Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
www.automation.ro/canscreen 2
Obiectivele proiectului
Canscreen
Obiectivul general - elaborarea unor strategii optime de screening pentru cancerul de col
uterin şi de sân, pe termen lung pentru Romania şi implicit reducerea incidenţei şi mortalităţii
prin cancer, precum şi creşterea calităţii vieţii bolnavilor.
www.automation.ro/canscreen 3
Etapele proiectului
Canscreen
www.automation.ro/canscreen 4
Funcţiile sistemului
Canscreen
Funcţiile sistemului informatic Canscreen constau în:
gestiunea lotului populaţional
gestiunea unităţilor medicale şi a personalului medical implicat in screening
producerea scrisorilor de invitaţie şi a documentelor de decontare pentru procesele de invitare la
screening
gestiunea programărilor la centrele de recoltare tratată în conjuncţie cu disponibilăţile
centrelelor de interpretare a rezultatelor
înregistrarea datelor din formularele de screening
înregistrarea componentelor imagistice rezultate din procesul de screening
îmbunătăţirea calităţii imaginilor şi eliminarea automată a fişierelor imagine care nu au calităţile
necesare interpretării
generarea de rapoarte pe persoană testată asupra istoricului evoluţiei acesteia in procesul de
screening
replanificarea automată a persoanelor implicate în procesul de screening funcţie de rezultatul
citologic / mamografic al testului
urmărirea persoanelor incluse în screening dacă se ajunge la testare HPV sau colposcopie în
scopul păstrării posibilităţii reintegrării lor în screening dacă starea lor evoluează în această
direcţie
prezentarea unor statistici anuale pe baza datelor individuale ale persoanelor incluse în
screening
exportul datelor către alte aplicaţii
www.automation.ro/canscreen 5
Protocoale medicale de screening
Canscreen
Protocoalele medicale de screening (col uterin şi sân) constituie documente
care furnizează cerinţele minime şi optime de asigurare a calităţii în
programele organizate de screening şi prin aceasta impun structura bazei
de date.
Protocoalele medicale stau la baza definirii specificaţiilor tehnice ale
sistemului:
stabilirea surselor de date medicale externe care trebuie importate în sistem
stabilirea datelor medicale gestionate de sistem
analiza posibilităţilor de cuantificare şi codificare a datelor
proiectarea configuraţiei hardware
stabilirea fuxului de date din punct de vedere informaţional
stabilirea cerinţelor necesare studiului şi elaborării algoritmilor de cost-eficienţă
www.automation.ro/canscreen 6
Colectarea datelor programelor de screening
Canscreen
Paşii necesari colectării datelor:
luarea probelor (frotiuri, mamografii)
procesarea probelor şi obţinerea imaginilor
interpretarea probelor/imaginilor
depozitarea
www.automation.ro/canscreen 7
Arhitectura sistemului
Canscreen
Arhitectura hardware este de tip – n-tier cu următoarele nivele:
nivelul de prezentare
www.automation.ro/canscreen 8
Arhitectura sistemului
Canscreen
Arhitectura software conţine umătoarele module:
modul de proiectare al interfeţelor cu utilizatorul la nivelul centrelor medicale implicate în
programul de screening pentru cancerul de col uterin şi cancerul de sân (MPI)
modulul de reprezentare şi cuantificare a datelor medicale necesare sistemului cu
eficacitate sigură de control al diagnosticului (MRCD)
modulul de achiziţie a imaginilor (frotiuri şi mamografii) medicale (MAI)
modulul de generare şi exploatare a bazei de date “CanScreen” care ulterior va da
posibilitatea corectării sau îmbunătăţirii protocolalelor medicale de screening, respectiv
raportare. O altă funcţie implementată la nivelul modulului descris este aceea de
management al tratamentului la care sunt supuse pacientele a căror investigaţii indică
necesitatea acestuia.(MGEBD)
modulul de filtrare a imaginilor urmăreşte optimizarea procedeului de interpretare a
frotiurilor citovaginali şi a mamografiilor prin elaborarea unor algoritmi de recunoaştere
pentru extragerea caracteristicilor cuantificabile (MFI)
modulul de calitate al sistemului selectează aleator un procent din imaginile analizate care
vor fi recitite şi transmise la un expert citolog (MAC)
modulul de analiză economică decide strategia de screening în funcţie de raportul cost-
eficienţă, folosindu-se modelul Markov aplicat datelor din baza de date (MAE)
www.automation.ro/canscreen 9
Arhitectura sistemului
Canscreen
Înlănţuirea modulelor software ale aplicaţiei:
www.automation.ro/canscreen 10
Baza de date a sistemului
Canscreen
Baza de date “Canscreen” cuprinde următoarele colecţii de date:
informaţii clinice – componenta cu grad maxim de relaţionalizare (high-order) – codifică
datele medicale implicate în procesul de screening conform protocoalelor de screening
depozitul de imagini - componenta cu grad minim de relaţionalizare (low-order) – baza de
date cuprinde doar adresele imaginilor, imaginile fiind stocate pe un server de fişere
Baza de date este realizată sub Erwin şi Microsoft SQL Server 2005.
