MECANISMELE MOLECULARE ALE EXPRESIEI GENICE. REGLAREA EXPRESIEI GENELOR Conf. dr. Cristina RUSU MECANISMELE MOLECULARE ALE EXPRESIEI GENICE Expresia informaiei genetice flux informaional, unidirecional i universal:
ADN genic ARNm PROTEIN transcripie translaie
NUCLEU i MITOCONDRII R I B O Z O M I Procesul este supus unui control riguros care regleaz: tipul de celul n care are loc sinteza proteinei, momentul, cantitatea i ritmul U.M.F IAI U.M.F IAI T R A N S C R I P I A - DATE GENERALE (1). Transcripia: procesul de copiere a informaiei unei gene - sub form codificat, complementar i antiparalel ntr-o molecul de ARN (2). ARN = polimer de ribonucleotide: [P R N]n ARN ADN: riboz n loc de deoxiriboz, uracil n loc de timin, micropolimer, monocatenar. ARN: codant = ARNm necodant ( gene ARN) cu roluri multiple: - n translaie (ARNr i ARNt); - n reglare (ARNmi; ARNsi; ARNa); - n procesarea altor molecule ARNsn), - parazit (retrovirusuri; retrotranspozoni) ADN ARNm Numr de catene 2 1 Coninut de gene Sute de gene O singur gen Structura genei Exoni i introni Numai exoni (fr introni) Baze azotate Purine: A, G Pirimidine: T, C Purine: A, G Pirimidine: U, C Sinteza Se copie ambele catene (35 continuu, 53 discontinuu) Se copie numai catena 35 Comparatie ADN ARNm matur U.M.F IAI A) TRANSCRIPIA: DATE GENERALE (3) Pentru sinteza ARNm sunt necesare: o caten (3 5) ADN ca matri;
ARN polimeraza II face sinteza ARNm;
factori de transcripie (fixeaz i poziioneaz ARNpol la promotor);
un mediator leag factorul de transcripie la ARNpolimeraz;
5'...AUGUUACGACGU... 3' ARNm U.M.F IAI TRANSCRIPIA: DATE GENERALE (4). Transcripia 2 etape: Formarea ARNm precursor (transcriptul primar) prin transcrierea integral a regiunii centrale a genei (Ex+In);
Procesarea ARNm precursor i formarea ARNm matur, ce prsete nucleul. U.M.F IAI 1. FORMAREA ARNm PRECURSOR a). Decondensarea regiunii din ADN care conine gena / genele ce vor fi transcrise prin: acetilarea histonelor din nucleozomi reduce condensarea fibrei cu nucleozomi;
repoziionarea nucleozomilor
Ambele mecanisme - implicate n REGLAREA expresiei genelor U.M.F IAI ETAPELE DE FORMARE A ARNm PRECURSOR b). Transcripia propriu zis (1). Iniierea transcripiei : fixarea i poziionarea ARN polimerazei II n regiunea promotor (pe secvenele TATA sau GC) astfel ca transcripia s nceap (la SIT) cu nucleotidul 1; se realizeaz cu ajutorul unor factori de transcripie (FT) i a unui mediator care leag FT la ARNpolimeraz . U.M.F IAI (2). Transcripia propriu-zis (elongaia) prin: Separarea celor dou catene ale ADN; Fixarea secvenial i complementar a ribonucleotidelor activate pe catena matri n sensul 35 !!!; Polimerizarea ribonucleotidelor (n sensul 5 3); Transcripia - codificat, complementar i antiparalel catenei matri. Copierea integral a exonilor + intronilor transcriptul primar U.M.F IAI (3). Terminarea transcripiei: Cand ARNpol ntlnete situsul de terminare a transcripiei se semnaleaz clivarea 3 a transcriptului primar; ARNm precursor va fi secionat (de nite nucleaze) n dreptul situsului de poliadenilare (de adaugare a cozii poliadenilice) U.M.F IAI 2. MATURAREA ARNm PRECURSOR a) Modificarea extremitilor: - 5 CAP se adaug 7-metil- guanozin; - 3 poli A se adaug coada poliadenilica (~ 200 adenine); Rol: crete stabilitatea, faciliteaz transportul ARNm i fixarea la ribozom
b) Procesarea (matisarea) ARN precursor: - decuparea precis i eliminarea intronilor: - legarea cap la cap a exonilor ARNm matur TRANSCRIPIA INVERS ADN ARN
transcripie invers
T. Invers = transcrierea unei molecule de ARN monocatenar ntr-o caten de ADNc, care va deveni apoi bicatenar (prin sinteza unei catene complementare).
