Tendine n taxonomia fungilor revoluia molecular

Cu cteva decenii n urm, vechea sistematic ce stabilea ntr-o manier cvasisimplist apartenena lumii vii la doar dou regnuri (vegetal i animal) a fost abandonat. n locul acesteia, s-a impus o nou clasificare, mai obiectiv i mai realist, ns permanent perfectibil n structura ei, datorit noilor criterii adoptate. Astfel, cele peste 1.400.000 de specii eucariote cunoscute au fost ncadrate n regnurile: Protozoa, Chromista, Fungi, Plantae i Animalia. Fungilor li s-a atribuit un regn aparte, a crui structur a fost obiectul a numeroase modificri i adugiri. Acestea s-au datorat n principal faptului c organismele considerate ca aparinnd n mod obinuit fungilor sunt deosebit de complexe i diverse. n plus, studiile de biologie molecular au artat c gradul de omologie al genomului este mai mare n cazul fungilor i animalelor, dect n cel al fungilor i plantelor. Regnul Fungi este alctuit din uniti taxonomice majore denumite phylum-uri i diviziuni subsecvente ale acestora clasele, ordinele, familiile i genurile fiecare dintre acestea putnd fi uor recunoscut pe baza terminaiei: Phylum-ul: - mycota Subphylum-ul: - mycotina Clasa: - mycetes Ordinul: - ales Familia: - aceae Apartenena fungilor la o unitate taxonomic sau alta, are la baz criterii morfologice, biochimice i genetice, care fac posibil discriminarea ntre diversele categorii de microorganisme. In cazul fungilor, noiunea de specie este un concept insuficient elucidat. Dac n cazul fungilor sexuai, specia este considerat a fi o populaie izolat prin bariere reproductive intrinseci, n cazul fungilor asexuai, noiunea de specie capt alte conotaii. In acest caz, specia este reprezentat de un grup de indivizi care au n comun o combinaie de caractere, n principal morfologice i biochimice. Ins, principalul impediment este reprezentat n acest caz de stabilirea numrului minim de caractere difereniale care s permit considerarea unei tulpini fungice ca nou specie. Demersurile taxonomitilor devin cu 105 att mai anevoioase, cu ct utilizarea tehnicilor moleculare de analiz a ADN-ului au demonstrat o inconstan secvenional a fragmentelor genice, chiar la tulpini considerate ca aparinnd aceleiai specii. De pild, secvena D2 o regiune variabil a genei codante pentru subunitatea ribozomal 25S, este suficient de polimorf pentru descrierea de noi specii, chiar n cazul n care gradul de substituie al nucleotidelor este mai mic de 1%. Taxonomia modern utilizeaz analiza secvenelor de nucleotide din componena ADNului, urmrind reclasificarea fungilor pe baza conceptului filogenetic de specie. Dezvoltarea tehnicilor de amprentare ADN a fcut posibil compararea genomului diverselor tulpini de fungi i stabilirea gradului de omologie al acestora. Pe aceast baz sunt reclasificate n prezent microorganismele acestui regn. Tehnicile moleculare, prin stabilirea secvenelor nucleotidice ale diferitelor fragmente de ADN, permit clasificarea cu acuratee a ntregii biodiversiti. Ele intesc elucidarea dispunerii nucleotidelor n diverse gene sau poriuni de gene. ADN-ul ribozomal este regiunea genomului fungic cea mai intens studiat deoarece ribozomii sunt prezeni n toate organismele i, n plus, poriunile genice comune, existente n toat lumea vie, alterneaz cu poriunile variabile, specifice, permind evaluarea gradului de coeziune taxonomic a entitilor vii studiate. n cazul fungilor filamentoi, este vizat ADN-ul codant al subunitii ribozomale 18S, iar n cazul levurilor domeniile variabile D1 i D2 ale fragmentului genic pentru subunitatea 25S. Alturi de ADN-ul ribozomal, sunt folosii uneori i intronii unor gene codante ale diverselor proteine sau enzime celulare ca -tubulina, actina, chitinsintetaza, acetilCoA-sintetaza, gliceraldehid-3fosfat dehidrogenaza sau lignin-peroxidaza. ADN-ul mitocondrial este de asemenea folosit ca marker genetic, att pentru identificarea unei tulpini fungice ct i pentru obinerea de date importante pentru studiile epidemiologice. Dimensiunea mic a moleculei de ADN mitocondrial cteva zeci de kilobaze perechi, i existena a ctorva copii identice ale moleculei reprezint caractere care faciliteaz extracia i purificarea sa comparativ cu moleculele de ADN

