Structura genei si controlul epigenetic al expresiei
genice Ce este o gena? Gena – Definitie (2) Sistematic, o GENA este considerata acea secventa de ADN ce contine informatia necesara (care va fi utilizata) pentru sinteza unei biomolecule: proteina (lant peptidic) -> “gene codificatoare” sau molecula de ARN -> “gene necodificatoare”
genelor: 4. în dependenţă de perioada de expresie 1. după tipul produsului genic: fenotipică: - gene codificatoare de proteine – gene - gene active în toate perioadele vieţii; structurale; - gene active numai în perioada - gene codificatore de ARNr şi ARNt. embrionară; 2. după numărul de copii în genom: - gene active în perioada pubertăţii; - unice - cu o singură copie; - gene active la adult - cu mai multe copii (repetate în tandem 5. după gradul de activitate: sau dispersate). - gene normomorfe - cu activitate 3. în dependenţă de numărul de celule în normală; care se expreseaă genele: - gene hipomorfe - cu activitată redusă: - genele comune („house keeping”) – - gene hipermorfe - cu activitată în active în toate celulele; exces; - gene specifice de ţesut. - gene amorfe - cu activitate blocată. De la expresia genelor la fenotip Structura discontinua a genei Gena este o notiune definita functional (vezi mai sus) prin prisma produsului sau O gena contine, intricate, segmente codante (ce se exprima) numite EXONI si segmente non-codante (ce se vor transcrie initial in ARN, insa vor fi eliminate apoi) numite INTRONI Asamblarea exonilor are loc in citoplasma si se poate efectua “sarind” o parte din ei (ALTERNATIVE SPLICING), generand proteine similare dar diferite/neidentice Structura functionala a genei Promotor (capatul 5’) Contine codonul start – ATG
Unitatea functionala (regiunea transcrisa)
Terminator (capatul 3’)
Contine unul din codonii stop - TAG,TAA,TGA Elemente reglatoare ale expresiei genelor Cele cu actiune directa asupra Reglarea activităţii genelor genei: se clasifica in enhancers = se poate realiza la mai stimuleaza transcriptia (ex. multe nivele, evidente în Cutiile GC si CAAT) si silencers cursul citodiferenţierii: = inhiba transcriptia Actioneaza la nivelul Reglaj genetic la nivel Promoterului transcripţional Reglaj genetic la nivelul maturării ARNm Reglaj genetic la nivelul transportului ARNm Reglaj genetic la nivelul translaţiei mesajului genetic Reglaj genetic la nivelul degradării ARNm PROMOTORUL cutia TATA (Hogness) determina primul nucleotid ce va fi transcris in ARN ; prezinta secvenţă TATAAAA situată la circa 30 pb în amonte de SIT
cutia CAAT (5’ GGCCCAATCT 3’) situată în amonte de caseta TATA (la circa 75 pb de SIT)
cutia GC, cu secvenţa consens
GGGCGG situata la circa 90 p.b. în amonte faţă de SIT . Gena structurală reprezintă o combinaţie de secvenţe nucleotidice reglatoare şi codificatoare: – secvenţe reglatoare proximale – secvenţe reglatoare distale – secvenţa codificatoare ce este formată din exoni separaţi de introni. Reglarea epigenetica a expresiei genice In afară de factorii genetici, Caracteristici generale controlul expresiei genice poate fi influenţat si de • Implică modificări factori negenetici (care nu structurale ale cromatinei la interesează secvenţa de nivelul histonelor sau ADN- nucleotide a ADN), cu alte ului. cuvinte informaţia • Influenţează funcţia genetică ramâne cromatinei şi nivelul de nemodificată şi, de aceea, transcriere al unor gene. au fost denumite • Nu apar schimbări ale modificari epigenetice (epi secvenţei nucleotidice – peste). Pentru ca o genă să poată fi transcrisă, factorii reglatori trebuie să aibă acces la promotorul genei. Aceasta necesită o modificare a structurii cromatinei prin mecanisme epigenetice (reversibile şi transmisibile ereditar): - modificări ale histonelor - metilarea ADN. Enzime implicate in modificarea covalenta a cromatinei - efectori enzimatici epigenetici ADN metiltransferaze (ADNMT sau DNMT -DNA methyltransferases) - Rol in atasarea grupelor metil la resturi de citidina (C), in inleul pirimidinic al bazei azotate citozina Histon metilaze (HMT) - Rol in atasarea grupelor metil la resturi de aminoacizi bazici (lizina , serina, arginina etc) in cozile histonice (COO-) Histon demetilaze (HDM - jumondji) - Rol in deatasarea grupelor metil de la resturi de aminoazizi bazici (lizina, serina, arginina etc) in cozile histonice (COO-) Histon acetilaze (histone acetyltransferases, HAT) - Rol in atasarea grupelor la resturi de aminoazizi bazici (lizina, serina, arginina etc) in cozile histonice (COO-) Histon deacetilaze (histone acetyltransferases, HDAC) - Rol in detasarea grupelor acetil de pe resturile de aminoacizi bazici acetilati din in cozile histonice (COO-) Modificari ale histonelor Histonelor le pot fi adăugate grupuri metil, dar şi alte unităţi chimice, incluzând aici grupuri fosfat, grupuri acetil şi chiar şi proteine mici, cum ar fi ubicuitina. Modificările histonelor se asociază cu modificări ale structurii cromatinei: Cromatina activă adoptă o conformaţie "mai deschisă" produsă de acetilarea histonelor nucleosomale Cromatina inactivă transcripţional se află într-o conformaţie puternic condensată şi asociată cu fixarea strânsă a histonei H1. Metilarea ADN poziţia 5' a citozinei din cadrul dinucleotidelor C(p)G din Promotor Asociata cu supresia trascrierii genei Variaţii în configuraţia ADN
Supraînrularea ADN face bazele din
regiune promotor a genelor mai accesibile proteinelor reglatoare. Trecerea de la forma B a ADN unor gene la forma Z a ADN ar putea fi esentiala pentru reglarea activităţii genice.
Se consideră că trecerea tranzitorie în configuraţia
Z ar face secvenţele ADN mult mai accesibile la factorii de transcripţie.