Biochimie - Cursul 7

Metabolismul este o activitate celular n care sunt implicate mai multe sisteme enzimatice n
scopul:
obinerii energiei chimice prin captarea energiei solare sau degradarea unor nutrieni
din mediu;
conversiei moleculelor (care joac rolul de nutrieni) n alte molecule indispensabile
celulei;
obinerii macromoleculelor (proteine, acizi nucleici sau polizaharide) din precursorii
acestora;
sintezei sau degradrii unor biomolecule (lipide, mesageri celulari);
Metabolismul poate fi divizat n dou procese distincte:
a) catabolismul (degradarea) n care nutrienii i constituienii celulei sunt scindai n
scopul folosirii componenilor pentru obinerea energiei;
b) anabolismul (biosinteza) este procesul prin care moleculele sunt sintetizate din
componenii mai simpli.
Organismele vii pot fi imprite n dou grupuri mari n funcie de forma n care preiau
carbonul din mediu. Autotrofele (de exemplu procariotele) sunt organisme care pot sintetiza
constituienii lor celulari plecnd de la molecule simple ca H2O, NH3, CO2 sau H2S.
Chemolitotrofele pot obine energie prin oxidarea compuilor anorganici (NH3, H2S sau Fe2+):
NH3 + 4 O2 2 HNO3 + 2 H2O
H2S + 2 O2 H2SO4
4 FeCO3 + O2 + 6 H2O 4 Fe(OH)3 + 4 CO2
Fotoautotrofele pot transfera electronii de la donori anorganici ctre CO2 n scopul sintezei
carbohidrailor, molecule care pot fi convertite ulterior pentru a produce energie.
Heterotrofele pot obine energie n urma oxidrii compuilor organici (carbohidrai, lipide i
proteine) i din acest motiv sunt dependente de autotrofe (care biosintetizeaz aceste substane).
Organismele pot fi clasificate i n funcie de agentul oxidant folosit la modificarea nutrienilor.
Organismele aerobe (incluznd i animalele) pot utiliza oxigenul, pe cnd cele anaerobe (E.
coli) pot crete att n absena ct i n prezena oxigenului.
Cile metabolice sunt o serie de reacii enzimatice cuplate n care se obin produi specifici.
Reactanii, intermediarii i produii de reacie poart numele de metabolii. Se cunosc peste 2000
de reacii metabolice fiecare fiind catalizat de ctre o enzim distinct. Enzimele i metaboliii
dintr-o celul variaz n funie de organism, tipul celulei, nutrienii din mediu i de stadiul de
dezvoltare al celulei.
n cile catabolice metaboliii sunt scindai conducnd la produi mai simpli. Unul dintre
aceti produi este acetil-coenzima A. Energia liber rezultat din aceste procese este stocat sub
forma ATP-ului (sintetizat prin cuplarea dintre ADP i fosfat) sau prin reducerea coenzimei
NADP+ la NADPH. ATP-ul i NADPH-ul constituie sursa principal de energie pentru reaciile
anabolice.

O caracteristic a catabolismului este aceea c n decursul cilor metabolice un numr mare

