10/19/2009

Evoluia conceptului despre gen

ADN
macromolecul bicatenar; secvene nentrerupte de perechi de nucleotide; deine informaia despre sinteza ARN i

Codul genetic - ADN:

Litere: A, G, C, T Cuvinte (un codon un aminoacid):
AAG - lys AGC - ser GCA - ala TTC phe TAG stop

proteine.

Fraze: 5' AAGAGCGCATTCTAG 3'

lys ser ala phe stop

Expresia genelor

ADN

ARNm

Protein
Catena codogen (netranscris) Catena anticodogen (transcris)

5-ATTGCAAGATTACCATGT-3 ATTGCAAGATTACCATGT3-TAACGTTCTAATGGTACA3-TAACGTTCTAATGGTACA-5 5-AUUGCAAGAUUACCAUGU-3 AUUGCAAGAUUACCAUGU-

Transcripie (ARN-polimeraza)
ARNm

Translaie (ARNt, pe ribozomi) Leu Ala Arg Leu Pro Cys polipeptid

10/19/2009

Gena:
Definiie Localizare i granie Structur Funcii Tipuri Proprieti Particulariti

Definiie:
Gena un fragment polinucleotidic din molecula de ADN care deine informaia despre sinteza:
unui lan polipeptidic sau ctorva lanuri polipeptidice nrudite sau a unei molecule de ARN funcional (ARNr, ARNt, ARNsn)

Expresia genelor

Clasificarea genelor:
ADN ARNm ARNr ARNt Protein
Gene clasa I - pentru ARNr 28S, 18S i 5,8S; Gene clasa II = structurale pentru ARNm

proteine;
Gene clasa III pentru ARNt, ARNr 5S.

Localizarea i graniele genelor:

Genele sunt localizate de-a lungul moleculelor de ADN; Genele se prezint sub form de secvene unice sau repetate; Genele unei molecule de ADN sunt separate prin secvene necodificatoare spaiatori (spacer); Genele nu au granie fixe morfologice, doar granie funcionale; Lungimea genelor este variabil.

10/19/2009

Numrul i mrimea genelor la diferite organisme

Specia Mrimea genomului, p.n. 4.2 x 106 Mrimea medie a genelor, kb 1.2 Numrul aproximativ de gene 2.350

Escherichia coli Saccharomyces cerevisiae Drosophila melanogaster Homo sapiens

1.3 x 107 1.4 x 108 3.16 x 109

1.7 11.3 16.3

5.200 8.000 30.000

- Dimensiunile genomului uman 3,164 x 109 pb - 2% din genomul uman codific pentru proteine - Numrul genelor - 30000-40000 - Cromozomul 1 conine cel mai multe gene 2610 - Cromozomul Y conine cel mai puine gene 255 - Funcia cunoscut la 50% dintre genele umane studiate - Dimensiunile genelor n medie 3000 pb - Gena -globinei 1,5 kb - Gena insulinei 1,7 kb - Gena catalazei 34 kb - Gena distrofinei - 2,4 Mb

Repartizarea genelor umane dup lungime

Lungimea, kb pn la 10 10-25 25-50 51-100 101-500 peste 500 n % de la numrul total 23,3 35,6 20,2 13,0 6,7 1,2

Funcia genelor:
La nivel molecular controlul biosintezei unui

Fiecare celul a organismului conine setul complet de gene (30-40000 perechi gene pentru 46 mol. ADN nuclear) (30Expresia genic numai 10% din toate genele

polipeptid protein funcional; La nivel celular formarea unei structuri celulare, lan metabolic, cale de semnalizare, etc.; La nivel tisular i de organe realizarea unei funcii specifice (respiraie, digestie, contracie muscular, etc.;) La nivel de organism caracter specific.

Expresie continu Gene ARNr Gene ARNt Gene house keeping

Expresie temporal dependent: - de esut; - de perioada ontogenetic; - de perioada ciclului celular; - de factorii de mediu

Non-expresie pseudogene

10/19/2009

Structura general a unitilor transcripionale

Gene cl.II = structurale

(25% din ADN nuclear)

Codific unul sau mai multe polipeptide; Formeaz uniti transcripionale monocistronice; Au structur mozaic (exon/intron); Pot fi transcrise:
n toate celulele organismului cu specificitate de esut sau vrst;

Regiune central codificatoare; Regiuni reglatoare: proximal PROMOTORUL distal TERMINATORUL

Secvene modulatoare

Sunt transcrise de ARN polimeraza II ntr-un transcript primar preARNm; Sunt numeroase, de regul, unice i heterogene; Pot forma familii multigenice repetitive sau nonrepetitive; Prezint polimorfism individual.

