Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
EXAMEN
2015 - 2016
1. Etapele elaborrii tehnologiilor de biosintez;
ETAPELE ELABORRII TEHNOLOGIILOR DE BIOSINTEZ
- cuprinde mai multe faze
- Laborator
- Micropilot
- Staii pilot
- Producie industrial
1. Faza de laborator cuprinde 2 etape
Etapa I
a. Izolarea, selectarea i testarea microorganismului productor prin tehnici specifice pentru
fiecare microorganism. Metode folosite pentru izolarea i testarea microorganismului:
- Tehnica diluiilor
Microorganismele sunt preluate din diferite habitate si sunt cultivate pe medii:
- solide
- lichide
Iniial se urmrete realizarea unei culturi pure prin tehnici microbiologice specifice
(epuizarea ansei, diluii succesive), apoi se stabilete o metod de triere (screening).
Microorganismul este cultivat pe plci Petri pe medii de agar-agar. In cazul in care se urmrete
selectarea unor microorganisme productoare a unui anumit tip
de enzim se realizeaz se fac teste de identificare:
- calitative
- cantitative
De ex. Pt. a dezvolta anumite tipuri de enzime, prin includerea substratului specific pentru
enzima dorit:
- amidon/amilaze
- cazein/proteaze
- celuloz/celulaze
Enzimele difuzeaz n gelul de agar-agar.
Dac nu se poate aplica un test calitativ, coloniile izolate se cultiv pe medii specifice iar
extractul (lichidul) de biosintez este:
- prelevat
- prelucrat in scopul dozarii compusului prin metode:
spectrofotometrice
fluorimetrice
tritrimetrice
polarimetrice
In urma acestei etape se rein numai cteva tulpini care au dat cele mai bune rezultate.
b. ntreinerea culturilor productoare
Dup faza de izolare i selecie, tulpinile productoare se supun unor teste de caracterizare dup
criterii :
- morfologice
- biochimice
- fiziologice
1
- imunologice
- toxicologice
Tulpina astfel caracterizat se nregistreaz ntr-o colecie de microorganisme, sub un numr de
identificare.
Selecia unui mutant nalt productor prin ucrri de selecie:
- Natural
- Artificial (mutagenez)
Conservarea microorganismelor de interes, att tulpinile parentale, ct i tulpinile modificate
genetic (mutante sau recombinate) se face metode speciale, la temperaturi sczute:
- Liofilizarea
- Conservarea n azot lichid
Cultura stoc
- Cultura de la care se pornete procesul de biosintez
- Tulpinile din colecie utilizate n lucrrile de biosintez
- Metodele de ntreinere a culturilor sunt specifice fiecrui microorganism
- Condiii de pstrare
- La frigider
- Pe geloz nutritiv
- n tub nclinat
- punctul de plecare pentru prepararea unei culturi inocul de laborator
Cultura inocul
- constituie
- cultur microbian n curs de multiplicare
- materialul de nsmnare a mediului de biosintez n etapa urmtoare
- condiii de dezvoltare
- format pe un substrat nutritiv corespunztor
- pH
- Temperatur
- Agitare
- Aerare
- Transvazarea inoculului
- n mediul de biosintez
- Condiii aseptice
- Dup o perioad de dezvoltare bine stabilit i definit prin
- Vrst
- Cantitate
- Aspect microscopic
- Aparatur
- Plci Petri
- Tuburi test
- Flacoane Ehrlenmeyer
- Faza de laborator
Etapa a II-a
- Stabilirea parametrilor optimi de cultivare
- Mediul de cultur
- pH
- Temperatur
- Agitare
- Aerare
2
Aparatur
- Flacoane Ehrlenmeyer
- Agitatoare rotative
2. Faza de micropilot
- stabilirea condiiilor de cultivare
- pH
- temperatur
- consum de O dizolvat
- turaie
- debit de aer
- aparatur
- bioreactor de laborator - 10 L
3. Faza de staie pilot
- A - stabilirea parametrilor
- de cultur
- biosintez
- aparatur
- instalaii de capacitate medie
- bioreactoare 100 1000 L
- B - stabilirea condiiilor de lucru la nivel semiindustrial
- aparatur
- bioreactoare 5000 10.000 L
- sterilizarea
- precede operaiile de nsmnare vitamina C
- aparaturii
- mediului
- mediul de cultur
- sterilizat
- rcit la temperatura optim de cultivare
- cultur intermediar
- treapt intermediar de cultivare
- apare atunci cnd raportul de inoculare
- cantitatea de inocul/cantitatea de mediu de fermentaie
- nu permite pregtirea culturii inocul n laborator
- moduri de cultivare
- A - culturi de suprafa
- B - submers
- mediu lichid
- agitat
- aerat
- adoptat
- n funcie de fiziologia productorului
- rentabilitate
4. Producia industrial
- iniial - faz experimental industrial
- apoi obinerea industrial a medicamentelor
- bioreactoare 10.000 100.000 L
Avantaje
- se preteaz la automatizri
- economie de spaiu
- o bun amestecare i aerare a mediului - condiii optime pentru microorganisme
- randamente ridicate
cel mai utilizat pentru
- aminoacizi
- proteine
- enzime
sisteme industriale
- discontinui (arje)
- continui
- productivitate mare
- aparte de capaciti mici pstreaz mai bine parametrii optimi
tipul de operare
- sistemele omogene