de substane (carbohidrai, lipide sau proteine) este convertit ntr-un numr redus de intermediari
metabolici. Aceti intermediari sunt mai trziu utilizai n cile metabolice oxidative (de exemplu
oxidarea atomilor din gruparea acetil din acetil-CoA la CO2 n cadrul ciclului acidului citric). n
situaia n care o substan este oxidat (pierde electroni) alt substan este redus (accept
electroni; n ciclul acidului citric rezult formele reduse ale coenzimelor-NADH i FADH2) i
cedeaz electronii acesteia moleculelor de oxigen cu formarea apei.
Cu cteva excepii interconversia metaboliilor n cile metabolice degradative sau de
biosintez este asistat de enzime. n absena enzimelor reaciile sunt prea lente pentru a sprijini
supravieuirea celulei. n plus, specificitatea enzimelor garanteaz eficiena reaciilor metabolice
prin prevenirea formrii compuilor nedorii sau toxici.
Exist 6 tipuri majore de reacii enzimatice:
1. reaciile de oxido-reducere catalizate de oxidoreductaze;
2. reaciile de transfer a unor grupe (grupri fosfat, resturi de peptide), catalizate de
transferaze;
3. reaciile hidrolitice (hidroliza esterilor, hidroliza legturilor C-X, adiia apei la legtura
dubl) catalizate de hidrolaze;
4. reaciile de eliminare n care legatura dubl este format, catalizat de liaze;
5. reaciile de izomerizare, catalizate de izomeraze;
6. reaciile de formare a unor legturi chimice (C-C), pe baza energiei consumate de o surs
de energie (uzual ATP), catalizate de ligaze (sintetaze).
Compartimentarea citoplasmei eucariotelor permite desfaurarea proceselor metabolice n
locaii diferite. De exemplu, fosforilarea oxidativ are loc n mitocondrie, iar glicoliza (cile de
degradare a carbohidrailor) i biosinteza acizilor grai au loc n citozol. n tabelul A sunt
ilustrate o serie de ci metabolice majore care au loc n organitele celulare ale eucariotelor.
Procesele metabolice din procariote, organisme n care nu sunt prezente organitele celulare, pot
fi localizate ntr-o anumit zon a citozolului.
Tabel A. Funciile metabolice ale organitelor celulare
Organita celular
Principalele funcii
Mitocondria
Ciclul acidului citric, fosforilarea oxidativ, oxidarea
acizilor grai, catabolismul aminoacizilor
Citozol
Glicoliza, calea metabolic a fosfatului pentozei,
biosinteza acizilor grai, reacii din cadrul glucogenezei
Lizozomi
Digestia enzimatic a componentelor celulare i a
materiei ingerate
Nucleu
Replicarea i transcripia ADN-ului, procesarea ARNului
Aparatul Golgi
Modificarea postranslaional a lipidelor sau proteinelor;
formarea membranelor plasmatice i a veziculelor
secretorii
Reticulul endoplasmaic rugos
Sinteza proteinelor membranare sau secretorii
Reticulul endoplasmaic neted
Biosinteza lipidelor i steroidelor
Peroxizomi (Glioxizomii din
Reacii oxidative catalizate de aminoacid oxidaze i
plante)
catalaze; reacii din ciclul glioxilatului n plante

Compui macroergici
n urma oxidrii complete a glucozei se elibereaz o cantitate considerabil de energie:
C6H12O6 + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O
Go = 2850 KJ/Mol
Oxidarea complet a palmitatului este mai exoterm
C16H32O2 + 23 O2 16 CO2 + 16 H2O Go = 9781 KJ/Mol
Metabolismul oxidativ decurge gradual. Energia care se elibereaz din aceste procese
exergonice este conservat cu ajutorul unor intermediari cu energie ridicat prin a cror hidroliz
se susin procesele endoterme.
Celulele utilizeaz cteva forme de energie, incluznd compuii fosforilai asemeni
nucleotidei ATP, compui care conin legturi tioesterice i coenzime reduse ca NADH. Fiecare
dintre acestea reprezint o surs de energie liber pe care celula o utilizeaz n numeroase
moduri (inclusiv n sinteza ATP-ului).
ATP-ul i gruprile fosforil
Intermediarul adenozintrifosfat (ATP) apare n toate formele de via cunoscute. ATP-ul
const dintr-un rest de adenozin (adenin + riboz) la care sunt ataate trei grupe fosforil (o
legtur fosfoesteric i dou legturi fosfoanhidridice).
NH2

Importana biologic a ATP-ului rezid

din cantitatea de energia liber care
acompaniaz
ruperea
legturilor
fosfoanhidridice. Aceste reacii nsoesc de
regul transferul unei grupri fosforil
(conducnd la ATP) sau nucleotidil (AMP;
rezultnd i pirofosfat - PPi):
ATP + H2O ADP + Pi
ATP + H2O AMP + PPi
Valorile G0 ale hidrolizei compuilor
fosforilai sunt tabelate mai jos (tabelul B).

legatura
fosf oesterica

legatura
fosfoanhidridica
O

N
-O

P
O-

P
O-

O
O

O-

OH

OH

Adenozina

AMP

ADP

Tabel B. Energiile libere standard de hidroliz a

unor compui fosforilai
Compus
G0, KJ/
Mol
Fosfoenol piruvatul
-61,9
1,3-bifosfogliceratul
-49,4
ATP ( AMP + PPi)
-45,6
Acetil fosfat sau fosfocreatina
-43,1
ATP ( ADP + Pi)
-30,5
Glucoz-1-fosfatul
-20,9
PPi (pirofosfat)
-19,2
Fructoz-6-fosfatul, Glucoz-6-13,8
fosfatul
Glicerol-3-fosfatul
-9,2

