Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Curs 04
Curs 04
Partea proteică a enzimei este denumită şi apoenzimă sau apoproteină şi are rolul de a
asigura specificitatea de substrat şi specificitatea de reacţie. Partea proteică prezintă structură
primară, secundară, terţiară şi uneori cuaternară.
Structura primară este reprezentată de lanţul polipeptidic, unic pentru fiecare enzimă.
Înlocuirea unuia sau a mai multor aminoacizi din structura primară poate determina
modificarea activităţii enzimei cu apariţia de acţiuni noi sau dispariţia acţiunii acesteia.
Lanţul polipeptidic prezintă un capăt N-terminal ( ) şi
unul C-terminal ( ). Lanţul polipeptidic este sintetizat pornind
de la capătul N-terminal spre cel C-terminal.
Uneori lanţul poate fi stabilizat prin realizarea de legături disulfidice între grupările tiol
(-SH) ale resturilor de cisteină.
Analiza prin cristalografie cu raze X a enzimelor a evidenţiat faptul că legătura amidică din
structura proteinei are caracter parţial de legătură dublă, iar substituenţii sunt dispuşi în configuraţie
trans.
Stabilirea structurii primare a proteinezimei se realizeză prin:
- hidroliză pe cale chimică sau enzimatică urmată de analiza aminoacizilor,
- analiza pe baza tehnicilor electroforetice.
Analiza structurii primare permite evidenţierea mutaţiilor genetice deoarece sinteza
proteinei este condiţionată de structura genei aferente proteinei.
1
- legături de hidrogen – între atomul de hidrogen al grupărilor hidroxi din structura hidroxi-
aminoacizilor şi atomul de oxigen din grupările carbonil amidice ale glutaminei şi asparaginei,
- interacţiuni hidrofobe – între resturile hidrocarbonate (R) din structura aminoacizilor.
Structurile secundară şi terţiară formează centrul activ al enzimei adică acea zonă din
enzimă unde are loc fixarea şi transformarea substratului.
Dacă predomină radicali R încărcaţi electric (hidrofili) molecula este alungită, dacă
predomină radicali R hidrofobi, molecula este globulară.
Structura cuaternară apare în cazul enzimelor care prezintă mai multe lanţuri polipeptidice.
Fiecare lanţ are structură primară, secundară şi terţiară proprie. Acestea sunt denumite monomeri,
protomeri sau oligomeri, sunt asociate prin legături ionice, de hidrogen, sunt în general în număr par
şi pot fi identici sau diferiţi.
Enzima este funcţională numai în cazul în care monomerii sunt asociaţi, iar separarea lor
determină dispariţia acţiunii biologice. Monomerii trebuie să fie complementari între ei şi să
aparţină aceleiaşi specii.
Localizarea enzimelor
Enzimele pot prezenta localizare:
- nespecifică – se găsesc în toate celulele –
- specifică – doar în anumite ţesuturi:
- citoplasmă –
- nucleu –
- lizozomi –
- ribozomi –
- reticul endoplasmatic –
- mitocondrii
- membrana externă mitocondrială –
- matricea mitocondrială –
- aparatul Golgi –
2
Denumirea enzimelor
Denumirea enzimelor se poate realiza pe baza a trei sisteme:
Sistemul 1 - denumirea enzimei se obţine prin adăugarea sufixului „ază” la
denumirea substratului a cărui transformare este catalizată de enzimă.
Exemple:
ENZIME
Clasificarea enzimelor
În funcţie de tipul reacţiilor pe care le catalizează Comisia de Enzimologie a IUBMB a
clasificat enzimele în 6 clase:
1. oxidoreductaze (cod EC 1)
2. transferaze (cod EC 2)
3. hidrolaze (cod EC 3)
4. liaze (cod EC 4)
5. izomeraze (cod EC 5)
6. ligaze (cod EC 6).
EC 1. OXIDOREDUCTAZE
Sunt enzime care catalizează reacţii de oxido-reducere conform reacţiei generale:
a. Dehidrogenaze
3
Sunt enzime care catalizează transferul hidrogenului de la grupe funcţionale (-CH2-OH, -
CHO, -CH2-NH2), nucleotide (NADH, NADPH) la un substrat în absenţa oxigenului.
AH2 + B → A + BH2
Reacţiile catalizate de aceste enzime sunt denumite şi reacţii de oxidare anaerobă, iar
enzimele sunt denumite dehidrogenaze anaerobe.