- compoziia mediului este uniform pe tot parcursul bioprocesului
- sistem este monofazic
- microorganismele sistemului au aceeai stare fiziologic (stadiu de dezvoltare)
- sistemele heterogene
- compoziia mediului de fermentaie are gradiente de celule sau de substrat
- sisteme
- monofazice
- multifazice (lichid/lichid; lichid/gaz)
- microorganismele
- expuse la diferite condiii de mediu
- diferite stri fiziologice (diferite stadii de dezvoltare)
tipul de operare
- bioprocese nchise
- celulele microbiene meninute n totalitate n sistem
- nu pot atinge o stare staionar
- bioprocese deschise
- celulele trec continuu n efluent
- celulele prsesc sistemul n rata n care se formeaz
- rezult c se gsesc n stare staionar
tipul de operare
- sistem continuu de operare
- deschis
- omogen
- cu un stadiu
- cu mai multe stadii
- heterogen
- cu un stadiu
- cu mai multe stadii
- mixt
5
nchis
- omogen
- heterogen
- mixt
organizare celular
- de tip procariot
- unicelular
perete celular rigid
- ac. mureinic
- ac. teichoic
- ac. diaminopimelic
multiplicare prin diviziune direct
mare variabilitate explicat prin fenomene
- de recombinri genetice
- mutaii
Levurile (drojdiile)
-
fungi microscopici
unicelulari
organizare celular de tip eucariot
dimensiuni mari
aspect
- monoforme
- sferice
- ovale
- alungite
- dimorfe
- polimorfe
perete celular
- gros
- format din
- polizaharide
- glucani
- manani
nucleu
- bine definit
- nconjurat de o membran nuclear tipic
reproducerea
- asexuat
- nmugurire
- diviziune
- sexuat
- prin conjugarea a dou celule sexuale
puine ca numr (350 de specii)
importante datorit numeroaselor utilizri practice, industriale
Fungii filamentoi
microorganisme eucariote
metabolism de tip chimioorganotrof
corp hife - miceliu
- filamente
- tubulare
- microscopice
- lungi
- subiri
perete celular
- semirigid
- chitin asociat cu celuloz
reproducerea
- spori asexuai
- formai prin derivare din celule vegetative
- sporangiospori
- conidiospori
- spori sexuai
10
5. Medii de cultur;
Medii de cultur
Criterii de clasificare
Consistena
Lichide
Solide
Semisolide
Compoziie
1.Naturale
Contin elemente nutritive de origine:
Vegetale
Animale
Pot conine
Subproduse agroalimentare
- rot de floarea soarelui
- Fin de porumb
- Tre de gru
- Extract de porumb
Completate cu mici cantiti de sruri minerale
Avantaje
Mai ieftine
Dezavantaje
Nu permite
- Standardizarea
- Reproducerea procesului cu un randament constant
2.Sintetice
Reproductibile la scar industrial
Numai compui
cu structur chimic cunoscut
care pot fi dozai
Dupa tipul de respiraie al microorganismelor
aerobe
anaerobe
Dupa scopul i frecvena
de uz curent
medii speciale pentru studiile de izolare la nivel de laborator
elective
selective
de mbogire
11
de conservare
de identificare
Dupa faza de biosintez la care este folosit
laborator
pilot
industrial
Dupa destinaia final
pentru cultura inocul
cultura de regim (medii de fermentaie, de biosintez)
Trebuie s conin
surs de carbon - carbohidrai
sursa principal de energie
regleaz necesarul de O i H
glucoz
amidon
fructoz
zaharoz
surs de azot
organic
aminoacizi
proteine
uree
anorganic
amoniac
sulfat de amoniu
surs de fosfor
acid fosforic
fosfat de amoniu
fosfat acid de potasiu
oligoelemente
potasiu
clorur de potasiu
fosfat acid de potasiu
magneziu
sulfat de magneziu
fier
clorur feric
factori de cretere
aminoacizi
proteine
vitamine
coenzime
precursori
poriuni structurale ale moleculei produsului biosintetizat
sursa de carbon
Exist o valoare a concentraiei elementelor necesare dezvoltrii nerestrictive
definit de Peppler, Harrison, 1970
12
transvazarea inoculului
prima situaie
inoculul provine dintr-o cultur aflat n curs de multiplicare
mediu nutritiv cu aceeai compoziie
i pstreaz ritmul rapid de dezvoltare
cazul
transvazrii inoculului n intermediar
pentru obinerea unor cantiti mai mari de inocul
a doua situaie
inoculul provine dintr-o cultur aflat n curs de multiplicare
mediu nutritiv cu alt compoziie
perioad de adaptare
cretere neevident de la nceput
2.faza de multiplicare exponenial (cretere logaritmic)
precedat de o perioad scurt (cca. 2h)
accelerare a ritmului de cretere
multiplicarea se produce cu o vitez progresiv mrit
diviziunile sunt sincronizate
nr. celulelor
se dubleaz brusc
la intervale de timp regulate
progresie geometric
cretere exponenial
scurt timp 2-3 ore
tendina de multiplicare rapid scade progresiv
epuizarea substanelor nutritive
acumularea de produse de catabolism cu efect inhibitor
celulele de tip embrionar
dimensiuni mai mari
citoplasma
mai omogen
nu conine materiale de rezerv
afinitate pentru coloranii bazici
coninut ridicat de ARN
cele mai potrivite pentru lucrri de genetic
