Proteinele

Proteinele sunt substane organice macromoleculare formate din lanuri simple sau complexe de
aminoacizi; ele sunt prezente n celulele tuturor organismelor vii n proporie de peste 50% din greutatea
uscat. Toate proteinele sunt polimeri ai aminoacizilor, n care secvena acestora este codificat de ctre o
gen. Fiecare protein are secvena ei unic de aminoacizi, determinat de secvena nucleotidic a genei.
Sinteza proteinelor
Biosinteza
La nivelul ribozomilor se realizeaz translaia informaiei genetice de la ARNm n lanul
polipeptidic. n nucleu ARN m copiaz informaia genetic de la ADN nuclear iar apoi migreaz n
citoplasm. Fiecare molecul de ARNt posed la mijlocul lanului su un anticodon a cror 3 baze
consecutive se pot asocia prin legturi de hidrogen cu 3 baze complementare de un codon ARNm[1]. Pe
baza acestui anticodon aminoacizii vor fi poziionai conform mesajului genetic din ARNm. Aceast
poziionare a aminoacil-ARNt se realizeaz la suprafaa ribozomului la nivelul a 2 situsuri
stereospecifice: situl "P" (peptidil) i situl "A" (aminoacil), situate la suprafaa subunitilor [2].
Biosinteza proteinelor este un proces prin care fiecare celul i sintetizeaz proteinele proprii, prin
intermediul unui proces care include multe etape, sinteza ncepnd cu procesul de transcripie i terminnd
cu procesul de translaie. Procesul dei similar, este diferit n funcie de celul: eucariot sau procariot.
Transcripia
Procesul de transcripie necesit prezena unei singure molecule de ADN dublu catenar, numit
ADN ablon, molecul care intr n procesul de iniiere. Aici acioneaz enzima ARN polimeraza,
enzim care se leag de o anumit regiune din molecula de ADN, regiune (denumit promoter), de unde
va ncepe transcripia. Pe msur ce ARN polimeraza se leag de promoter, lanurile de ADN vor ncepe
sa se desfac. Urmtorul proces n care intr ADN este procesul de elongaie (alungire a catenei). Pe
msur ce ARN polimeraza se mic de-a lungul catenei de ADN, are loc sinteza ribonucleotidelor
complementare (ARNm - ARN mesager). Acest ARN, dup cum i arat i numele, se poate deplasa i n
alte pri ale celulei cum ar fi reticulul endoplasmatic sau citoplasma.
Gruparea 5' se gsete n captul 5' final al moleculei de ARNm, i este format din guanosin
grefat printr-o legtur de tip 5'- 5' de molecula de ARN prin intermediul unei legturi trifosfat..Are loc
adiia unei grupri 5', grupare dinucleotidic care are rolul de a asigura stabilitatea ARN i de a-l
transforma n ARN matur. O secven de aminoacizi este grefat n poziia 3' terminal pentru protecie
dar i pentru a sluji drept ablon pentru procesele urmtoare.Mai departe are loc formarea ARN, care este
apoi utilizat in ribozomi pentru sinteza proteinelor. La procariote legarea ARN de ribosomi are loc dup
ce acesta este ndeprtat de nucleoid; n contrast la procariote acest proces are loc chiar n membrana
nuclear i apoi translocat n citoplasm. Rata sintezei proteic poate ajunge la circa 20 aminoacizi la
procariote, mult mai puin la eucariote.

Translaia
n timpul translaiei ARN transcris din ADN este decodat de ribozomi pentru sinteza
proteinelor.Acest proces este divizat n 3 etape:
Iniierea
Elongarea
Faza terminal.
