Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Enzimele din punct de vedere al biochimiei sunt macromolecule de natura glicoproteică care
se biosintetizeaza in celula vie, se găsesc in organismele vii in concentrații deosebit de mici
comparativ cu concentrația reactanților. Au rolul de a creste viteza reacțiilor termodinamic
posibile.
Enzimele sunt biocatalizatori care sunt strict specifici tuturor biosistemelor, in absenta
enzimelor reacțiile metabolice nu se pot produce si metabolismul nu funcționează, iar
organismul moare.
Viteza de reacție este un parametru al oricărui proces chimic si este studiata in cadrul cineticii
de reacție. Ca funcție de stare implicata in cinetica de reacție este studiata cu prioritate
energia de activare . Aceasta reprezintă minimul de energie necesar unui sistem reactant de a
se transforma in produși de reacție.
Catalizatorul (enzima) are rolul de a diminua substanțial energia de activare si in acest mod un
număr mai mare de molecule de reactanți poseda acel minimum de energie in așa mod încât
sa se transforme in produși de reacție.
Denumirea trivială (nesugestivă)-nu prezinta nicio legătură cu procesul sau reactanții sau
produșii de reacție (ex: pepsina, tripsina, chimotripsina).
De regula, in articolele științifice se utilizează denumirea sistematica care este însă greoaie,
iar denumirile triviale si raționale sunt relativ mai simple si mai ușor de reținut.
OXIDOREDUCTAZE
TRANSFERAZE
HIDROLAZE
LIAZE
IZOMERAZE
LIGAZE
Enzimele acționează întotdeauna asupra unui reactant (mai multor reactanți) care se numesc
substraturi (S), interacția enzima-substrat (E-S) se realizează prin complementaritate (intre
enzima si substrat se realizează interacții specifice). Întotdeauna interacțiile E-S sunt de natura
slaba si reversibile. O enzima poate acționa strict asupra unui substrat si numai asupra unuia,
realizând o interacție strict specifica (absoluta) sau poate acționa asupra unui grup de
substraturi care prezinta structuri apropiate, in acest caz acțiunea catalitica prezinta
specificitate relativa de grup.
Ex: hexokinaza (asupra hexozelor fosfatate), peptidaze.
Daca exista o specificate absoluta intre enzima si substrat, acesta recunoaște si interacționează
doar cu unul dintre substraturile posibile, in acest caz deosebindu-se specificitatea geometrica
a enzimelor, când din izomerii geometrici acționează numai asupra unui (cis sau trans).
Acțiunea absoluta a enzimelor poate sa fie si stereospecifica, asupra unui amestec de izomeri
optici, enzima acționează strict asupra unuia dintre ei sau din procesul catalizat rezulta unul si
numai unul dintre izomerii optici posibili.
În metabolism exista numeroase situații in care un reactant poate fi supus acțiunii mai multor
enzime care acționează specific (strict specific) asupra acestuia cu formarea produșilor de
reacție corespunzători transformărilor.
Enzime alosterice sunt acele specii enzimatice care in afara centrului catalitic posedă si un alt
centru alosteric care se poate găsi de-a lungul lanțului polipeptidic oriunde, dar nu se
suprapune peste centrul catalitic. Centrul alosteric are rolul de a recunoaște și de a lega la
nivelul său un efector alosteric care se numește cofactor si care in majoritatea cazurilor este de
natura exogenă.
Cofactorul dacă este de natură organică se numește coenzimă și acesta după interacția cu
enzima la nivelul centrului alosteric poate facilita schimbul de electroni si de protoni,
transferul grupărilor funcționale, torsionarea unor legături. Prin acțiunea coenzimelor la
nivelul centrului alosteric este definit întotdeauna mecanismul de desfășurare al procesului
biochimic (înșiruirea unor reacții simple in urma cărora reactanții se transforma in produși de
reacție). Daca, la nivelul centrului alosteric (in cazul enzimelor alosterice), nu se realizează
interacția cu coenzima (cofactorul), enzima nu poate desfășura activitatea catalitica. Din
aceasta cauza, pentru enzimele alosterice exista definiția holoenzimei care este complexul
activ enzimatic constituit din proteinenzimă si cofactor (coenzima) si respectiv apoenzima
care reprezintă proteinenzima inactivă datorita absenței interacției cu cofactorul (coenzima).