ATP

Cu ct valorile G0 sunt mai negative cu att compusul fosforilat are tendina de a transfera
grupele fosforil apei (are potenial de transfer al grupelor fosfat mai ridicat). De remarcat este
faptul c molecula de ATP are un potenial de transfer intermediar. Astfel, compuii care posed
valori ale G0 mai negative pot transfera gruparea fosfat pe ADP situaie n care rezult ATP-ul.
Aceast molecul (ATP-ul) poate transfera gruparea fosfat pe moleculele de fructoz sau
glucoz.
Reaciile exoterme ale compuilor macroergici sunt cel mai adesea cuplate cu reaciile
endoterme. De exemplu hexokinaza este o enzima care catalizez formarea glucoz-6-fosfatului,
dar nu catalizeaz i reacia de hidroliz a ATP-ului. n contrapartid, ATP-ul se formeaz prin
transferul unei grupri fosforil de pe fosfoenolpiruvat pe ADP reacie catalizat de piruvat
kinaza. Cele dou reacii sunt cuplate i poriunea din calea metabolic n care se afl acestea
este per amsamblu exoterm.
Potenialul ridicat de transfer al grupelor fosforil al fosfoguanidinelor (fosfocreatina i
fosfoarginina) apare datorit stabilizrii prin rezonan (mai pronunat dect fosfoanhidridele).
NH2+
C

H
N

R = CH2 - CO2 ; X = CH3

Fosfocreatina

O-

R = CH2 - CH2 - CH2 - CH - CO2 ; X = H

Fosf oarginina

NH3
R

Fosfogu anid ine

Fosfocreatina constituie un rezervor energetic pentru formarea ATP-ului.
Celulele din musculare i nervoase, care se bazeaz pe folosirea ATP-ului, se bazeaz pe
fosfoguanidin pentru a regenera rapid ATP-ul. n vertebrate fosfocreatina este sintetizat prin
fosforilarea reversibil a creatinei de ctre ATP, reacie catalizat de creatin kinaza.
G0= +12,6 KJ/ Mol
n stare de repaus muchii scheletici ai vertebratelor conin o cantitate suficient de
fosfocreatin pentru a suplini nevoiile energetice pentru cteva secunde. n muchii
nevertebratelor (de exemplu al homarilor) fosfoarginina joac un rol similar. Aceste fosfo
guanidine sunt denumite i fosfageni.
Interconversia nucleozid trifosfailor
Majoritatea proceselor biosintetice (sinteza proteinelor sau acizilor nucleici) necesit ali
nucleozid trifosfai dect ATP-ul. Dac sinteza ARN-ului necesit alturi de ATP i CTP, GTP
sau UTP, sinteza ADN-ului este posibil doar n prezena dCTP, dGTP, dTTP sau dATP. Toi
aceti nucleozid trifosfai (NTP) sunt sintetizai din ATP i nucleozid difosfaii corespunztori
(NDP) n prezena enzimei nucleozid difosfat kinaz:

Adenilat kinazele catalizeaz conversia nuclozid monofosfailor la difosfai pe seama

