Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
PRINCIPII TERMODINAMICE
45
organismul poate s consume hidrai de carbon, grsimi i proteine pentru a
produce energie prin oxidare aerobic. Mai multe organisme oxideaz
hidrocarburile, formele reduse de sulfuri sau sulful elementar i alte
organisme oxideaz fierul. Nici un organism nu oxideaz azotul elementar
pentru energie, fapt ce este explicat de legile termodinamicii. Aceste
exemplificri termodinamice sunt importante in controlul vieii.
Termodinamica dezvolt studiile asupra mainii termice i asupra
ciclului Carnot. Mrimile termodinamice sunt proprietii ale strii
substanelor i nu depind de modul de obinere a substanelor. Diferena
ntre starea iniial i cea final este important; calea prin care rezult
starea final din starea iniial nu prezint importan. Proprietile
substanelor pot fi mprite n proprieti intensive i proprieti extensive.
Proprietile extensive depind de cantitatea materialului. Multe proprieti
termodinamice pot fi discutate dependent de cantitatea materialului.
Volumul, masa i energia sunt proprieti care depind de cantitatea
materialului. Proprietile intensive sunt proprieti intrinseci ale substanei
i nu depind de cantitatea de material. Astfel sunt, de exemplu, densitatea,
presiunea, temperatura i concentraia.
46
kB = 1,3807.10-23 J.K-1
Constanta gazelor
R = NkB R = 1,9872 cal.K-1.mol-1
R = 8,3145 J.K-1.mol-1 R = 0,08203 atm.K-1.mol-1
47
dE dq dw (2)
Cum lucrul produs contra unei presiuni constante este dw = pdV, de aici:
dE dq pdV (3)
V.2. ENTALPIA
w pV (4)
q p E pV (5)
H E pV (6)
48
Pentru un schimb mic al entalpiei avem:
dH dq Vdp (8)
dE dq sau dE q v (9)
dH dq sau dH q p (10)
49
Pentru exemplificare putem prezenta calcularea H, utiliznd
entalpiile standard a reaciei dintre amoniacul gazos i acidul acetic lichid
pentru formare de glicin i hidrogen.
50
HO CH2-CH-COO- + 1/2O2 HO CH2-C-COO- + NH4+
NH3+ O
tirozina p-hidroxipiruvat
NH3+ NH3+
tirozina
fenilalanina
H H
CONH2 CONH2
CH3CH2OH + CH3CHO + + H+
etanol N N
R R
NAD+ acetaldehid NADH
51
amoniu se desfoar cu absorbie de cldur fiind condus de ctre entropie,
noiune ce urmeaz s fie tratat n continuare.
S k ln W (11)
S Nk ln W R ln W (12)
52
unde N este numrul de molecule ntr-un mol (cca. 6x10 23) i R este
constanta gazelor [R = 2 cal/(oC.mol)].
Dac noi avem N molecule n starea de energie T de la 1 la T i n i
molecule n starea lor de energie , noi gsim numrul total de ci W prin
care se poate aranja sistemul i va fi:
N!
W (12)
n 1! n 2 ! n 3 !....n T
______o______
_______o____o_______
53
Entropia absolut a unui compus se poate calcula prin metodele
mecanicii statistice dac se cunosc toi parametri de vibraie i de rotaie.
Acestea includ constantele de energie, momentele de inerie i barierele de
rotaie. Calculele mecanicii statistice pentru entropie sunt posibile numai
pentru molecule relativ mici i certitudinea nu poate fi folosit pentru
reactanii biochimici uzuali. Contribuia entropiei la propan se poate calcula
prin metodele mecanicii statistice (vezi tabelul V.2). Aceste valori arat o
contribuie important a rotaiei i translaiei la entropie o contribuie mic
pentru vibraie i nu este o contribuie electronic pentru valoare entropiei.
Aceast distribuie calitativ a entropiei este tipic pentru molecule mici ca
i propanul sau pentru molecule mari ntlnite n sisteme biochimice.
Iat c sunt mai multe proprieti ale moleculei care sunt importante
n determinarea entropiei unui compus. Dac noi lum n considerare toate
aceste i modul n care afecteaz entropia , atunci vom avea o apreciere
calitativ mai bun a entropiei.
Din mecanica statistic noi am gsit entropia de translaie care este
termenul cel mai important, chiar ntr-un domeniu larg de molecule i este
proporional cu 3/2RlnM, unde R este constanta general a gazelor i M
este masa molecular. n acest fel entropia molar crete dat cu masa
molecular. De exemplu, entropia hidrocarburilor n faz solid crete cu
5,8 eu pentru fiecare CH2 introdus, n faz lichid cu 7,7 eu i n faz
gazoas cu 10,0 eu. Entropia hidrocarburilor lichide este egal cu
25,0+7,7n, unde n este numrul de atomi de carbon ai hidrocarburii.
