Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
LUCRARE DE LICENŢĂ
CONDUCĂTOR ŞTIINŢIFIC:
PROF.UNIV.DR. BRAGA VICTORIA
ÎNDRUMĂTOR:
ASIST.UNIV.DR. VOINEAGU LAVINIA
ABSOLVENT:
DANCIU MARIANA
CONSTANŢA
2011
MINISTERUL EDUCAŢIEI, CERCETĂRII ŞI TINERETULUI
UNIVERSITATEA “OVIDIUS” CONSTANŢA
FACULTATEA DE MEDICINĂ – COLEGIUL LABORATOR CLINIC
CATEDRA DE FIZIOLOGIE NORMALĂ ŞI PATOLOGICĂ
DISCIPLINA MICROBIOLOGIE
CONDUCĂTOR ŞTIINŢIFIC:
PROF.UNIV.DR. BRAGA VICTORIA
ÎNDRUMĂTOR:
ASIST.UNIV.DR. VOINEAGU LAVINIA
ABSOLVENT:
DANCIU MARIANA
CONSTANŢA
2011
CUPRINS
PARTEA GENERALĂ
CAPITOLUL I
Genul Staphylococcus - prezentare generală............................................3
1.1. Particularităţi microscopice........................................................ 3
I.2. Caractere de cultură..................................................................... 6
I.3. Habitat şi implicaţii în patologia infecţioasă...............................12
CAPITOLUL II
Modalităţi de identificare ale germenilor genului Staphylococcus folosite în
laborator................................................................................................... 16
CAPITOLUL III
Modalităţi şi mecanisme de rezistenţă la antibiotice la germenii genului
Staphylococcus...........................................................................................24
PARTEA PERSONALĂ
CAPITOLUL I
Obiectiv.........................................................................................................30
CAPITOLUL II
Material şi metodă..........................................................................................31
CAPITOLUL III
Rezultate obţinute...........................................................................................39
Concluzii.........................................................................................................52
Bibliografie......................................................................................................53
CAPITOLUL I
Staphylococcus pasteuri
Staphylococcus saccharolyticus
Staphylococcus warneri
Staphylococcus saprophyticus Staphylococcus saprophyticus
Staphylococcus xylosus
Staphylococcus cohnii
Stafilococii sunt Gram pozitivi, dar în condiţii de stres metabolic (temperatură, pH,
presiune osmotică, factori antimicrobieni) pot deveni Gram variabili. Astfel: în aceeaşi
grămadă, alături de coci Gram pozitivi apar mai mult sau mai puţin coci Gram negativi; o
dată cu anomalia tinctorială, apar de regulă şi anomalii morfologice, cum ar fi forme uşor
alungite şi contururi imperfecte. [2, 6, 10,11].
I.2. Caractere de cultură
Stafilococii se dezvoltă cu uşurinţă în 18-24 de ore pe medii nutritive simple în
aerobioză; vitamina B1 şi acidul nicotinic sunt factori indispensabili pentru creştere.
Staphylococcus auricularis creşte într-un timp mai îndelungat după 24-36 de ore în
aerobioză şi pe aceleaşi medii nutritive; Staphylococcus saccharolyticus şi Staphylococcus
aureus anaerobius se dezvoltă mai repede şi mai abundent în anaerobioză. Unele variante
rare de S. aureus se dezvoltă numai în prezenţa CO 2 sau a altor metaboliţi, cum ar fi hemina
sau menadiona. [2, 10, 26, 29, 35].
Formele cu deficienţe ale peretelui celular necesită mediu hiperton pentru a putea
supravieţui şi a se multiplica.
Temperatura optimă de creştere pentru stafilococi este de 37°C, iar pH-ul optim este
de 7,5 dar sunt tolerate şi variaţii mari.
