Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
3/G/15852
Formarea de competene de predare a
pentru cadrele didactice din
chimiei p
nvmntul preuniversitar liceniate n alte
discipline nrudite
nrudite
20:06
Structura i Funcia
Biomacromoleculelor
20:06
Carbohidraii
Lipidele
Proteinele
Acizii nucleici
20:06
20:06
4 din 109
Reacii de condensare
Polimerii
P
li
ii se fformeaz
prin
i reacii
ii d
de condensare
d
n care 2
molecule sunt legate covalent prin eliminarea unei molecule de
ap (unul din monomeri furnizeaz o grupare hidroxil
hidroxil, iar
cealalt un hidrogen
Celulele
pentru
condensare
Ce
u e e cheltuiesc
c e tu esc energie
e e g e pe
t u reaciile
eac e de co
de sa e
(polimerizare)
20:06
Reacii de hidroliz
Polimerii
P
li
ii suntt d
dezasamblai
bl i n monomerii prin
i
reacie de hidroliz
Hidroliza nseamn rupere cu ap (lysis = rupere)
Principial reacia de hidroliz este reversul reaciei
de condensare, dar n celule reaciile sunt
catalizate de enzime diferite
n celule att reaciile de
condensare ct i cele de
hidroliz sunt ireversibile
Hidroliza proteinelor n
procesul de digestie se
desfoar total diferit de
sinteza proteinelor
UVT CBG - Biochimie
20:06
CARBOHIDRAI
GLUCIDE
ZAHARIDE
20:06
Zaharide
Zaharide
Z
h id glucide
l id
carbohidrai = sinonime
Monozaharide (glucide
simple)
Formula molecular
(CH2O)n, unde n 3
Moleculele au o grupare
carbonil i multiple grupri
hidroxil
Polihidroxialdehide
aldoze
Polihidroxicetone - cetoze
20:06
Aldoze
Majoritatea
M
j it t numelor
l monoglucidelor
l id l se ttermin
i n oz:
glucoz, galactoz
n funcie de numrul de atomi de carbon din molecul avem
3 atomi trioze
4 atomi tetroze
5 atomi pentoze
6 ato
atomi hexoze
e o e
20:06
Aldoze
20:06
Cetoze
Dihidroxiacetona cea mai simpl cetoz nu are
atomi de carbon asimetrici
Cetozele cu 4 sau mai muli atomi de carbon
asimetrici au 1 sau mai muli atomi de carbon
asimetrici compui chirali (ce rotesc planul luminii
polarizate)
20:06
Izomerii
Variaia n arhitectura moleculelor organice poate fi
vzut n izomeri compui ce au aceeai formul
p
diferite.
molecular dar structuri diferite
i p
proprieti
1. Izomeri structurali (sau de caten) difer prin
aranjamentul covalent al scheletului catenei de
b
carbon
Numrul izomerilor posibili crete odat cu numrul
atomilor de carbon
Izomerii structurali pot s difere i prin poziia dublelor i
triplelor legturi
Butanul are doar 2
izomeri de caten
C8H18 are 18 izomeri
de caten
C20H42 are 366
366.319
319
izomeri structurali
UVT CBG - Biochimie
20:06
Izomerii
2 Izomeri geometrici difer prin aranjamentul
2.
substituenilor n jurul atomilor de carbon dublu legai
Izomeria geometric se datoreaz inflexibilitii legturilor
duble, care, spre deosebire de legturile simple, nu
permite atomilor s se roteasc n jurul axei legturii duble
Situsurile de legare ale enzimelor sau receptorilor pot s
discrimineze ntre izomerii cis trans: biochimia vederii
implic o schimbare indus de lumin n rodopsin un
compus chimic din ochi
20:06
Izomeri geometrici
n retina vertebratelor, evenimentul iniial n detectarea luminii
este absorbia luminii vizibile de ctre 11-cis-retinal. Energia
luminii absorbite (n jur de 250 kJ/mol) convertete 11-cisretinalul la all-trans-retinal, declannd schimbri electrice n
retina celulei ce conduc la formarea impulsului nervos
20:06
14 din 109
Izomerii optici
Enantiomerii sunt molecule care sunt imaginea n
oglind a celuilalt
Carbonul din mijloc
mijloc, hibridizat sp3, este numit carbon
asimetric fiind legat de 4 atomi sau grupe de atomi
toate diferite
Cele 4 grupri pot fi aranjate n spaiu n jurul atomului de
carbon asimetric n 3 moduri diferite, care sunt unul
imaginea
g
celuilalt n oglind
g
20:06
15 din 109
Stereoizomeri
Cnd sunt prezeni n molecul 2 sau mai muli (n)
centri chirali, atunci p
pot exista 2n stereoizomeri.
Unii izomeri sunt imaginea celuilalt n oglind i se
numesc enatiomeri.
