Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Partajare Thompson and Thompson. Genetica Medicala Ed. 8
Partajare Thompson and Thompson. Genetica Medicala Ed. 8
GENETICAE%l+^
MEDICATA
Robert L. Nassb&u,mt MD, FACB FACMG
Holly Smith Chair of Medicine and Science
Professor of Medicine, Neurology, Pediatrics and Pathology
Department of Medicine and Institute for Human Genetics
University of California San Francisco
San Francisco, California
ELSEVIER
Cuprins
CAPITOLUL 1 CAPITOLUL 6
Introducere l Bazele cromozomiale 9i genomice ale bolilor:
Aparilia ;i dezvoltarea geneticii afecliuni autozomale
gi gonozomale 75
;i genomicii, 1
CAPITOLUL I9 CAZIJRI
Probleme etice Ei sociale in Studii de cazuri clinice ilustrind
senetici gi genomicl 383 principiile genetice 391
Pr incipiile eticii biomedicale, 383
Dilemele etice in genetica medicald, 383
Glosar 489
C o nfi d e n{i alit at e a info r m al iil o r
Surse Ei mullumiri 509
genetice, 386
Efectele eugenice 5i disgenice R[spunsuri Ia probleme 515
ale geneticii medicale,i88
Genetica in meclicind, i90 Index 533
Introducere
de boli inflamatorii intestinale netratabile, care se intind caracteristice. Cele mai multe defecte de acest fel sunt rare,
pe mai mul1i ani qiii pun viala in pericol. Secvenlierea cu o frecvenld ce ar putea atinge o valoare de 1 Ia 500-1.000
relevi o mutalie intr-o geni care nu fusese anterior de indivizi, insi, de obicei, incidenla este mult mai mic[.
suspectati, clarificd'nd diagnosticul clinic gi modificind Degi sunt destul de rare luate individual, ca gi grup disfunc-
tratamentul pacientului (vezi Capitolul 16). liile provocate de o singuri gend sunt responsabile pentru
. Oamenii de gtiinli din industria farmaceutici secvenliazi un procentaj semnificativ de imbolniviri gi decese. in total,
ADN-ul celulelor canceroase pentru a identifica schim- incidenla bolilor monogenice grave in populalia pediatric[
blrile specifice produse ln cadrul cdilor de semnalizare a fost estimati la aproximativ I din 300 copii nlsculi vii. Pe
oncogene, activate in mod inadecvat de o muta{ie soma- parcursul unei vieli intregi, relevanla disfuncliilor provocate
tici, ducAnd astfel Ia dezvoltarea unor inhibitori specifici de o singurd' geni' este de 1 la 50. Aceste disfunclii sunt pre-
care induc ln mod sustenabil remisia cancerului Ia zentate ln Capitolul 7.
pacienli (Cazut 10). Bolile multi-factoriale cu mostenire complexi se referl
la majoritatea bolilor in care existi gi o contribu{ie genetic6,
aga cum ne arati riscul crescut de aparilie a unei boli Ia
Categorii de boli genetice
gemenii identici sau la rudele apropiate ale indivizilor deja
Aproape orice boali este rezultatul acliunii combinate a afecta\i de maladia respectivi (comparativ cu populatia gene-
genelor gi a mediului inconjuritor, insi rolul relativ al com- rala), degi antecedentele familiale nu coincid cu modelele de
ponentei genetice poate fi mai mare sau mai mic. Printre transmitere geneticl intAlnite in mod normal in cazul defectelor
bolile cauzate in totalitate sau par{ial de factori genetici sunt monogenice. Bolile multi-factoriale includ anomalii congeni-
recunoscute trei mari categorii: disfunclii cromozomiale, tale, precum boala Hirschprung (Cazul 22), cheiloschizisul,
disfunclii ale unei singure gene gi boli multi-factoriale. defecte cardiace congenitale gi multe boli comune apirute la
in cazul disfunc{iilor cromozomiale, defectul nu este maturitate, precum boala Alzheimer (Cazul 4), diabetul qi
cauzat de o singuri greqeald apiluti in design-ul genetic, ci boala arteriali coronariani. in cazul multora dintre aceste boli
de un exces sau o deficienli de gene situate pe cromozomi nu pare si existe o eroare unici a informaliei genetice. Mai
intregi sau pe segmente intregi de cromozomi. De exemplu, degrabi, aceste maladii sunt rezultatul impactului combinat al
prezenta unei copii in plus dintr-un cromozom, cromozomul unor forme de varialie a mai multor gene diferite. Fiecare
2l,indicil o disfuncfie specificl, sindromul Down, degi nicio varialie poate catza, proteja sau predispune la un defect grav,
geni individuali din acel cromozom nu este anormald. adesea in combinalie sau declangat de factorii de mediu. Esti-
Duplicarea sau delelia unor segmente mai mici de cromo- mirile privind impactul bolilor multi-factoriale variazd. intre
zomi, cu dimensiuni cuprinse intre o singurl geni gi cAteva 5%, in populafia pediatricn gi pAn[ \a 60o/o,la nivelul intregii
procente din lungimea unui cromozom, pot casza defecte populatp Aceste boli sunt subiectul Capitolului 8.
complexe la nagtere precum sindromul DiGeorge sau chiar
autismul izolat, fard. si existe nicio anomalie fizici vizibili.