Caracteristicile structurale ale moleculei pot introduce rigidizarea
unor legturi ceea ce reduce contribuia rotaiei i translaiei la valoarea
entropiei. O legtura dubl reduce entropia cu aproximativ 2,5 eu, legtura
tripl cu cca 4,5 eu, un inel cu aproximativ 14 eu, i o caten lateral cu 3,0
eu. Reducerea entropiei cu introducerea unui inel este prezentat n tabelul
nr. V.3.
Starea fizic este de asemenea un factor foarte important n entropia
unui compus. Un gaz poate avea o libertate de translaie i de rotaie mai
mare dect un lichid i acesta are o libertate mai mare dect un solid. De aici
rezult c entropia relativ scade de la gaz la solid. Entalpia crete la
vaporizare i la topire i poate fi determinat din cldura de vaporizare
mprit la temperatura de fierbere sau din cldura de fuziune mprit la
temperatura de topire. Entropia crete la vaporizarea apei cu 26 eu/mol i la
topirea gheii cu 5,3 eu/mol. Entropia poate fi prezentat pentru un proces
54
reversibil izoterm, de exemplu creterea entropiei la topirea gheii la 0 oC
(273 K), este dat de relaia:
q topire H topire
S
Ttopire Ttopire
(13)
unde T este temperatura absolut n grade Kelvin.
-6,9 ue
-10,3 ue
-13,1 ue
-21,1 ue
55
se constat o contribuie pozitiv a entropiei. Aceast ecuaie se aplic la
amestecarea soluiilor ideale n care nu exist interaciuni ntre molecule.
n cazul disocierii unor compui ionici vor rezulta mai multe
particule i implicit va crete entropia. Acest efect este n contra balan cu
efectul de solvatare. Formarea ionilor (anioni i protoni) n soluie apoas
n afara gheii duce la o cretere a entropiei, proces ce este urmat de
hidratare care determin o scdere semnificativ a entropiei. Entropia de
ionizare a acizilor slabi n ap este n jur de -22 ue. Treapta nti i a doua de
ionizare a aminoacizilor poate prezenta o descretere a entropiei datorit
unui grad nalt de ionizare a anionilor i a protonilor. Entropia de ionizare a
aminoacizilor n prima etap a cationului glicinei este de -7,3 ue iar pentru
etapa doua de ionizare este de -9,2 ue.
decurge cu o cretere a entropiei de 16,5 ue. Aceasta este mai ales datorit
mrimii foarte mari NAD+ fa de proton.
56
n care decurge spontan un proces se utilizeaz o alt funcie termodinamic
numit entalpie liber sau energia liber, G. Descreterea entalpiei libere a
unui sistem este egal cu lucrul util pe care-l poate produce sistemul n
cursul unui proces decurgnd la presiune i temperatur constant. Entalpia
liber, G, se definete:
G H TS (14)
G H TS (15)
qp q
S vec i S sis (16)
T T
G H
S vec Ssis S vec Ssis S vec S sis (17)
T T
G 0 (18)
57
Entalpia liber, G, ntocmai ca i entalpia, H, i entropia, S, sunt
proprieti extensive ale substanelor. Dimensiunea fizic a entalpiei libere
este aceeai cu a energiei (kcal/mol). Entalpia liber a unui proces este egal
suma algebric a entalpiilor libere ale substanelor ce particip la procesul
respectiv.
Ecuaia entalpiei libere (V.15.) exprim n form cantitativ
contribuia termenului entalpic (sau energetic), H (sau E) i a termenului
entropic, TS, la producerea sau consum de lucru i anume, n mecanic, de
lucru mecanic, n chimie, de lucru electric sau chimic etc.
Toate sistemele din natur tind spre o stare a entalpiei libere, G,
minim . Pentru atingerea acestei stri, sistemele tind s-i micoreze
entalpia, H (sau energia intern E=H - pV) i s-i mreasc entropia,
S. Contribuia fiecruia din cei doi termeni, H i S, depinde de
temperatur. La temperatur joas, termenul entalpic H determin sensul
procesului. La temperatur nalt, termenul entropic, TS joac un rol din ce
n ce mai mare. Cnd T este mic, TS este de asemenea i semnul, plus sau
minus, al lui H determin semnul lui G. Cnd T este mare, semnul lui
G, adic sensul n care decurge procesul spontan este determinat de ctre
termenul entropic, TS.
