Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
MULTIFACTORIALA
(BOLILE COMPLEXE)
Boli multifactoriale
Fenotipul este determinat de efectul cumulativ a mai multor gene cu loci diferiți
și a factorilor de mediu; fiecare genă exercită un efect aditiv mic
●
Astm, schizofrenia, autismul, artrita reumatoidă, HTA, cardiopatia ischemică,
diabetul zaharat, colonul iritabil, boala Crohn, majoritatea tipurilor de cancer
●
Malformații congenitale: spina bifida și alte defecte de tub neural, stenoza
pilorică, malformațiile cardiace, defectul de buză și palat, displazia
congenitală de șold
●
Riscul recurențial pentru rudele de gr. I (frați, copii) al
unei persoane afectate este aproximativ rădăcina
pătrată a incidenței în populația generală
●
Dacă incidența în populația generală este 1 la 1000,
riscul pentru frați/copii este de ≈3% sau √1/1000
Studiile gemenilor
Dacă unul din gemeni este afectat, care este
probabilitatea pentru al doilea?
MZ DZ Tip de boală
90% 90% Probabil determinată de mediu
100% 25% Autosomal recesiv
●
Eritabilitatea reprezintă procentul din variația fenotipică care este
determinată de factorii genetici; oferă informații asupra importanței
factorilor genetici în apariția afecțiunii
Concordanța la gemenii monozigoți/dizigoți= ambii membri dezvoltă
sau nu caracterul H = CMZ – CDZ / 100 - CDZ
H > 0,5- rolul preponderent al factorilor genetici;
Despicătura de buză și 38 8
palat
Artrita reumatoidă 34 7
Astm 47 24
Afecțiuni coronariene 19 9
Diabet 56 11
• Ipoteză alternativă:
– Alelele ce crează predispoziție sunt noi mutații posibil în aceeași
genă ce apar în combinații diferite cu markeri polimorfici locali. În
familii diferite sunt descrise mutații diferite.
●
0-5
Bolile complexe
●
Scanarea genomului uman pentru ~ un milion de markeri genetici
și genotiparea a zeci de mii de pacienţi cu aceeaşi boală şi a unui
lot control de indivizi sănătoşi a permis identificarea regiunilor
genomice asociate semnificativ cu boala în care sunt
localizate variantele genelor de susceptibilitate la boală.
●
În ultimii ani, studiile de asociere „caz-control“ (pe baza ipotezei
„boală comună – variantă comună“) s-au realizat la nivelul
întregului genom– Genome-Wide Association Studies (GWAS)
●
GWAS si secvențierea ADN-ului au identificat anumiți loci de
susceptibilitate pentru bolile complexe dar implicarea lor in
mecanismul fiziopatogenic rămâne de stabilit.
Variații genice asociate cu bolile complexe
Prin compararea frecvenței alelelor la pacienții afectați și
neafectați (cazuri control) se pot identifica genele de susceptibilitate
și variantele alelice care oferă protecție (studii caz-control).
Studiile caz-control stabilesc corelații între variantele alelice și o
afecțiune.
ApoE4
Cazuri control
ApoE4
Pacienți cu
Alzheimer
Cases Controls
Reference Original
standard haplotype
10,000 nucleotides
Person 1 Haplotype 1
Person 2 Haplotype 2
Person 3 Haplotype 3
Person 4 Haplotype 4
Asocierea SNP-urilor
SNP 1
SNP 3
SNP 6
A G G T G A
A G C C C C 3 SNP-uri în total
T A G C G C
Testarea asocierilor:
T A C C C C
SNP 1
high r2 high r2 high r2 SNP 3
SNP 6
●
Folosind genotiparea prin tehnici cu „debit mare“ (microcipuri ADN în
tehnica microarray pentru SNP-uri), se pot cerceta printr-o singură
scanare a genomului uman un număr imens de markeri genetici.