Global, disfuncliile cromozomiale sunt comune, afectAnd iru loc DE coNcluzu
aproximativ 7 din 1.000 de copiii nlsculi vii gi provocdnd Pe parcursul vielii profesionale de 50 de ani a profesioniqtilor
aproximativ jumitate din avorturile spontane produse in gi a studenlilor de astizi, este foarte probabil si se produc[
primul trimestru de sarcinl. Aceste tipuri de disfunclii sunt schimbiri semnificative in ceea ce privegte descoperirea,
prezentate in Capitolul 6. dezvoltarea si utilizarea cunoqtin{elor gi a instrumentelor
Defectele unei singure gene sunt caszate de mutalii genetice gi genomice in medicini. ]udecAnd dupl ritmul tot
patologice produse in gene individuale. Mutalia poate fi pre, mai accelerat al descoperirilor fbcute doar in ultima decadi,
zenti in ambii cromozomi ai unei perechi (unul de origine este aproape sigur ci ne aflim abia la inceputul unei revolulii
paternS: qi altul de origine materni) sau intr-un singur cro- de integrare a cunogtinlelor de genetici qi genomici in sis-
mozom al unei perechi (combinat cu o copie normali a genei temele de slnitate publici gi in practica medicali. Introdu-
respective, al celuilalt exemplar al cromozomului in cauzd). cerea in limbajul qi in conceptele legate de genetica umand
Defectele unei singure gene cauzeazS" adesea boli care qi medicali gi aprecierea perspectivelor geneticii gi genomicii
urmeazd.unul dintre modelele clasice de mogtenirb in cadrul asupra sinlti{ii qi a bolilor vor constitui un suport pentru
familiilor (autozomal recesiv, autozomal dominant sau acumularea continui de cunogtinle care face parie din
X-linkat. (XJinked)). in anumite caztri,mutafia se regiseqte cariera fiecdrui profesionist din domeniul sinlti{ii.
in genomul mitocondrial, gi nu in cel nuclear. in orice caz,
cauza este reprezentatd de o eroare criticl apiruti in infor-
BIBLIOCIRAFIE CENERA[[
malia genetici purtatl de o singuri geni. Disfunctiile unei
singure gene, precum fibroza chistici (Cazul 12), anemia cu Feero WG, Guttmacher AE, Collins FS: Genomic medicine-an updated
primer, N Engl I Med 362:2001-2011, 2010.
celule in r...ie 1c*ol 42), sau sindromul Marfan (Cazul Ginsburg G, Willard HF, editors: Genomic and personalized medicine (vols
30) prezintS, de obicei, modele genealogice evidente Ei 1 & 2), ed 2, New York,2012, Elsevier.
Genomul uman
notiuni
,
introductive
46. De atunci, s-au acumulat multe cunogtinle despre cro- Iocus specific, omologii pot avea secvente identice sau dife-
mozomii umani, structura qi compozilia lor normali, iden- rite; aceste forme diferite ale unei gene poarti numele de
titatea genelor pe care le conlin, precum qi despre numeroasele alele. Unul dintre cei doi cromozomi omologi ai unei perechi
qi variatele anomalii cromozomiale. se mogtenegte de la tati iar celllalt de la mami. in general,
Cu exceptia celulelor care se transformd in gameli cei doi cromozomi ai unei perechi de autozomi nu se deoseb-
(celulele liniei germinale), toate celulele care contribuie Ia esc intre ei microscopic. La femei, cromozomii de sex, cei
formarea structurilor corpului sunt denumite celule soma- doi cromozomi X, nu se deosebesc intre ei. La birbali, insl,
tice (soma, corp). Genomul prezent in nucleul celulelor cromozomii de sex diferi intre ei. Un cromozom al perechii
somatice umane conline 46 de cromozomi, are 24 de tipuri este X, identic morfologic celor doi cromozomi de la femeie,
de cromozomi diferite morfologic gi este organizatin23 de pe care birbatul il mogteneqte de la mama sa qi il transmite
perechi (Fig.2-1). Dintre cele 23 de perechi de cromozomi, fiicelor sale; celilalt cromozom al perechii, cromozomul Y,
22 sunt deopotrivi la birbali gi la femei fiind numili auto- este moqtenit de la tati si este transmis numai fiilor sii. in
zomi gi numerota{i in ordinea descrescitoare a mS.rimii lot Capitolul 6, in care vom explora bazele cromozomiale qi
de la cei mai mari citre cei mai mici. Perechea 23 include doi genomice ale bolilor umane, vom expune cAteva exceplii de
cromozomi de sex diferifi: cromozomul X Ei cromozomul Y la regula simpli qi aproape universali ci femeile au cromo-
Ia birbali gi doi cromozomi X la femei. Un aspect fundamen- zomii de sex XX 9i bnrbalii XY.
