Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Curs 13 Biochimie - Acizi Nucleici 2 PDF
Curs 13 Biochimie - Acizi Nucleici 2 PDF
(SINTEZA ARN)
1
Aspecte generale
• Informația stocată în ADN devine utilă atunci când este exprimată sub formă de
ARN și proteine
• ARN este alcătuit din ribonucleotide (ce conțin riboza ca pentoză) unite prin
legături 3’-5’ fosfodiesterice
• Bazele sunt - purinice: adenina și guanina
- pirimidinice: citozina și uracil
• Trei tipuri majore de ARN participă la sinteza proteinelor: ARNm, ARNt și ARNr
• Unele molecule de ARN sunt capabile să catalizeze reacții chimice – aceste enzime
se numesc ribozime (funcția catalitică este conferită de gruparea 2’-OH a
moleculelor de riboză)
2
Cei trei produși ai
transcripției
3
ARNm (mesager)
• Transportă informația genetică de la ADN-ul nuclear în citoplasmă, la nivelul
ribozomilor, unde este utilizat ca matriță pentru sinteza proteinelor
• Secvența nucleotidelor din ARNm specifică secvența aminoacizilor dintr-o proteină
• ARNm este format prin transcripția (copierea) unei secvențe de nucleotide din
ADN ce constituie o genă, în conformitate cu regulile de complementaritate
4
Transcripția
• Transcripția = sinteza unei copii a unui fragment de ADN corespunzător unei gene,
sub formă de ARN
• Regiunea codantă a unei gene conține secvența de ADN care este transcrisă sub
formă de ARNm, ce va fi translat ulterior într-o proteină
• Numai una din cele două catene ADN care formează o genă este copiată → aceasta
este numită catena matriță sau antisens (noua moleculă de ARN va fi
complementară și antiparalelă cu catena de ADN matriță)
• Cealaltă catenă ADN = catena codantă sau sens a acelei gene → are aceeași
direcție și secvență a bazelor ca și transcriptul ARN (cu excepția faptului că timina
din ADN este înlocuită cu uracil în ARN)
• Catena de ADN matriță este complementară și antiparalelă atât cu catena codantă
a ADN, cât și cu transcriptul ARN
5
• În cazul unei molecule de ADN dublu-catenar conținând mai multe gene, una dintre
catene servește ca matriță pentru unele gene, în timp ce cealaltă catenă servește ca
matriță pentru alte gene
• Nucleotidul din catena ADN codantă a genei, care servește ca punct de start al
transcripției este numerotat cu +1 (corespunde primului nucleotid încorporat în ARN
la capătul 5’ al transcriptului)
• Următoarele nucleotide din regiunea transcrisă a genei sunt numerotate +2, +3,
etc., spre capătul 3’ al catenei codante (în aval)
• Secvențele netranscrise situate în amonte față de punctul de start (spre capătul 5’)
sunt numerotate cu –1, –2, –3, etc.
6
ARN polimerazele
• Transcripția este realizată de către ARN polimeraze, care catalizează formarea de
legături fosfodiesterice între nucleotide care sunt complementare cu nucleotidele
din catena de ADN matriță
8
Tipuri de ARN polimeraze
9
Etapele procesului de transcripție
I. Inițierea transcripției și reglarea sa
• Pentru a iniția transcripția, ARN polimerazele trebuie să fie capabile să recunoască:
- genele care trebuie să fie transcrise – acestea pot să difere de la un tip celular
la altul și în funcție de modificările condițiilor fiziologice
- catena de ADN care va fi folosită ca matriță pentru fiecare genă și punctul de
start al transcripției
• ARN polimerazele trebuie să fie sensibile la semnale care controlează ritmul
transcripției – aceste semnale reflectă necesitatea pentru produsul unei anumite
gene (o anumită proteină)
10
1. Expresia bazală a unei gene
• Promotorul unei gene – o regiune reglatorie de ADN localizată în amonte de
regiunea codantă a genei, care controlează transcripția acelei gene
• Promotorii variatelor gene sunt diferiți, însă conțin două regiuni conservate la
toate genele, numite secvențe consens:
a) caseta TATA → controlează legarea ARN polimerazei la locul corect pe
catena de ADN matriță și este responsabilă pentru inițierea transcripției
b) caseta CAAT și regiunile bogate în GC → determină frecvența de inițiere a
transcripției (ritmul transcripției)
➢ a) Caseta TATA
• Proteine numite factori generali de transcripție se leagă la caseta TATA și
facilitează legarea ARN polimerazei II – sunt desemnați ca TFII
• Proteina de legare la caseta TATA (TBP - TATA-binding protein), care este o
componentă a factorului TFIID, recunoaște caseta TATA și se leagă la ea → apoi
TFIIA și TFIIB se asociază
• TFIIB recrutează ARN polimeraza II (având TFIIF asociat) → ulterior TFIIE și TFIIH se
asociază la ARN-Pol II
11
• Asocierea factorilor generali de transcripție și a ARN-Pol II la nivelul casetei TATA
duce la formarea complexului bazal de transcripție
• TFIIH acționează ca o ADN helicază ATP-dependentă, care desface dublul helix ADN
pentru a permite procesul transcripției
• TFIIH are o funcție suplimentară: una din subunitățile sale are activitate kinazică și
