Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Definiţie
Enzimele sunt proteine globulare care catalizează reacţiile biologice permiţând astfel
desfăşurarea proceselor chimice necesare vieţii.
1
Proprietăţile enzimelor
Fiind catalizatori biologici, enzimele au atât proprietăţi specifice catalizatorilor chimici cât
şi proprietăţi determinate de natura lor biologică:
- se regăsesc neschimbate la sfârşitul reacţiei;
- nu modifică echilibrul reacţiilor ci permit atingerea lui într-un timp mai scurt, mărind
vitezele ambelor reacţii care au loc simultan dar în sensuri opuse;
- sunt de natură proteică;
- eficienţă catalitică extrem de mare: cresc foarte mult vitezele reacţiilor biochimice prin
micşorarea energiilor de activare ale acestora, permiţând astfel atingerea unor timpi de reacţie foarte
mici, până la ordinul ps (10-12s); o reacţie catalizată enzimatic decurge cu o viteză de 10 8-1020 ori
mai mare decât reacţia necatalizată.;
Exemplu:
* hidratarea CO2 necesară îndepărtării acestuia din ţesuturi are loc în prezenţa enzimei anhidrază
carbonică (AC), cu o viteză de 36 milioane molecule/min; în absenţa AC viteza ar fi mult prea mică
pentru a putea asigura schimbul de CO2 dintre sânge şi plămâni;
* descompunerea apei oxigenate are următoarele energii de activare:
- fără catalizator: 18Kcal/mol
- în prezenţă de Pt coloidală: 11,7 Kcal/mol
- în prezenţa enzimei catalază: 2 Kcal/mol (o moleculă de catalază descompune 5x10 6 molecule
H2O2/min)
- specificitate: nu numai faţă de reacţie ci şi faţă de substrat; astfel, deşi fiecare celulă
conţine mii de compuşi chimici care pot reacţiona între ei în numeroase moduri, în realitate au loc
numai câteva dintre acestea în funcţie de enzimele prezente. DE COMPLETAT BOGDAN
Specificitatea de substrat poate fi absolută, relativă de grup sau largă.
- evită formarea produşilor secundari de reacţie (datorită eficienţei catalitice şi a
specificităţii ridicate);
- permit atingerea unor randamente de 100%;
- acţionează în concentraţii foarte mici (cca 10-6 moli);
- acţionează în condiţii blânde de temperatură (~ 37°C) şi la pH neutru (există şi excepţii, de
exemplu pepsina din sucul gastric acţionează la pH acid; tripsina şi chimotripsina acţionează în
intestinul subţire la pH bazic);
- activitatea lor poate fi reglată şi mai ales autoreglată: viteza reacţiilor biochimice este
controlată de necesarul celulei, iar cantitatea de produşi este controlată prin reglarea acţiunii
enzimelor.
Cofactorul Vitamina
Tiamin pirofosfat Tiamina (B1)
NAD+ and NADP+ Niacina (B3)
Piridoxal fosfate Piridoxina (B6)
Lipoamida Acidul lipoic
Metilcobalamina Vitamina B12
Cobalamina Cobalamina (B12)
Biotina Biotina (H)
Coenzima A Acidul pantotenic (B5)
Acid tetrahidrofolic Acidul folic (B9)
Menaquinona Vitamina K
Acid ascorbic Vitamina C
Flavin mononucleotida (FMN) Riboflavina (B2)
Flavin adenindinucleotida (FAD) Riboflavina (B2)
3
In afara acestor vitamine şi derivaţi mai există şi alte molecule organice care funcţionează
drept cofactori.
● grupări prostetice: cofactori strâns legaţi de moleculele proteice ale enzimelor (dar şi ale altor
proteine) şi care au un rol foarte important în exercitarea funcţiilor biologice ale acestora. Exemplu:
hemul – componentă a citocromilor (enzime cu rol în transportul electronilor în procesul
respiraţiei). Spre deosebire de coenzime, cofactorii nu pot fi separaţi de apoenzime prin dializă şi
rămân permanent legaţi de acestea.