tal al genomului uman este acela ci fiecare cromozom poarti Pe lingi
genomul nuclear, o micd dar importanti parte
un set diferit de gene dispuse intr-o succesiune liniari de-a a genomului uman se gi:segte in mitocondria din cito-
lungul moleculei sale de ADN. Cromozomii unei perechi plasma celulei (vezi Fig.2-l). Cromozomul mitocondrial,
(denumi{i cromozomi omologi sau omologi) conlin ce va fi descris mai jos in acest capitol, prezintd, un numir
informalie genetici echivalenti intre ei; astfel cI, ei au carac- de particularitdli care-l deosebesc de restul genomului
teristic aceleagi gene in aceeaqi ordine. Totugi, la nivelul unui uman.
somaticl
^{
\ '.\r.. r
Iuj,t
\")'.--l''
; )t
i\r
. t., " r-Gl*
Cromozomi
mitocondriali
Cromozomi nucleari ;*r{ - r,
I '*\'lrn
rF.A
drl J
o
ooo I
/o ---"^'----
/
/
mmmm- T*TTATG
.,,{:TAG CAATT{:TTATAATC GTACG {:TAG
G AAACTGTG AATAGG *TTATAAIAG
G]'CTTAGCCATT*GAAII G"IAilGCTAG{,...
G AG
Purine Pirimidine
NHz o
I il
NZ"\a--\t *,r/c\.,'ctt.
I ll )cH lil
o7"\*/t'
"\^,,2.-*'
', I
I
H H o
r
AdeninS (A) Timin5 (T)
-o-Pil _O - Bazd
I
o - lz"\^
CH,
lr.3_3Zl
o NHz tl I
il OHH
l\,*
I
,*-zc\a--\a N
Fosfat Dezoxiribozd
I ll )c* I il
n,r.rtc\^,./"-*/
't\l o"\*/t'
I
H
H
FiEUfa 2-2 Cele 4baze azotate ale ADN gi structura generali, a unui nucleotid ADN. Fiecare dintre cele
4 baze se leagd cu dezoxiriboza (prin leglturi de hidrogen indicate prin culoarea tnagenta) 9i cu un grup
fosfat pentru a forma nucleotidul corespunzitor.
GENELE DIN GENOMUL UMAN Degi catalogul definitiv a1 genelor umane rimine un obiectiv
dificil de reaiizat,se recunosc doui tipuri generale de gene, acelea
Ce este gena? Cdte gene avem? Aceste intrebiri au ri'spunsuri al ci'ror produs de sintezi este o proteini ;i acelea al clror produs
mult mai dificil de gisit dec6t pare. este un ARN func{ional.
Termenul gend, introdus pentru prima datl in 1908, a fost . Numirul de gene codificatoare de proteine - recunoscut
utilizat in multe contexte diferite de la prima descriere a carac- ca o caracteriStici a genomului va fi pre-zentat in Capitolul
teristicilor esenlia1e ale ,,unitililor ereditare" fhcutd de Mendel 3 - este estimat lntre 20.000 qi 25.000. In aceasti carte, se
cu peste 150 de ani in urmi. Pentru medici (qi, de asemenea, foloses,te un numir aproximativ de 20.000 de gene, dar
pentru Mendel gi alli geneticieni din vremea sa), o geni poate fi cititorul ar trebui si gtie ci aceastd cifri este imprecisi Ei
definiti prin efectul vizibil asupra unui organism qi funclia de posibil subdstimati.
transmitere in succesiunea generaliilor determinatd statistic. . in plus, de cAteva decenii se s,tia clar cd produsul final al
Perltru medicii geneticieni, o geni este recunoscut[ clinic in unor gene nu este o proteini ci un ARN transcris folosind
contextul unei variante observabile care determini o tulburare ca matrild secvenla ADN. Existi numeroase tipuri diferite
clinicl distincti. in prezent sunt recunoscute aproximativ 5.000 de astfel de gene ARN (denumite, de obicei, gene neco-
de tulburiri de acest tip (vezi Capitolul 7). dificatoare pentru a le deosebi de genele codificatoare de
Proiectul Genomul Uman oferi o bazi mult mai sistematicl proteine) Ei, in prezent, se estimeazd ci mai existi incd cel
pentru descrierea genelor umane, suslinuti mai degrabi pe pu[in alte 20.000-25.000 de gene ARN necodificatoare in
analiza secventei ADN decAt pe criteriul clinic gi studii familiale; genomul uman.