Centrul alosteric nu participa direct la procesul catalitic, dar modulează acest proces prin
modificarea conformației ghemului statistic enzimatic in așa mod încât substratul sa aibă
acces la nivelul centrului activ enzimatic. In procesul catalitic intre enzima si substrat se
realizează o interacție specifica cu formarea unui complex ES bogat energetic (instabil). Acest
complex ES poate sa revină la reactanți sau se poate transforma ireversibil in produsul de
reacție eliberând enzima care este capabila sa reia ciclul catalitic. Din aceasta cauza
concentrația enzimei in mediul de reacție este deosebit de mica, ea refăcându-se calitativ si
cantitativ după fiecare ciclu catalitic.
Izoenzimele rezultate prin cuplarea necovalentă a mai multor lanțuri polipeptidice, dependent
de tipul lanțurilor polipeptidice si numărul acestora, din structura cuaternara rezultata poseda
structuri bine determinate de la o izoenzima la alta si respectiv caracteristici fizico-chimice
diferite: mobilitate electroforetica (diferita deoarece gradul de încărcare electrica a
izoenzimelor este diferit si atunci si migrarea in câmp electric continuu este diferita), cinetica
de reacție (influențată de condițiile de mediu care presupun deschiderea sau închiderea
accentuata a structurii cuaternare in raport cu substratul in vederea interacției pentru
transformarea in produs de reacție).
Acidul sialic face parte din lanțurile oligozaharidice. Timpul de viață al enzimelor este legat
de existenta acidului sialic. Timpul de viață al majorității enzimelor din biosisteme este mic si
foarte mic (de ordinul secundelor sau subunităților secundelor).
In genere, după acțiunea unei enzime, exista sisteme enzimatice specializate care hidrolitic
rup lanțul oligozaharidic de acid sialic si, astfel enzima este preluata, transportat la nivelul
celulelor efectuare in vederea degradării.
CATALIZA MULTIENZIMATICĂ
Enzimele implicate in desfășurarea proceselor metabolice de regulă sunt prezente sub forma
unui complex multi-enzimatic, care acționează independent asupra substratului si respectiv
intermediarilor metabolici pana la obținerea produsului final. Cataliza in acest caz se
realizează in cascada si diminuează substanțial distanta dintre intermediarii metabolici si
enzimele corespunzătoare realizându-se o economie de timp. Constituirea agregatelor multi-
enzimatice (nu structura cuaternara) permite realizarea unei reglări continue a intermediarilor
si produșilor de reacție si acțiunea prin feedback negativ a produsului final de reacție asupra
primei enzime a produsului enzimatic ceea ce permite un control riguros al desfășurării
reacțiilor metabolice.
Cinetică enzimatică
Valoarea ΔG < 0 indică faptul că reacţia este termodinamic posibilă şi raportul concentraţiilor
produşilor şi reactanţilor este mai mic decât cel de la echilibru (Fig.2-10). Viteza de
transformare a substratului în produsul de reacţie, depinde de numărul de molecule care
posedă energia de activare, în unitatea de timp.
Starea de tranziţie ES* reprezintă complexul enzimă-substrat bogat energetic, de a cărui
stabilitate (constantă de disociere) depinde viteza de desfăşurare a reacţiei catalizate. În
genere, celulele trăiesc la temperaturi relativ scăzute, astfel că temperatura nu poate fi utilizată
pentru creşterea vitezei de reacţie. Pentru creşterea vitezei de desfăşurare a reacţiilor chimice
în sistemele vii, la temperaturi relativ mici, acestea utilizează biocatalizatori (enzime). Efectul
catalitic al enzimelor se materializează prin scăderea energiei de activare a moleculelor
reactante, în aşa fel încât un număr mai mare de molecule să posede acel minim energetic
necesar pentru formarea stării de tranziţie. În genere efectul enzimelor este descompunerea
unei reacţii date, într-o cascadă de etape tranzitorii, care nu sunt separate unele de altele decât
prin bariere energetice mici (o suită de stări discrete) în care minimele energetice corespund
stărilor intermediare ale sistemului, iar maximele energetice corespund stărilor de tranziţie.
