Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
BIOSINTEZA
C3+C4+C5
C-C
C-H
legaturi
C-N
C-O
C-Het
reactii de oxido-reducere
Reactii de transformare a grupelor functionale
- reactii care au scopul de a modifica anumite grupe functionale de pe
scheletul molecular
Functiunile care apar odata cu formarea unei legaturi C-C (sau carbon-
heteroatom), in unele cazuri trebuie transformate in alte functiuni, necesare
pentru desfasurarea reactiilor ulterioare, iar in final, in grupele caracterisice
moleculei tinta.
necesitatea protejarii unor grupe, care altfel ar fi atacate de
reactantii utilizati pentru a interactiona cu alte centre din molecula.
- alcatuirea proteinelor
-
alifatici
Aminoacizi -
aromatici
COOH -
COO
HN H + H
HN
2 3
R R
aminoacid amfion 5
(ion dipolar)
Astfel, n func ie de pH, aminoacizii pot exista n soluie apoas sub trei
forme: amfioni, cationi, anioni:
R + + R - R
+ +H H3N + HO
HN CH CH H2N CH
3
- -
COOH COO COO
Cation Amfion Anion
(ion pozitiv) (ion bipolar) (ion negativ)
R" H
C N H COOH
H2 N H C
O R'
Dipeptida
H R O
-HO +
2 N C
H H OH
R" H O R
C N H C COOH
H2 N H C N H
O R' H
Tripeptida
R" O R
H
C N H C COOH
H2N H C N H
H
O R' n 9
Polipeptida
H2N O H
COOEt + N
R HC CH R R R
NH2 EtOOC - 2 EtOH N
H O
H2O
H2N CH C NH CH COOH
R O R
10
H2N CH COOH + H2N CH COOH
R1 R2
R1 O R R2 O R2
1
R O R2 R2 O R1
1
11
Pentru a reduce numarul de compusi ce se pot forma, se poate bloca
una dintre pozitii printr-o reactie de protejare:
+ H2N CH COOH
R1
H2N CH COOH H2N CH COO
R2 R2
grupare protectoare
12
H2N CH COOH H2N CH COO
R2 R2
= grupare protectoare
= grupare activatoare
R1 R2
Aminoacidul ce contine gruparea carboxil activata
H 2N CH COOH H 2N CH COO
R2 R2
= grupare protectoare
R1 R2
HN CH C HN CH COO
14
O
R1 R2
Conditiile pe care trebuie sa le indeplineasca grupele protectoare sunt:
sa fie usor de introdus (conditii blande de reactie) pentru a nu
degrada peptida in constructie
introducerea sa se faca prin reactii cantitative
sa nu prezinte carbon asimetric (se obtine racemicul, deci se pierde
jumatate din materie, ori, pentru un produs biologic activ a carui sinteza
numara foarte multe etape, scaderea randamentului va fi semnificativa)
sa fie usor de deslocuit (conditii blade si randamente cantitative)
toate reactiile sa se desfasoare in conditii neracemizante
necesitatea protejarii acestor grupe prin reactii specifice fiecareia dintre ele
Grupa protectoare:
- nu trebuie sa fie prea stabila (altfel reactivii de deprotejare ar putea ataca
R1 H2N-Peptida 16
I.1. URETANII = esteri ai acidului carbamic (derivat de acid carbonic)
HO C OH HO C NH2 R O C NH R'
O O O
acid carbonic acid carbamic uretan
R O C NH R'
O
.. +
R O C NH R' R O C NH R'
-
O O
17
I.1.1. Uretani sensibili la acizi
RO R' R O C NH R' + C NH R'
C NH R +O
: +
O: OH OH
+ - CO2
H
+ H2N R'
R :
Carbocation benzilic
+
C6H5 CH2 C6H5 CH2 O C NH R'
O
Cbz sau Z sau Cbo
(Carboxi-benzil sau N-benziloxicarbonil)
Introducere:
- reactia cu cloroformiat de benzil
C6H5-CH2-OH + Cl H2N-R'
C H
C Cl C6H5 CH2 O C Cl 6 5 CH2 O C NH R'
- HCl - HCl
O O O 18
cloroformiat de benzil
Modalitati de deprotejare:
acidoliza puternica cu HF (ori sistemul HBr/CH3COOH)
hidrogenare catalitica H2/Ni sau Pd/C sau Pd/BaSO4 in solventi
organici anhidri sau aposi (toluen, izo-propanol,)
O
Introducere: (CH3)3C O O C O C(CH3)3
- reactia cu pirocarbonatul de tert-butil C
O O
Caracter de ester
Modalitati de deprotejare: caracter de ester
acidoliza medie cu acid trifluoroacetic
Modalitati de deprotejare:
acidoliza foarte blanda cu acid trifluoroacetic
H H O R"
R' H H3C
R C CH2 + O C R"
C C O C NH R" NH
- BH
-
H H O H3C O
- -
.. BH
B .. -B
O C NH R"
OH
- CO2
22
H2N R"
CH2
H
CH2 O C NH R"
O
Fmoc (Fluoren-metil-oxi-carbonil)
Introducere:
Modalitati de deprotejare:
sub influenta unei baze slabe (piperidina)
HC CH O C NH R HC CH CH + H N R
3
S
CH 2 3
S
2 2
- CO2
(H) O (H) O
O H
- ..