perioada de post-lag
spre sfritul fazei de multiplicare logaritmic
ncetinirea
desincronizarea creterii populaiei
acum sunt amorsate biosintezele n culturi continui
3.faza staionar maxim
numrul celulelor viabile
maxim
rmne constant (ore cteva zile)
nsoit de
epuizarea substanelor nutritive
acumularea unor produi toxici
celulele nu se mai multiplic
14
4.faza de declin
scderea progresiv a numrului celulelor viabile
celule
btrne
cu fenomene de involuie
n unele cazuri fenomene de autoliz
Metode de apreciere a creterii unui microorganism
determinarea substanelor uscate a masei celulare
determinarea concentraiei sursei de carbon din mediu
determinarea nr. total de celule, cu ajutorul celulelor de numrat
determinarea gradului de turbiditate a suspensiei bacteriene n funcie de timp
7. Dinamica multiplicrii la fungi;
lipide
ARN
Separarea produselor din lichidul rezultat din fermentaie, constituie o problem dificil,
indiferent de procedeul aplicat. Dificultile provin din faptul c produsele biologic active
obinute n general prin biosintez sunt substane termolabile, ceea ce impune evitarea
degradrii sau modificrii chimice a acestora. Pentru a alege cea mai adecvat metod de
separare a produselor biosintetizate, este necesar s se cunoasc proprietile fizico chimice a
acestora i anume:
Solubilitatea :
o n ap sau n soluii diluate de sruri ;
o n solveni polari (metanol, etanol, aceton) ;
o n solveni slab polari (cloroform, hidrocarburi) ;
Stabilitatea n soluie :
o n funcie de pH ;
o efectul temperaturii ;
o efectul soluiilor tampon ;
o efectul solvenilor organici ;
Stabilitatea n stare solid n funcie de temperatur precum i efectul umiditii asupra
produsului ;
Proprieti fizice :
o dializabilitate prin membrane ;
o adsorbia pe suprafee solide ;
o migrarea n cmp electric ;
o sedimentarea n ultracentrifuge ;
Proprieti chimice :
o stabilitatea fa de diverse enzime ;
o stabilitatea la aciunea unor ageni chimici.
Pentru separarea produsului din mediile de biosintez se aplic n general urmtoarele metode:
extracia cu solveni organici; separarea pe schimbtori de ioni; cromatografie; adsorbia.
In industria de biosintez exist ns metode de prelucrare integral a mediului de
cultur prin aplicarea diferitelor metode de uscare, produsul rezultat fiind utilizat ca atare.
Acest mod de prelucrare a mediilor de biosintez este mult aplicat n tehnologia aditivilor
furajeri (coninnd aminoacizi, enzime, vitamine).
Prelucrarea primar
Filtrarea
Centrifugarea
Decantarea
Concentrarea fazei lichide
Dezagregarea celulelor
Extracia
Uscarea
Atomizarea
Precipitarea
cu solveni organici
cu sruri anorganice
ultrafiltrare pentru
purificri
concentrri
echipamente complexe i specifice
dificulti ale separrii produselor din lichid
produse termolabile
20
21
probleme datorate
compoziia chimic a mediului
materialul biologic
adjuvani de filtrare
formeaz paturi microscopice cu micorarea dimensiunilor porilor
mresc vitezei de filtrare
reduc consumul de materiale
mai multe scheme
aplicarea pe materialul filtrant (pnz, hrtie) a unui strat subire de material
adjuvant
amestecarea adjuvantului cu suspensia de filtrat
raclarea permanent a stratului adjuvant cu ajutorul unor cuite pentru
meninerea stratului la o valoare constant (cazul filtrelor rotative)
se folosete foarte mult filtrarea sterilizant
prefiltrare grosier
apoi filtrarea sterilizant
filtre din
acetat de celuloz
azbest
polimeri sintetici
22
Paste subiri
Se realizeaz o cea de lichid din particule de 2 200 m
Uscare rapid nct materialul nu se nclzete
Se obine o pulbere nu este necesar mrunirea
23
24
A patra etap cuprinde o metod de a muta ADN recombinat din eprubet ntr-o celul
gazd care poate furniza complexul enzimatic necesar pentru replicarea ADN recombinat.
n a cincea etap se folosesc metode de a seleciona sau identifica celulele gazd ce
conin ADN recombinat din totalul de celule gazd.
Metodologiile folosite pentru a realiza aceste etape i altele similare sunt denumite
colectiv tehnologia ADN recombinat sau clonare molecular, clonarea genelor, clonarea
ADN.
21. Elementele constitutive ale tehnologiei ADN recombinat;
Tehnologia ADN recombinat se bazeaz, n principal, pe utilizarea unor elemente
descrise n paragrafele urmtoare.
I.
special n tehnologia ADN recombinat. n particular, dou tipuri de enzime sunt eseniale pentru
obinerea de ADN recombinat: endonucleaze de restricie i ADN ligaze.
II.
Vectorul de clonare (vehiculul) este o structur alctuit din ADN, care are poate fi
acceptat ntr-un organism gazd i care are capacitatea de a se replica autonom. Prin inseria
genelor de interes n vehicul, acesta realizeaz transferul genelor de la un organism la altul.