Tipurile genelor structurale

House keeping gene ce codific proteine celulare

Familiile de gene pentru globine

indispensabile, active n toate tipurile de cel., n toate perioadele vieii; esut specifice gene ce codific proteine necesare specializrii tisulare; Reglatoare ale ontogenezei; Dependente de factorii de mediu.

Particularitile structurii genelor de clasa II

Iniierea transcripiei genelor de clasa II

-40

-30

-20

-10

+1

+10

+20

+30

TAFs TFIID TFIIA TFIIB

ARN-Polimeraza II TFIIF TFIIE

10/19/2009

Regiunile genelor cl.II

Promotor: boxa TATA (-20, -30) boxa CAAT (-70, - 100) boxe esut specifice ( - ) Regiunea codificatoare: SIT - +1, secvena lider exon1/intron/exon2/intron/.../exonn

Promotorul genelor cl.II

Regleaz iniierea transcripiei:
Activarea genei int; Fixarea TF i ARN polimerazei II; Identificarea (+1) i catenei transcrise; Direcionarea ARN polimerazei II.

Nu se transcrie; Promotorii diferitor gene se deosebesc prin combinarea diferitor boxe; Mutaiile n secvena de nucleotide a promotorului poate duce la inactivarea genei.

Terminatorul
Situs de poliadenilare

Enhancers i silencers

Elemente structurale din compoziia promotorilor la eucariote

Structura Secvena Poziia Dimensiunile ADN-ului legat 10 p.n. Factorii de transcripie

Structura promotorului genelor structurale la eucariote (gene de clasa II)

TATA-box

TATAAAA

- 30

TBP

Structura promotorului genelor structurale la procariote

CAAT-box GGCCAATCT - 75 22 p.n. CTF/NF1

GC-box Octamer

GGGCGG ATTTGCAT

- 90

20 p.n. 20 p.n.

SP1 Oct1, Oct2

Interaciunea enhancer-promotor

Exoni
Secvene polinucleotidice ale genelor

structurale ce codific secvene polipeptidice; Se regsesc n preARNm, ARNm; Se transcriu i se transleaz; Fiecare exon codific un domeniu proteic; n timpul splicing-ului alternativ unii exoni pot fi nlturai.

10/19/2009

Introni
Secvene polinucleotidice necodificatoare ale genelor structurale ce separ exonii; Se regsesc n preARNm, dar nu n ARNm; Se transcriu, dar nu se transleaz; n timpul splicing-ului alternativ intronii sunt nlturai; Asigur posibilitatea splicing-ului alternativ (combinrii diferite ale exonilor) sursa polimorfismului proteinelor codificate de aceeai gen.

Structura terminatorului

Structura unitilor transcripionale ale genelor ribozomale la eucariote (gene clasa I)

Organizarea genelor de clasa III

Promotor - boxa A (+ 55) i boxa B (+ 80) Gene ARNt / ARNr5S Terminator Organizarea genelor pentru ARNr 5S

Promotor (-45 ... +20) Gena 18S Gena 5,8S Gena 28S terminator

10/19/2009

Structura operonului la procariote

Genomul mitocondrial uman

Elemente genetice mobile = TRANSPOZONI

Tipul Transpozoni ADN Gena principale
Transpozaza

Rolul biologic al transpozonilor

Recombinarea situs-specific Polimorfismul individual al ADN Mutageneza inserional Instabilitate genomic produc situsuri fragile n ADN Evoluia genomurilor

Modul de transpoziie

Exemple

Transferul secvenei Tn (bacterii) de ADN prin excizie P (Drosophila) sau replicaie Transfer prin THE-1 (uman) intermediul ARN produs pe baza Tz (drojdii) promotorilor din LTR Transfer prin intermediul ARN pe baza promotorilor alturai L1 din grupul LINEs

Transpozoni de Reverstranscriptaza tip retroviral Retrotranspozoni

Reverstranscriptaza

10/19/2009

Rolul medical al transpozonilor

Modificarea structurii / funciei genelor structurale

apariia bolilor genetice (hemofilia B, epilepsia, retinita pigmentosum, etc) Asigur variabilitatea agenilor patogeni rezisten la antibiotici i la aciunea sistemului imun