www.automation.ro/canscreen 11
Baza de date a sistemului
Canscreen
Modelul relaţional global al entităţilor
www.automation.ro/canscreen 12
Realizat sub Microsoft Visual Studio 2005
Gestionează baza de date şi
Canscreen
www.automation.ro/canscreen 13
Interpretarea imaginilor citologice
Canscreen
Algoritmi pentru interpretarea imaginilor citologice:
algoritmul de segmentarea automată a celulelor prezente în cadrul imaginilor citologice (metoda lui Otsu)
segmentarea automată a celulelor prezente în cadrul imaginilor citologice prin intermediul algoritmilor de
clustering (grupare) (algoritmul de clustering Moving k means)
post-procesarea imaginii segmentate prin intermediul algoritmului de clustering (algoritmului Modified
Seed Based Region Growing)
segmentarea automată a celulelor prezente în cadrul imaginilor citologice prin intermediul algoritmilor de
clustering şi a tehnicilor de segmentare cu prag
www.automation.ro/canscreen 14
Interpretarea imaginilor mamografice
Canscreen
Algoritmi pentru interpretarea imaginilor mamografice:
algoritmul de segmentare multi-scală şi îmbunătăţire a imaginii mamografice
algoritmul de detecţie a microcalcifierilor din cadrul imaginii mamografice pe baza minimizării
entropiei încrucişate
algoritmul de detecţie a microcalcifierilor din cadrul imaginii mamografice pe baza matricii de co-
apariţie bidimensională
algoritmul de detecţie a microcalcifierilor din cadrul imaginii mamografice pe baza maximizării
entropiei condiţionale
www.automation.ro/canscreen 15
Modelul Markov
Canscreen
Baza de date “Canscreen” este folosită pentru Stare Tranzacţii posibile
o evaluare economică a intervenţiilor W W, L, H, D, A
medicale din programele de screening
asigurând eficienţa calităţii acestora. L W, L, H, D, A
Analiza deciziilor medicale se face folosind H W, L, H, UC1, D, A
modelul Markov:
UC1 UC1, C1, UC2, D, A
permite modelarea avansării bolilor
cronice (cancerul de col uterin şi de sân) UC2 UC2, C2, UC3, D, A
face predicţia schimbărilor apărute UC3 UC3, C3, UC4, D, A
datorită modului de tratare a cancerului de
col uterin şi de sân UC4 UC4, C4, UC2, D, A
D1 D1, D2, S, DC, D, A
Stările modelului Markov sunt cunoscute sub
denumirea de stări absorbante (vârsta D2 D2, D3, S, DC, D, A
persoanelor care participă la screening).
D3 D3, D4, S, DC, D, A
Tranzacţiile care au loc între stările modelului D4 D4, S, DC, D, A
Markov pot fi date de o matrice a tranzacţiilor.