sulfona
B
Modalitati de deprotejare:
cu o solutie slab bazica de hidroxid de potasiu
O
..
S NH
O 24
Introducere:
NaOH sau Et3N
H3C C6H4 SO2 Cl + H2N-R H3C C6H4 SO2 NH R
p-toluensulfoclorura - HCl
Modalitati de deprotejare:
reducere cu sodiu in amoniac lichid (pot aparea insa reactii
secundare nedorite din cauza excesului de sodiu metalic)
- CO tosilamida
25
gruparea tosil nu este foarte potrivita pentru protejarea grupei amino a unui aminoacid
I.2.2. Impiedicarea sterica - alchilarea
reactie de cuplare
R1 R1
reactie de auto-cuplare
R1 R1 R1 R1
R R
Baza Schiff
H2/Ni
sau
NaBH4
CH CH2 NH CH COOR
6 5
F3C CO NH R'
trifluor-acetil grupare amido-
H2 N CO (F3C-CO)2O
CH TFA NH CH CO
exces
R R
Modalitati de deprotejare:
reducere cu o baza (hidroxid de sodiu in solutie diluata, hidroxid de bariu
sau hidroxid de amoniu) 30
grupa formil
Introducere:
incalzirea cu acid formic anhidru la 100 C
formilare cu un amestec de acid formic anhidru si anhidrida
acetica (agentul de formilare este anhidrida mixta formil-acetica)
- CH3COOH
R
OH
O R = CHR'-COOH O
O O
N COOC2H5 H2N-R N R
NaHCO3
O O
Reacivul lui Nefkens
32
Modalitati de deprotejare:
hidrazinoliza prin refluxarea aminoacidului ori peptidei astfel protejate
cu hidrat de hidrazina intr-un solvent adecvat
O O +
H3N CH CO
H2N-NH2 N R Na2CO3
N CHR CO
NH
O O
+
O Na
N + H2N CH CO
- H2O NH
R
- CO2 O
33
II. Strategii de protejare deprotejare a grupei carboxil
Protejarea grupei carboxil se efectueaza in scopul blocarii acesteia fie temporar (mai rar), fie permanent (ceea ce este cazul in majoritatea sintezelor peptidice).
Blocarea permanenta nu inseamna blocarea definitiva: grupa carboxil va fi impiedicata sa reactioneze de-a lungul intregii sinteze peptidice, dar va fi eliberata la sfarsitul
acesteia.
+ - protejare carboxil H2N CH COO
H3N CH COO (permanent)
R1 R1
aminoacid aminoacid
forma amfionica protejat la grupa carboxil
HN CH COO A
cuplare R2
aminoacid
protejat temporar la grupa amino
activat la grupa carboxil
H2N C CO HN CH COO deprotejare HN CH CO HN CH COO
la grupa amino
R2 R1 R2 R1
34
peptida
grupa carboxilica ester
Structura esterului = f (tipul de strategie utilizat la lungirea lantului peptidic).
