Cursul 1 2.10.

2013

Introducere

Rolul i structura aminoacizilor



Aminoacizi
Rolul aa
-intr n structura proteinelor
-sunt surs primar de azot pentru esuturi
-din aa se obin:
purine, pirimidine
hem
hormoni
neurotransmitori (GABA)
peptide biologic active
amine (histamina)

Din ~ 300 de aa care se afl n natur:

21 aa naturali sunt proteinogeni,
specificai prin codul genetic

dintre care 9 aa sunt eseniali (organismul nu i
sintetizeaz)


Structura aa proteinogeni
Formula general:

21 aa







Un iminoacid
(prolina)
R CH COOH
NH
2
H
2
C
H
2
N
+
CH
2
CH
2
CH
COO
-
Aminoacizi alifatici
Glicina Gly (G) Nepolar

Alanina Ala (A) Nepolar

Valina Val (V) Nepolar

Leucina Leu (L) Nepolar

Izoleucina Ile (I) Nepolar
H CH COO
-
NH
3
+
C H
3
CH COO
-
NH
3
+
CH CH COO
-
NH
3
+
H
3
C
CH
3
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
CH
CH
3
H
3
C
CH
CH COO
-
NH
3
+
CH
2
H
3
C
CH
3
Aminoacizi aromatici
Fenilalanina Phe (F)
Nepolar
Tirozina Tyr (Y)
Polar nencrcat

Triptofan Trp (W)
Nepolar
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
HO
N
H
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
Aminoacizi cu grupri hidroxil
Serina Ser (S)
Polar nencarcat

Treonina Thr (T)
Polar nencrcat
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
HO
CH CH COO
-
NH
3
+
H
3
C
OH
Aminoacizii dicarboxilici
Aspartat (Acid aspartic) Asp (D)
Polar ncrcat negativ


Glutamat (Acid glutamic)Glu (E)
Polar ncrcat negativ

CH
2
CH COO
-
NH
3
+
O
-
OC
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
CH
2
O
-
OC
Amidele aminoacizilor
dicarboxilici
Asparagina Asn (N) Polar nencrcat



Glutamina Gln (Q) Polar nencrcat
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
C
O
H
2
N
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
CH
2
C
O
H
2
N
Aminoacizi bazici
Lizina Lys (K) Polar ncrcat pozitiv


Arginina Arg (R) Polar ncrcat pozitiv


Histidina His (H) Polar ncrcat pozitiv
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
CH
2
CH
2
H
2
C
NH
3
+
(CH
2
)
3
CH COO
-
NH
3
+
NH C H
2
N
NH
2
+
HN
+
N
H
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
Aminoacizi coninnd sulf
Cisteina Cys (C) Polar nencrcat



Metionina Met (M) Nepolar
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
CH
2
S
CH
3
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
HS
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
HSe
Selenocisteina
Iminoacizi
Prolina Pro (P) Nepolar
H
2
C
H
2
N
+
CH
2
CH
2
CH
COO
-
Aminoacizii eseniali
(nu se sintetizeaz n organism)
valina
leucina
Izoleucina
lizina
metionina
treonina
fenilalanina
triptofanul i histidina
se procur din alimente
Activitatea optic a aminoacizilor
Cu excepia glicinei toi aminoacizii naturali
sunt optic activi


R CH COO
-
NH
3
+
o
H C
COO
-
R
NH
3
+
H C
COO
-
R
H
3
N
+
D-aminoacid L-aminoacid
-n structura proteinelor sunt
L-o-aminoacizi

Treonina i izoleucina au un carbon
asimetric adiional, atomul C|.

CH CH COO
-
NH
3
+
H
3
C
OH
CH
CH COO
-
NH
3
+
CH
2
H
3
C
CH
3

Cursul 2 9.X.2013

Ionizarea aminoacizilor n soluie apoas
pH izoelectric
Proprietile aa date de radicalii R
Peptide
Clasificare proteine

R CH COOH
NH
2
Ionizarea aminoacizilor n soluie
apoas
n funcie de pH-ul mediului aa pot avea: sarcin +, - sau zero.