Perechile de stereoizomeri care nu sunt imaginea n
oglind a celuilalt se numesc diasteroizomeri.
diasteroizomeri
20:06
Stereoizomeri
Exist 4 derivai ai 2,3-disubstituit butanului
2 centri chirali 22=4 stereoizomeri
2 cte 2 sunt enataiomeri (imagina celuilalt n oglind)
2 cte 2 sunt diasteroizomeri
20:06
17 din 109
Stereoizomeri
Enantiomerii au proprieti chimice aproape
identice dar difer ntr-o
identice,
ntr o caracteristic fizic
interacia cu lumina plan-polarizat.
n soluii
l ii separate,
t 2 enantiomeri
ti
i rotesc
t
planul
l
l
luminii plan-polarizate n direcii opuse, cu acelai
numr
de
d grade
d
Soluiile echimolare ale celor 2 enantiomeri
(amestec racemic) nu prezint rotaie optic
20:06
Polarimetru
Lumin plan
polarizat
Surs de
lumin
rotaia
observat
Tub prob
0
0
0
0
0
polarizor
Planu
este rotit
analizor
chimistul
tocilar
Se rotete pn
trece lumina
20:06
Conformaii
Conformaiile moleculare se refer la
aranjamentul spaial al gruprilor substituente,
substituente
care, fr ruperea vre-unei legturi, au
libertatea de a ocupa diferite poziii n spaiu,
spaiu
datorit liberei rotaii n jurul legturilor simple
20:06
Conformaii
n cazul etanului sunt posibile mai multe conformaii.
Conformaia intercalat este cea mai stabil, iar cea eclipsat cea mai puin
stabil
Nu este posibil s se izoleze nici una dintre aceste conformaii, deoarece
ele trec liber dintr-una n alta.
Dac unul sau mai muli atomi de H sunt nlocuii cu grupri funcionale
mari,
i gradul
d ld
de lib
libertate
t t d
de rotaie
t i scade
d ii numrul
ld
de conformaii
f
ii se
reduce
20:06
21 din 109
Stereochimia glucidelor
D,L
D
L se refer
f lla configuraia
fi
i centrului
t l i asimetric
i ti
cel mai ndeprtat de gruparea carbonilic
D,L se refer la centrul stereochimic de interes
raportat la D- i L-gliceraldehid
D,L nu specific semnul rotaiei luminii planpoliarizate
Toate structurile prezentate pn acum au fost
din seria stereochimic D
D l id l predomin
D-glucidele
d i n natur
t
20:06
Stereochimia glucidelor
20:06
Ciclizare monozaharide
n soluii
l ii apoase, monozaharidele
h id l cu 5 sau maii
muli atomi de carbon se ciclizeaz
n urma ciclizrii apare un nou centru chiral cei
doi izomeri se numesc anomeri.
OH-ul anomeric are caracter reductor
Reacioneaz cu ionii Cu22+ n mediu alcalin,
alcalin cu formare
de Cu+ i chiar Cu0.
Video Clip
20:06
24 din 109
20:06
20:06
20:06
20:06
20:06
Monozaharide
Monozaharidele
M
h id l ii n special
i l glucoza
l
suntt
molecule combustibil foarte importante pentru
celule
l l
n respiraia celular celulele extrag energia stocat
n moleculele de glucoz
20:06
Dizaharide
Dizaharidele
Di
h id l constau
t din
di 2 sau maii multe
lt
monozaharide unite printr-o legtur
glicozidic.
Maltoza dizaharid format prin condensarea a 2
molecule de glucoz
Se formeaz prin degradarea amidonului
amidonului. Se gsete n
bere
20:06
20:06
Dizaharide
Zaharoza
Z
h
dizaharidul
di h id l fformatt prin
i
condensarea unei molecule de glucoz i o
molecul
de ffructoz
l
l d
t
Plantele transport carbohidraii de la frunze la
f
f
rdcini i alte organe nefotosintetice
sub form
de
zahr.
L
Lactoza
dizaharidul
di h id l di
din llapte o molecul
l
l de
d
glucoz, condensat cu una de galactoz
20:06
Polizaharide
Polizaharidele
P
li h id l suntt macromolecule,
l
l polimeri
li
i cu
cteva sute pn la cteva mii de
monozaharide unite prin legturi glicozidice
Unele polizaharide servesc ca material de rezerv
cnd este nevoie de glucoz pentru energie
polimerii sunt hidrolizai
Alte polizaharide au rol structural - servesc ca
material pentru realizarea pereilor celulari a a altor
componente structurale.
20:06
Amidonul
Amidonul p
polizaharid de rezerv n plante
p
format
din uniti de glucoz unite prin legturi (14) i
(16) glucozidice.
Unghiul acestor legturi face ca polimerul s fie o spir
helix.