COOH CoQ10H2 COOH
CoQ10
CH2 succinat CH
dehidrogenaza
CH2 HC
EC 1.3.5.1
COOH COOH
acid succinic acid fumaric
b. Oxidaze
Sunt enzime care catalizează transferul hidrogenului de la substrat la oxigen cu formare de apă
sau peroxid de hidrogen. Procesul este denumit şi oxidare aerobă.
AH2 + 1/2 O2 → A + H2O
AH2 + O2 → A + H2O2
O O
C C
L-ascorbat
HO-C oxidaza O=C
2 O +O 2 O + H 2O
HO-C 2 EC 1.10.3.3. O=C
HC HC
HO-CH HO-CH
CH2-OH CH2-OH
acid L-ascorbic acid dehidroascorbic
c. Oxigenaze
Sunt enzime care catalizează introducerea de atomi de oxigen în moleculă. În funcţie de
numărul acestora pot fi:
c.1. Monooxigenaze (hidroxilaze) – catalizează reacţii de tipul:
AH + O2 + BH2 → A-OH + B + H2O
CH2-CH-COOH CH2-CH-COOH
O2 H2O
NH2 NH2
fenilalanin-4-
hidroxilaza
NADPH + H+
fenilalanina NADP+ OH
tirozina
4
O CO-CH2-CH-COOH
CH2-CH-COOH 2 triptofan
2,3-dioxigenza NH2
NH2
N EC 1.13.11.11. NH-CHO
H
triptofan N-formil-kinurenina
d. Hidroperoxidaze
Sunt enzime care catalizează descompunerea peroxidului de hidrogen sau a altor peroxizi.
catalaza
2 H2O2 2 H2O + O2
EC 1.11.1.6.
EC 2. TRANSFERAZE
Sunt enzime care catalizează transferul unei grupe funcţionale de la un donor la un acceptor.
În funcţie de natura grupului care este transferat enzimele se clasifică în 9 subclase:
EC 2.1. Enzime care catalizează transferul unui grup ce conţine un atom de carbon
Gruparea transferată poate fi grupare metil, hidroximetil, formil, carboxi, carbamoil sau amido.
Aceste enzime conţin drept coenzimă tetrahidrofolatul obţinut prin reducerea acidului folic.
OH CH3
N metionin
N CH2-NH-R CH -CH -CH-COOH
+ 2 2 B12 sintaza
SH NH2 EC 2.1.1.13.
H2N N N
H L-homocisteina
5
N -metil-tetrahidrofolat
OH
H
N
N CH2-NH-R CH2-CH2-CH-COOH
+
S-CH3 NH2
H2N N N
H L-metionina
acid tetrahidrofolic
EC 2.2 Enzime care catalizează transferul unei grupări arbonilice – sunt denumite
transadolaze sau transcetolaze în funcţie de natura grupării carbonilice
5
CH2-OH
CH2-OH CHO C=O
H-C-OH CHO
C=O HO-C-H
+ transcetolaza + CH-OH
HO-C-H H-C-OH H-C-OH
EC 2.2.1.1. CH2-OPO3H2
H-C-OH H-C-OH H-C-OH
gliceraldehid-3-fosfat
CH2-OPO3H2 CH2-OPO3H2 H-C-OH
xilulozo-5-fosfat ribozo-5-fosfat
CH2-OPO3H2
sedoheptulozo-7-fosfat
EC 2.4. Enzime care catalizează transferul unui rest de glucoză – sunt denumite şi
glicoziltransferaze
hexozil
transferaza (glicogen sintaza)
glu-UDP + -(glu) n-1 glicogen + UDP
EC 2.4.1.11
COOH COOH
COOH TGO COOH
C=O (AST, ASAT) HC-NH2
HC-NH2 C=O +
+ CH EC 2.6.1.1. CH2
CH2 2 CH2
CH2 CH2
COOH COOH
acid aspartic COOH acid oxalacetic COOH
acid -cetoglutaric acid glutamic
COOH COOH
COOH C=O TGP COOH
(ALT, ALAT) HC-NH2
HC-NH2 + CH C=O +
2 EC 2.6.1.2. CH2
CH3 CH2 CH3
CH2
alanina COOH acid piruvic
COOH
acid -cetoglutaric
acid glutamic
6
Sunt denumite în mod general kinaze. De foarte multe ori substratul este activat în urma acestui
transfer.