III.
25
Funcia (Activitatea)
Scindeaz ADN n secvene ce conin
ADN-ligaze
baze specifice
Leag dou molecule de ADN sau
ADN-polimeraza I (E.coli)
Revers transcriptaza
Polinucleotid kinaza
Transferaza terminal
polinucleotidice
Transfer un homopolimer la gruparea
3-OH final din structura duplexului
Exonucleaza III
Bacteriofag exonucleaza
liniar
Mut nucleotide reziduale din poziia
Mut nucleotide din poziia 5
terminal a ADN bicatenar elibernd
Fosfataza alcalin
Dintre enzimele prezentate n tabelul nr. 2.I., n mod particular, dou tipuri de enzime
stau la baza metodei generale de a izola i propaga o molecul de ADN recombinat.
n primul rnd, endonucleazele de restricie scindeaz (taie) molecula de ADN cnd
recunosc anumite secvene specifice pentru a genera un set de fragmente de ADN mai mici.
n al doilea rnd fragmentul de ADN de clonat este izolat i legat de alt fragment de ADN
care este vectorul de clonare folosindu-se ADN ligaze.
Vectorul recombinat este apoi introdus ntr-o celul gazd care l cloneaz pe msur ce
celula trece prin numeroase generaii de diviziune celular.
Endonucleazele de restricie
Clonarea unui anumit fragment de ADN presupune identificarea i obinerea sa n stare
pur din genomul unei celule. Aceast operaie este practicabil numai pentru genoamele de mici
26
dimensiuni. ADN donor al genei de interes ca i ADN vector, este clivat astfel nct s se poat
forma extremiti monocatenare omoloage, avnd posibilitatea de a realiza o sinaps molecular
Endonucleaze de restricie recunosc n molecula de ADN o secven anumit de baze i
cliveaz cte o legtur fosfat diesteric de pe ambele catene, ntr-un loc particular al secvenei
recunoscute. Endonucleazele de restricie se gsesc ntr-un numr mare de specii bacteriene.
Funcia biologic a endonucleazelor de restricie este de a recunoate i de a scinda un
ADN strin (de exemplu ADN al unui virus infectant); acest ADN se spune c este restrns.
ADN propriu al celulei nu este clivat n mod obinuit pentru c secvena recunoscut de
endonucleaza de restricie este metilat de o enzim, ADN metilaz specific, fiind astfel
protejat. n celula bacterian endonucleaza de restricie i ADN metilaza corespunztoare este
uneori asimilat cu sistemul de restricie modificare.
Exist trei tipuri de endonucleaze notat cu cifrele romane I, II i III.
Endonucleazele de restricie de tip I i III sunt n general complexe mari cu mai multe
subuniti coninnd ambele activiti: de endonucleaz i de metilaz.
Tipul I de endonucleaze de restricie scindeaz ADN n poziii aleatoare care pot fi la
distan de 1000 de perechi de baze sau mai mult, de la secvena de recunoatere.
Tipul III de endonucleaze de restricie scindeaz ADN la distan de 25 de perechi de
baze de la secvena de recunoatere.
Amndou tipurile se deplaseaz de-a lungul ADN printr-o reacie care necesit energie
din molecule de ATP .
Endonucleazele de restricie de tipul II izolate iniial de Hamilton Smith sunt mai simple,
nu au nevoie de ATP i scindeaz ADN chiar la nivelul ei de recunoatere.
Sunt deci enzime cu ajutorul crora se realizeaz scindarea exact n locuri bine definite
ale moleculelor de ADN bicatenare. Ele sunt instrumentele indispensabile att pentru excizarea
fragmentelor de ADN (gene) din diferite molecule de ADN viral, bacterian sau din celule
eucariote, ct i pentru conversia moleculelor circulare ale vectorilor n molecule liniare.
Unele endonucleaze de restricie scindeaz ambele catene de ADN, astfel nct nu rmne
nici o baze nepereche la fiecare capt ; aceste capete sunt numite capete rotunjite.
Alte endonucleaze de restricie scindeaz neregulat, decalat cele dou catene de ADN,
astfel nct rmn dou pn la patru nucleotide nemperecheate la fiecare capt al catenelor.
Acestea sunt numite capete coezive sau adezive (coninnd nucleotide complementare ) i deci se
pot mperechea ntre ele sau cu alte capete adezive complementare ale unor alte fragmente de
ADN.
27
28
capacitatea de a se replica rapid i ntr-un numr ct mai mare de copii n celula gazd
(30 50 copii/celul);
s posede cel puin un marker genic (de exemplu, gena rezistenei la anumite
antibiotice) care s permit selecia celulelor ce conin ADN recombinat;
s conin elemente de reglaj ale unui operon procariot tipic, inclusiv o mic poriune
dintr-o gen structural aparinnd operonului respectiv.
29
Celulele astfel tratate devin apte de a accepta ADN strin (gena de interes). n
continuare este necesar o metod de a seleciona moleculele care au acceptat ADN al plasmidei
pentru c numai o mic parte din celule se transform [50, 51, 61].