Je fapt, acesta a fost unul dintre motivele pentru care a fost iniliat Prin urmare - in functie de ceea ce inlelege fiecare prin
:roiectul la sfArqitul anilor '80. Cu toate acestea, deqi secven(ierea aceastd noliune - numirul de gene din genomul uman este
:ra completi in 2003, era evident ci abilitatea noastri de a estimat lntre 20.000 Ei 50.000 de gene. Totugi, cititorul va aprecia
:e.unoaEte caracteristicile unei secven{e care sugereazi existenla ci acesti cifri se poate schimba, in funclie de evolulia defini$iloa
.au identitatea unei gene era limitatd. Interpretarea secvenlei posibilitilile tehnologice qi precizia analitici, progresul infor-
:enomice umane qi coreialia varialiei ei cu biologia umani, atAt matic Ei medicina digitali, precum qi adnotarea mai completl a
:1 starea de sinetate cat gi cea de boala, este o provocare constante genomului.
.:. cercetdrii biomedicale.
A B
capdtul 5' O-
I
-O-P:O
I
o
I Bazal
"'!2o:-l
Ylu
H\r
ttY
(H
a'-a-
rt I
OH
I
-O- P =O
I
o
I Baza?
FigUta 2-3 Structura moleculei ADN. A, O regiune a secvenlei nucleotidice a unei catene ADN in care
se observl leglturile fosfodiester 3'-5' asigurAnd continuitatea nucleotidelor invecinate. B, Modelul dublei
eiice ADN conform propunerii lui Watson gi Crick. ,,Treptele" orizontale reprezintl 1eglturile dintre bazele
azotate pereche. Se crede ci elicea este risuciti spre dreapta deoarece catena care merge de jos-stinga in
sus-dreapta infigoari catena opusi. Secliunea detaliatl a figurii ilustreaziL cele doui catene complementare
ADN, arltAnd perechile de baze AT gi GC. Reiine(i ci orientarea celor doui catene este antiparaleli. Vezi
Surse ;i mul(umiri.
citozina (C). Nucleotidele, fiecare dintre ele fiind compusi catenei complementare, iar G cu C. Natura specifici a
din bazd azotatl, grup fosfat gi pentozi, polimerizeazd in informaliei genetice codificatd in genomul uman corespunde
catene lungi polinucleotidice prin legituri 5'-3' fosfodiester secvenlei debaze azotate C, A, G si T prezente in cele doui
formate intre dezoxiribozele adiacente (Fig. 2-3A). in catene ale dublului helix dispuse in fiecare dintre cromo-
genomul uman, aceste lanluri polinucleotidice existl sub zomi, atefi in nucleu cAt gi ln mitocondrie (vezi Fig. 2-l).
forma dublului helix (Fig.2-38) avind lungimi mari de sute AvAnd in vedere complementaritatea celor doud catene
de milioane de nucleotide caincazul celui mai mare cromo- ADN, cunoasterea secvenlei de baze nucleotidice a unei
zom uman. catene permite automatic determinarea secvenlei de baze
Structura anatomici a ADN poarti informalia genetici nucleotidice a catenei pereche. Structura dublu-catenari a
inscrisi chimic, ceea ce permite transmiterea fidell a moleculei ADN ii permite si se replice fidel prin separarea
informaliei genetice de Ia celula mamd la celulele fiice gi de celor doul catene, urmate de sinteza noilor catene comple-
la o generalie la alta. in acelagi timp, structura primari a mentare in concordan![ cu secven]a originali a catenelor
ADN specifici secvenla de aminoacizi din lanlurile polipep- matrild (Fig.2-a). De asemenea, ori de cdte ori este necesar,
tidice ale proteinelor, aEa cum se va descrie in capitolul complementaritatea bazelor permite o reparare eficientd qi
urmitor. ADN prezinti caracteristici adecvate funcliilor corecti a moleculei ADN cu erori de replicare.