Obişnuit, coloniile de 24 de ore pe mediu solid au aspect S, sunt cremoase, rotunde cu
diametru cuprins între 2-3 mm, margini perfecte, suprafaţă netedă bombată şi lucioasă, aşa
cum se vede în imaginile de mai jos:
Stafilococ auriu – cultură pe geloză-sânge
(Dilip K. Banerjee – Pocket Picture Guide)
Fosfataza + + -
Novobiocină, - - +
rezistenta la
Acidifierea + + +
zaharozei (aerob)
Acidifierea + - +
trehalozei (aerob)
Acidifierea + d
manitolului(aerob)
- Streptococacceae
- Micrococcus
- Celelalte specii
Coagulază liberă + - -
Acidifierea manitolului + - -
anaerob
Termonuclează + - +
Acidifierea manitolului + - -
anaerob
Termonuclează + - +
Testul pe lamă pentru proteina A - coagulază legată şi polizaharid capsular (jos pozitiv -
S. aureus; sus negativ - S. epidermidis)
Testul termonucleazei: pozitiv - godeurile de la ora 4 şi 6; negativ
restul godeurilor
Mai multe firme produc truse de identificare şi/sau instrumente automatizate care
identifică speciile de stafilococi cu acurateţe între 70 şi 90%. Dintre acestea amintim sistemul
de identificare API pe truse API STAF IDENT, sistem de identificare de care beneficiază şi
Laboratorul Spitalului Clinic Judeţean Constanţa.
Procedura:
Se pregăteşte şi se etalonează inoculul ca pentru testarea difuzimetrică.
Se imersează un tampon de vată în inoculul etalonat, se scurge excesul de fluid prin
rularea tamponului pe peretele tubului.
Se însămânţează placa cu tamponul în spot sau în striuri pe o arie limitată. Alternativ
se pot însămânţa spoturi de 0,01 ml din suspensia etalonată şi diluată 1:10.
Se incubează placa 24 ore la 35°C.
Citirea şi interpretarea: Chiar o singură colonie de stafilococ per spot indică tulpină cu
fenotipul clasic de rezistenţă (tulpină med pozitivă). Tulpinile cu rezistenţă
intermediară, indiferent de fenotip, nu cresc pe placa de triaj.
Controlul de calitate al testărilor pentru heterorezistenţă: Foloseşte tulpina de S.
aureus ATCC 29213, sensibilă şi ATCC 38951 heterorezistenţă la oxacilină.
3. Identificarea şi semnificaţia clinică a altor fenotip uri de rezistenţă ale
stafilococilor ia oxacilină/meticilină.
Dacă tulpina testată nu creşte pe placa de triaj, dar alte metode de testare o indică
sensibilă la oxacilină/meticilină, trebuie considerată cu rezistenţă la limită şi aparţine altui
fenotip de rezistenţă. Testează tulpina faţă de oxacilină asociată cu un inhibitor de beta-
lactamază: dacă apare sensibilă aparţine fenotipului inactivator prin exces de beta-lactamază,
dacă rămâne rezistentă aparţine fenotipului MOD-SA. În infecţii grave care ameninţă viaţa
bolnavului, această diferenţiere trebuie făcută şi comunicată.
OBIECTIV
HEMOCULTURA
1. RECOLTARE
2. FROTIU COLORAT
■ albastru de metilen
■ Gram
3. ÎNSĂMÂNŢARE ÎN FLACOANE PENTRU SISTEM BACT/ALERT
Probă pozitivă:
■ Examen microscopic pe frotiu colorat Gram
■ Însâmânţare pe:
a) Gelozâ-sânge (pentru coci Gram pozitivi) → Catalază →pozitivă →Stafilococ →
→ ID 32 Staph. ↓
negativă
(Streptococ, Enterococ) →
→ ABE→pozitivă (Enterococ)
↓
negativă - Streptococ → β hemoliză (+)
↓
β hemoliză (-)→ ID 32 Strep.
b) Geloză chocolat → API-NH (Neisseria sau Haemophylus) → Frotiu → Antibiogramă
a) AABTL (pentru bacili Gram-) → Identificare ID 32 E → Antibiogramă
b) Sabouraud → 30°C 5 - 7 zile → ID 32 C → Antibiogramă
c) Mediu VF cu acid tioglicolic (10ml/tub) → 37°C 5 zile → Geloză Columbia cu
pirogalol.
Hemoculturi neconfirmate → Culturi pe bulion cu thioglicolat 48 h → Geloză Columbia →
→Se dă rezultat fals pozitiv după 48 h.
Alături de metodele clasice de însămânţare şi identificare, pentru o parte din produse
am folosit metoda modernă de cultivare BacT/Alert (pentru hemoculturi) şi identificare în
sistem automat API.