La pH=7,4 snge i 7,1 mediu intracelular




COO
-
COOH
acid baza conjugat
+ H
+
- H
+
NH
3
+
NH
2
baz acidul conjugat
+ H
+
- H
+
R CH COOH
NH
2
R CH COO
-
NH
3
+
Amfiion (ion bipolar)
pKa = - log Ka

-COOH din o are pKa ~ 2

pKa~10

-COOH din radical are pKa ~ 4

are pKa ~ 11

alfa din
3
+
NH
radical din
3
+
NH
Aminoacid pK
1
pK
2
pK
R
PI
1. Glicocol 2,34 9,60 5,97
2. Alanina 2,35 9,69 6,02
3. Valina 2,32 9,62 5,97
4. Leucina 2,36 9,60 5,98
5. Izoleucina 2,36 9,68 6,02
6. Fenilalanina 1,83 9,13 5,98
7. Prolina 1,99 10,60 6,10
8. Triptofan 2,38 9,38 5,88
9. Serina 2,21 9,15 5,68
10.Treonina 2,63 10,43 6,53
11.Tirozina 2,20 9,11 10,07 5,65
12.Cisteina 1,71 10,78 8,33 5,02
13.Metionina 2,28 9,21 5,75
14.Asparagina 2,02 8,80 5,41
15.Glutamina 2,17 9,13 5,65
16.Acid aspartic 2,09 9,82 3,86 2,97
17.Acid glutamic 2,19 9,67 4,25 3,22
18.Histidina 1,82 9,17 6,00 7,58
19.Lizina 2,18 8,95 10,53 9,74
20.Arginina 2,17 9,04 12,48 10,76
Aminoacizii au rol de sistem tampon

au grpare cu caracter acid

au grupare cu caracter bazic
pH izoelectric
pI = pH la care ncrcarea electric a aa
este zero;
(sarcina + este egal cu sarcina -) i
aa nu migreaz n cmp electric.


La pI solubilitatea aa este minim
pH izoelectric
important pentru
separarea aa prin electroforez
Calculul pI
Se face semisuma valorilor pKa ale gruprilor care
genereaz amfiionul fr sarcin net:
aa monoamino-monocarboxilici



Pentru Ala pI:

CH
R
COOH H
3
N
+
CH
R
COO
-
H
3
N
+
CH
R
COO
-
H
2
N
02 , 6
2
69 , 9 35 , 2
2
pK pK
pI
2 1
=
+
=
+
=
aa monoamino dicarboxilici
acidul glutamic n funcie de pH-ul soluiei







Aminoacizii dicarboxilici Asp i Glu au pI la valori net acide (2,97 I
RESPECTIVE 3,2).
La pH fiziologic resturile acestor aa vor avea o sarcin net (-).






COOH
CH
2
CH
2
HC
COOH
NH
3
+
- H
+
- H
+
- H
+
COOH
CH
2
CH
2
HC
COO
-
NH
3
+
COO
-
CH
2
CH
2
HC
COO
-
NH
3
+
COO
-
CH
2
CH
2
HC
COO
-
NH
2
22 , 3
2
25 , 4 19 , 2
2
pK pK
pI
R
1
=
+
=
+
=
aa diaminomonocarboxilici
Lizina






pI se calculeaz astfel:
NH
3
+
H
2
C
(CH
2
)
3
HC
COOH
NH
3
+
- H
+
- H
+
- H
+
NH
3
+
H
2
C
(CH
2
)
3
HC
COO
-
NH
3
+
NH
3
+
H
2
C
(CH
2
)
3
HC
COO
-
NH
2
NH
2
H
2
C
(CH
2
)
3
HC
COO
-
NH
2
74 , 9
2
53 , 10 95 , 8
2
2
=
+
=
+
=
R
pK pK
pI
Arginina are caracter bazic prin gruparea guanidinic:



Histidina prezint caracter bazic determinat de nucleul
heterociclic al imidazolului:



Bazicitatea acestei grupri este mai redus (pK=6,00) i
pI este situat la valori apropiate de pH-ul fiziologic.