sale. Modelul structurii originale a ADN, elucidat de fames
Watson gi Francis Crick in 1953, aratd similar unei duble
Slructura crornozomilor umani
elice (vezi Fig.2-3B). Structura elicoidali este asemlnltoare
unei sciri in spirali. r[sucite spre dreapta in care cele doui Structura genelor din genomul uman, precum gi factorii
catene polinucleotidice orientate in direclii opuse sunt legate determinanli ai expresiei genice sunt specificali in ADN-ul
intre ele prin pun{i de hidrogen intre perechile de baze celor 46 de cromozomi umani din nucleul celulei somatice
azotate complementare: T unei catene se imperecheazi cu A plus ADN-uI cromozomului mitocondrial . Fiecare
CAPITOLUL 2 GENOMUL UMAN _ NOTIUNI INTRODUCTIVE
-
cromozom uman este alcdtuit dintr-o singurd moleculd ADN in cromatini, in care ADN-ul genomic se asociazi cu prote-
dublu catenard, continud; fieclrui cromozom ii corespunde ine specializate din clase diferite. ExceptAnd perioada divizi-
o moleculi dublu-catenari, lung6, astfel ci genomul nuclear unii celulare, cromatina este distribuiti in tot spaliul nuclear
are 46 molecule ADN liniare totalizAnd peste 6 miliarde de prezentAnd un aspect relativ omogen la microscop' Atunci
perechi de nucleotide (vezi Fig. 2-1). cand celula se divide, genomul siu condensat este vizibil
Cromozomii nu sunt formali numai din ADN-ul dublu microscopic sub forma cromozomilor. Prin urmare' cromo-
catenar. in interiorul fiecirei celule, genomul este organizat zomii sunt vizibili ca structuri distincte doar in timpul
diviziunii celulare, dar iEi pdstreaz| integritatea qi intre
diviziunile celulare.
in cromatini, molecula ADN cromozomial[ se asociazi
cu o familie de proteine cromozomiale numite histone' Acest
complex interaclioneazi cu un grup heterogen de proteine
nonhistonice, proteine implicate in stabilirea unei structuri
spaliale qi funclionale adecvate care sA asigure comporta-
mentul normal al cromozomilor qi expresia corespunzetoare
a genelot.
Se cunosc cinci clase majore de histone care joace un rol
fundamental in impachetarea (compactarea) cromatinei'
Existi cAte doud copii ale fiecirei histone H2A, H2B, H3 9i
H4 dispuse in miezul nucleozomului formind octamerul
histonic in jurul ciruia se inflgoar[ un segment de ADN
dublu-catenar similar unui fir pe o bobini (Fig. 2-5)' ADN-ul
asociat octamerului histonic are circa 140 de perechi de baze
(pb) Ci formeazd doui ture in jurul acestuia. Dupd un scurt
(intre ZO qi 60 pb) segment ADN ,,spacer" se formeazi
urm[torul complex ADN-octamer histonic qi, in continuare,
se adaugi succesiv noi complexe ADN-octamer histonic
conferind cromatinei un aspect asemenetor unui girag de
mirgele pe o a!i. Fiecare complex ADN-octamer histonic
este numit nucleozom (vezi Fig. 2-5) 9i reprezint[ unitatea
FigUra 2-4 Replicarea dublului helix ADN are ca rezultat formarea
structurali de bazi a cromatinei. Fiecare dintre cei 46 de
ceior doui molecule fiice, fiecare fiind formatl dintr-o cateni veche qi
ilna nou sintetizatl. cromozomi umani conline intre clteva sute de mii qi mai mult
Fiecare buclS
conline
Celula in interfaza
timpurie -100-200 kb
ADN
-140 pb
ADN
Regiune a
cromozomului Octamer
interfazic histonic
de un milion de nucleozomi. Cea de a cincea histoni, Hl, se comparativ cu lungimea celui mai mic cromozom nuclear)
fixeazb. la ADN-ul
,,spacer" gi ADN-ul nucleozomului gi conline doar 37 de gene. Degi produqii acestor gene sunt
formind legltura internucleozomali care conecteaze doi activi in mitocondrie, majoritatea proteinelor din mitocon-
nucleozomi succesivi. Cantitatea de ADN asociat miezului drie sunt, in realitate, produqi ai genelor nucleare. S-au
nucleozomic impreuni cu ADN-ul ,,spacer" conline aproxi- descris mutalii mitocondriale in afecliuni transmise exclusiv
mativ 200 pb. Pe lAngi principalele tipuri de histone mai pe linie materni dar gi in cazul unor tulburlri spora-
existi gi un numir de histone specializate care pot inlocui dice (Cazul33) (vezi Capitolele 7 qi l2).