S S, D, A
Matricea tranzacţiilor unui model Markov cu
15 stări pentru screeningul cancerului de col DC Stare absorbantă
uterin D Stare absorbantă
A Stare absorbantă
www.automation.ro/canscreen 16
Rezultate preconizate
Canscreen
De natură cuantificabilă direct:
realizarea modelului unui sistem cu eficacitate sigură de control al diagnosticului în
programul de screening
realizarea unei baze de date şi de imagini care va conţine informaţii privind identificarea
femeilor testate, parametrii medicali, precum şi registre cu femeile la risc crescut
realizarea unui studiu de analiză economică de tip cost-eficienţă pentru deciderea
strategiei de screening
impact asupra forţei de muncă, specializarea în domeniul informatic a personalului
medical-cca. 10 persoane
De natură cuantificabilă indirect:
creşterea şansei de viaţă a pacientelor, prin elaborarea unor algoritmi de diagnostic
individualizat şi a unui prognostic cu indicaţii terapeutice consecutive
creşterea capacităţii manageriale a conducătorului de proiect în realizarea proiectelor
interdisciplinare
www.automation.ro/canscreen 17
Potenţiali beneficiari
Canscreen
Unităţile oncologice din reţeaua de sănătate publică
Proiectul poate fi extins, ca reţea la nivelul zonelor rurale, izolate din punct de
vedere geografic sau în cabinetele medicilor de familie şi în centrele de sănătate,
eficientizând sistemul de sănătate publică şi introducând sistemul sanitar românesc
pe coordonatele europene.
Prin realizarea proiectului se preconizează obţinerea următoarelor beneficii:
accesul populaţiei feminine cu risc crescut pentru cancer de col uterin şi mamar la
monitorizarea situaţiei conform standardelor Comunităţii Europene
accesul populaţiei feminine la screening organizat pentru depistarea precoce a cancerului
de col uterin după o strategie optimă
crearea unui sistem complex în vederea controlului calităţii diagnosticului în programul
de screening al cancerului
realizarea unui studiu de analiză economică de tip cost-eficienţă pentru a se decide
strategia de screening
www.automation.ro/canscreen 18
Diseminarea proiectului
Canscreen
Lucrări prezentate la manifestări ştiinţifice şi conferinţe naţionale şi internaţionale:
The Role of Cancer Registries in Suveillance and Cancer Care, Improvement of Data Quality in
Institutional Cancer Registry by Data Linkage, Luciana Neamţiu, Daniela Coza, Florian Nicula, Ofelia
Suteu, pp. 129, Poster, octombrie 2006, Amsterdam (Olanda)
XII-th International Conference on Applied Stochastic Models and Data Analysis (ASMDA), Stochastic
Fractal Interpolation Function and its Applications to Fractal Analysis of Normal and Pathological
Body Temperature Graphs by Children, Anna Soos, mai – iunie 2007, Chania, Creta (Grecia)
Meditech 2007, Data Management System for Cervical Cancer Screening – CanScreen, Teodora
Sanislav, Ioan Stoian, Dorina Căpăţînă, Mihaela L. Drăgan, Luciana Neamţiu, Florian Nicula, Ofelia
Şuteu, Liana Lupşa, septembrie 2007, Cluj-Napoca (România)
ENUMATH 2007, Multiple Dynamic Programming Applied in Cervical Screening, Luciana Neamţiu,
Ioana Chiorean, Final Program and Abstracts, septembrie 2007, Graz (Austria)
ENUMATH 2007, Special Efficient Solutions for Multicriterial Transport Problems, Liana Lupşa,
Ioana Chiorean, Dorel I. Duca, Luciana Neamţiu, Final Program and Abstracts, septembrie 2007, Graz
(Austria)
IACR 29TH ANNUAL MEETING, The Role of Cancer Control Department in Our Comprehensive
Cancer Center – Oncological Institute „Ion Chiricuţă”, Daniela Coza, Florian Nicula, Ofelia Şuteu,
Luciana Neamţiu, Ioana Rădulescu, Mihaela Sârbu, Lidia Lovasz, septembrie 2007, Ljubljana (Slovenia)
Seminarul de Ecuaţii funcţionale, Aproximare şi Convexitate, Lex-Min Assignment Problem, Luciana
Neamţiu, Radu-Lucian Lupşa, Volume 5, septembrie 2007, Cluj-Napoca (România)
Lucrările Seminarului Tiberiu Popoviciu de Ecuaţii funcţionale, Aproximare şi Convexitate, Posibilităţi
de aplicare în medicină a măsurilor de neconvexitate, Liana Lupşa, septembrie 2007, Cluj-Napoca
(România)
www.automation.ro/canscreen 19