Plasmidele sunt vectori frecvent utilizai n tehnologiile ADN recombinat deoarece
prezint urmtoarele avantaje:
traverseaz uor prin membrana celulei gazd, avnd dimensiuni relativ reduse;
Strategia uzual pentru construirea unei plasmide este de a introduce n plasmid o gen
de care celula gazd are nevoie pentru a se dezvolta n anumite condiii specifice. Dac celulele
sunt crescute n acele condiii, celulele transformate sunt selectate; plasmida astfel construit
este selectabil. Gena introdus, numit uneori marker de selecie este de obicei una ce
confer rezistena la un antibiotic. Astfel, numai cele cteva celule transformate de plasmida
recombinat vor fi rezistente i vor crete deci in prezena antibioticului.
Muli vectori de clonare plasmidici au fost creai prin modificarea unor plasmide naturale.
Plasmidele uzual utilizate pentru clonare au fost modificate n laborator i conin n genele de
rezisten la antibiotice situsuri recunoscute de unele enzime de restricie.
Plasmida pBR322
Cteva din proprietile importante ale unui vector de clonare sunt ilustrate de plasmida
pBR322.
Plasmida cuprinde:
regiunea ori, adic originea replicrii care este necesar pentru a propaga plasmida i
a o menine la un nivel de 10 pn la 20 de copii n fiecare celul;
dou gene ce confer rezisten la diverse antibiotice permind selecionarea
celulelor care conin plasmida sau o versiune recombinat a acesteia;
cteva secvene de recunoatere unice pentru diverse endonucleaze care furnizeaz
situsuri unde plasmida poate fi tiat i ADN strin inserat.
30
Deci plasmida pBR322 conine doi markeri de selecie, gena de rezisten la ampicilin i
gena de rezisten la tetraciclin. Inactivarea uneia dintre acestea, prin inseria unui ADN strin,
ofer posibilitatea unei excelente selecii a celulelor transformate coninnd molecula de ADN
recombinat. n gena de rezisten la ampicilin exist un loc specific de clivare pentru enzima de
restricie Pst I, care poate fi utilizat pentru inseria genelor strine, nsoit de inactivarea acestei
gene. Similar, n gena de rezisten la tetraciclin se poate aciona prin intermediul enzimelor de
restricie Bam HI sau Sal I, pentru a realiza inactivarea inserional (figura nr. 2.4) [50, 74, 96].
Vectorul plasmidei pBR 322 are o mas molecular mic, mrimea total destul de mic
faciliteaz intrarea plasmidei n celule. Eficacitatea transformrii bacteriene descrete pe msur
ce crete mrimea plasmidei, i este dificil de clonat segmente de ADN mai lungi de 15000
perechi de baze atunci cnd se folosesc ca vectori plasmide.
25. Vectori de clonare de natur viral;
Bacteriofagul este un vehicul de clonare care poate fi folosit pantru a clona molecule de
ADN care au mrimi mai mari de 16 000 perechi de baze. A fost numit i bacteriofagul gt (gt =
generalized transduction) .
Acesta are un mecanism foarte eficace pentru a introduce ntr-o bacterie cele 48 500
perechi de baze (48,5 kb) ale ADN propriu. Mecanismul general de clonare de ADN n
bacteriofagul este bazat pe dou proprieti cheie ale genomului :
- n jur de o treime din genomul este neesenial i deci poate fi nlocuit cu ADN strin;
- ADN strin (gena de interes) va fi mpachetat (nserat) n particulele infecioase
numai dac mrimea lui este cuprins ntre 40 000 50 000 de perechi de baze
Au fost dezvoltai vectori bacteriofagi care pot fi uor clivai n trei fragmente, dintre care
dou conin gene eseniale i care mpreun sunt lungi de aproximativ 30 000 perechi de baze.
ADN adiional (gena de interes) trebuie deci s fie inserat ntre ele pentru a produce particule
viabile. Astfel, vectorii permit clonarea de fragmente de ADN de pn la 23000 perechi de
baze. Prin construirea acestor vectori se asigur faptul c toate particulele viabile vor
conine fragmentul de ADN strin.
Odat ce fragmentele de bacteriofag sunt legate de fragmentul de ADN strin de
mrime potrivit, ADN recombinat rezultat poate fi mpachetat n particule de fagi prin
adugarea lor ntr-un extract de celule bacteriene ce conin toate proteinele necesare pentru
31
asamblarea unui fag complet. Acest proces este denumit mpachetare in vitro. Pregtit astfel
vectorul bacteriofag e gata pentru a insera ADN recombinat n Escherichia coli.
Bacteriofagul filamentos M13 RF
Acesta are un ADN circular monocatenar care este aezat ntr-un buzunar al unui helix al
proteinei format din 2700 aminoacizi. Inseria de ADN strin ntr-o zon neesenial a
cromozomului M13 duce la producerea de particule mai lungi ale fagului.
Vectorii de clonare de tip baceriofag M13 nu pot menine n mod stabil nseriile de ADN cu o
mrime mai mare de 1000 de perechi de baze (1kb). Aceti vectori produc direct ADN
monocatenar cu 300 de nucleotide.
26. Cosmidele i cromozomii artificiali de drojdie ca vectori de clonare;
Cosmidele sunt construcii artificiale rezultate din asamblarea unor plasmide de
dimensiuni mari cu unele secvene de ADN din bacteriofagul . Cosmidele sunt deci plasmide
recombinate care combin trsturi utile ale plasmidelor i ale bacteriofagului . Ele sunt
proiectate pentru a permite clonarea unor fragmente de ADN foarte mari (pn la 45.000 perechi
de baze).