SNP chip
Control Disease
Population Population
IL1A in Europa
• 18.5 kb
• 50 SNP
• 46 SNP-uri comune
(> 10% din populație)
Homozigot comuni
Heterozigot
Carlson et al. (2004)
Am J Hum Genet. 74: 106-120. Homozigot alela alternativă
nu se cunoaște
Studii genomice de asociere în DZ tip II
folosind 317503 SNP-uri
4549 cazuri, 5579 controli
7q21
●
Realizează o scanare a genomului fără a lua în considerare
mecanismele etio- sau fiziopatologice ale bolii
●
Evidențiază regiuni genomice asociate cu boala nu gena cauzală
●
Studiile de asociere indică:
– Gene sau regiuni care ar trebui reanalizate și secvențiate complet
pentru a identifica gene sau variante alelice
– Sunt necesare studii genice și proteomice suplimentare pentru
identificarea structurii și funcției produsului genic
●
GWAS corelate cu studiul structurii și funcției produsului genic:
– Identifică cauze ale bolii care nu au fost incriminate anterior;
– Evidențiază mecanisme genetice - tipuri de mutații diferite ce pot
determina boala (mutații în zona reglatoare, mutații missense, splicing
alternativ, variații ale numărului de copii etc)
– Mai multe gene și mecanisme celulare diferite implicate
– Modalitați noi de diagnostic, prognostic și tratament
BOLI MULTIFACTORIALE
●
pentru definirea mecanismului etiologic al bolilor complexe
este necesară definirea heterogenitații lor.
●
Studii de "Omică": transcriptomică, metabolomică si
proteomică pot “privi” in interiorul acestor afectiuni pentru a
explica patogeneza si heterogenitatea.
HIPERTENSIUNEA ARTERIALĂ
●
În perioada 2008–2011 au fost realizate pe populaţii largi şi cu origini
etnice diferite şapte studii GWAS pentru HTA:
au fost identificate 41 de SNP-uri asociate semnificativ cu HTA
●
Analiza locilor identificaţi prin GWAS pentru TA şi/sau HTA relevă
câteva elemente surprinzătoare :
Excepții:
●
gena CYP17A1 – ce participă la sinteza steroizilor, inclusiv a aldosteronului;
●
genele NPPA, NPPB şi NRP3 (pentru peptidele natriuretice şi receptorul
lor) sau
●
Gena AGT, pentru angiotensinogen – implicate în echilibrul electrolitic
renal;
●
gena EDN3 ce codifică o endotelină – care are funcţii vasculare.
●
Restul locilor asociaţi cu HTA participă la alte căi patogenice, fie
necunoscute, fie nou identificate
HIPERTENSIUNEA ARTERIALĂ
●
Până în prezent s-au identificat polimorfisme în mai multe gene
implicate în acţiunea unor medicamente, care explică variaţiile
individuale ale efectelor lor:
●
gena ACE (codifică angiotensinogenul) şi inhibitorii de
angiotensină;
●
gena ADD1 (codifică a-aducina, senzor de presiune hidrostatică)
şi diureticele tiazidice;
●
gena ADRB1 (codifică receptorul adrenergic b1) şi beta-blocante
●
gena KCNMB1 (codifică subunitatea beta a canalului de potasiu
activat de calciu) şi medicamente anticalcice sau betablocante
Factori de risc pentru afecțiunile coronariene
●
Ele sunt caracterizate prin reducerea secreţiei de insulină
●
diabetul neonatal (DN) – ce apare în primele şase luni de
viaţă este produs de mutaţii în genele cu un rol important în
funcţia sau dezvoltarea celulelor β codificând: subunităţi ale
canalului K+ATP, insulina sau glucokinaza
Diabet zaharat tip I
Diabetul zaharat este un grup de afecțiuni metabolice
heterogene caracterizate de alterarea toleranței la glucoză
prin afectarea secreției sau acțiunii insulinei;
●
Rezultatul distrucției celulelor beta pancreatice
– Deficitul secreției de insulină
– Apare hiperglicemie, cetoacidoză; potențial letală în
absența tratamentului cu insulină
– A doua boală cronică la copii
– Incidența crește cu ~3% pe an (relație cu creșterea
incidenței DZ tip II?)