TFA
Boc CH CO HN CH COO R
HN
35
R1 R2
O O O
C C C +
+R
+
O R O R O
..
H H
+
H
C
Bzl-Br
O CH2 Br (NO2) Bzl-NO2
Modalitati de deprotejare:
cu hidrogen catalitic H2/Ni
amestec de acid acetic-acid bromhidric, la circa 70 C poate fi
daunator pentru catena peptidica
37
esteri ai alcoolului benzilic para-substituiti cu grupe electro
-atragatoare dar care sa prezinte si un efect electromer donor de
electroni mult mai puternic (gruparea metoxi)
O
Bzl-OCH3
C
O CH2 OCH3
Modalitati de deprotejare:
tratare cu acid trifluoracetic
38
esteri alcoolului t-butilic (t-Bu) sau trifenil-metilic (tritil - Trt)
O O
C
C
O C(CH3)3 O C(C6H5)3
R C
OH
H3C
H C C+ +
3
-H
H3C
39
Modalitati de deprotejare:
acid clorhidric in dioxan
acid bromhidric in acid acetic, la cald
tratare cu acid trifluoracetic
esterii trifenil-metilici hidrogenare catalitica
t
Protejarea cu grupele Bzl-OCH3 sau Bu/Trt, sensibile atacului acidului
trifluoracetic se utilizeaza in strategii ce implica utilizarea, pentru grupa
amino, de protectie de tip Fmoc, unde reactia de indepartare a grupei
protectoare se efectueaza in mediu bazic, cu piperidina.
40
II.2. Grupa protectoare esterica rezistenta la atacurile
bazice (deprotejare in mediu bazic)
Esterii cei mai utilizati din aceasta categorie sunt: metilic, etilic, benzilic.
Reactia de deprotejare a carboxilului esterificat este clasica hidroliza bazica a unui ester (saponificare).
O O- O
-
+ OR
C C OR C
O R O H
- OH
HO ..
-
Pentru a decide asupra naturii lui RO se va tine seama de unul din
urmatorii factori:
- impiedicarea sterica
(cu cat esterul este mai voluminos eliminarea de alcoxid va fi mai dificila
- stabilizarea alcoxidului - spre exemplu prin conjugarea sarcinii
negative cu un nucleu aromatic
-
-O O etc.
41
Reactia de deprotejare se realizeaza cu NaOH in acetona, dioxan sau metanol.
esteri metilici sau etilici
Esterificarea cu alcool metilic
reactia in cataliza acida, in exces de metanol, cu acid clorhidric gazos sau
chiar cu solutie 0,1 M de acid clorhidric
reactia in cataliza acida, cu folosirea unui exces de metanol mai redus, in
prezenta de clorura de tionil
2 - +
+ CH OH SOCl Cl
HN CH COOH [HN CH COOCH + SO 2 + HCl
2 3 3 3
R R
R
Esterificarea cu un derivat halogenat de benzil
O O
R C + CsOH R C
OH - +
O Cs
O O
R C
C + CH2
R -
- Cl O
O- Cl CH2
+
Cs
COOH
introducerea a doua grupari protectoare diferite, specifice uneia sau alteia
dintre cele doua grupe carboxil formarea de chelati cu metalele, la care participa alaturi de grupa amino si cea carboxilica
vecina
(CH2)2
H2N CH COO Bzl
COO Bzl
(CH2)2
COO Bzl HI + NBu3 H2N CH COO Bzl
(CH2)2
COOH
45
III. Strategii de protejare - deprotejare a gruparilor aflate
pe catenele laterale
Aminoacizii comuni din proteine contin o serie de grupari functionale ce
trebuiesc la randul lor protejate: gruparea hidroxil, gruparea tiol,
gruparea imidazoil, gruparea indolil, etc.
gruparea hidroxil
caracter nucleofil
(datorat perechii de electroni neparticipanti ai oxigenului) 46
III.1.1. Protejarea gruparii hidroxil prin esterificare
III.1.2. Protejarea gruparii hidroxil prin eterificare
.. H + H
+
R O CH CH COOH R O CH CH COOH HO CH CH COOH
.. 2 .. 2 + 2
-R
NH2 NH2 NH2