Ribozomul are situsuri de legare care permit altei molecule de ARNt (ARN de transfer), s se
lege de o molecul de ARn m, proces nsoit de prezena unui anticodon. Pe msur ce ribozomul
migreaz de-a lungul moleculei de ARNm (un codon o dat) o alt molecul de ARNt este ataat
ARNm. Are loc eliberarea ARNt primar, iar aminoacidul care este ataat de acesta este legat de ARNt
secundar, care l leag de o alt molecul de aminoacid. Translaia continu pe msur ce lanul de
aminoacid este format. La un moment dat apare un codon de stop, o secven format din 3 nucleotide
(UAG, UAA), care semnaleaz sfritul lanului proteic. Chiar dup termminarea translaiei lanurile
proteice pot suferi modificri post-translaionale i plierea lanului proteic, responsabil de structura
secundar i cea teriar. Modificrile post-translaionale se refer la posibilitatea formrii de legturi
disulfidice, sau de ataarea la scheletul proteic a diferite grupri ca rol biochimic: acetat, fosfat etc.
Sinteza chimic
Procesul de sintez chimic poate avea loc n laborator, dar pentru lanuri mici de proteine. O
serie de reacii chimice cunoscute sub denumirea de sinteza peptidelor, permit producerea de cantiti
mari de proteine. Prin sinteza chimic se permite introducerea n lanul proteic a aminoacizilor ne-
naturali, ataarea de exemplu a unor grupri fluorescente. Metodele sunt utilizate n biochimie i in
biologia celulei. Sinteza are la baz cuplarea gruprii carboxil -COOH (carbon terminus) cu gruparea -
amino -NH2 (segmentul N terminus). Se cunosc 2 metode de sintez pe cale chimic_
Sinteza n faz lichid, metoda clasic, care a fost nlocuit cu sinteza
n faz solid.
Sinteza n faz solid (Solid-phase peptide synthesis SPPS), a crei baz a fost pus de Robert
Bruce Merrifield. Prin aceat metod, se pot sintetiza proteine D, cu aminoacizi D. n prima faz
Merrifield a folosit metoda tBoc (ter-butil-oxi-carbonil). Pentru nlturarea acestuia din lanul peptidic se
folosete acidul fluorhidric (HF), care este foarte nociv, periculos, iar din acest motiv, metoda nu se mai
utilizeaz. Atunci cnd este vorba de sinteza analogilor peptidici non-naturali de tip baz (depsi-peptidele)
este necesar.O alt metod este cea introdus de R.C. Sheppard n anul 1971, i are la baz folosirea
Fmoc (fluorenil metoxi carbonil), iar pentru neprtarea acesteia se folosete de obicei mediu bazic
asigurat de o soluie 20% piperidin/DMF (dimetil formamid). ndeprtarea gruprii din lanul proteic se
face prin incubare n acid trifluoracetic (TFA).Aceast grup de protejare cu simetrie ortogonal se
folosete n multe sinteze chimice.Protejarea gruprii prin intermediul Fmoc este de obicei lent, deoarece
anionul nitro produs la sfritul reaciei nu este un produs favorabil desfurrii reaciei.

Rol
Datorit compoziiei, fiind formate exclusiv din aminoacizi se ntlnesc alturi de ali compui
importani de tipul polizaharidelor, lipidelor i acizilor nucleici ncepnd cu structura virusurilor, a
organismelor procariote, eucariote i terminnd cu omul.Practic nu se concepe via fr
proteine.Proteinele pot fi enzime care catalizeaz diferite reacii biochimice n organism, altele pot juca
un rol important n meninerea integritii celulare (proteinele din peretele celular), n rspunsul imun i
autoimun al organismului.
Nutriia
Majoritatea microorganismelor i plantelor pot sintetiza toi cei 20 aminoacizi standard, n timp
ce organismele animale obin anumii aminoacizi din diet (aminoacizii eseniali). Enzime cheie, cum ar
fi de exemplu aspartat kinaza, enzim care catalizeaz prima etap n sinteza aminoacizilor lisin,
metionin i treonin din acidul aspartic, nu sunt prezente n organismele de tip animal. La aceste
organisme aminoacizii se obin prin consumul hranei coninnd proteine. Proteinele ingerate sunt supuse
aciunii acidului clorhidric din stomac i aciunii enzimelor numite proteaze, proces n urma cruia
lanurile proteice sunt scindate (denaturate). Ingestia aminoacizilor eseniali este foarte important pentru
sntatea organismului, deoarece fr aceti aminoacizi nu se poate desfura sinteza proteinelor necesare
organismului. De asemenea, aminoacizii sunt o surs important de azot; unii aminoacizi nu sunt utilizai
direct n sinteza proteic, ci sunt introdui n procesul de gluconeogenez, proces prin care organismul
asigur necesarul de glucoz n perioadele de nfometare (mai ales proteienele aflate n muchi).