HO-H2C O OH H2O3PO-H2C O OH
hexokinaza
HO + ATP HO
CH2-OH EC 2.7.1.1 CH2-OH + ADP
OH OH
fructoza fructozo-6-P
CH2OH CH2-OPO3H2
O ATP ADP O
OH glucokinaza OH
HO OH HO OH
EC 2.7.1.2.
OH OH
glucoza glucozo-6-fosfat
EC 3. HIDROLAZE
Sunt enzime care catalizează hiroliza substratului.
Enzimele se clasifică în 13 subclase în funcţie de natura legăturii care este desfăcută sau în
funcţie de natura compusului care este hidrolizat.
EC 3.5. Enzime care catalizează hidroliza legăturilor amidice diferite de cele din structura
peptidelor
7
ureaza
H2N-C-NH2 + H2O CO2 + 2 NH3
EC 3.5.1.5.
O
EC 4. LIAZE
Sunt enzime care catalizează scindarea nehidrolitică a unor legături din structura moleculei,
cu eliminarea de CO2, H2O sau NH3.
Enzimele sunt clasificate în 7 subclase în funcţie de natura legăturii care este scindată.
N CH2-CH-COOH N CH2-CH2-NH2
histidin-
NH2 decarboxilaza
+ CO2
N N
H H
histidina histamina
EC 5. IZOMERAZE
Sunt enzime care catalizează transformarea izomerilor optici, geometrici sau structurali.
8
EC 5.2. Enzime care transformarea izomerilor geometrici cis-trans
COOH COOH
C-H maleat izomeraza H-C
C-H EC 5.2.1.1. C-H
COOH COOH
acid maleic acid fumaric
EC 5.4. Enzime care catalizează transferul intramolecular a unor grupe de atomi (mutaze)
CH2-OPO3H2
CH2-OH
O O
fosfoglucomutaza
OH OH
HO OH EC 5.4.2.2. OPO3H2
HO
OH OH
glucozo-6-fosfat glucozo-1-fosfat
EC 6. LIGAZE
Sunt enzime care catalizează formarea unei noi legături cu consum de energie furnizat de
ATP.
9
Sistemul citocrom P450 (CYP450)
Este un sistem format din mai multe enzime organizate în familii şi subfamilii. denumirea
indică localizarea (cito – celulă), culoarea (crom, P), lungimea de undă la care prezintă absorbanţă
maximă atunci când fixează CO (450).
Este localizat la nivel celular în toate ţesuturile (concentraţia cea mai mare este în ficat),
fiind prezent în membrana reticulului endoplasmatic. din punct de vedere structural, fiecare enzimă
conţine trei unităţi:
- o grupare heminică – conţine hem cu fier în stare de oxidare 2+ sau 3+ în funcţie de tipul
reacţiei. aceasta fixează substratul şi oxigenul,
- o flavoproteină enzimatică – este enzimă, conţine un derivat de vitamina B2 (de aceea are
prefixul flavo); este denumită şi NAD(P)H- CYP450 reductaza; catalizează reacţia,
- fosfatidilcolină – are rolul de a asigura legătura funcţională dintre cele două unităţi
anterioare.
În organismul uman există 36 de familii ale sistemului CYP450, dar nu au fost caracterizate
toate. fiecare enzimă este codoficată în funcţie de familie şi subfamilie, astfel primul număr din cod
indică familia; litera indică subfamilia, iar al doilea număr este specific enzimei. De exemplu
CYP2C19 – este enzima din familia 2, subfamilia C şi are numărul 19. fiecare enzimă prezintă
afinitate diferită faţă de un anumit substrat. cea mai importantă enzimă a sistemului este CYP3A4
deoarece este catalizează foarte multe reacţii de transformare a compuşilor endo- şi exogeni,
inclusiv transformarea pro-drug-urilor La nivel intestinal şi hepatic (substanţe farmaceutice
inactive) în substanţe active. în timpul vieţii intrauterine acesta există sub forma CYP3A7 care
dispare după naştere.
Cele mai importante reacţii catalizate sunt cele de hidroxilare în care sursa de hidrogen este
NADH-ul (nicotinamidadenin dinucleotidul forma redusă) sau NADPH-ul (nicotinamidadenin
dinucleotid fosfatul forma redusă):
R-OH + O2 + 2H+ + 4E- → R-OH + H2O
Reacţiile care au loc sunt:
R-OH
H2O
R-H
Fe3+
Fe2+ R-H
2H+ Fe3+ R-H
FADH2 NADP+
2 O2-
e-
e- FAD NADPH + H+
O2
O2
10
- sinteza unor compuşi endogeni – colesterol, hormoni steroizi
11