Cosmidele sunt molecule de ADN circulare mici (5000 7000 perechi de baze).
Ele conin mai multe secvene importante:
un fragment numit origine plasmidic de replicare (ori)
unul sau mai muli markeri de selecie
cteva situsuri de restricie specifice unde ADN strin (gena de interes) poate fi
inserat
un situs numit cos (o secven de ADN, din bacteriofagul necesar pentru
mpachetare).
Cosmidele nu conin alte gene i pot fi propagate n Escherichia coli ca i plasmidele.
Cnd un fragment mare de ADN strin este clonat pe ele, transformarea bacteriei E. coli cu
aceste construcii de ADN recombinat devine dificil tiind c transformarea este introducerea
plasmidei n celule bacteriene.
Cnd cosmida conine destul ADN inserat pentru a fi npachetat ntr-un fag, sistemele de
mpachetare in vitro permit bacteriofagului s fie vehicul eficace pentru introducerea ADN al
cosmidei n celula bacterian. n interiorul celulei bacteriene, cosmida se propag din nou ca o
plasmid deoarece nu are genele necesare pentru nmulirea particulelor n celule.
Cromozomii artificiali de drojdie ca vectori de clonare
32
Segmentele de ADN care sunt mai mari dect acelea care pot fi vehiculate de cosmide pot
fi clonate n cromozomi artificiali de drojdie (de exemplu cele notate cu YACS).
YACS sunt segmente liniare de ADN care conin toate fragmentele moleculare necesare
procesului de dedublare n drojdie: o origine de dedublare (copiere) cunoscut sub denumirea de
secven de dedublare n mod autonom (ARS = autonomously replicating sequence), un
centromer (segmentul cromozomal ataat de fus n cursul procesului de mitoz i meioz) i
telomeri (terminaiile cromozomilor liniari care permit dedublarea lor).
Moleculele de ADN cu mai multe sute de perechi de baze au fost mbinate cap la cap n
YACS i au putut fi clonate cu mult succes
27. Gena de interes n clonarea molecular;
Gena de interes, deci fragmentul specific de ADN care prezint interes din punctul de
vedere al proteinei specifice pe care o codific, reprezint componenta cheie n tehnologia
clonrii genelor, n tehnologia ADN recombinat.
Genele eucariote au n general o structur complex, iar localizarea lor nu n toate
cazurile cunoscut. Exist totui numeroase strategii pentru obinerea genelor de interes.
Sinteza chimic a genelor
Sinteza chimic a genelor const n oninerea unor fragmente de gene module
constituite din 12-16 nucleotide care apoi sunt legate ntre ele enzimatic, cu ajutorul ADN.
Aceast metod permite sinteza oricrei gene pentru care se cunoate structura.
Determinarea structurii genelor se realizeaz fie direct, prin analiza secvenei bazelor
azotate, fie indirect pe baza echivalenei secvenei aminoacizilor din protein, cu cea a bazelor
azotate din gena corespunztoare, conform codului genetic.
Procedeul indirect a permis stabilirea structurii genelor unor biocompui de mare
importan pentru industria farmaceutic, cum sunt de exemplu somatostatina i insulina uman.
Sunt cunoscute n prezent mai multe metode de sintez chimic a genelor:
metoda fosfodiesterelor,
metoda fosfotriesterilor,
Este de menionat c modalitatea de sintetizare chimic de ADN de interes este posibil doar
pentru clonarea genelor care codific proteine mici.
33
Aceast cale de sintez a ADN permite alegerea, ori de cte ori exist mai muli triplei
(codoni) disponibili pentru un anumit aminoacid, a tripletului care e folosit foarte frecvent n
gazda care urmeaz s fie utilizat pentru sinteza proteinei de interes [61, 74].
Izolarea unei gene din cromozomul celular
O gen reprezint o parte foarte mic dintr-un cromozom. De aceea, izolarea unui
fragment de ADN care s conin o gen particular, necesit de regul parcurgerea a dou etape:
construirea unei biblioteci genomice (de ADN) care conine mai multe mii de
fragmente de ADN derivate dintr-un cromozom celular.
identificarea fragmentului de ADN care conine gena de interes folosind proprietatea
care l distinge de toate celelalte fragmente: secvena sa nucleotidic.
28. Receptori gazd pentru clonarea ADN recombinat;
Escherichia coli
Bacteria Escherichia coli a fost primul organism folosit pentru recombinarea ADN i este
nc celula gazd cea mai rspndit.
Prezint o serie de avantaje:
-
exist muli vectori de clonare naturali bacteriofagi sau plasmide asociate cu E. coli care
sunt bine cunoscute;
34
Aceast problem a fost rezolvat prin metode care cupleaz o degradare enzimatic
parial a peretelui celular cu un tratament cu calciu-polietilen glicol care face peretele celular
suficient de poros pentru ptrunderea ADN.
29. Etapele tehnologiei ADN recombinat;
Tehnologia ADN recombinat implic parcurgerea urmtoarelor etape eseniale:
I.
Aceast etap presupune utilizarea unor metode specifice de pregtire att a vectorului
ct i a genei de interes n vederea inserrii genei n vehicul.