A il
Amiloza
numaii llegturi
t i (14)
(1 4)
Amilopectina legturi (14) dar i (16) glucozidice puncte de ramificare
20:06
35 din 109
Amidonul
Plantele stocheaz surplusul de glucoz sub form
f
de amidon (form de stocare a energie)
Granule
G
l n
structuri
t t i celulare
l l
numite
it plastide
l tid termen
t
generic inclusiv cloroplaste. Lanurile de amidon sunt
unite
prin legturi
u
te ntre
tep
egtu de hidrogen.
d oge
-Amilazele
A il
l ((numaii n plante)
l t ) hid
hidrolizeaz
li
tot
t t numaii
legturile (14) glucozidice, dar pornind de la
captul nereductor
nereductor, cu formare de maltoz
maltoz.
UVT CBG - Biochimie
20:06
Glicogenul
Animalele
a e e stoc
stocheaz
ea g
glucoza
uco a sub form
o de g
glicogen
coge
similar cu amilopectina, uniti de glucoz unite prin
legturi (14) i (16) glucozidice dar mai
ramificat.
ramificat
1-2% din greutatea umed a muchilor i 5-8% din cea a
ficatului reprezint
p
glicogenul
g
g
Prin hidroliza sa poate susine activitatea muchilor i
respectiv a ntregului organism pentru perioade scurte de
timp (ntre mese
mese, maxim o zi)
zi).
20:06
37 din 109
Polizaharide de structur
Celuloza
C
l l
componenta
t major
j a pereilor
il
celulari ai plantelor
La nivel planetar plantele produc 1011 (100 miliarde)
tone celuloz pe an cea mai abundent
component organic de pe Terra
Este format din uniti de glucoz unite prin legturi
(14) glicozidice.
Cele 2
forme
anomerice
ale
glucozei
UVT CBG - Biochimie
20:06
38 din 109
Amidonul i Celuloza
n amidon
id legturile
l t il di
dintre
t moleculele
l
l l d
de
glucoz sunt (14) iar n celuloz (14).
20:06
Amidonul i Celuloza
Moleculele
M
l
l l d
de
amidon sunt sub
form de elice
(helix),
Amidonul
reacioneaz cu iodul
i d o coloraie
albastr
Amidonul este
hid li t d
hidrolizat
de - ii
amilaze
UVT CBG - Biochimie
20:06
40 din 109
Celuloza
C l l
Celuloza
este
t lilinear,
nu are ramificaii
ifi ii
Neformnd elice, nu reacioneaz cu iodul
Nu este atacat de amilaze
Celuloza este hidrolizat de celulaze
Foarte puine organisme au celulaze
Oamenii nu au celulaze fibrele de celuloz trec
prin tubul digestiv i sunt eliminate cu fecalele
Fibrele de celuloz freac pereii tubului digestiv
i stimuleaz secreia de mucus, care ajut la
trecerea mai uoar a mncrii prin tractul
digestiv
Dei celuloza nu este un nutrient, este o
component important pentru o diet sntoas
UVT CBG - Biochimie
20:06
Celuloza
Lanurile
L
il d
de
celuloz sunt
unite
it ntre
t ele
l
prin legturi de
hid
hidrogen se
formeaz
mnunchiuri
hi i d
de
astfel de lanuri
microfibrile
i fib il
cabluri
puternice
t i de
d
legtur
UVT CBG - Biochimie
20:06
Celuloza
Anumite
A
it b
bacterii
t ii pott d
degrada
d celuloza
l l
lla
glucoz
n rumenul vacilor (primul compartiment din
stomacul lor) exist bacterii ce diger celuloza
Furnicile fac i ele o asociaie simbiotic cu
bacteriile ce difer celuloza
Unii fungi pot digera celuloza
20:06
Chitina
Chitina polizaharid
Chiti
li h id ffolosit
l it d
de
artropode (insecte, pianjeni,
crustacee i alte animale
nrudite) s-i
s i construiasc
exoscheletul
Exoscheletul o cutie extern
dur, ce nconjoar prile moi
ale unui animal
Chitina pur este flexibil, dar se
ntrete prin impregnare cu
carbonat de calciu.
UVT CBG - Biochimie
20:06
44 din 109
Chitina
Chitina formeaz exoscheletul artropodelor se
vede cum un fluture iese din nveliul su de chitin
j ca p
p
n care era p
protejat
pup
Chitina este folosit pentru a face firele chirurgicale
puternice i flexibile, care se descompun dup un
ti
t refacerea
f
il
timp
necesar pentru
rnilor
20:06
LIPIDE
20:06
Lipide
Lipidele
Li
id l suntt una di
dintre
t cele
l 4 clase
l
majore
j
d
de
biomolecule, care nu includ polimeri
Clasa este foarte eterogen - compuii numii
lipide sunt grupai mpreun pentru c nu sunt
solubili n ap (sunt hidrofobi) dar sunt solubili
solveni
n
l
i organici
i i (b
(benzen, cloroform,
l f
etc.)
t )
Dei
unele lipide
p
p
prezint i p
poriuni
p
polare,, cea
mai mare parte a moleculelor lor sunt
hidrocarburi
20:06
Lipide
Clasificare
Complexe saponificabile - conin n
molecul acizi grai
Uleiuri, grsimi, fosfolipide, ceruri
Simple
Si
l nesaponificabile
ifi bil nu coni
i
acizi grai
g
Steroizi, terpene
20:06
Lipide
F
Funcie
i
Energetic similar cu glucidele prin
oxidare pun n libertate o mare cantitate de
energie (mai mare dect glucidele)
Structural formeaz bistratul lipidic al
membranelor biologice
20:06
Grsimile
Grsimile
G
i il suntt lilipide
id complexe
l
fformate
t prin
i
esterificarea glicerinei cu acizii grai.