histonele H3 sau H2A conferind ADN-ului genomic carac-
teristici specifice in regiunile cromozomiale respective. De
asemenea, histonele pot suferi modificlri chimice producAnd Secvenla genomului uman
schimbarea proprietililor nucleozomilor care Ie conlin. AEa Plecind de la cunoqtinlele generale despre structura gi semni-
cum se va prezenta mai detaliat in Capitolul 3, modelul tipu- ficalia clinici a cromozomilor si genelor pe care le poarti,
rilor principale de histone specializate qi modificirile lor oamenii de stiin!5. qi-au concentrat atenlia asupra identificirii
poate varia de la o celuli la alta considerAndu-se a fi gi localizirii unor gene specifice din genomul uman. Din
rispunzitor de impachetarea ADN qi conformalia accesibili acest efort comun a fost ini{iat Proiectul Genomul Uman
moleculelor reglatoare care determinl expresia genici sau care a reunit sute de laboratoare din intreaga lume intr-un
alte funclii genomice. consortiu interna{ional pentru a determina secventa
Pe parcursul ciclului celular, dupi cum se va detalia mai completi a celor 3 x 10e pL 1:.eOo milioane de pb ale unui
jos in acest capitol, cromozogrii trec prin faze succesive de set haploid de cromozomi) din ADN nuclear distribuiti in
condensare qi decondensare. Totugi, chiar gi atunci cAnd cele 24 tipuri diferite de cromozomi umani (22 de autozomi,
cromozomii sunt mai lacgi, decondensali, in interfaza ciclu- plus cromozomii X qi Y).
lui celular, ADN-ul impachetat in cromatini este mai com- Timp de un deceniu gi jumitate, suslinute de progresele
pactat decAt ar fi in forma sa nativi de dubln elice, neasociat majore ale tehnologiei de secvenfiere a ADN, marile centre
cu proteine. Mai mult, filamentele lungi cu nucleozomi sunt de secven{iere au colaborat pentru stabilirea ordinii liniare a
ele insele condensate intr-o structuri elicali secundari., nucleotidelor ADN ale fiecirui cromozom prin secvenlierea
fibra de cromatini, rezultati prin intiqurarea filamentelor unor segmente mici asamblate, ulterior, in secvente con-
in jurul unui ,,solenoid" (din grecescul solenoeides, tlub in tinue. in anul 2003, la finalizarea Proiectului Genomul
formd de cilindru) gi considerati unitatea fundamentali de Uman, s-a publicat o secventi consens de,,referin16" oblinuti
organizare a cromatinei (vezi Fig. 2-5). La rAndul lor, sole- prin secven{ierea unor genomuri provenite de la mai multe
noizii se pliazl in bucle gi domenii ataqate la intervale de persoane diferite gi utilizatd cabazS, in analize comparative
aproximativ 100.000 pb (echivalentul a 100 kilobaze [kb], cu secven{ele genomurilor individuale. Aceasti secven(i de
deoarece 1 kb = 1.000 pb) unui schelet proteic (matrice), referinli se glseqte ln bazele de date accesibile public pentru
nonhistonic, din interiorul nucleului. S-a presupus ci. a facilita aplicarea in practica medicali a descoperirilor
aceste bucle sunt unitili funcfionale ale genomului, iar gtiinlifice. Secvenla genomici este prezentati, de reguli, in
punctele de atagare la schelet ale fiecirei bucle sunt specifice direclia 5'-3' doar pe una dintre cele doui catene ADN
de-a lungul ADN-ului cromozomial. Dupi cum se va pentru ci secven{a catenei complementare 3'-5' poate fi
observa in continuare, unul dintre nivelurile de control al dedusd pebaza structurii complementare a moleculei ADN
expresiei genice depinde de modul cum ADN-ul qi genele descrisl mai sus (Fig.2-6).
se condenseazd,in cromozomi gi de interac[iunile acestora
cu proteinele cromatinei in procesul de organizare a ADN
in celuli.. Organizarea genomului uman
Imensa cantitate de ADN poate fi observati dupi prelu- Cromozomii nu sunt doar o coleclie aleatorie de gene dife-
crarea cromozomilor cu scopul de a separa ADN--iil de rite qi alte secvenle ADN. Regiuni genomice cu caracteristici
scheletul proteic (vezi Fig. 2-1). Prin eliberarea ADN-ului similare tind si se grupeze, rar organizarea func{ionali a
in acest mod, pot fiviutalizate atAt bucle lungi de ADN cit genomului reflecti secvenla gi structura sa. Unele regiuni
gi scheletul proteic cu forma identici a unui cromozom cromozomiale sau chiar cromozomi intregi au o densitate
tipic. genici mare (regiuni ,,urbane"), in timp ce altele au o densi-
tate genici sclzuti (regiuni ,,degertice") (Fig. 2-7). Conse-
Cromozomul mitocondrial cinlele clinice ale anomaliilor structurale genomice reflecti
DupI cum s-a amintit deja, un grup mic, dar important de natura specifici a genelor gi secventelor implicate. prin
gene ale genomului uman se gS.sesc in mitocondriile cito- urmare, anomaliile cromozomilor sau regiunilor cromozo-
plasmei (vezi Fig. 2-1), Genele mitocondriale se transmit miale cu densitate genici mare tind si produci efecte clinice
exclusiv pe linie maternd (vezi Capitolul 7). Celulele umane mult mai severe decAt defectele unor regiuni genomice simi-
au sute sau mii de mitocondrii, fiecare avind mai multe copii lare ca mi"rime, dar cu densitate genici mic[.
ale unei molecule mici, circulare reprezentat5 de cromozo- Ca urmare a cunogtinlelor furnizate de Proiectul Genomul
mul mitocondrial. ADN-ul mitocondrial are o lungime de Uman, rezultl clar ci organizarca ADN in genomul uman
numai 16 kb (reprezenti.nd un segment minuscul este mult mai variati gi complexd decAt se credea anterior.