Tipuri de proteine
n funcie de compoziia lor chimic ele pot fi clasificate n:
Holoproteine cu urmtoarele clase de proteine
Proteine globulare (sferoproteine) sunt de regul substane solubile n ap sau n soluii saline:
protaminele, histonele, prolaminele, gluteinele, globulinele, albuminele.
Proteinele fibrilare (scleroproteinele) caracteristice regnului animal, cu rol de susinere, protecie i
rezisten mecanic: colagenul, cheratina i elastina.
Heteroproteinele sunt proteine complexe care sunt constituite din o parte proteic i o parte prostetic; n
funcie de aceast grupare se pot clasifica astfel:
Glicoproteine
Lipoproteine
Nucleoproteine
Proprieti fizico-chimice
Mas molecular
Datorit formrii aproape n exclusivitate din aminoacizi, putem considera proteinele ca fiind de fapt nite
polipeptide, cu mas molecular foarte mare, ntre 10.000 i 60.000.000. Masa molecular se determin
prin diferite metode, mai ales n cazul proteinelor cu masa molecular foarte mare ca de exemplu proteina
C reactiv. Masa molecular a diferitelor proteine
Deoarece la multe proteine masa molecular apare ca un multiplu de 17,500, mult vreme s-a
mers pe ipoteza c particulele proteice sunt formate prin unirea mai multor molecule de baz ce au masa
molecular n jurul valorii de 17,500. Aceste molecule de baz s-ar putea uni ntre ele prin aa numitele
valene reziduale, ducnd la formarea de agregate moleculare. Atunci cnd are loc ruperea acestor valene
reziduale ar avea loc doar modificarea proprietilor fizice ale proteinelor, n timp ce dac are loc ruperea
legturilor principale (legturile peptidice), proteina i modific proprietile fizico-chimice.
Solubilitatea proteinelor
Proteinele sunt substane solide, macromoleculare, solubile n general n ap i insolubile n
solveni organici nepolari. Unele proteine sunt solubile n ap dar insolubile n alcool, altele sunt solubile
n soluii apoase de electrolii, acizi organici. Datorit gradului diferit de solubilitate n diferii solveni,
proteinele se pot izola, identifica i separa. Solubilitatea lor depinde foarte mult de legturile care se
stabilesc ntre gruprile libere de la suprafaa macromoleculelor i moleculele solventului. La suprafaa
macromoleculelor proteice se gsesc grupri libere de tip polar,-COOH, -NH2, -OH, -SH, -NH, grupri
cu caracter hidrofil care favorizeaz dizolvarea proteinelor n ap. De asemenea exist grupri de tip
apolar, hidrofobe, de regul radicali de hidrocarburi -CH3, -C6H5, -C2H5, care favorizeaz dizolvarea
proteinelor n alcool. ns n marea lor majoritate predomin gruprile polare, determinante pentru
caracterul hidrofil. n contact cu apa proteinele greu solubile manifest fenomenul de gonflare, datorit
tendinei de hidratare datorat gruprilor polare. Gelatina de exemplu se mbib foarte puternic cu apa
dnd natere prin rcire la geluri. La dizolvarea proteinelor n ap, are loc fenomenul de formare a
coloizilor hidrofili. S-a constatat c n soluii diluate se gsesc macromolecule proteice izolate, iar n
cazul soluiilor concentrate se formeaz agregate de macromolecule proteice. Soluiile coloidale ale
proteinelor, coaguleaz prin nclzire, prezint efectul Tyndall (dispersia fasciculului de lumin).