Fungi & Mycotoxins

Volume 2, No. 1, april 2008

nuclear a cror lungime mai mare le face vulnerabile n timpul procesrii. Sistemul clasic de taxonomie a microorganismelor utilizeaz exclusiv caractere morfologice i biochimice, a cror capacitate discriminatorie este oarecum limitat. Ele sunt nc destul de uzitate n sistematic, cu caracter orientativ ns, verdictul final de ncadrare a unei specii ntr-un gen sau altul revenind tehnicilor de genetic molecular. Aceast veritabil revoluie molecular care a condus la numeroase resistematizri ale lumii microorganismelor a debutat n anii '90 prin amplificarea i analiza genelor responsabile de sinteza ARN-ului ribozomal. In ultimul deceniu, odat cu avntul tehnicilor de biologie molecular, prin analiza genic de tip multi-locus, s-a intenionat propunerea unei taxonomii moleculare viabile, bazat pe grupri sistematice monofiletice. Astfel, s-au produs modificri majore ale grupelor sistematice, la toate nivelurile de organizare, cu dispariia unor entiti i apariia altora sau cu reclasificarea unor genuri i specii. Pn nu demult, cele 4 phylum-uri acceptate n regnul Fungi erau Chytridiomycota, Zygomycota, Ascomycota i Basidiomycota; la acestea, se aduga cu statut incert, Deuteromycota fungi fr nmulire sexuat cunoscut. Astzi, phylum-urile propuse n urma secvenializrii mai multor gene sunt Chytridiomycota, Neocallimastigomycota, Blastocladiomycota, Glomeromycota, Ascomycota, Basidiomycota i Microsporidia. Microsporidiile (microorganisme unicelulare parazite la animale) au fost incluse n regnul Fungi pe baza similitudinii structurale la nivelul genelor codante pentru subunitile ribozomale, - i -tubulina etc. O categorie aparte de microorganisme, incluse tradiional n regnul Fungi datorit aspectelor clinice exprimate, sunt nc studiate n cadrul micologiei medicale, dei din punct de vedere taxonomic ele aparin altor grupri sistematice. Este vorba de aa-numiii pseudofungi microorganisme aparinnd regnului Protozoa (phylum Mesomycetozoa, genul Rhinosporidium), respectiv regnului Chromista (phylum Oomycota, genurile Pythium i Saprolegnia).

Deuteromicetele, denumite i fungi imperfeci, fungi asexuai sau mitosporici, reprezint o grupare de microorganisme artificial creat n care au fost inclui micromiceii fr nmulire sexuat cunoscut. Morfologia majoritii deuteromicetelor este similar cu cea a fazelor anamorfe ale ascomicetelor i mai rar, ale basidiomicetelor, unele studii moleculare susinnd cu argumente irefutabile originea lor comun. De aceea, tendina actual este de a reclasa aceti fungi, incluzndu-i n phylum-urile Ascomycota i Basidiomycota, n uniti taxonomice aparte i bineneles dispariia acestui phylum denumit n trecut Deuteromycota. Pentru phylum-urile Ascomycota i Basidiomycota a fost propus o nou supragrupare taxonomic care le include subregnul Dikarya, datorit stadiului dicariotic (diploid) al hifelor care survine adeseori n ontogenia acestora. n cadrul phylum-ului Basidiomycota, vechile clase Basidiomycetes, Urediniomycetes i Ustilaginomycetes au fost nlocuite cu subphylumurile Agaricomycotina, Pucciniomycotina, respectiv Ustilaginomycotina. Argumentul adus n favoarea acestei modificri este faptul c termenul basidiomicete este folosit generic pentru toi fungii din phylum Basidiomycota, ceea ce nu este corect. Modificarea cea mai ampl au suferit-o zygomicetele al cror phylum (Zygomycota) nu mai este acceptat n cadrul regnului Fungi, deoarece analiza genetic a dovedit c este o grupare polifiletic, cu origini multiple. Astfel, taxoni tradiional inclui n phylum Zygomycota sunt astzi redistribuii n phylum Glomeromycota i n 4 subphylum-uri incertae sedis (care nu se regsesc n nici unul dintre phylum-urile existente) Mucoromycotina, Entomophthoromycotina, Kickxellomycotina i Zoopagomycotina. Taxonomia fungilor este i va rmne un domeniu extrem de dinamic, deoarece criteriile de referin pentru caracterizarea entitilor sistematice sunt mereu adugite i completate, pe msura acumulrii de noi cunotine i metode. Viitorul sistematicii fungilor st n adoptarea unei taxonomii moleculare, filogenetice, care s includ grupri monofiletice, cu grad mare de omologie genotipic. Dr. Mihai Mare

106
Copyright 2008, Romanian Society for Medical Mycology and Mycotoxicology