20:06
Acizii grai
Acizi
A
i i graii - acizi
i i carboxilici
b ili i cu maii mult
lt d
de 12 atomi
t i
de carbon lungime
Saturai
Acid Lauric (12 C)
Acid Miristic (14 C)
Acid Palmitic (16 C)
Acid Stearic (18 C)
Acid Arahidic (20 C)
Molecula linear
20:06
51 din 109
Acizii grai
Acizi
A
i i graii - acizi
i i carboxilici
b ili i cu maii mult
lt d
de 12 atomi
t i
de carbon lungime
Saturai
Acid Lauric (12 C)
Acid Miristic (14 C)
Acid Palmitic (16 C)
Acid Stearic (18 C)
Acid Arahidic (20 C)
Molecula linear
20:06
52 din 109
Acizii grai
Mononesaturai
Palmitoleic acid (16:19)
Oleic
(18:1
Ol i acid
id (18
1 9)
M l
l f
t
Molecule
frnte
20:06
Acizii grai
20:06
20:06
20:06
Unturi i uleiuri
Majoritatea grsimilor animale sunt
saturate
Cozile sunt formate din acizi grai
g
saturai
U t
Untura
ii untul
t l grsimi
i i saturate
t t suntt
solide la temperatura
p
camerei
20:06
Unturi i uleiuri
Majoritatea
M
j i
grsimilor
i il di
din plante
l
((ii peti)
i)
sunt nesaturate
Uleiurile sunt lichide la temperatura camerei
Legturile duble, curbnd lanurile, nu permit
p
compact
p
a moleculelor i
o mpachetare
solidificarea uoar
Uleiurile hidrogenate legturile duble
hidrogenate artificial pentru a obine
margarine cu puncte de solidificare mai
ridicate
UVT CBG - Biochimie
20:06
Unturi i uleiuri
O diet
di t bogat
b
t n
grsimi
i i saturate
t t este
t unull di
din
mulii factori ce contribuie la formarea bolilor
cardiovasculare ateroscleroza
Depozite de lipide formeaz plci pe pereii interni
ai vaselor de snge, mpiedicnd curgerea sngelui
i reducnd elasticitatea vaselor
Grsimile au primit o conotaie aa de negativ n
cultura noastr nct te ntrebi dac au vreun scop
util
20:06
20:06
20:06
20:06
20:06
63 din 109
Ceruri
Esteri
E
t i aii alcoolilor
l
lil cu caten
t
lung cu acizi grai cu
caten lung
Sunt (foarte) insolubili n medii
apoase
Pielea animalelor i blnurile
sunt acoperite cu ceruri
F
Frunzele
l ii ffructele
t l multor
lt
plante sunt acoperite cu
straturi
t t i groase de
d cear
20:06
64 din 109
Terpene
Derivai pe baz de izopren
Moleculele de izopren pot condensa cap
cap
coad sau coad coad.
Aminoacizi
20:06
Terpene
Derivai pe baz de izopren
Compuii ce conin 2 molecule de izopren se numesc
monoterpene
Aminoacizi
20:06
66 din 53
Terpene
Compuii ce conin 3 molecule de izopren se
p
numesc sescviterpene
Aminoacizi
20:06
Terpene
Compuii cu 4 molecule de izopren se numesc
diterpene, cu 6 triterpene, cu 8 tetraterpene, .a.m.d.
Aminoacizi
20:06
68 din 53
Terpene
Toii sterolii
T
t lii (i
(inclusiv
l i colesterolul)
l t l l) suntt molecule
l
l b
bazate
t pe tterpene
Hormonii steroizi sunt compui terpenici
Aminoacizi
20:06
69 din 53
Aminoacizi
20:06
20:06
Aminoacizi
20:06
n
animale balana ionic, funcii metabolice i
funcii sexuale
20:06
Steroizi
Hormoniiii sexuali,
H
li d
deii au o structur
t t de
d b
baz
20:06
PROTEINE
Aminoacizi
Structuri primare, secundare,
t i
teriare,
cuaternare
t
ale
l proteinelor
t i l
20:06
Proteine
IImportana
t proteinelor
t i l este
t artat
t t ii d
de
numele lor proteios = primul loc.