Realizat de ctre transcriptaza invers / revers transcriptaz (H. Temin i D. Baltimore, Pr. Nobel, 1975).
Utilizat de: virusurile ARN; retrotransposoni, telomeraz precum i n tehnologiile ADN, pentru obinerea de gene U.M.F IAI Retrovirusurile (HIV; hepatit C,unele virusuri oncogene) au genom ARN sintetizeaz transcriptaz invers: transcrie genomului viral ARN ntr-o copie ADN complementar care apoi se integreaz n genomul ADN al gazdei i se reproduce odat cu acesta. Tratament = molecule ce inhib transcriptaza invers viral (ex. Retrovir; viramune etc).
Retrotransposoni secvene repetitive de ADN uman, transcrise n ARN i apoi retrotranscrise ntr-o copie ADN ce se va insera n alt loc n genom (amplificare; mutaii). U.M.F IAI U.M.F IAI
B) TRANSLAIA Translaia = procesul de decodificare a informaiei genetice din ARNm ntr-o secven specific de aminoacizi i polimerizarea lor ntr- o caten polipeptidic. Necesit: Un dicionar = CODUL GENETIC; Un APARAT DE TRANSLAIE (ce include traductorul = ARNt i ribozomii) U.M.F IAI CODUL GENETIC = un sistem de corespondene ntre o secven de 3 nucleotide (codon) i un anumit amino acid (Khorana i Nirenberg - Pr. Nobel, 1968) Cunoasterea codului genetic permite intelegerea mecanismului mutatiilor ! PROPRIETI:
3. DEGENERAT (4 3 = 64 codoni 20 AA) : 1 AA 2-6 codoni sinonimi; sistem TAMPON/ protecie contra efectelor mutaiilor m. silenioase;
4. NESUPERPOZABIL + FR VIRGULE (adiaceni); codonii sunt aezai unul dup altul, fr suprapuneri sau pauze intre codonii vecini;
5. LIPSIT DE AMBIGUITATE: un codon totdeauna acelai AA;
6. UNIVERSAL: un codon nseamn acelai AA la toate fiinele (cteva mici excepii n CG mitocondrial) U.M.F IAI APARATUL DE TRANSLAIE a) RIBOZOMII (Palade, Pr. Nobel, 1974) = platformele de asamblare a AA n Pr; - Alctuii din ARNr + Pr; - 2 subuniti.
b) ARN de transfer (ARNt) = translatorul care leag i transport AA la codonul corespunztor din ARNm
c) ENZIMELE i COFACTORII PROTEICI ai translaiei U.M.F IAI PROCESUL DE TRANSLAIE a) Iniierea translaiei plasarea primului AA n dreptul codonului iniiator AUG din ARNm;
b) Elongaia aezarea secvenial a AA (pe baza ordinii codonilor din ARNm) + polimerizarea lor = polipeptid;
c) Terminarea translaiei oprirea sintezei la codonul STOP U.M.F IAI AMPLIFICAREA SINTEZEI DE PROTEINE O celul poate produce cantiti mari dintr-o anumit protein pe baza informaiei unei singure gene.
Explicaiile amplificrii: Prin transcripie se pot produce copii multiple a unui ARNm; Fiecare ARNm poate fixa zeci de ribozomi copii multiple protein Aceste procese presupun o reciclare rapid a materialelor folosite: ARN, ribozomi, enzime etc U.M.F IAI LOCALIZAREA sau SORTAREA PROTEINELOR Dup sintez proteinele sunt orientate spre un anumit compartiment celular sau sunt secretate la exteriorul celulei: Sortarea proteinelor exportate la exteriorul celulei prin reticulul endoplasmic sau aparatul Golgi de cele ce vor rmne n celul; Transportul proteinelor intracelulare n: nucleu, mitocondrii, lizozomi, peroxizomi, membran.