– Factori virali intrauterini, factori alimentari, stress, etc
Screening genomic în DZ tip I
IDDM1 6p21 IDDM13 2q34-q35
IDDM2 11p15 IDDM15 6q21
IDDM3 15q26 IDDM17 10q25
IDDM4 11q13 IDDM18 5q31-q33
IDDM5 6q25-q27 PTPN22 1p13
IDDM6 18q21 8q24
IDDM7 2q31 VDR, INFγ 12q12-qter
IDDM8 6q27-qter 16p11-p13
IDDM9 3q21-q25 16q22-q24
IDDM10 10p11-q11 17q24-qter
IDDM11 14q24-q31 TGFβ1 19p13-q13
IDDM12 2q33 Xp11
Predispoziția pentru DZ tip I: prin determinarea
haplotipurilor în regiunea antigenelor de
histocompatibilitate (sistemul HLA – 6p21)
– În general screening
bazat pe determinarea
haplotipurilor DQA1-
DQB1
●
Haplotipuri cu risc crescut
pentru DZ I
– DQA1*0501-DQB1*0201
– DQA1*0301-DQB1*0302
Gena Insulinei (INS)
Locus pe 11p15
●
Clasa I de VNTR se asociază cu reducerea toleranței la insulin ă
Factori genetici în DZ tip II
●
90 % din cazurile de DZ au DZ tip II
Indivizii cu istoric familial pozitiv au un risc de 2-6 X mai mare de a
dezvolta diabet tip II comparativ cu cei fără istoric familial
●
Factorii de risc din mediu sunt reprezentaţi de: alimentaţia
hipercalorică (cu conţinut mare de zahăr şi grăsimi),
●
Studii caz-control cu testarea întregului genom
DIABETULUL ZAHARAT tip II
●
diabetul care debutează la tineri (MODY – maturity-onset
diabetes of the young) se manifestă înaintea vârstei de 25
de ani
●
este un grup heterogen de afecţiuni (zece forme produse de
mutaţii în gene diferite), cu caracter familial şi transmitere
autozomal dominantă.
●
Cele mai frecvente cazuri sunt produse de mutaţii în gena
GCK care codifică glucokinaza (MODY2) şi gena HNF1A
pentru factorul hepatocitar nuclear 1a (MODY3 )
DIABETUL ZAHARAT tip II
●
In forma comună, multifactorială a DZ tip 2 cu debut la adult,
problema genetică principală este identificarea genelor de
susceptibilitate şi descifrarea mecanismelor prin care acestea
determină vulnerabilitatea la boală.
●
studiilor „caz-control“ de asociere la nivelul întregului genom
(GWAS) a unor variante comune (frecvenţă > 5%) au identificat 40
de regiuni cromozomiale/loci (care conţin variante ale unor gene
sau elemente reglatoare) asociate cu un risc crescut de DZ
●
s-a constat că cele mai multe dintre genele de susceptibilitate
identificate produc – prin mecanisme multiple şi variate – deficienţe
iniţiale minore în funcţia celulelor β (de exemplu, genele KCNJ11,
TCF7L2, WFS1, HNFIB, GCK, MTNR1B ş.a.) şi/sau modificări ale
numărului celulelor β (de exemplu, genele CDKN2A, CDKN2B).
DIABETUL ZAHARAT tip II
●
fiecare individ cu predispoziţie genetică la DZ tip 2 are o
combinaţie unică – un profil specific al variantelor genelor de
susceptibilitate care interacţionează cu factorii de mediu
●
la fel ca în formele monogenice – genotipuri diferite pot fi asociate
cu fenotipuri (subtipuri clinice) diferite care ar trebui identificate
●
Această heterogenitate a bolii devine importantă pentru
management, care va fi mai „personalizat“ pe măsură ce vom
înţelege aceste mecanismelor patogenice.
●
Un argument suplimentar îl reprezintă susceptibilitatea individuală
diferită a pacienţilor cu DZ tip 2 la anumite complicaţii (nefropatie
diabetică, neuropatii, retinopatii sau boli cardiovasculare).
●
Astfel, studiile genomice au identificat gene de susceptibilitate
asociate cu riscul de nefropatie diabetică(ELMO1, PLEKHH2) sau
cu riscul pentru retinopatie diabetică (genele SERPING1, VEGF)
DIABETULUL ZAHARAT tip II
●
Actual, se acordă o atenţie deosebită rolului efectelor
epigenetice şi „programării fetale şi neonatale“ în unele boli
comune ale adultului
●
Dovezi experimentale şi epidemiologice, stabilesc o legătură între
dieta necorespunzătoare a gravidelor şi/sau întârzierea de
creştere intrauterină şi dezvoltarea la adult a obezităţii, DZ tip 2,
HTA, bolii renale cronice şi bolilor cardiovasculare.