R NH C NH
2
NH
+ H
+
- H
+
R NH C NH
2
NH
2
+
ion guanidinium
+ H
+
- H
+
N
N
H
HN
+
N
H
La pH fiziologic

resturile aspartil i glutamil au sarcina
net negativ

resturile lizil, histidil i arginil au
sarcina pozitiv.
Aminoacizi derivai
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
CH
2
CH H
2
C
OH H
3
N
+


H
2
C
H
2
N
+
CH
2
CH
CH
COO
-
OH
4-hidroxi prolin
5-hidroxi lizin
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
CH
2
CH
2
H
3
N
+
Ornitin
CH
2
CH COO
-
NH
3
+
CH O
-
OC
COO
-
Acid carboxi glutamic
Proprietile aa date de:
gruprile COOH
gruprile NH
2
gruprile din

radicalii R

R CH COOH
NH
2
Proprietile aa date de radicalii R
Legturile necovalente dintre radicalii R:
-legturile de hidrogen sunt interacii electrostatice ntre atomii de
hidrogen legai covalent la un atom puternic electronegativ (O sau
N) i electronii neparticipani ai unui atom electronegativ dintr-o
molecul vecin.
X
o
H
o+

o
Y
donor de hidrogen
Acceptor de hidrogen
O H
N
H
O H
O C
O H O C
N H
N
Interaciuni electrostatice
asociaii ntre perechi de ioni, legturi
saline (ex. ntre un rest de Arg sau Lys i
Glu);
COO
- +
H
3
N


Interaciunile hidrofobe
gruprile nepolare se asociaz reducndu-se la
minimum contactul lor cu apa

Radicalii aminoacizilor pot fi polari sau nepolari.
Peptide
Peptide
Produi de policondensare a aa
Legtura peptidic se formeaz prin eliminare de
H
2
O ntre 2 aa





CH
2
C
H
3
N
+
N CH
2
O
H
COO
-
Legtura peptidic
Glicil-glicin
legtura peptidic are caracter parial de
dubl legtur (Pauling i Corey)
O
C
N
H
R

C
C
o
C
o
N
O
H
H
Planul legturii amidice
Radicalii aminoacizilor
C
o
Diversitatea peptidelor
dat de modul de combinare a celor 20 aa

Dipeptide (simple sau mixte)
Trei aa formeaz 6 tripeptide
Polipeptide




Peptidele ncep cu captul N-terminal.
Peptidele sunt derivai acilai ai aa C-terminal
Captul N-terminal Captul C-terminal
H
3
N
+
CH
R
1
CO NH CH
R
2
CO NH CH
R
3
CO
HN CH
R
4
CO NH CH
R
5
CO NH CH
R
6
COO
-
Glutationul ( -glutamil-cisteinil-
glicin)





HOOC CH
NH
2
CH
2
CH
2
CO NH CH CO NH CH
2
COOH
CH
2
SH
o |
Roluri:
tampon redox:
- 2 H
+
+ 2 H
+
G SH G S S G
2
forma redus
forma oxidat

agent reductor intracelular
menine gruprile SH din centrul activ al
enzimelor n forma lor redus:
Enz-S-S-R + G-SH Enz-SH + G-S-S-R


descompune H
2
O
2
i peroxizii lipidici (L-
OOH) protejnd membranele celulare de
aciunea oxidant a acestora:
L-OOH + 2G-SH L-OH + HOH + G-S-S-G

transform MetHb n Hb:
Met Hb (Fe3+) + 2G-SH Hb (Fe2+) + G-S-
S-G + 2H+


Inactiveaz insulina prin desfacerea
legturilor de sulf din molecula acesteia;


Particip la neutralizarea xenobioticelor:
R + G-SH R-S-G unde
R=xenobiotic (anumite medicamente i
carcinogene).


Transport aminoacizii de-a lungul membranelor,
din spaiul extracelular n citosol.


Glutationul este un indicator sensibil
al funcionalitii celulelor


Rolul peptidelor
roluri reglatoare, la nivelul creierului n procesele de:
Memorie
Durere
Somn

Din proopiomelanocortin (POMC), polipeptid cu ~
285 aa
sintetizat n lobul anterior i intermediar al hipofizei
se formeaz o, |, - endorfine i Met-encefalin.


precursor PRE Proopiomelanocortin (~285 aa)
gena se exprim n lobul anterior si intermediar din adenohipofiz
procesare n adenohipofiz
POMC (1-134)
ACTH (1-39) |-LPH (42-134)
o-MSH (1-13) CLIP (18-39) -LPH (42-101) |endorfina (104-134)
|-MSH (84-101) -endorfina (104-118)
o-endorfina (104-117)
Endorfinele sunt neuropeptide
cu aciuni asemntoare cu ale

Morfinei
principiu activ extras din opiu,
compus cu aciune analgezic i euforic
Primele opioide descoperite au fost cele dou
pentapeptide numite encefaline secretate de
celulele cromafine din medulosuprarenal.
H
3
N
+
Thr Gly Gly Phe Met COO
-
H
3
N
+
Thr Gly Gly Phe Leu COO
-
Endorfinele
se leag la terminaiile nervoase din creier care transmit semnalele
durerii, i blocheaz activitatea neuronal, alinnd durerea.