*Sistemul BacT/Alert este un sistem automat capabil să incubeze şi să monitorizeze
probe aerobe şi anaerobe; flacoanele cu medii de cultură sunt incubate la 37°C având
posibilitatea de a indica multiplicarea bacteriilor prezente în produs prin refractometrii de
fază solidă prezenţi la baza flacoanelor. Probele pozitive sunt apoi însămânţate pe medii
de cultură aerobe şi anaerobe urmând ca în final germenii dezvoltaţi să fie identificaţi în
sistem automat API.
♦ Metoda cantitativă;
♦ Metoda semicantitativă de examinare a cateterelor.
Metoda cantitativă
Inserţia intravenoasă a cateterului a fost retezată cu foarfece steril; în extremitatea
proximală a inserţiei intravenoase a cateterului a fost fixat un ac steril şi apoi într-un volum
cunoscut de bulion a fost realizată agitarea produsului.
*s-au efectuat diluţii decimale în acelaşi mediu de cultură;
*0,1 ml din fiecare diluţie a fost însămânţat pe o placă cu geloză sânge;
*plăcile au fost incubate 24 de ore la 37°C;
*numărul de colonii dezvoltate x inversul diluţiei determină numărul de unităţi
formatoare de colonii pe inserţie.
Interpretare
-prezenţa a peste 103UFC/inserţie atenţionează asupra iminenţei inflamaţiei şi
bacteriemiei;
-prezenţa a peste 104UFC/inserţie dă certitudinea existenţei inflamaţiei şi/sau
bacteriemiei.
c) Antibiograma
Testarea sensibilităţii la antibiotice am realizat-o în parte prin metoda clasică -
antibiograma difuzimetrică prin metoda Kirby-Bauer şi pe sistem automat API.
Metoda difuzimetrică pe aparat API
Principiu: testul se bazează pe rata de dezvoltare a microorganismelor în
prezenţa antibioticelor.
Stripul este realizat dintr-un plastic transparent, rigid şi conţine 16 - 32 godeuri cu
antibiotic deshidratat cu o concentraţie cunoscută.
Stripurile sunt însămânţate cu suspensie bacteriană preparată într-un mediu special.
Stripurile pot fi citite după 24 de ore automat sau vizual.
Cititorul recunoaşte codul stripului, realizează măsurătorile şi le transferă
computerului care stabileşte profilul corespunzător: rezistent, sensibil, intermediar.
Măsurarea turbidităţii poate fi citită pe aparatul API în 2 moduri:
Turbinefelometrică - se face turbidimetric (măsoară intensitatea luminii transmise
care este invers proporţională cu conţinutul de cultură bacteriană şi nefelometric –
măsoară intensitatea luminii împrăştiate la 30°C care este direct proporţională cu
cantitatea de cultură bacteriană;
Colorimetric - măsoară transmisia luminii pentru fiecare godeu în 4 regiuni ale
spectrului vizibil.
În figura următoare este prezentată imaginea unui strip ATB STREPTO.
REZULTATE OBŢINUTE
Secţia %
Chirurgie 18
Urologie 9
STI 15
Obstetrică – ginecologie 3
Ortopedie 13
Chirurgie plastică şi reparatorie 4
Ponderea speciilor bacteriene izolate din plăgi este prezentată în tabelul şi graficul
următor:
Tabel 11
Microorganisme %
Staphylococcus aureus 42
Stafilococ coagulază negativ 19
Escherichia coli 32
Klebsiella 3
Proteus 2
Piocianic 2
Sensibilitatea la antibiotice a tulpinilor de Staphylococcus aureus izolate din plăgi este
prezentată în tabelul următor:
Tabel 12
Determinarea sensibilităţii la antibiotice a tulpinilor de S. aureus
izolate din plăgi
Tabel 13
Proporţia relativă a principalelor fenotipuri de rezistenţă la S. aureus
izolate din plăgi
Fenotipul Tulpini rezistente
%
P, Te 12.61
P 10.67
P, Te, S, K, CN 9.70
P, S, K, CN 6.79
P, Te, S, K 5.82
P, Te, Ox, S, K, CN 4.85
P, Te, E, S, K, CN 4.85
P, Te, E, S, K, 3.88
