Înainte de al Doilea Război Mondial, 97% din populație se declara catolică (ritul roman), aproximativ

2,5% ca luteran și aproximativ 0,5% dintre rezidenți se identificau ca membri ai altor culte. [208]
Catolicismul era o trăsătură importantă a vieții sociale și politice în Slovenia precomunistă. După
1945, țara a suferit un proces de secularizare treptată, dar constantă. După un deceniu de
persecuție a religiilor, regimul comunist a adoptat o politică de relativă toleranță față de biserici.
După 1990, Biserica Catolică a recâștigat o parte din influența sa anterioară, dar Slovenia rămâne o
societate în mare măsură secularizată. Conform recensământului din 2002, 57,8% din populație este
catolică. În 1991, 71,6% erau catolici autodeclarați, ceea ce înseamnă o scădere cu mai mult de 1%
anual.[236] Marea majoritate a catolicilor sloveni aparțin ritului latin. Un număr mic de greco-
catolici locuiesc în regiunea Carniola Albă(d). [237]
În ciuda numărului relativ mic de protestanți (mai puțin de 1% în 2002), cultura protestantă are
importanță istorică, având în vedere că limbii standard și literaturii slovene li s-au pus bazele în
urma Reformei Protestante din secolul al XVI-lea. Primož Trubar(d), un teolog în tradiția luterană, a
fost unul dintre cei mai influenți reformatori protestanți(d) din Slovenia. Protestantismul a fost stins
în Contrareforma implementată de dinastia Habsburgică, care controla regiunea. El a supraviețuit
numai în regiunile din estul țării, datorită protecției nobililor maghiari, care, adesea, erau reformați
calvini. Astăzi, o minoritate luterană semnificativă trăiește în regiunea cea mai estică din Prekmurje,
unde reprezintă aproximativ o cincime din populație și este condusă de un episcop care are sediul
la Murska Sobota.[238]
Pe lângă aceste două mari culte creștine, o mică comunitate evreiască(d) a fost de asemenea
prezentă în trecut. În ciuda pierderilor suferite în timpul Holocaustului, iudaismul încă numără câteva
sute de adepți, care, în cea mai mare parte, locuiesc în Ljubljana, locul singurei sinagogi active
rămase în țară.[239]