● ioni metalici: aceştia se leagă sub formă de chelat de anumiţi aminoacizi din molecula apoenzimei
acţionând fie ca grupare catalitică, fie ca mijloc de legare a substratului la enzimă, fie ca activatori
ai reacţiilor enzimatice. Cele mai numeroase metalenzime sunt cele care conţin Zn 2+, iar altele
conţin Fe2+, Cu2+, Mg2+, Mn2+, Ni2+ etc.
4
II. Mecanismul ajustării induse
- presupune existenţa unei anumite flexibilităţi a conformaţiei centrul activ
- se aplică enzimelor care în stare liberă nu se află în conformaţie optimă pentru cataliză,
grupările funcţionale responsabile de activitatea catalitică fiind într-o poziţie relaxată. Legarea
substratului determină o ajustare a centrului activ care dobândeşte o geometrie optimă pentru
formarea complexului intermediar ES şi transformarea lui ulterioară în produşi; în fapt, legarea
substratului determină modificarea atât a conformaţiei centrul activ cât şi a substratului, aceasta din
urmă apropiindu-se de geometria stării de tranziţie ceea ce duce la accelerarea reacţiei.
In cazul enzimelor cu cofactor, modificările conformaţionale ale centrul activ pot fi induse
prin legarea iniţială a cofactorului la enzimă, fapt ce determină legarea ulterioară a substratului la
centrul activ astfel ajustat.
E + P1 +P2
- ordonate: primul se leagă obligatoriu unul dintre substraturi (cel principal) şi apoi cel
secundar; eliberarea produşilor de reacţie decurge de asemenea într-o anumită ordine.
6
E + S1 ES1
ES1 + S2 ES1S2 EP1P2
EP1P2 P2 + EP1 E + P1
E* + S2 E*S2 E + P2
Efectori enzimatici
Efectorii enzimatici sunt substanţe cu structuri diverse care acţionează asupra enzimelor
modificând cinetica reacţiilor enzimatice. După modul de acţiune se clasifică în inhibitori şi
activatori.
Inhibitorii enzimatici influenţează negativ acţiunea enzimatică pe care o pot anula definitiv –
inhibiţie ireversibilă sau temporar – inhibiţie reversibilă.
Inhibiţia reversibilă nu modifică structura moleculară a enzimei. Este de trei tipuri:
competitivă, incompetitivă şi necompetitivă.
a) Inhibiţia reversibilă competitivă este produsă de inhibitori competitivi; aceştia sunt
substanţe care prezintă analogie structurală cu substratul manifestând afinitate pentru centrul activ
al enzimelor. Existǎ, prin urmare, o competiţie între substrat şi inhibitor pentru ocuparea centrul
activ al enzimei, aceasta putând forma complecşi intermediari disociabili atât cu substratul cât şi cu
inhibitorul – produsul de reacţie, însǎ, se genereazǎ numai din complexul enzimǎ – substrat. Prin
legarea inhibitorului la centrul activ este diminuat accesul moleculelor de substrat la situs însǎ, prin
creşterea concentraţiei de substrat se îndepǎrteazǎ inhibitorul de centrul activ, rezultând anularea
inhibiţiei.
Exemple:
• acidul malonic (malonatul) este un inhibitor competitiv cu acidul succinic (succinatul) în
reacţia de dehidrogenare a acestuia la acid fumaric, în prezenţa succinat dehidrogenazei.
• în medicinǎ, sulfonamidele (sulfamidele) îşi exercitǎ acţiunea bacteriostaticǎ printr-un
proces de inhibiţie competitivǎ, astfel: acidul p-aminobenzoic este un metabolit esenţial pentru
biosinteza acidului folic şi a derivaţilor reduşi ai acestuia - acizii dihidrofolic şi tetrahidrofolic.
Aceştia reprezintă cofactori enzimatici esenţiali, implicaţi în biosinteza acizilor nucleici şi a unor
aminoacizi, în procesele de diviziune şi creştere celularǎ etc., constituind astfel un factor de creştere
pentru numeroase bacterii cauzatoare de boli.
p-Aminofenilsulfonamida se aseamǎnǎ structural cu acidul p-aminobenzoic şi deci
funcţioneazǎ ca inhibitor competitiv. Astfel, coenzima FH 4 nu mai poate fi sintetizatǎ, reacţiile la
care aceasta participǎ fiind blocate sau diminuate; acest fapt determină perturbarea sintezei acizilor
nucleici şi deci a proteinelor microbiene, ca şi a multor sisteme enzimatice, ceea ce duce la
împiedicarea multiplicării şi dezvoltării bacteriilor (efect bacteriostatic).