Realizat pe baza unor secvene semnal (din structura proteinei), un veritabil cod potal, ce indic adresa sa de destinaie (Blobel, Pr. Nobel, 1999);
Sortarea corect este esenial pentru celul; erorile vor genera boli (ex. adrenoleucodistrofie) U.M.F IAI MODIFICRILE POST-TRANSLAIONALE ALE PROTEINELOR Determin funcia proteinelor Dup sintez se produc: Configuraia spaial, tridimensional specific; Modificri reversibile: fosforilarea serinei sau acetilarea lyzinei; Modificri permanente: Structurale: puni disulfidice; clivare enzimatic a unui precursor inactiv (pro-hormon; pro-ferment); Adiia unor grupri funcionale; ex., glicozilare, adugare de lipide etc Adugarea altor proteine U.M.F IAI Conformaia unei proteine este crucial pentru celul;
Exist sisteme de control de calitate care:
asigur c proteina este corect plicaturat; distrug proteinele eronat plicaturate nainte ca ele s omoare celula BOAL
Perturbarea acestor sisteme boli; ex. boli ale SNC: b. Huntington; g. Alzheimer; scleroza lateral amiotrofic; b. Parkinson U.M.F IAI REGLAREA EXPRESIEI GENELOR Toate celulele corpului posed aceeai informaie genetic (rezult prin mitoze succesive din zigot). Expresia genelor este diferit, datorit unor mecanisme complexe de reglare a expresiei genice. Unele gene (constitutive) exprimate continuu, n toate tipurile celulare produc proteine permanent necesare metabolismului celular.
Alte gene (autorizate): au o expresie limitat la anumite esuturi specifice difereniere celular. Expresia genelor autorizate s se exprime poate fi limitat temporal (stadii diferite ale dezvoltrii) i adaptat la stimulii extracelulari (ex).
Multe alte gene sunt complet i permanent inactivate. U.M.F IAI REGLAREA PRE-TRASNCRIPIONAL (EPIGENETIC) A EXPRESIEI GENELOR Vizeaz expresia spaial a anumitor gene n anumite esuturi i tipuri celulare: selecia unor gene n celulele embrionare nedifereniate i meninerea expresiei lor la celulele descendente (difereniate).
Se realizeaz prin modificarea configuraiei cromatinei (despiralizare) care permite accesul ARN pol + factorilor de transcripie la promotorul genelor transcripie. U.M.F IAI Modificrile conformaiei cromatinei NU intereseaz secvena de nucleotide (informaia genetic) i se numesc modificri epigenetice:
Metilarea ADN condensarea cromatinei represie genic; ex. Amprentarea genomic una din genele alele de pe o pereche de cromozomi omologi este represat Inactivarea unui cromozom X U.M.F IAI REGLAREA TRASNCRIPIONAL A EXPRESIEI GENELOR Vizeaz reglarea activitii ARN polimerazei II (transcriptaza). Se realizeaz prin interaciunea
unor FACTORI DE TRANSCRIPIE cu anumite SECVENE ALE PROMOTORULUI determin transcripia anumitor gene n anumite esuturi, ntr-un anumit moment cu o anumit intensitate. U.M.F IAI REGLAREA POST-TRASNCRIPIONAL A EXPRESIEI GENELOR Vizeaz moleculele de ARN sintetizate prin transcripie. Mai multe mecanisme din care importante sunt: Matisarea alternativ o gen produce mai multe molecule de ARNm diferite (prin selecia exonilor) mai multe proteine diferite; de ex, calcitonina i neuropeptidul nrudit cu calcitonina (v. cursul precedent);
Interferena ARN (RNAi) A. Fire i C.Mello Pr. Nobel 2006 U.M.F IAI INTERFERENA ARN ARNi mecanismul prin care se inhib expresia genic cu ajutorul unor molecule mici de ARN complementar intei: Genomul ARN al unor virusuri (HIV, polio, hepatita C etc) sau ARNm produs de genele virale;
Gene din genomul ADN al celulei.
Rolul cheie n acest proces l au: ARNsi (small interfering RNA) acioneaz n citoplasm unde recunosc i cliveaz enzimatic moleculele de ARN int (virale);
ARNmi (microRNAs) produs prin transcripia unor gene ADN reglatorii acioneaz n nucleu i prin metilare blocheaz transcripia altor gene (n special n procesul de difereniere celular) U.M.F IAI REGLAREA EXPRESIEI GENICE: CONCLUZII Proces foarte complex care se realizeaza in fiecare etapa a fluxului informational: ADNARNmPROTEINA
Regleaza expresia anumitor gene in anumite tesuturi;
Genele autorizate se exprima in anumite momente ale dezvoltarii si in anumite etape ale ciclului celular , cu o anumita intensitate, determinata de stimulii extracelulari