energiei ATP-ului:
Aceast enzim este prezent n toate esuturile i are drept scop de a menine un echilibru n
concentraia celor 3 nucleotide. n situia n care se acumuleaz AMP-ul majoritatea este
convertit n ADP i mai trziu utilizat la sinteza ATP-ului.
Tioesterii
Legturile tioesterice apar n unii intermediari metabolici (implicnd resturile de cistein din
situsurile enzimatice) sau n unii compui din metabolismul lipidic (incluznd acetil-CoA un
compus rezultat n urma catabolismului carbohidrailor, acizilor grai sau aminoacizilor).
O Gupare acetil
Coenzima A (CoA) are o grup S C CH3
mercapto-etil aminic legat printr-o
grupare amidic la acidul pantotenic, care,
CH2
rest de -mercaptola rndul su este ataat la un rest de 3etilamina
CH2
fosfoadenozin printr-o punte pirofosfoNH
ric. Gruparea acetil din acetil-CoA este
C O
implicat n formarea unei puni tioesterice
CH2
cu gruparea sulfidril (-SH) dinadenozinCH2
3'-fosfat
mercapto-etil amin. Astfel, rolul CoA este
NH
NH2
de a transporta gruprile acetil sau n
rest de acid
C O
pantotenic
N
general grupri acil.
N
HO C H
Acil-CoA este un compus cu energie
N
N
ridicat. Reacia de hidroliz a gruprii
H3C C CH3 O
O
tioesterice G0 este de -31,5 KJ/ Mol, fapt
H2C O P O P O
O
care face ca reacia s fie mai exergonic
H
H
OOH
H
dect hidroliza ATP-ului. Acest fapt s-ar
O
H
putea explica prin faptul c n cazul
O P Otioesterilor gruparea acestora este stabiliOzat mai puin prin rezonan.
Structura acetil-coenzimei A
Formarea legturilor tioesterice n cazul unor intermediari metabolici permite conservarea
energiei libere rezultate n urma oxidrii combustibililor metabolici (lipide). Energia stocat
poate fi utilizat n alte reacii care necesit energie. De exemplu, n ciclul acidului citric clivarea
unei grupri tioesterice (succinil-CoA) elibereaz suficient energie liber pentru a sintetiza
GTP-ul din GDP si Pi (fosfat).
n timp ce o serie de metabolii sunt oxidai la CO2 electronii sunt transferai prin intermediul
unor compleci moleculari la oxigenul molecular. Procesul de transport al electronilor mpreun
cu traslocarea protonilor prin membranele celulare induc sinteza ATP-ului (fosforilarea
oxidativ).

Cofactorii (NAD+ i FAD)

Doi dintre cei mai cunoscui purttori de electroni sunt coenzimele nicotin-adenin-dinucleotidul (NAD+) i flavin-adenin-dinucleotidul (FAD). Restul de nicotinamid din NAD+ (sau
NADP+, forma fosforilat a NAD+) este locul n care poate avea loc reducerea reversibil,
fenomen care const n transferul ionului hidrur (H-):

Reducerea NAD+ la NADH (R = riboz-pirofosforil-adenozin)

FAD-ul este o coenzim care

accept unul sau doi electroni
N
N
O
conducnd la forma semichinonic
FAD forma oxidata
(un radical stabil, FADH) sau
forma chinonica
NH
forma complet redus (FADH2).
N
Schimbrile care apar n decursul
O
+
reducerii pot fi vizualizate prin
+ H +e
virajul culorii de la galben (FAD)
R
la galben pal (FADH2). Funcia
important a acestor coenzime
N
N
O
+
FADH f orma radicalica (NAD i FAD) const n reversibilitatea reducerii. Astfel, aceste
f orma semichinonica
NH
molecule pot accepta electroni pe
N
care pot s-i transfere pe ali
O
H
purttori i ca atare pot fi
+ H+ + eregenerate s participe n alte
cicluri de oxidare i reducere.
R
R

H3C

H3C

H3C

H3C

H3C

H
N

O
NH

H3C

FADH forma redusa

forma hidrochinonica

N
H

Reducerea FAD la FADH2 (R = ribitol-pirofosforil-adenozin)

FAD-ul nu poate fi sintetizat direct de ctre organismul uman, dar poate fi obinut prin diet
n form de riboflavin (vitamina B2).
NADH si FADH2 rezultate n urma glicolizei, oxidrii acizilor grai sau din ciclul acidului
citric sunt molecule bogate n energie i conin perechi de electroni avand un potenial de transfer
ridicat. Aceti electroni pot utilizai pentru reducerea O2 la H2O, proces n care o mare parte de
energie liber este eliberat i poate fi utilizat la producerea ATP-ului. Fosforilarea oxidativ
este procesul n care ATP-ul este format ca urmare a transferului electronilor NADH-ului sau
FADH2-ului la O2 prin intermediul unor purttori de electroni. Acest proces are loc n membrana
mitocondrial intern a organismelor aerobe i are ca efect pomparea protonilor nafara matricei
mitocondriale.
Sursele de carbon sunt oxidate n ciclul acidului citric i asigur electronii cu potenial ridicat
de transfer. Mai trziu, energia de transfer a electronilor este convertit ntr-o energie de transfer
a protonilor i mai trziu ultima form de energie este convertit ntr-un potenial de transfer al
grupei fosforil.

Reprezentarea sumara a fosforilarii oxidative

Sinteza ATPului si oxidarea sunt cuplate
prin intermediul fluxului de protoni