P, S, K 2.91
P, Te, Ox, E, S, K, CN 2.91
P, Te, Ox, S, K, CN 2.91
P, Te, Ox, E, S, K 1.96
P, Te, Ox, E, S, K 1.96
S, K, CN 1.96
P, Te, Ox, E 1.96
P, S, K, CIP 1.96
Alte 21 fenotipuri (câte 2 tulpini) 20.38 (0.97%)
Tabel 14
Tulpini Antibiotic Sensibil Rezistent
Stafilococi coagulază Azitromicină 92 8
pozitivi Eritromicină 76 24
Claritromicină 83 17
Stafilococi coagulază Azitromicină 98 2
negativi Eritromicină 82 18
Claritromicină 90 10
Tabel 15
Tulpini sensibile (%) Tulpini rezitente (%)
Cefepimă 96.4 3.6
Cefoperazonă 90.9 9.1
Ceftazidim 90.4 9.6
Tabel 16
Determinarea sensibilităţii la antibiotice a tulpinilor de S. aureus
izolate din catetere
Tabel 17
Determinarea sensibilităţii la antibiotice a tulpinilor de S. aureus
izolate din plăgi
CONCLUZII
1. Din studiul nostru rezultă că există diferenţe privind nivelele de sensibilitate la
antibiotice a tulpinilor de S. aureus izolate, diferenţe legate de secţia în care au fost izolate
aceste tulpini; există nivele de rezistenţă mai mare la antibiotice a tulpinilor izolate de pe
catetere de la pacienţii internaţi în secţii cu risc crescut (arşi, STI).
2. Pe perioada luată în studiu s-au constatat modificări ale sensibilităţii în sensul
scăderii acesteia pentru unele antibiotice, fenomen explicat de exercitarea unei presiuni
selective a antibioticelor folosite asupra tulpinilor de staflococ izolate.
3. Aceste considerente obligă o apreciere globală continuă a evoluţiei sensibilităţii la
antibiotice astfel încât să fie posibilă prevenirea transformării tulpinilor rezistente în populaţii
rezistente şi apariţia supergermenilor de spital, lucru realizabil printr-o colaborare strânsă între
medicul epidemiolog, clinician şi microbiolog.
4. Cunoaşterea fenotipurilor de rezistenţă ne informează asupra mecanismelor de
instalare a rezistenţei, modalităţi de răspândire a acestora creând premisele de apreciere a
evoluţiei posibilei rezistenţe în viitor.
BIBLIOGRAFIE
1. Bismuth R. - Cocci a Gram positif et aminosides, L'antibiogramme, MPC Vigot,
1995.
2. Bismuth R., Caillon J. - Staphylocoques, Bactericidie. Aspects thepretiques et
therapeutiques, Maloine, 1990.
3. Bismuth R., Zilhao R. şi coiab. - Gene heterogenicity for tetracyclin resistance in
Staphylococcus spp. Antimicrob. Agents Chemoter, 1990.
4. Bismuth R., Jarlier V., şi colab. - Etat actuel des phenotypes de resistance aux
antibiotiques de S. aureus, Les infections a staphylocoques meticilino-resistants, Arnette,
1984.
5. Bismuth R., Vermee F., şi colab. - Activite bacteriostatique et bactericide des
streptogramines sur des souches de S. aureus en fonction des principaux phenotypes de
resistance aux MLS, Macrolides et synergistines, Arnette, 1990.
6. Bîlbîie V., Pozsgi N. - Bacteriologie medicală, voi. II, Editura Medicală, Bucureşti,
1985.
7. Buu-Hoi A. - Cocci a Gram positif et macrolides-lincosamides- streptogramines,
L'antibiogramme. MPC Vigot, 1995.
8. Bryan L.E. - General mechanisms of resistance to antibiotics, JAC, suppl. A, 1994.
9. Budnik L.D., Schlaefler S. - Ciprofloxacin - resistant Methicilin resistant Staphylococcus
aureus in New York Health care facilities, Am. J. Publ. Health, 1990
10. Buiuc D. - Microbiologie clinică, vol. I, Editura Didactică şi Pedagogică, Bucureşti 1998.
11. Codiţă I. - Genul Staphylococcus, Bacteriol. Virusol. Parazitol. Epidemiol., 1993
12. Debeleac L, Popescu Dranda M.C. - Microbiologie – Editura Medicală Amaltea,
Bucureşti, 1994.