Vectorul de clonare este izolat prin metode specifice i apoi clivat ntr-un singur loc cu o
enzim de restricie (aceeai endonucleaz folosit la izolarea genei). Clivarea produce
deschiderea vectorului (plasmidei) care este transformat dintr-o molecul circular ntr-o
molecul linear, avnd dou capete ce pot interaciona cu gena.
Gena de interes este izolat cu ajutorul enzimelor de restricie sau sintetizat prin una din
metodele descrise mai sus.
Vectorul i gena astfel pregtite se asociaz spontam in vitro pe baza complementaritii
capetelor coezive.
Prin intervenia unei ADN ligaze se restabilete continuitatea structural covalent prin
formarea de legturi fosfodiesterice ntre fragmentele de ADN.
Rezultatul este obinerea unei plasmide himere, o structur circular bicatenar n care
este inserat gena de interes.
Eficiena cuplrii genei de vector poate fi mrit prin modificri structurale ale vectorului
i/sau genei, ca de exemplu: defosforilarea vectorului, sinteza de capete coezive pe plasmid
i pe fragmentul ADN de inserat, ataarea de linkeri.
II.
n cazul utilizrii E. coli, cultivarea n prezen de CaCl2 precum i ocul termic de scurt
durat (30 secunde la 42C) determin celulele s intre ntr-o stare de competen care
permite acceptarea moleculelor de ADN strin.
n cazul celulelor care posed un perete celular este necesar ca acesta s fie nlturat cu
enzime litice. O alt posibilitate este utilizarea de lipozomi n care se ncorporeaz ADN
strin.
Eficiena transformrii este limitat, ntruct un numr redus de celule devin competente.
III.
Exist mai multe metode pentru identificarea coloniei (clonei) de celule care a acceptat
vectorul himeric n urma experienei de transformare.
Una dintre acestea const n utilizarea plasmidelor purttoare de gene care confer
rezisten la antibiotice i a bacteriilor gazd sensibile la antibiotice.
De exemplu, se poate utiliza plasmida coninnd gene pentru rezisten la ampicilin (AR)
i la tetraciclin (TR) cu situsul de restricie aflat n interiorul genei TR.
Dup transformare, cultivnd bacteriile pe un mediu cu ampicilin, vor crete numai
bacteriile care au acceptat plasmida. Cultivarea mai departe a acestor colonii pe un mediu
coninnd tetraciclin va mpiedica creterea celulelor coninnd fragmentul de ADN strin a
crui inserare la nivelul genei TR din plasmid inactiveaz aceast gen.
Prin recuperarea coloniilor sensibile la tetraciclin se constituie o banc.
Etapa urmtoare const n selecionarea dintre diferitele colonii ale bncii a celei care
poart gena de interes. Pentru aceasta exist metode variate.
Astfel, dac gena de interes se exprim n mod normal n celula gazd, se pot utiliza
celule deficiente pentru aceast gen i identifica celulele care redobndesc acest funcie prin
introducerea genei lips. Dac gena nu exist n mod natural n celula gazd, prezena ei poate
fi reperat prin sinteza produsului specific de activitate a genei.
Multe metode sunt ns bazate pe utilizarea sondelor moleculare, ca de exemplu ARNm
codat de gena de interes, marcat radioactiv. Coloniile coninnd segmente de ADN
neidentificate sunt transferate pe filtre speciale (nitroceluloz) care au proprietatea de a fixa
ADN. Celulele sunt lizate in situ, ADN denaturat i filtrele sunt plasate n contact cu o soluie
coninnd ARNm. Dac o colonie conine plasmide asociate genei corespunztoare, ARNm se
36
ataeaz de ADN genei i colonia astfel marcat este vizualizat prin autoradiografie (tehnica
hibridizrii acizilor nucleici).
Alte metode sunt bazate pe selecia genei de clonat nainte de asocierera acesteia cu vehiculul.
30. Obinerea insulinei prin ADN recombinat construit din genele sintetizate chimic;
Pentru catena A a insulinei sunt necesare 63 de nucleotide nlnuite n mod
specific, iar pentru catena B de 90 de nucleotide cuplate (catena A are 21 aminoacizi x
3 nucleotide/aminoacid = 63, catena B 30 aminoacizi x 3nucleotide/aminoacid = 90
nucleotide).
Proiectul a mai prevzut ataarea la capetele lor a unor nucleotide care s
asigure:
cuplarea corect a genelor de vector - adugarea a 12 nucleotide, dintre care
6 asigur jumtate din situsul enzimei de restricie EcoRI, iar celelalte 6 nucleotide
jumtate din situsul enzimei de restricie BamHI.
prezena semnalelor necesare pentru pornirea i oprirea exact a transcrierii
genelor - pornirea este realizat de codonul ATG plasat la nceputul genei ntre situsul
enzimei EcoRI i gena structural; oprirea transcrierii este asigurat de doi codoni
(TAA i TAG) plasai ntre captul genei structurale i situsul enzimei de restricie
BamHI.
Gena A a fost obinut din 12 oligodeoxinucleotide sintetizate chimic prin
metoda fosfotriesterilor, iar gena B a fost obinut din 18 oligodeoxinucleotide diferite
sintetizate prin aceeai metod chimic.
Cele dou gene corespunztoare catenelor A i B ale insulinei mature au fost
apoi inserate independent pe cte un vector de clonare genetic prevzut cu elementele
de control ale operonului lac.