7
C
COOH
NH CH CH2 CH2 COOH
COOH C O
SO2NH2
Acid tetrahidrofolic (FH4)
B
OH
H
N
NH2 NH CH2 N
NH2
Acid p-aminobenzoic p-Aminobenzensulfonamida N N NH2
H
A
Acidul folic este alcătuit structural din trei componente: o componentă pteridinică A (care
reacţionează sub formă de dihidropteroat-difosfat), o moleculă de acid p-aminobenzoic B şi un rest
de acid glutamic C. Acidul p-aminobenzenzoic condensează cu dihidropteroatul, sub acţiunea
dihidropteroat-sintetazei, ducând la formarea acidului dihidropteroic şi ulterior, prin combinarea cu
acidul glutamic la acizii dihidrofolic şi tetrahidrofolic, cofactori enzimatici esenţiali şi implicaţi de
asemenea în biosinteza unor aminoacizi şi a acizilor nucleici. Inlocuind acidul p-aminobenzoic în
reacţia catalizată de dihidropteroat-sintetază, sulfonamidele reprezintă un inhibitor competitiv
pentru aceasta, împiedicând reacţia şi, implicit, şi pe cele ulterioare ce conduc la acid
tetrahidrofolic.
Organismul uman nu poate sintetiza folaţi din componente, asemenea bacteriilor, întrucât nu
are enzimele necesare (inclusiv dihidropteroat-sintetaza), astfel că sulfonamidele nu au efect negativ
asupra celulelor umane.
b) Inhibiţia reversibilă incompetitivă
Inhibitorul incompetitiv se fixeazǎ numai la complexul enzimǎ-substrat (enzima fixeazǎ
întâi substratul şi apoi inhibitorul). Complexul enzimǎ-substrat-inhibitor este inactiv, prin urmare
viteza maximǎ a reacţiei scade. Viteza reacţiei inhibate incompetitiv nu se apropie niciodatǎ de
viteza maximǎ, chiar şi la cele mai mari valori ale concentraţiei substratului, spre deosebire de
reacţia inhibatǎ competitiv a cǎrei vitezǎ maximă nu se modificǎ.
c) Inhibiţia reversibilă necompetitivă este determinatǎ de inhibitori (necompetitivi) care nu
prezintǎ analogie structuralǎ cu substratul. Aceştia se pot fixa fie la enzimǎ (într-o regiune diferitǎ
de centrul activ), simultan cu substratul, fie la complexul enzimǎ-substrat. Rezultatul este scăderea
concentraţiei de enzimă activă (şi nu micşorarea proporţiei de enzimă care leagă substratul), ceea ce
este echivalent cu scăderea activităţii molare a enzimei (a numărului “turnover”). Viteza maximǎ a
reacţiei este diminuatǎ. Nici în acest caz, inhibiţia nu poate fi anulată prin creşterea concentratiei
substratului.
Spre exemplu, enzimele care au drept cofactori metale grele (ioni) sunt inhibate
necompetitiv de substanţe capabile sǎ lege (coordineze) ionul metalic respectiv. Este cazul EDTA
(etilendiaminotetraacetatul) care poate forma chelaţi cu ioni metalici bivalenţi şi deci poate inhiba
enzima care are nevoie de ionul respectiv drept cofactor.
Inhibiţia ireversibilă este produsǎ de inhibitori (ireversibili) care se leagă strâns la enzimă
în special prin legǎturi covalente cu anumite grupe funcţionale ale enzimelor, esenţiale pentru
activitatea cataliticǎ a acestora. Astfel, enzima devine inactivǎ, iar prin îndepǎrtarea inhibitorului
enzima nu îşi mai recapǎtǎ funcţia cataliticǎ. Acest tip de inhibiţie a fost foarte util în identificarea
grupelor funcţionale cu rol catalitic din situsul activ al enzimelor; de asemenea, el stă la baza
mecanismul de acţiune al unor medicamente.