Proteinele reprezint 50% din greutatea uscat a
majoritii celulelor
Proteinele sunt cele mai sofisticate molecule
cunoscute fiecare tip de protein avnd o form
tridimensional unic conformaia
Dei diverse ca structur
structur, toate proteinele sunt
formate din 20 de aminoacizi.
20:06
Aminoacizii
Aminoacizii
A
i
i ii suntt molecule
l
l ce prezint
i t o grupare
carboxil acid i o grupare amino bazic.
n centrul moleculei
este un atom de
carbon asimetric
numit carbon alfa ()
La el se leag o
grupare carboxil,
una amino,
amino un H i un
radical R
Atomul C este
asimetric (optic activ)
dac cei 4
substitueni sunt
diferii
UVT CBG - Biochimie
20:06
77 din 109
20:06
Aminoacizi hidrofobi
20:06
79 din 109
20:06
80 din 109
Aminoacizi ncrcai
20:06
20:06
Aminoacizi neproteici
Aa neproteici nu se gsesc n proteine
Nu au cod genetic nu exist pentru ei
tRNA.
tRNA
Acidul
-aminoabutiric ((GABA)) un
neurotransmitor, este format prin
decarboxilarea Glu
Histamina amin biogen, rezultat din
decarboxilarea His
Neurotransmitor
20:06
Aminoacizi neproteici
Al i
-Alanina
p
p p
prezent n 2 peptide
naturale
carnozina i anserina,
ct i n vitamina acidul pantotenic,
precursorul coenzimei A.
Adrenalina (epinefrina)
Derivat din Tyr
hormon
20:06
Aminoacizi neproteici
Betaina
B
t i - intermediar
i t
di metabolic
t b li
provenind din Gly
Homoserina - intermediar
metabolic provenind din Ser
Homocisteina - intermediar
metabolic provenind din Cys
UVT CBG - Biochimie
20:06
Aminoacizi neproteici
Penicilinamina
P
i ili
i constituent
tit
t all penicilinelor
i ili l
Ornitina intermediar metabolic provenind din
Lys
20:06
20:06
87 din 109
Legturi peptidice
Prin
P
i eliminarea
li i
enzimatic a
elementelor
l
t l apeii
(dehidratare) de
la o grupare
carboxil a unui aa
ii o grupare
amino a altui aa
se obine un
dipeptid, unit
printr-o legtur
peptidic.
UVT CBG - Biochimie
20:06
88 din 109
Peptide
Oligopetide
Oli
id un numr
relativ
l i redus
d ((sub
b
20) de aminoacizi unii prin legturi
peptidice
Peptide (polipeptide) un numr relativ
mare (de la 20 la cteva sute sau chiar
mii) de aa unii prin legturi peptidice
Captul amino-terminal primul aminoacid
Captul carboxi-terminal
carboxi terminal ultimul aminoacid
20:06
Peptide
Termenul de peptid se utilizeaz
cnd ne referim doar la lanul de
aminoacizi, iar termenul de protein
cnd considerm c acel lan are o
conformaie tridimensional i o
anumit funcie
biologic
g
20:06
20:06
La p
proteinele formate din 2 sau mai multe
subuniti monomerice definim i structuri
cuaternare
20:06
Structura primar
Ordinea
O
di
aminoacizilor
i
i il n llanul
l
polipeptidic pornind de la
captul
t l amino-terminal
i t
i l pn
lla
cel carboxi-terminal
Lizozimul o enzim ce hidrolizeaz
structurile polizaharidice din pereii
bacterieni este format din 129 aa
Ordinea celor 129 aa este precizat
de structura genei ce sintetizeaz
aceast polipeptid
Dac secvena de aa ar fi fost la
ntmplare ar fi existat 20129 peptide
cu structuri primare diferite
UVT CBG - Biochimie
20:06
93 din 109
Structura primar
Chiar i schimbarea unui singur aa n structura
primar a peptidelor face ca proteinele respectiv s
modifice sau s-i
p
p activitatea
i
piard complet
biologic
Schimbarea Glu6 cu Val6 n structura primar a
hemoglobinei duce la apariia anemiei falciforme
hemoglobinei,
Celulele
falciforme
pot bloca
vasele
capilare,
mpiedicnd
hrnirea
unor organe
g
vitale
20:06
94 din 109
Structura primar
Frederick Sanger a fost primul biochimist ce a
descifrat structura primar a unei proteine insulina
Proteinele ce urmau s fie analizate erau supuse unei
digestii controlate cu enzime specifice
Fragmentele
obinute
polipeptidice
ag e te e ob
ute prin
p ruperea
upe ea lanurilor
a u o po
pept d ce la
a
nivelul unor anumii aminoacizi erau separate prin metode
cromatografice
Pi t
Printr-un
procedeu
d chimic
hi i recurentt se d
determina
t
i structura
t t
primar a fragmentelor mici (sub 15 aa)
Structura primar era apoi determinat prin potrivirea a 2-3
seturi de fragmente obinute prin hidroliza controlat cu
enzime sau catalizatori chimici diferii
Seria I: Ala-Gly-Ser-Leu-Trp Glu-Cys-Ala-Val-Ser-Met
Seria II: Ala-Gly-Ser Leu-Trp-Glu-Cys-Ala Val-Ser-Met
Final: Ala-Gly-Ser-Leu-Trp-Glu-Cys-Ala-Val-Ser-Met
UVT CBG - Biochimie
20:06
Structura secundar
Aranjamentul
A
j
t l
reproductibil al lanului
polipeptidic
li
tidi urmnd
do
singur direcie n spaiu
n structura unui lan
polipeptidic o treime din
l t il simple
legturile
i l suntt
legturi C-N care nu se
pot roti,
roti deoarece au
caracter de dubl
legtur.