Morfina ca i alte opiacee nu sunt peptide. Structura lor este ns
similar cu a altor opioide care se leag de terminaiile nervoase din
creier.
O
N
OR
OR`
H
3
C
R=H R`=H morfin
R=H R`=-CH
3
codein
R=Acetil R`=Acetil heroin
Endorfinele
sunt produse de ctre creier ca rspuns la o
varietate de stimuli
reduc stresul
scad senzaia de durere
creaz euforie
elibereaz hormonii sexuali i
mbuntesc sistemul imunitar
Care este diferena dintre morfin i codein i
endorfine ??
endorfinele nu creiaz dependen


Cine stimuleaz producerea de endorfine
???
exercitiile fizice repetate i prelungite
stresul i durerea sunt cei mai ntalnii factori
care duc la eliberarea de endorfine.
anumite mncruri, precum ciocolata i ardeii
iui
acupunctura, terapia prin masaj, sexul
producerea de endorfine
variaza de la o persoana la alta


Peptide cu rol hormonal
bradikinina agent hipotensiv

angiotensina II stimuleaz secreia de aldosteron
este agent hipertensiv.

Vasopresina este antidiuretic.

Somatostatina sintetizat n hipotalamus i n
pancreas regleaz eliberarea glucagonului.

Glucagonul este hormon produs de pancreas cu rol
n reglarea glicemiei.
OXITOCINA
Se secreta in
momentele in
care ne gandim la
cineva drag si are
numeroase efecte
viscerale.
Poate influenta
pana si stadiile
de somn, de
aceea iubitii se
viseaza frecvent
ADH-VASOPRESINA
Creaza stari de
beatitudine si
extaz, fiind
secretat in
cantitati mai
mari in
imbratisari sau
sub influenta
feromonilor.

FENILETILAMINA (PEA)

ESTE CONSIDERATA MOLECULA DRAGOSTEI

Importana comercial a peptidelor
aspartamul (L-aspartil L-fenilalanil-1-metil ester) este un
ndulcitor artificial de 160 de ori mai dulce ca zaharoza
Indivizii care nu pot metaboliza fenilalanina au
intoleran la acest ndulcitor.
H
3
N
+
CH CO NH CH CO OCH
3
CH
2
COO
-
CH
2
L-aspartil-L-fenilalanin-1-metil ester

Proteine
Compui macromoleculari

Sunt 10
10
10
12
tipuri de proteine n lumea vie
Clasificarea proteinelor
Dup compoziia chimic

proteinele simple formate numai din aa (lizozimul, ribonucleaza).


proteinele conjugate conin grupri adiionale (prostetice)
hem (hemoglobina, mioglobina, citocromii, catalaza);
coenzime provenite din vitamine (succinat dehidrogenaza, transaminazele,
lactat dehidrogenaza);
metale (feritina, ceruloplasmina);
acizi nucleici (ribozomii, nucleozomii);
lipide (chilomicroni, VLDL, LDL, HDL);
glucide (imunoglobulinele, colagen).
Clasificarea proteinelor dup mrime i
form
Proteine globulare
uor solubile n ap
intracelulare: hemoglobina, mioglobina, imunoglobulinele,

Proteine fibrilare
insolubile n ap
extracelulare, cu roluri de susinere: collagen, cheratin, miozin,
elastin.
Clasificarea proteinelor dup rol

structural: colagenul, elastina, keratina;
catalitic (enzime): tripsina, chimotripsina, revers transcriptaza;
aprare: imunoglobulinele , interferonii
hormonal: insulina, glucagonul, parathormonul;
transport:
- albuminele serice (transport cationi, vitamine, metabolii)
-hemoglobina (transport oxigen)
-transferina (transport fier)