys
Rhinopithecus bieti

Formați din aceste secvențe un fișier FASTA

3. Aliniați secvențele selectate utilizând Muscle


4. Formați un fișier FASTA cu secvențele aliniate.
5. Vizualizați alinierea în Mesquite.

6. Repetati pașii de mai sus pentru secvența de aminoacizi:

MHSSIVLATVLFVAIASASKTRELCMKSLEHAKVGTSKEAKQDGIDLYKHMFEHYPAMKKYFKHRENYTP
ADVQKDPFFIKQGQNILLACHVLCATYDDRETFDAYVGELMARHERDHVKVPNDVWNHFWEHFIEFLGSK
TTLDEPTKHAWQEIGKEFSHEISHHGRHSVRDHCMNSLEYIAIGDKEHQKQNGIDLYKHMFEHYPHMRKA
FKGRENFTKEDVQKDAFFVNKDTRFCWPFVCCDSSYDDEPTFDYFVDALMDRHIKDDIHLPQEQWHEFWK
LFAEYLNEKSHQHLTEAEKHAWSTIGEDFAHEADKHAKAEKDHHEGEHKEEHH

Fisierul FASTA urmează a fi construit pentru primele 5 raspunsuri BLAST

S-ar putea să vă placă și