MASTER GENETICĂ MOLECULARĂ

2019 – 2020

Nume:

1. Identificați secvențe de ADN similare secvenței:

GTGGCAATCACGCGCTGATTCTTCTCTACCAACCACAAAGACATTGGTACCCTTTATCTAGTATTTGGTGCCTGAGC
CGGAATAGTAGGAACCGCTTTAAGCCTCCTCATTCGAGCTGAACTTAGTCAACCCGGATCACTTCTAGGTGATGAC
CAAATTTACAATGTAATTGTTACCGCCCACGCCTTCGTAATAATTTTCTTTATAGTAATGCCCATCCTCATTGGAGGA
TTTGGAAACTGACTTGTACCCCTAATAATTGGAGCCCCAGACATGGCATTCCCACGAATGAACAATATAAGCTTCT
GACTTCTTCCCCCATCCTTCCTGCTGCTGCTAGCTTCTTCTGGTGTTGAAGCTGGTGCCGGAACCGGATGAACAGTA
TACCCCCCTCTTGCAGGAAACCTAGCCCATGCAGGAGCATCAGTAGACCTAACAATTTTCTCACTACATTTAGCAGG
TGTCTCATCAATCCTGGGGGCAATCAACTTCATTACTACAACCATTAACATAAAACCCCCAGCCATTTCCCAATACC
AAACACCCCTATTTGTTTGATCTGTGCTTGTAACCGCTGTCCTTCTTCTCCTATCACTGCCTGTTCTGGCTGCCGGCA
TTACAATGCTTTTAACAGATCGAAATCTCAACACCACATTCTTTGATCCTGCAGGCGGGGGAGACCCAATCCTCTAC
CAACACTTATTCTGATTCTTTGGTCATCCAGAAGTTTATATTCTGATCCTTCCAGGATTTGGAATTATTTCTCACGTT
GTAGCCTATTATTCAGGTAAAAAAGAACCATTTGGTTATATAGGAATAGTATGAGCCATAATGGCCATTGGTCTCC
TAGGGTTCATTGTATGAGCCCACCATATGTTTACCGTCGGAATGGACGTAGACACCCGTGCATATTTTACATCCGC
AACAATAATCATCGCAATTCCAACAGGTGTAAAAGTATTTAGCTGACTAGCTACACTTCACGGAGGATCAATTAAA
TGAGAAACACCAATACTATGAGCCCTGGGGTTCATTTTCCTGTTTACAGTAGGGGGACTTACAGGAATTGTCCTCT
CTAATTCATCACTTGACATTGTCCTTCACGACACCTATTATGTAGTAGCACATTTCCACTACGTTCTATCAATGGGTG
CTGTATTCGCCATTATAGCAGCCTTTGTACACTGATTCCCCCTACTAACAGGGTACACTTTACATAGCGCTTGGACA
AAAATCCACTTTGGGGTTATATTTATTGGAGTTAACCTCACATTCTTCCCACAACACTTCCTAGGCCTAGCAGGAAT
GCCACGACGATATTCTGACTACCCAGACGCTTATGCCCTATGAAATACAGTATCGTCTATTGGGTCCCTAATCTCCC
TAGTAGCAGTAATTATGTTCCTATTTATTCTATGAGAAGCCTTCGCCGCTAAACGAGAAGTGCTATCTGTAGAACTA
ACAATAACAAATGTGGAATGACTCCATGGCTGCCCTCCTCCTTACCACACATACGAGGAACCAGCATTTGTTCAAA
TTCAATCAAATTAA

2. Identificați gena și genomul

Carassius auratus x Megalobrama amblycephala pentaploid hybrid
isolate 5RB2 mitochondrion, complete genome
3. Descărcați din NCBI / Nucleotide, (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/) secvențe ale aceleiași gene,
care provin de la: om, cimpanzeu și gorilă.
Homo sapiens chromosome 8, GRCh38.p12 Primary Assembly
4. Aliniați secvențele
5. Editați secvențele
6. Modificați codul genetic
7. Construiți un arbore filogenetic și identificați relațiile evolutive între cele 3 specii. Salvați arborele
8. Reveniți la aliniere și translatați secvențele în secvențe de aminoacizi
9. Refaceți arborele filogenetic pe baza secvențelor polipeptidice. Salvați arborele si comparați-l cu cel
realizat pe baza secvențelor nucleotidice.
10. Căutați în baza de date NCBI secvențe ale aceleiași gene care provin de la alte specii de vertebrate
(mamifere), descărcați-le, refaceți alinierea și arborele filogenetic.