CAPITOLUL 2 GENOMUL UMAN _ NOTIUNI INTRODUCTIVE
-
rs€cventar :l
de'referifrtd .
.,; G G AT'TT C TAG GTAACI'CAGT c G4..,
rndividurl GGATTTCTAGGTAACTCAGTCGA',.
.,,
2
INdiVidUI ,,, GG ATTTCEAGGTAACTCAGTCGA,,.
rndividur3,,. GG ATTTCgAGGTAACTCAGTCGA,.,
rndividur 4 ,.. GG ATTTCTAGGTAACTCAGTEIGA..'
rndividur5 ..,GGATIECTAGGTAACTCAGTCGA.,,
FigUfa 2-6 Un segment din secvenfa de referinti a genomului uman. Prin conven{ie, sunt Prezentate
numai secven[ele unei catene de ADN, deoarece secvenla catenei complementare poate fi dedusi pebaza
structurii dublu catenare a ADN-ului (prezentate mai sus secventa de referinli). Secvenla ADN a unui
grup de indivizi este similari, dar nu identici cu cea de referinfi qi se observl schimbarea unui singur
nucleotid la unii indivizi gi o mici delelie a doul baze la al[i.
0 50 100
Merirnee
FigUfa 2-7 Mirimea gi conlinutul de gene al celor 24 de cromozomi umani. Linia diagonald punctatd
corespunde densitl1ii medii a genelor din genom, aproximativ 6,7 gene codificatoare de proteine per
megabazS (Mb). Cromozomii relativ bogali in gene sunt deasupra diagonalei gi au tendinla de a fi localizali
in partea stAngi, superior. Cromozomii relativ siraci in gene sunt sub diagonali qi au tendinla de a 6
Localiza{i in partea dreapti, inferior. Yezi Surse ;i mulfumiri.
IO THOMPSON & THOMPSON GENETICA MEDICALA
Din miile de milioane pb ADN ale oricdrui genom, mai Diferitele tipuri de repetilii in tandem sunt numite generic
pulin de 1,5% din genom codificd, de fapt, proteine. Se ADN satelit deoarece multe dintre familiile de repetifii in
credea c[ elementele de reglare care influenleazi sau tandem au putut fi separate cabenzi (,,sateli1i") distincte fald
determini modele de expresie genici in timpul dezvoltd'rii de restul ADN genomic prin centrifugare.
sau lesuturi ar reprezenta lnci aproximativ 5o/o din secvenla Familiile ADN cu secvente repetate in tandem yariazd
genomicd: dar, recent, studiile asupra caracteristicilor croma- in func(ie de localizarea lor in genom gi caracteristicile
tinei sugereazd c5: o cantitate mult mai mare din genom poate secvenlelor din care sunt formate. in general, astfel de
furniza semnale relevante pentru funcfiile genomice. Aproxi- blocuri de secvenle repetate in tandem ating dimensiuni
mativ jumitate din lungimea totali a secvenlei liniare mari de peste cdteva milioane de pb gi reprezintd un procent
genomice constl din asa-numita copie-simpli sau ADN cu semnificativ din cantitatea ADN a unui cromozom uman.
secven{e unice per genom, adici ADN a clrui ordine liniari Unele secvenle repetate in tandem sunt utilizate pentru
de nucleotide specifice este reprezentati doar o singuri datir analiza citogeneticl in clinici (vezi Capitolul 5). Blocurile
(sau cel mult un numir mic de copii) in genom. Aceastl lungi de secvenle repetate formate din repeti{ii (cu unele
observalie poate pirea surprinzitoare avAnd in vedere cI variafii) ale unei secvente scurte, cum ar fi un pentanucleo-
existi doar patru tipuri diferite de nucleotide in ADN. Dar tid, se glsesc in regiunile genetic inerte ale cromozomilor
daci luim in considerare chiar gi un segment genomic mic 1, 9 gi 16 gi reprezinti mai mult de jumitate din cromozo-
cu o lungime de numai 10 baze combinAnd cele patru tipuri mul Y (vezi Capitolul 6). Alte familii de secvenle repetate
de nucleotide se oblin peste un milion de secvenle de nucleo- in tandem au repetilii ale unei secvente ceva mai lungi. De
tide posibile. $i, deqi ordinea bazelor in genom nu este exemplu, ADN-ul alfa-satelit conline secvente (unitnli) de
complet aleatorie, orice secventi particulari de 16 nucleo- 171 pb repetate in tandem gi se afli localizat in regiunea
tide se estimeaz[ ci existi doar o singurl data in oricare centromerici a fieclrui cromozom fiind esential pentru
genom analizat. ataqarea cromozomilor de microtubulii fusului de diviziune
Restul genomului este format din mai multe clase de in timpul diviziunii celulare.