Intermediarii au în genere viaţă scurtă şi pot fi izolaţi din mediul de reacţie prin diferite
tehnici, în timp ce stările de tranziţie sunt instabile şi neizolabile.
Fig.10-9 Diagrama energetică a reacţiei catalizate enzimatic, în raport cu cea necatalizată
Într-o reacţie catalizată enzimatic, viteza de reacţie se defineşte ca fiind cantitatea de substrat
(S) care se transformă în unitatea de timp, respectiv cantitatea de produs (P) formată în uni-
tatea de timp (Fig. 10-10).
Din multitudinea de etape ale unei reacţii catalizate enzimatic, există una care limitează şi
impune ritmul în ansamblul de apariţie a produsului de reacţie (determinantă de viteză) care
posedă cea mai mare energie de activare şi o variaţie defavorabilă a entalpiei libere.
[S] mol/L
legătura dintre viteza procesului enzimatic, viteza maximă şi concentraţia iniţială a substratului prin
constanta Michaelis-Menten.
Daca k-1>> k2, Km poate fi definită ca raportul k-1/k1, care semnifică constanta de disociere a
complexului ES.
Fig.10-12 Descrierea unei reacţii catalizată enzimatic şi a relaţiei
Michaelis-Menten, asociată ei
Dacă viteza reacţiei catalizată enzimatic este jumătate din viteza maximă, se obţine K m = [S]. Deci
constanta Michaelis-Menten este concentraţia substratului, la care viteza procesului catalitic este
jumătate din viteza maximă. Valoarea constantei Michaelis-Menten este independentă de concen -
traţia enzimei, iar unitatea de măsură a acesteea este mol/L. Constanta Michaelis-Menten măsoară
disocierea complexului ES şi estimează stabilitatea acestuia. Valorile mari ale constantei indică
deplasarea echilibrului de formare a complexului ES spre stanga în care enzima şi substratul sunt
libere.
Constanta Km este caracteristică fiecărui sistem enzimatic şi indică afinitatea enzimei faţă de
substrat. Cu cât valoarea acesteea este mai mare, cu atât afinitatea enzimei faţă de substrat
este mai mică, deoarece este necesară o cantitate mai mare de substrat pentru atingerea
semisaturării enzimei şi invers, cu cât valoarea Km este mai mică, cu atât afinitatea enzimei
faţă de substrat este mai mare, deoarece este necesară o concentraţie mai mică de substrat
pentru atingerea semisaturării enzimei.Valorile Km foarte joase (sub 1 µM) presupun
existenţa unei afinităţi foarte mari a enzimei faţă de substrat. O enzimă poate prezenta valori
Km diferite, dacă acţionează asupra mai multor substraturi, deci prezintă afinităţi diferite faţă
[S] mol/L
dreptei cu abscisa este –1/Km. Pentru orice sistem enzimă-substrat, cu ajutorul reprezentării
1/[S] L/mol
1/[S] L/mol
Constanta k2 este denumită constanta vitezei catalitice (activitate moleculară, turnover) iar
reciproca acesteea reprezintă timpul necesar pentru efectuarea unui ciclu catalitic complet.
Constanta de viteza k2 este coeficientul cinetic esenţial şi reprezintă puterea catalitică
intrinsecă a proteinenzimei, care se defineşte prin numărul de molecule de substrat care sunt
convertite de o singură moleculă de catalizator, în unitatea de timp. Constanta k 2 desemnează
etapa limitantă a unui proces complex şi prezintă o valoare foarte mică în raport cu k -1, care
este constanta de ordinul I a disocierii complexului ES. Pentru anumite substraturi sunt
prezentate în tabelul 10-6 valorile Km şi k2. Raportul k2/Km reprezintă constanta de viteză
aparentă a reacţiei dintre substrat şi enzima liberă.
La concentraţiile foarte mari ale substratului, datorită plasării stabile a acestuia de-a lungul
lanţului polipeptidic enzimatic, se diminuează accesul altor molecule de substrat la centrul
activ enzimatic. Aceasta determină o diminuare a vitezei reacţiei (Fig.10-15b) substratul în
concentraţii foarte mari acţionând ca inhibitor enzimatic.