●
Diabetul gestaţional este puternic implicată în patogenia DZ tip 2
(diabetul gestaţional este frecvent nediagnosticat în primele 24–28
săptămâni de sarcină)
●
alimentaţia deficitară în vitamină B12 în cursul sarcinii a fost
asociată cu adipozitatea şi rezistenţa la insulină.
DIABETUL ZAHARAT tip II
●
descoperirea prin analize genomice a unor gene implicate în
patogenia bolii duce la identificarea unor noi ţinte
terapeutice
●
astfel, genele PPARG şi KCNJ11 codifică proteine ce au
devenit „ţinte“ pentru glitazone şi, respectiv sulfonilureice,
folosite deja în terapia DZ tip 2.
●
Alte opţiuni atractive sunt „abordarea“ produselor genelor:
SL30A8 – codifică un transportor de zinc implicat în
formarea granulelor secretorii de insulină
OBEZITATEA
●
Boală metabolică caracterizată prin acumularea excesivă a
țesutului adipos, cu creșterea greutății corpului, determinate de o
dereglare a homeostaziei eneregetice: aportul energetic alimentar
este mult mai mare decât consumul.
●
Prevalență crescută (20-40%) din populația Europei; complicații
frecvente (cardiovasculare, DZ tip II, boli endocrine) și speranță de
viață redusă.
●
Cel mai important factor de risc: obezitatea parentala (risc de 80%
dacă ambii părinți sunt obezi); eritabilitate de 40-70%
●
>150 sdr. monogenice cu obezitate
●
rolul sistemului hipotalamo-leptină-melanocortină în reglarea
apetitului si metabolismului
●
GWAS a identificat 60 loci care se corelează cu obezitatea
Obezitatea: afecțiune cronică cu diferite stadii de evoluție
Evenimente epigenetice
Intervention
Genes_ Environment Interaction
weight
years
Constitution Aggravation Chronic disease Resistance/Regain
Complications
U872
Forme monogenice de obezitate sau influențe genetice
importante
●
BMI >30
– BMI = Î/G2
Corelații intre indicii de masă corporeală
la gemenii monozigoți și dizigoți crescuți impreună
sau separat
Efectul polimorfismului FTO asupra greutatii corporeale la adolescenți în
funcție de activitatea fizica și sex
OBEZITATEA
●
Gene implicate în controlul apetitului: leptina (induce sațietate),
neuropeptidul Y, grelina (stimulează apetitul)
●
Gene implicate în reglarea energetică, metabolismul lipidelor,
adipogeneză (gena PPAR-gama) etc
●
Variantă a genei FTO prezentă în 1% din cazuri care crește
expresia acestei gene ce codifică o demetilază ADN, cu rol
important in reglarea epigenetică
●
Variantele genetice influențează și răspunsul la tratament și la
modificarea stilului de viață: anumite variante în gena FTO,
ADBR3 răspund mai bine la modificările dietetice și activitatea
fizică
●
Medicină personalizată în obezitate în funcție de profilul genetic
individual
Boala Alzheimer
●
Pierderea progresivă a memoriei și a altor funcții cognitive, asociate cu
pierderea anumitor tipuri de neuroni corticali
●
Vârsta (peste 65ani), sexul (feminin) și istoricul familial sunt cei mai
importanți factori de risc
Boala Alzheimer
●
Anatomopatologic: prezența agregatelor proteice (plăcile de β-
amiloid ce au ca componentă pricipală o proteină mica de 39-42
aa ce rezultă din scindarea unei proteine neuronale normale)
●
Există 3 forme de boală Alzheimer cu debut precoce (30-50 ani),
cu transmitere autosomal dominantă
●
Forma comună are debut după vârsta de 60 ani, cu agregare
familiala; concordanța la gemeni MZ de 50% și la DZ de 18%
●
Studiile de asociere au relevat locusul genei APOE care codifică
apolipoproteina E, componentă a LDL, implicată în eliminarea
LDL și componentă a plăcii de amiloid
●
Gena APOE prezintă 3 alele: ε2, ε3, ε4.
●
Genotipul ε4 în stare homozigotă sau heterozigotă a fost intâlnit
de 2-3 ori mai frevant la pacienții afectați comparativ cu cazurile
control; homozigolii prezintă un debut precoce al bolii și un risc
de a dezvolta BA de 60% până la 85 ani; heterozigoții ε3 ε4 au
un risc de 40% de a dezvolta BA până la 85 ani