legtur
Restricii suplimentare
apar datorit tipului
radicalilor R
UVT CBG - Biochimie
20:06
96 din 109
Structura secundar
ntre gruprile C
C=O
O i N
N-H
H
(fie de pe acelai lan, fie
de pe lanuri polipeptidice
diferite) se pot forma
legturi de hidrogen
Cu ct numrul legturilor
de hidrogen este mai mare
cu att conformaia
f
este
mai stabil
Tipuri de structuri
secundare
-Helix
-Foi pliate
20:06
97 din 109
Structuri -helix
Structur
St
t tip
ti elice
li ((spiral)
i l) d
de
dreapta cu
3,6 aminoacizi pe spir
0,15 nm pasul spirei
Legturi de hidrogen intralan, ntre
gruprile C=O ale unui aminoacid i
gruprile N
N-H
H ale cel
cel-ui
ui de
de-a
a3
3-lea
lea
aminoacid, practic de pe spira
urmtoare
Legturile de H sunt paralele ntre
ele,, ca nite
linii g
generatoare p
pe
cilindrul imaginar creat de lanul
polipeptidic
UVT CBG - Biochimie
20:06
Structuri -helix
-Keratinele
K ti l suntt proteine
t i ce au structuri
t t i helix pe toat lungimea lanului polipeptidic
Se gsesc n coarne i unghii, unde sunt proteine
dure, fragile conin pn la 22% Cys
n piele, pr, ln coninutul de Cys este de numai
10.14% i aceste keratine sunt mai flexibile.
n -keratinele din pr 2 lanuri polipeptidice cu
structura secundar -helix de dreapta sunt
rsucite
20:06
Structuri -helix
20:06
Structurile
-Keratinele
keratinele
nu se ntind
n aceste
condiii.
condiii
-keratinele
formeaz
structuri mai
relaxate
numite
-foi
pliate.
UVT CBG - Biochimie
20:06
paralele.
Considernd sensurile lanurilor, acestea pot fi
paralele
l l sau antiparalele
ti
l l
n foile paralele distana
47
ntre lanuri este de 3
3,47
n foile antiparalele 3,25
20:06
20:06
20:06
Bucle-
Cu excepia keratinelor i a altor cteva tipuri de
proteine n care structurile de tip -helix sau -foi
pliate sunt unicele aranjamente
aranjamente, majoritatea
proteinelor globulare prezinte zone sau bucle de
ntoarcere a lanului polipeptidic gruparea C=O
C O este
legat prin legturi de hidrogen cu gruparea N-H de la
al 3-lea aa.
n zonele de curbur predomin Pro i Gly.
20:06
Structuri teriare
Aranjamentul
A
j
t l specific,
ifi reproductibil
d tibil all llanului
l i
polipeptidic n spaiul tridimensional
Moleculele globulare i obin conformaia
tridimensional prin faptul c lanul polipeptidic ia
i i scurte
t dif
it structuri
t t i secundare
d
pe poriuni
diferite
helix, -foi pliate, unite prin bucle -de ntoarcere i
chiar i prin zone fr o structur organizat
organizat.