Moleculele de ADN recombinat rezultate au fost utilizate pentru transformarea
celulelor de E. coli. n celulele transformate ADN recombinat se replic.
Sub controlul elementelor de reglaj ale operonului lac se sintetizeaz complexul
-galactozidaza-catena A a insulinei n celulele transformate cu ADN recombinat
coninnd gena A i complexul -galactozidaza-catena B n celulele transformate cu
ADN recombinat coninnd gena B a insulinei.
37
38
dintre care arginina este n proporie de 65-70%. Momentul n care, dup cristalizare,
n soluie nu mai exist protamin sau insulin msurabil este denumit ca fiind
punctul de isophane. De aceea Insulina NPH se mai numete Insulina "Isophane".
Insulina NPH are o declanare a aciunii cuprins ntre 1-2 ore, o activitate
maxim cuprins ntre 6-12 ore i o durat a activitii de 18-24 ore.
Ca i n cazul altor formulri, variaiile observate la relaia timp-aciune sunt
datorate unor factori cum ar fi: doza, locul injectrii, temperatura i activitatea fizic a
pacientului.
Insulina NPH poate fi amestecat uor cu Insulina regular fie ex tempore, de
ctre pacient, fie n formulri preamestecate. Insulina preamestecat, de exemplu
NPH/Regular n raportul 70/30 sau 50/50, ofer pacientului o ameliorare a exactitii
la dozare i, n consecin, o ameliorare a controlului glicemiei.
Au fost soluionate i controversele privind imunogenitatea la protamin prin
folosirea de Insulin Lente sau Insulina Ultralente.
Insulina Lente este o suspensie de zinc-insulin care a fost conceput
pentru o singur injecie zilnic. Ea este un amestec constituit din dou forme
insolubile de insulin, 70% cristale romboedrice de zinc-insulin (componenta
ultralente) i 30% particule de insulin amorf (componenta semilente). Formularea
aceasta este un preparat neutru care conine tampon pe baz de acetat i un exces de
zinc care se leag la suprafaa hexamerului insulinei, reducnd astfel solubilitatea
insulinei i, n felul acesta, se produce o ncetinire a profilului timp-aciune.
Insulina Lente are o declanare a aciunii dup 1-3 ore, activitatea maxim este
ntre 6-12 ore i durata aciunii revine la 18-24 ore. Ca i n cazul altor formulri,
variaiile observate n ceea ce privete profilul timp-aciune sunt datorate unor factori
cum ar fi: doza, locul injectrii, temperatura i activitatea fizic a pacientului.
Capacitatea de amestecare a Insulinei Lente cu Insulina Regular este limitat la
amestecurile ex tempore care sunt utilizate imediat dup preparare din cauza
precipitrii insulinei din produsul Regular datorat probabil cuplrii surplusului de
zinc aflat n preparatul Lente la suprafaa structurii pe hexamerice a insulinei solubile.
Formulri farmaceutice ale insulinei cu aciune prelungit
n mod curent singura insulin cu aciune prelungit disponibil este insulina
Ultralente, care este o suspensie de insulin cristalizat. Formularea conine un agent
de tamponare cu valoare neutr a pH-ului i un surplus de zinc.
41
33. Dezvoltarea unui nou medicament (etapele parcurse i rezultatele studiilor de cercetaredezvoltare);
34. Autorizarea i nregistrarea unui medicament;
35. Staia pilot n industria farmaceutic: definire, roluri, structur, amplasare, studii pilot;
36. Personalul i tehnologia de fabricaie ca element al asigurrii calitii medicamentului
industrial;
37. Materialele i echipamentul de producie ca element al asigurrii calitii
medicamentului industrial;
38. Calificarea echipamentelor;
39. Validarea procedeelor de fabricaie;
40. ntreprinderea: caracteristici generale, clasificare, resurse, amplasare, ciclu de via;
41. Planul de dezvoltare i afacere, concurena, cooperarea, criza i evaluarea
ntreprinderilor;
42. Calitatea farmaceutic i principii generale ale regulilor de bun practic de fabricaie;
43. Rolul sistemului de asigurarea calitii;
44. Responsabiliti specifice directorului de producie i directorului de asigurarea calitii;
45. Responsabiliti comune ale directorului de producie i directorului de asigurarea
calitii;
46. Instruirea personalului implicat n procesul de fabricaie;
47. Evaluri care preced alegerea spaiului pentru construcia unei faciliti de producie;
48. Responsabiliti specifice ale personalului implicat n studiile clinice;
49. Principii generale de proiectare a calitii;
50. Descrierea principiilor evalurii bazate pe ntrebri;
51. Aliaje i metale utilizate la construcia utilajelor folosite n industria farmaceutic;
Generaliti;
52. Fonta ca material de construcie a utilajelor folosite n industria farmaceutic;
53. Oelurile ca material de construcie a utilajelor folosite n industria farmaceutic;
54. Cuprul i aliajele sale, folosite ca material de construcie a utilajelor n industria
farmaceutic;
55. Aluminul ca material de construcie a utilajelor folosite n industria farmaceutic;
56. Emailurile folosite la construcia utilajelor n industria farmaceutic;
57. Tipuri de coroziune; generaliti;
58. Coroziunea chimic;
42
43