ADN repetitiv gi include ADN ale cirui secvente sunt Pe ling[ ADN cu secvente repetate in tandem, in
repetate de sute sau milioane de ori in genom, repetiliile genom mai existi o alti clasl importanti de ADN repeti-
fiind identice sau cu mici variafii. Degi majoritatea (dar nu tiv formatl din secvenle aseminitoare, dar dispersate ln
toate) celor 20.000 de gene din genom codifici proteine (vezi intregul genom gi nicidecum grupate intr-una sau mai
Cadranul prezentat anterior in acest capitol), ele fi.ind multe regiuni cromozomiale. Degi aceastl descriere
reprezentate de ADN nerepetitig cu secvenle unice, secven- generali se potrivegte mai multor familii de ADN, existi,
lele din clasele de ADN repetitiv contribuie la mentinerea in special, doui dintre acestea care meritl o atenlie
structurii cromozomului qi sunt o sursi importanti de deosebiti pentru ci, impreunl, reprezintd o parte
varialie geneticl intre indivizi; unele din aceste varialii pot semnificativl din genom gi au fost implicate in boli gene-
predispune Ia procese patologice in cadrul genomului, dupi tice. Printre elementele repetitive dispersate cel mai bine
cum se va prezenla in Capitolele 5 gi 6. studiate se numlri aga-numita familie AIa. Membrii
acestei familii au repetitii de secvenle cu o lungime de 300
Secvenfele ADN unice per genom pb fiecare gi, deqi asemin5:toare, nu sunt identice. in total,
Chiar dacl ADN cu secvenle unice reprezinti cel pufin existi in genom peste un milion de copii reprezentAnd cel
jumltate din genom, multe dintre fun4iile sale sunt necu- pulin 10% din ADN-ul uman. A doua familie de ADN cu
noscute pentru ci, aga cum s-a mentionat anterior, secvenlele repetilii dispersate este numiti LINE (prescurtatea din tb.
care codificl efectiv proteinele (regiunea codificatoare a englezd - Long Interspersed Nuclear Element) sau familia
genel) reprezinti doar o mici parte din intregul ADN cu cu elemente nucleare intercalate lungi (numitl, uneori,
secvente unice. Cea mai mare parte a secventelor ADN unice L1). LINEs au o lungime de pAni la 6 kb gi in genom se
au dimensiuni reduse (citeva Kb sau mai putin) gi sunt inter- gisesc circa 850.000 de copii reprezentAnd aproximativ
calate printre secvenlele variatelor tipuri de ADN repetitiv. 20o/o din ADN-u1 uman. Ambele familii au copii nume-
Organizarea genelor cu secvenle ADN unice este explicati roase in anumite zone ale genomului, iar ln altele sunt
ln Capitolul3. foarte rare. Regiunile cu conlinut bogat in GC tind sI aibi
o abundenli de elemente Alu fiind sirace in LINEs, iar
Secvenfele ADN repetate multe dintre regiunile bogate in AT, din contrd, tind si
Se cunosc mai multe clase de ADN cu secvente repetate. aibi a abundenli de LINEs 9i elemente rare Alu.
Pentru a determina tipul de secvenle repetate (,,repeti{ii")
este util si se eyidenlieze dacd secvenlele repetate sunt ADN-ul repetitiv 9i bolile genetice. AtAt secvenlele ALz
grupate intr-una sau citeva regiuni cromozomiale sau sunt cdt gi LINEs sunt considerate drept cats,zd. a mutaliilor
dispersate, intercalate printre secvenlele unice de-a lungul implicate in boli ereditare. Cel pulin cAteva copii ale fami-
cromozomului. Se estimeazi ci secvenlele repetate grupat, liilor LINE gi Alu produc copii ale propriilor secvente care,
in bloc, reprezinte l0-l5o/o din intregul genom gi se ulteriot se pot integra oriunde in genom si inactiva prin
organizeazd. in tandem prin aranjare una dupd alta, cap- inserfie, ocazional, o geni cu semnificalie medicall.
coad5", a secvenlelor scurte cu numir variabil de nucleotide. Frecvenla unor astfel de evenimente care determini boli