13. E Test Technical guide, 3rd edn. Solna, Sweden: AB Biodisk, 1993.
14. Gayral J.P., Albertini M.T. et. al. - Sensibilite â 27 antibiotiques de 858 souches de
Staphylococcus, Path. Biol., 1996.
15. Garrod P.L., Lambert P.H. şi colab. - Laboratory control, Antibiotic and
Chemotherapie, Fifth Ed. 1981, Churchill Livingstone.
16. Gerbaud G., Goldstein F. - Trimetophrime et Sulfamides. L'antibiogramme, MPC
Vigot, 1995.
17. Gutmann L, Goldstain F. - Staphylocoques et beta-lactamines, L'antibiogramme, MPC
Vigot, 1998.
18. Jarlov JO, Rosdahl VT - Quantitative determination of (β- lactamase production in
Staphylococcus aureus strains production in Staphylococcus aureus strains compared to
qualitative testing by a microbiologica! clover leaf test, a chromogenic cephalosporin test
and a iodometric test. Acta path Microbiol Immunol Scand Sect B 1996; 94:415-21.
19. Haley R.W., Cushion N.B. şi colab. - Eradication of endemic Methicillin-resistant
Staphylococcus aureus infections from a neonatal intensive care unit, J.I.D., 1995.
20. Ingram G.I.C. - Formation of clear zones with "sensitive" and "resistant" Staphylococcus
aureus in penicillin plate assays, J Gen Microbiol, 1995.
21. Komatzukava H., Suzuki J., şi colab. - Effect of combination oxacillin and non beta-
lactam antibiotics on methicillin resistant Staphylococcus aureus, J. Antimicrob. Chemother,
1994
22. Leclerq R., Duval J., şi colab. - Mecanisme et evolution des resistance aux macrolides,
lincosamides et streptogramines, Macrolides et synergistines, Arnette, 1998.
23. Leclerq R., Courvalin P. - Bacterial resistance to macrolide, lincosamide and
streptogramin, antibiotics by target modification, Antimicrob. Agents Chemother., 1991.
24. Le Minor L., Vernon M. - Bacteriologie Medicale. 2eme edition, 1990, Flammarion
Medicine-Sciences, Paris.
25. MacFaddin J.F. - Biochemical tests for the identification of medical bacteria, second
edition, 1980 Williams & Wilkins Co., Baltimore, MD.
26. Mandell G.L., Douglas R.G., şi colab. - Staphylococcus aureus. Principles and Practice of
Infectious Disease, Third Ed., 1990, John Wiley & sons, NY.
27. Mateos M., Knapp CC. et. Al. - Characterization of resistance Phenotype and
Cephalospohn activity in Oxaciilin resistant Staphylococcus aureus, Antimicrob. Ag.
Chemother, 1989.
28. Menkes R.E., Corner B.M. et. al. - Adaptation of methicilin resistant Staphylococcus
aureus during antibiotic therapy, J. Antimicrob. Chem., 1989.
29. Murray P.R., Baron E.J., Pfaller M.A., Tenover F.C. - Manual of Clinical Microbiology
Seventh Edition, 1999, American Society for Microbiology, Washington, D.C.
30. Nicolau D.P., Freeman CD. et. al. - Minocycline versus Vancomycin for treatment of
experimental endocarditis caused by Oxacillin resistant Staphylococcus aureus, Antimicrob.
Ag. Chemother, 1994.
31.Østravik I, Ødegaard K. - A simple test for penicillinase production in Staphylococcus
aureus, Acta Path Microbioi Scand Sect B 1995; 79: 855-6.
32. Pierre J., Gutmann L. - Bases biochimiques et genetiques de la resistance aux beta-
lactamines chez Ies staphylocoque, Lettre Infect, 1998.
33. *** - Manual of Clinical Microbiology, fifth edition, Washington, 1991.
34. Sneath P.H.A., Mair N.S., Sharpe M.E., Hoit J. G. - Bergey's Manual of Systematic
Bacteriology Ninth Edition, Voi. 2, 1986, Williams & Wilkins Co., Baltimore, MD.
35. The Staphylococci - Zentralblatt fur Bakteriologie, Mikrobiologie and Hygiene,
Supplement 14, Proceeding of the Vth International Symposionum on Staphylococci
and Staphylococcal Infections - Warszawa, June 1994