Structurile globulare sunt realizate datorit
interaciunilor dintre resturilor R
Interacii ionice ntre aa ncrcai pozitiv i / sau negativ
Legturi de hidrogen Ser,
Ser Tyr,
Tyr Cys,
Cys Lys,
Lys His,
His Arg
Arg, Asp
Asp,
Asn, Glu, Gln
Interacii
hidrofobe Leu, Ile, Val, Met, Trp,
p Phe
Legturi disulfidice intralan Cys-Cys
UVT CBG - Biochimie
20:06
Structuri teriare
20:06
Structuri teriare
20:06
Structuri teriare
Pe msur ce o protein se mpacheteaz pentru a
lua conformaia activ, aa hidrofobi se orienteaz
spre interiorul ghemului
ghemului proteic,
proteic ferii de contactul
cu apa, iar aa polari ocup poziii spre exterior,
pentru a avea contact cu moleculele de ap
Procesul de mpachetare este un proces dirijat
termodinamic impus de structura primar a lanului
termodinamic,
polipeptidic
20:06
Structuri cuaternare
Aranjamentul
A
j
t l specific,
ifi reproductibil,
d tibil all llanurilor
il
polipeptidice unele fa de altele n cazul unei
proteine
t i oligomere
li
Fiecare lan n parte are structura sa teriar, dar
care se asambleaz cu celelalte
prin modul n
lanuri din oligomer impune o anumit conformaie
acestuia
Interaciile care intervin n stabilizarea structurilor
cuaternare
Legturi electrostatice: ionice i dipolare
Legturi de hidrogen
Interacii hidrofobe
Legturi covalente Cys-Cys interlanuri
UVT CBG - Biochimie
20:06
Structuri cuaternare
20:06
Structuri cuaternare
Colagenul
C
l
l principala
i i l protein
t i a
esuturilor conective ale tendoanelor,
cartilajelor,
dinilor
til j l oaselor,
l di
il
Unitatea de baz este
tropocolagenul
trei helixuri polipeptidice (3,3 aa per
spir, cu pas de 2,9)
ncolcite ntre
ele (aprox. 1000 resturi de aa per lan)
M
Masa
molecular
l
l 285 kDa
kD
Lungime 300 nm, diametru 1,4 nm
Compoziie aproape tot al 3-lea aa
este Gly, iar Pro i Hyp formeaz 30%
20:06
Hemoglobina
Format
F
t din
di 2 llanuri
i ii 2 llanuri
i (a
( nu se
confunda cu structurile secundare)
Fiecare dintre
lanuri are poriuni
cu structuri
secundare de tip helix -foi pliate
helix,
pliate,
bucle de ntoarcere
i zone
aleatoare
((random
random coil)
coil )
UVT CBG - Biochimie
20:06
mpachetarea proteinelor
O polipeptid
li
tid cu o anumit
it structur
t t primar
i
se
auto-mpacheteaz ntr-o conformaie
tridimensional specific determinat i
meninut de diverse tipuri de legturi i
interacii ntre resturile de aminoacizi
C f
Conformaia
i adoptat
d t t d
de llanul
l polipeptidic
li
tidi
depinde de compoziia mediului nconjurtor
pH
Trie ionic i compoziia ionic a mediului
Temperatur
UVT CBG - Biochimie
20:06
Denaturarea proteinelor
Dac condiiile de mediu se schimb
schimb, se modific i
conformaia proteinelor din conformaia nativ
(activ) proteinele se pot despacheta i deveni
inactive
Conformaia despachetat random coil (fir la ntmplare
ntmplare,
aleatoare)
Procesul de denaturare poate fi reversibil sau ireversibil
20:06
Denaturarea proteinelor
D
Denaturarea
t
poate
t avea loc
l dac
d
g
Proteinele sunt p
puse ntr-un mediu organic,
hidrofob
eter, cloroform aa hidrofobi nu mai sunt n
interior ci vor fi expui
p la interfaa
cu mediul
organic.
Compuii chimici ce rup legturile de hidrogen
uree, guanidin hidrocloric destabilizeaz
structurile secundare ordonate.
Cldur excesiv coagularea albuului de ou la
fierbere
20:06
Denaturarea proteinelor
Deoarece n multe
D
lt situaii
it ii d
denaturarea
t
este
t
reversibil proteinele i reiau conformaiile
active
dup
ti d
ce agentul
t l denaturant
d
t
t a fost
f t
eliminat din mediu rezult c informaia
mpachetrii
h t ii este
t iintrinsec
ti
ii
necesar
depinde de structura primar a polipeptidei
Dei se cunosc structurile primare ale peste
proteine i
cele teriare
ale peste
p
100.000 p
10.000, structurile teriare nu se pot prezice cu
exactitate
Factorii de mediu din celule sunt compleci i
contribuia lor poate fi hotrtoare pentru
adoptarea unei anumite conformaii stabile
UVT CBG - Biochimie
20:06
Chaperoni
Chaperonii (chaperoninele) sunt proteine ce ajut
moleculele peptidice s se mpacheteze n
conformaia activ
activ.
Chaperonii nu specific exact conformaia activ ci izoleaz
polipeptidul
nou sintetizat de influenele
negative
din
p
p p
g
mediul celular, oferindu-i un mediu propice pentru a se autompacheta cum trebuie.
20:06
20:06
20:06
Funcia proteinelor
P t i structurale
Proteine
t t l funcia
f
i d
de suport:
t
j
Insectele
i p
pienjenii
folosesc fibre de mtase
pentru a-i realiza coconii i plasele
Colagenul i elastina realizeaz o reea fibroas n
esuturile conective animale
Keratinele asigur rigiditatea i elasticitatea unor
esuturi ca prul, coarnele, penele i alte derivate
ale pielii
20:06
Funcia proteinelor
Proteine
P
t i de
d rezerv
funcia
f
i d
de stocare
t
a
aminoacizilor:
Ovalbumina este proteina din albuul de ou, folosit
ca surs de aminoacizi n perioada de dezvoltare
a embrionului
Cazeina proteina major din lapte sursa major
de aminoacizi pentru puii mamiferelor
Plantele stocheaz proteine n semine: gliadina n
seminele de gru
20:06
Funcia proteinelor
Proteine
P
t i de
d transport
t
t funcia
f
i d
de transport
t
t a
altor substane:
Hemoglobina protein ce conine fier heminic
transport prin sngele vertebratelor O2 i CO2.