Starea de echilibru a unui sistem izolat este atins la valoarea
maxim a entropiei, care corespunde, de fapt, strii cu cea mai mare
probabilitate. n cazul unei transformri la presiune i temperatur constante
starea de echilibru corespunde la valoarea minim a entalpiei libere, deci:
dG = 0 sau G = 0 (19)
Tabel nr. V.3. Determinarea energiei libere standard la hidroliza ATP prin
nsumarea energiilor libere standard pentru alte dou reacii diferite.
Go(kcal/mol)
Glucoz + ATP Glucozo-6-fsfat + ADP -4,7
Glucozo-6-fosfat + H2O Glucoz + P -3,1
58
ATP + H2O ADP + P -7,8
aA + bB cC + dD
G d D c C a A b B (21)
59
C dD .C cC
G d oD c oC a oA b oB RT ln (22)
C aA .C bB
C dD .C cC
G G RT ln a b
o
(23)
C A .C B
La echilibru G = 0 i
C dD .C cC
K ech (24)
C aA .C bB
Prin urmare:
G o RT ln K ech (25)
60
C c .D d
G RT ln (26)
A a .B b
G / T
H (27)
1 / T p
G o nFE o (28)
61
unde n este numrul de electroni i F este o constant de proporionalitate
ntre electronvoli (nEo) i calorii. Constanta de proporionalitate F, numit
constanta lui Faraday, este egal cu 23.060 cal/eV. Simbolul Eo, este
potenialul standard a reaciei.
Alt expresie folosit este relaia ntre constanta de echilibru i
potenialul electric standard.
RT RT
Eo ln K ech 2,3 ln K ech (29)
nF nF
Aceast relaie deriv din ecuaia care prevede legtura dintre entalpia liber
i constanta de echilibru. Expresia logaritmic a relaiei prevede pentru o
modificare mic a potenialului o modificare nsemnat a constantei de
echilibru.
Relaia dintre potenial i concentraia reactanilor este dat de
ecuaia lui Nernst:
RT C dD .C cC
EE o
ln (30)
nF C aA .C bB
C exterior
j
j Z j F RT ln (31)
C int
j
erior
62
unde Cjexterior i Cjinterior sunt concentraiile speciilor de ioni j de pe structura
membranei, Zj este valena speciei j i este potenialul transmembranar.
Dac protonul este o specie de astfel de ion, aceast ecuaie devine:
H F RT ln pH (32)
A B C
B C
K1 0,1 i K2 10,0 (33)
A B
63
Constanta de echilibru pentru ntregul proces este un produs al constantelor
individuale de echilibru:
C
K1K 2 100 (34)
A
64
fi urmat de o nou hidroliz ce determin ireversibilitatea reaciei. Prima
reacie este folosit n cazurile n care reversibilitatea nu este admis, cum ar
fi n biosinteza acizilor nucleici. Cea de a doua reacie este folosit n multe
reacii n care este tolerat reversibilitatea. n acest caz energia degajat n
urma hidrolizei este utilizat pentru alte procese biochimice.
Valorile entalpiilor libere de hidroliz pentru civa compui este
prezentat n tabelul nr.V.4. Aici se poate vedea c se realizeaz o
considerabil entalpie liber atunci cnd grupa (grupele) fosfat sunt
hidrolizate la fiecare ATP sau ADP la AMP. De fapt, raiunea pentru entalpia
liber negativ relativ mare pentru primele dou hidrolize poate fi discutat
din dou puncte de vedere: factorii care conduc spre o instabilitate relativ
a reactantului, ATP, i factorii care conduc la stabilitatea relativ a
produilor de reacie. Compararea acestor dou reacii sugereaz dou
lucruri. Specia de reactant care produce o entalpie liber de hidroliz
ridicat are o mai mare ncrctura negativ i produce un proton n urma
hidrolizei. Contribuia diferiilor factori la energia liber de hidroliz este
destul de neclar.
H2O O- O- O- H2O
R-O-P-O-P-O-P-O-
O O O
1
2 H+
H+
O- O- O-
R-O-P-O-P-O- R-O-P-O-
O O O
+ +
O- O- O-
HO-P-O- HO-P-O-P-O-
O O O
65
TABEL NR. V.4. Entalpiile libere aproximative de hidroliz a
ATP i mai muli compui fosfatai de interes biologic.
