Ce sunt biomarkerii moleculari?

Biomarkerii moleculari sunt modificări ale cromozomilor, ADN-ului, ARN-ului,

proteinelor și moleculelor aferente care indică o condiție biologică particulară, cum ar fi
cancerul.

Anumite modificări în cromozomi, ADN, ARN, proteine și alte înrudite moleculele au

potențialul de a provoca cancer sau alte boli. Atunci când astfel de modificări au legatura cu o
anumită boală sau stare de sănătate, ele sunt cunoscute sub numele de biomarkeri moleculari.

Biomarkerii sunt asociați cu multe stări diferite de sănătate și boli - nu doar de cancer. De
exemplu, un nivel ridicat al unei proteine numita gonadotropină corionică umană în urină este
un biomarker pentru sarcină. În plus, biomarkerii nu sunt întotdeauna moleculari. Anumite
modele de activitate ale creierului pot fi biomarkeri pentru boala neurologică și tensiunea
arterială ridicată.

Alterările cromosomiale în cancer (Chromosomal

Alterations as Biomarkers in Cancer )

Cromozomul Philadelphia

Cromozomul Philadelphia este una dintre cele mai cunoscute modificări cromozomiale în
cancer. Cromozomul Philadelphia apare atunci când materialul genetic din cromozomul 9 iși
schimbă locul cu materialul genetic activat din cromozomul 22 - proces cunoscut sub
numele de translocare. Genetica combinată pe cromozomul 22 creează o genă cauzatoare de
cancer cunoscută sub numele de BCR-ABL. Această genă conține instrucțiunile pentru a
genera proteine anormale care provoacă leucemie. Proteinele anormale sunt similare cu
proteinele noastre normale, cu excepția faptului că nu se poat închide.
 Cromozomul Philadelphia si gena BCR-ABL

In imaginea de mai sus in partea stanga este reprezentarea grafica a cromozomilor 9 si 22 in

starea lor normala, necanceroasa, iar in partea dreapta este reprezentarea grafica dupa
translocația provocata de cancer a acestor cromozomi, observată în leucemia mielogenă
cronică.

Diagnosticul molecular care testează prezența cromozomului Philadelphia se poate face în

mai multe moduri. Una dintre cele mai frecvente metode este de a determina dacă secventa de
ARN a proteinei de fuziune este prezentă în sângele unei persoane. Prezența acestei secvențe
de ARN indică faptul că organismul face în mod activ proteina de fuziune și ne permite să
deducem prezența cromozomului Philadelphia.

Alte anomalii cromozomiale

Translocarea cromozomială, ca cea care produce cromozomul Philadelphia, este frecventă

în multe alte tipuri de cancer. Cel mai adesea, această translocare are ca rezultat proteine de
fuziune care nu se pot închide - de fapt, peste 200 de astfel de proteine au fost identificate.

Un alt exemplu în acest sens este o genă cunoscută sub numele de limfom kinază anaplastică
(ALK). Gena ALK reglează în mod normal creșterea celulelor. Cu toate acestea, când gena
ALK fuzionează cu oricare dintre alte câteva gene, aceasta produce o proteină care
îndepărtează frânele de la creșterea celulelor. Această creștere necontrolată a celulelor joacă
un rol esențial în unele tipuri de cancer; țesutul tumoral de la aproximativ 3-5% dintre
persoanele cu cancer pulmonar cu celule non-mici are această anomalie genică. O terapie
țintită cunoscută sub numele de crizotinib a fost dezvoltată pentru a inhiba proteina excesivă
produsă de hiperactivitatea ALK și poate fi utilă persoanelor cu cancer pulmonar cu celule
non-mici, a căror tumoră este pozitivă pentru gena fuziunii ALK.

Exemple de anomalii cromozomiale anormale asociate cu cancerul

Efectele potențiale ale modificărilor în ADN

Modificările ADN-ului pot avea una dintre cele trei consecințe:

- Fără efect / efect nedetectabil: modificările ADN-ului nu afectează structura sau funcția
rezultatului proteină.

- Activare: modificările ADN-ului determină proteina rezultată să obțină o funcție

necontrolată.

-Inactivare: modificările ADN-ului interferează cu proteina rezultată, ceea ce duce la

pierderea funcției sale, ceea ce duce la pierderea suprimării altor gene și la activarea lor
necontrolată

Alterari ale genelor in cancer(Gene Alterations as

Biomarkers in Cancer)
Micile modificări în anumite părți ale ADN-ului pot servi ca biomarkeri. Nici un om nu
are exact aceleași secvențe de ADN în toti cromozomii și genele lui, cu excepția cazului în
care sunt gemeni identici. Cu alte cuvinte, toti avem variații genetice. Unele dintre aceste
variații sunt moștenite, iar altele sunt dobândite de-a lungul vieții noastre.

Pot apărea mai multe tipuri diferite de variații genetice. Polimorfismele cu un singur
nucleotid( SNPs ) prezinta diferențe într-o singură pereche de baze nucleotidice în secvența
ADN care apare la cel puțin 1% din populație în comparație cu toți ceilalți. SNPs reprezintă
90% din toate variațiile ADN-ului uman. SNP-urile nu sunt exclusiv bune sau rele - unele pot
fi benefice și altele dăunătoare, iar altele, poate nu au niciun efect detectabil.

Polimorfisme cu un singur nucleotid

SNP-urile care pot avea consecințe negative asupra sănătății sunt adesea denumite mutații.
Cu toate acestea, SNP-urile sunt numite mutații numai dacă apar din nou, fie prin moștenire
(mutații ale liniei germinale), fie induse în țesutul canceros de evenimente din mediile interne
sau externe (mutații somatice).

Pot apărea mai multe tipuri diferite de mutații, așa cum se arată în graficul următor.