fosforilează ARN polimeraza II în domeniul său C-terminal → aceasta determină o
modificare conformațională a întregului complex, inițiind transcripția
• ARN-Pol II părăsește caseta TATA și începe să transcrie catena de ADN matriță,
începând cu nucleotidul +1 (punctul de start al transcripției)
12
➢ b) Caseta CAAT și regiunile bogate în GC
• Aceste secvențe reglatorii leagă anumite proteine reglatoare (factori de
transcripție comuni pentru promotorii diverselor gene), care determină frecvența
cu care este inițiat procesul transcripției (facilitează asamblarea complexului bazal
de transcripție prin interacțiune cu factorii generali de transcripție)
• Aceasta asigură transcripția genei cu o frecvență bazală
➢ Genele care sunt reglate numai de către secvențele consens din cadrul
promotorului sunt numite gene cu expresie constitutivă
GR - glucocorticoid receptor
GRE - glucocorticoid response element
14
II. Elongarea transcripției
• ARN polimeraza II disociază de factorii generali de transcripție (numai TFIIF rămâne
asociat) → se deplasează de-a lungul catenei de ADN matriță și adaugă
ribonucleotide (conform cu regulile de complementaritate), unindu-le prin legături
3’-5’ fosfodiesterice
• În cursul acestei etape, activitateta ARN-Pol II este amplificată de către proteine
numite factori de elongare, care se asociază cu enzima
• Catena de ADN matriță este citită în sensul 3’→5’, iar transcriptul ARN este sintetizat
în sensul 5’→3’
1. Marcarea capătului 5’
16
2. Adăugarea cozii poliadenilice - poli(A)
17
3. Procesul de splicing
• Intronii sunt îndepărtați (excizați) din transcriptul primar și exonii sunt uniți între ei
– proces numit splicing-ul ARN, realizat de un ansamblu molecular numit
spliceozom (”splicing” = înnădire)
• Spliceozomul conține ribonucleoproteine mici nucleare (small nuclear
ribonucleoproteins – snRNPs = complexe formate din ARN + proteine), numite
“snurps” (desemnate U1 până la U6, deoarece ARN-ul lor este bogat în uracil) –
activitatea catalitică aparține ARN-ului (ribozime): gruparea 2’-OH a ribozei din
ribonucleotide conferă activitate catalitică
• Complexele snurps recunosc limitele dintre fiecare doi exoni și intronul care îi
separă → realizează două incizii la limitele dintre intron și cei doi exoni → intronul
este îndepărtat (ca o structură în formă de lasou - ”lariat”) și exonii sunt ligaturați
pentru a forma o secvență continuă
18
Procesul de splicing al ARN
19
Structura generală a ARNm:
20
TRANSLAȚIA
(SINTEZA DE PROTEINE)
21
Genele din ADN codifică:
• ARNt
• ARNr
• ARNm → va fi translat sub formă de proteine
22
Codul genetic
• Translația = sinteza unei proteine utilizând informația din ARNm, care a fost
copiată de pe o genă din ADN (”limbajul” de nucleotide din ARNm este tradus în
”limbaj” de aminoacizi dintr-o proteină)
23
Proprietățile codului genetic
1. Este universal
• Specificitatea codului genetic a fost conservată de-a lungul evoluției → toate
speciile de organisme, de la bacterii până la om, utilizează același cod genetic
24
4. Este nesuperpozabil și fără semne de punctuație
• ARNm nu conține semne de punctuație care să separe un codon de cel următor și
codonii nu se suprapun (nu împărtășesc nucleotide)
• Codul este citit de la un punct de start fix și continuă ca o secvență continuă de
nucleotide, luate câte trei odată
• Un codon specific din secvență stabilește cadrul de citire (”reading frame”), în care
un codon nou începe la fiecare trei nucleotide
26
ARNr (ARN ribozomal)
• ARNr se găsește, în asociere cu mai multe proteine, în componența ribozomilor
(organitele subcelulare unde are loc sinteza de proteine)
• Celulele eucariote conțin patru tipuri de ARNr: 28S, 18S, 5,8S și 5S (S de la unitate
Svedberg, care este legată de greutatea moleculară și forma compusului)
• Ribozomii (80S) sunt alcătuiți din două subunități: mare (60 S) și mică (40S)
27
Formarea complexului
aminoacid-ARNt
2 Pi
28
Evenimente principale în cursul sintezei de proteine
• 3 etape: inițiere, elongare, terminare (în fiecare participă proteine specifice numite
factori de inițiere, de elongare și de terminare)
• Cele două subunități ale ribozomului se asociază și ARNm se leagă la subunitatea
mică → ARNm va fi citit de către aparatul de translație în direcția 5’→3’
• Translația începe de la codonul start (inițiator): AUG (pentru metionină)
• Terminarea translației – are loc atunci când un codon stop apare în ARNm →
polipeptidul este eliberat de pe ultimul ARNt care a fost situat în situsul P
30
Consecințele mutațiilor
• Mutațiile rezultă în urma leziunilor ADN sau a erorilor apărute în cursul replicării,
rămase nereparate → pot fi transcrise în ARNm și pot duce, astfel, la sinteza unei
proteine cu secvență aminoacidică anormală