Specia Produii de hidroliz Go kcal/mol
molecular
ATP4- ADP3- + HPO42- + H+ - 8,2
ATP4- AMP2- + H2P2O73- + H+ - 8,4
ADP3- AMP2- + HPO42- + H+ - 8,6
AMP2- Adenozin + HPO42- - 2,2
H2P2O73- + 2 HPO42- + H+ - 7,9
Acetilfosfat Acetat- + HPO42- + H+ -11,3
Fosfoenolpiruvat Piruvat- + HPO42- -14,7
Fosfocreatina Creatina+ + HPO42- -10,2
Fosforaginina Arginina+ + HPO42- - 9,1
K
ADP . HPO . H
3 2
4
ATP 4
(36)
66
Kf
ADP toate formele
. P toate formele
ATP toate formele
(37)
Valorile lui K pot fi calculate din K din urmtoarele expresii unde fATP,
fADP i fP sunt raportate ATP4- la ATP total, ADP3- la ADP total i HPO42- la
fosfatul anorganic total:
K fATP
Kf
.
H fADP.fP
(38)
ATP ATP 4 . 1 H
H 2
K 1 ATP K 1 ATP .K 2 ATP
1
fATP
1
H
H 2
(40)
K 1 ATP K 1 ATP .K 2 ATP
67
1,18x10-4
H2ADP- H+ + HADP-2
H2PO4- H+ + HPO4-2 1,66x10-7
ATP ATP 4
1 Mg
2
H
Mg
2
H 2
K ATPMg K 1 ATP K ATPHMg K 1 ATP K 2 ATP
Constantele KMgATP sunt constantele de echilibru pentru disocierea ionului
de magneziu din MgATP i respectiv din MgHATP:
Reacia acid-baz:
Donor de protoni H+ + acceptor de protoni
Reacii de oxido-reducere:
Donor de electroni e- + acceptor de electroni
68
Dup cum diferii acizi se deosebesc prin tendina lor de a pierde
protoni, tot aa diferii ageni reductori difer ntre ei prin tendina de a
pierde electroni. Tendina unui agent reductor de a pierde electroni (sau a
unui agent oxidant de a ctiga electroni) este dat de potenialul standard
de oxidoreducere, definit ca fora electromotoare (fem), n voli, dat de o
semicelul n care att reductorul ct i oxidantul se gsesc la o
concentraie de 1,0 M (pH = 7,0),temperatura de 25oC.
Prin convenie ecuaia la electrod este scris n sensul:
2H+ + 2e- H2
69
-0,324
NADP+ + 2H+ + 2e- NADPH + H+
acetaldehid + 2H+ + 2e- etanol -0,197
piruvat + 2H+ + 2e- lactat -0,185
oxalilacetat + 2H+ + 2e- malat -0,166
fumarat + 2H+ + 2e- succinat -0,031
2 citocrom bk(ox) + 2H+ + 2e- 2 citocrom bk(red) +0,030
ubiquinon + 2H+ + 2e- ubiquinol +0,100
2 citocrom cox + 2e- 2 citocrom cred +0,235
2 citocrom a3(ox) + 2e- 2 citocrom a3(red) +0,385
0,5 O2 + 2H+ + 2e- H2O +0,816
Fe+2 Fe+3 + e-
Fe(CN)6-4 Fe(CN)6-4 + e-
Eh E0
2,303
lg
acceptor de electroni (42)
nF
donor de electroni
n care: Eo este potenialul redox standard, Eh este potenialul de electrod
observat; R este constanta general a gazelor; T este temperatura n K; n este
numrul de electroni transferai i F sau faraday (23062 cal/V). La 25 o (298
70
K) termenul 0,303RT/nF are valoare 0,059 cnd n=1 i 0,03 cnd n=2.
Deoarece se obinuiete s se scrie echilibrele perechilor de electroni,
ecuaia lui Nernst se simplific:
E h E o 0,03 lg
acceptor de electroni (43)
donor de electroni
Ecuaia lui Nernst exprim matematic alura unei curbe de titrarea
unui donor de electroni dat cu un agent de oxidare puternic. Pe msur ce
titrarea progreseaz, o fraciune crescnd a donorului de electroni trece n
forma sa oxidat avnd ca rezultat creterea raportului [acceptor de
electroni]/[donor de electroni] pn la atingerea punctului de echivalen,
unde [acceptorul de electroni]=[donorul de electroni]. La acest punct
ecuaia lui Nernst se reduce la:
Eh = E o (44)
71
Figura nr. V.1.
Curbele de titrare de oxidoreducere a trei
perechi redox conjugate avnd diferite
poteniale standard, sau de echivalen
care pot fi extrapolate ducnd
perpendiculare la punctul de echivalen
la ordonat.
Hg.Hg2Cl2/KCl
RT RT RT
E cal E ocal ln K s ln[Cl ] E ' ln[Cl] (45)
2F F F
K s [ Hg 2 ][Cl ] 2
72
Se mai utilizeaz frecvent electrodul de argint clorur de argint,
electrod pe care are loc un proces reversibil care ne va da potenialul:
RT
E {AgCl,Cl } E {oAlCl,Cl } ln[Cl ] (46)
F
73