Exist proteine specializate ce transport molecule
prin membrane
20:06
Funcia proteinelor
Proteine
P
t i hormonale
h
l funcia
f
i d
de coordonarea
d
unor activiti ale organismului:
Insulina hormon secretat de pancreas ajut la
reglarea concentraiei glucozei n sngele
vertebratelor
20:06
Funcia proteinelor
Proteine
P
t i receptoare
t
funcia
f
i d
de rspuns
a
celulei la stimuli chimici:
Receptorii proteici membranari din celulele
nervoase detecteaz mediatorii chimici sinaptici
eliberai de alte celule nervoase
20:06
Funcia proteinelor
P t i contractile
Proteine
t til funcia
f
i d
de micare:
i
p
p
Actina i miozina sunt responsabile
pentru
contracia muscular
Alte proteine sunt implicate n micrile flagelilor
i cililor, micrile organitelor, etc.
20:06
Funcia proteinelor
P t i de
Proteine
d aprare
funcia
f
i d
de protecie:
t i
p recunosc i distrug
g bacteriile i
viruii.
Anticorpii
20:06
Funcia proteinelor
Proteine
P
t i enzimatice
i ti funcia
f
i d
de accelerare
l
selectiv a reaciilor chimice:
Enzimele digestive catalizeaz hidroliza polimerilor
din componena hranei.
20:06
ACIZI NUCLEICI
20:06
Acizii nucleici
E i t 2 titipurii d
Exist
de acizi
i i nucleici
l i i
DNA acid dezoxiribonucleic
RNA acid ribonucleic
20:06
DNA
DNA este o biomacromolecul foarte
lung ce conine sute sau chiar mii
de gene
Informaiile necesare activitilor
cel lare incl
celulare,
inclusiv
si cele cer
cerute
te pentr
pentru
autoreproducerea
p
((multiplicarea)
p
)
celulelor se afl n structura DNA
20:06
DNA
Totuii DNA nu este iimplicat
T
li
di
direct n
desfurarea activitilor celulare (aa
cum un program software nu tiprete un
d
t cii d
f
ii uneii
document,
doar d iinformaii
imprimante
p
cum s o fac)) p
proteinele
sunt cele care implementeaz programele
genetice
Hemoglobina
g
transport
p
oxigenul
g
i nu DNA,
care instruiete celula cum s fac
hemoglobin
hemoglobin.
UVT CBG - Biochimie
20:06
RNA
Fiecare gen
Fi
di
din
structura linear a
moleculei
de DNA
l
l id
codific sinteza unei
l
l d
RNA
molecule
de mRNA
mRNA interacioneaz cu
mainria
i i celular
l l pentru
t
sinteza proteinelor pe
care o informeaz cum s
construiasc acea
protein specific.
Curgerea informaiei
genetice
DNAmRNAprotein.
UVT CBG - Biochimie
20:06
20:06
20:06
Structura DNA
A fost elucidat
de Watson i
Crick (1953)
Structura primar
ordinea
nucleotidelor n
lanul
polinucleotidic
St uctu a
Structura
secundar
aranjamentul
lanurilor urmnd
o direcie n
spaiu
i
UVT CBG - Biochimie
20:06
Structura DNA
Molecula
M
l
l d
de DNA este
t fformat
t di
din 2 llanuri
id
de
polinucleotide ordonate spiralat, una n jurul
celeilalte, formnd un dublu-helix.
35)
Cele 2 lanuri sunt antiparalele (53
(5 3 3
5 )
Bazele azotate sunt orientate spre interior
formnd legturi de hidrogen: A=T
A=T, GC
Cele 2 catene (lanuri) au structuri complementare
5-ATGCAAGCCT-3 pe un lan nseamn
3-TACGTTCGGA-5 p
pe cellalt
Prin convenie se ncepe de la captul 5-terminal
20:06
Replicare DNA
Replicarea
R
li
semiconservativ se
poate
deoarece
t realiza
li d
cele 2 catene au
t t i complementare
l
t
structuri
20:06
Studiul evoluiei
Analiznd
A
li d structurile
t t il primare
i
ale
l proteinelor
t i l ii
acizilor nucleici (DNA i mRNA) de la specii diferite
se poate
de rudenie
filogenetic
t stabili
t bili gradul
d ld
d i fil
ti n
funcie de gradul de similaritudine
Specii
Om
Gorila
Gibon
Maimua Rhesus
oarece
B
Broasc
Numr de
aminoacizi diferii
n lanul al
hemoglobinei (total
146 aminoacizi)
0
1
2
8
27
67
20:06