Exemple:
• penicilinele modifică covalent transpeptidazele (enzimele implicate în formarea peretelui
celular bacterian), ducând la moartea celulei bacteriene;
8
• aspirina (acidul acetilsalicilic) modifică covalent enzima ciclooxigenază (care participă la
formarea prostaglandinelor, prostaciclinelor şi tromboxanilor; acestea sunt substanţe biologic active
din clasa lipidelor derivate de la acizi graşi C20 –eicosanoide, implicate în producerea răspunsului
inflamator), diminuând astfel inflamaţia;
• ionul CN- este un inhibitor ireversibil foarte toxic şi cu acţiune foarte rapidǎ. Acesta
acţioneazǎ asupra enzimei citocromoxidazǎ (cu rol în respiraţia celularǎ), ce conţine fier. Prin
reacţia CN- cu fierul din enzimǎ se formeazǎ un complex foarte stabil, iar enzima se dezactiveazǎ,
respiraţia celularǎ încetând. Aceasta conduce în câteva minute la moarte. Ca antidot se foloseşte
tiosulfatul de sodiu care transformǎ CN- în SCN-, acesta din urmǎ neatacând fierul din enzimǎ.
• metalele grele (ionii acestora), de exemplu Hg 2+, Pb2+, se combinǎ cu grupele SH din
enzime producând denaturarea lor. Intoxicarea cu aceste metale grele provoacǎ dereglǎri
neurologice permante. Ca antidot se administreazǎ intravenos sarea de calciu a EDTA care formeazǎ
chelaţi cu metale grele:
CaEDTA2- + Pb2+ → Ca2+ + PbEDTA2- → solubil în fluidele din organism şi se eliminǎ
prin urinǎ
Enzime alosterice
In numeroase cazuri, produsul util se formează în urma unei secvenţe de reacţii catalizate de
un sistem multienzimatic, în care enzima ce catalizează prima reacţie poate fi inhibată chiar de
produsul final al secvenţei de reacţii. Acestă enzimă este o enzimă alosterică, iar inhibiţia se
numeşte retroinhibiţie sau feed-back.
E1 E2 E3 E4 E5
S I1 I2 I3 I4 P
retroinhibitie (feed-back)
Enzimele alosterice mai conţin, pe lângă centrul activ, şi un situs alosteric, la care se leagă
molecule mici numite efectori alosterici. Aceştia modifică activitatea situsului catalitic (prin
modificarea conformaţiei acestuia), activându-l sau dezactivându-l - efectorii alosterici pot fi deci
activatori sau inhibitori.
Zimogeni
Sunt precursori de dimensiuni mai mari ai enzimelor proteolitice, inactivi biologic
(inclusiv faţǎ de substraturile specifice enzimelor respective). Aceştia sunt transformaţi enzimatic în
formele active prin hidroliza selectivǎ a unor legǎturi peptidice din moleculǎ.
Zimogenii sunt stabili numai în celulele secretoare unde sunt feriţi de acţiunea enzimelor
proteolitice specifice. Transformarea lor în formele active este ireversibilǎ. Dacă enzimele digestive
ar fi biosintetizate în foma activă atunci acestea ar digera ţesuturile care le sintetizează (spre
exemplu, una din cauzele pancreatitei acute o reprezintă prematura activare a enzimelor digestive
produse de acesta).
Exemple:
● Activarea tripsinogenului (zimogen pancreatic, la fel ca şi chimotripsinogenul) are loc
când acesta intră în duoden, sub acţiunea enteropeptidazei (o serin-protează) a cărei secreţie de către
mucoasa duodenală se află sub control hormonal. Aceasta detaşează o hexapeptidă de la capătul N-
terminal al tripsinogenului, scindarea realizându-se între resturile Lis 15 – Ile 16. Cum tripsina
poate scinda legăturile peptidice formate de lisină (şi arginină), rezultă că ea însăşi poate cataliza
scindarea tripsinogenului, activarea acestuia fiind deci autocatalitică.
● Pepsinogenul secretat de mucoasa stomacalǎ este transformat în pepsinǎ (forma activǎ)
chiar prin acţiunea pepsinei;