Structura Acizilor Nucleici

Olariu Alexandra

Cuprins
1.Importan 2.Acizii nucleici 3.Structura bazelor azotate 4.Structura pentozelor 5.Strucura nucleotidelor 6.Structura ADN-ului

Argument
Biologia reprezint zona dintre stin i realitate care poate lega aceste dou aspecte i s formeze un prag de nelege a ceea ce suntem de fapt. Am ales aceast tem deoarece este un capitol interesant din puncul meu de vedere .Scopul acestui proiect este de a informa pe oricine este interesat sa descopere tainele biologiei genetice.

Importana biomedical a acizilor nucleici: baza chimic a ereditii

Un clugr din secolul XIX pe nume Gregor Mendel a introdus pentru prima oar noiunea de gen: unitate de baz responsabil pentru deinerea i transmiterea a unei caracteristici unice. Iniial s-a crezut c proteinele car informaia genetic, pn la mijlocul secolului XX, cnd s-a descoperit c ADN-ul este baza ereditii, datorit faptului c este capabil de auto-replicare.

Acizii nucleici sunt ADN-ul i ARN-ul

ADN ARN Sediul principal al Diferitele tipuri de localizrii ADN-ului ARN sunt localizate n este nucleul celulelor. nucleu, citoplasm, mitocondrii, ribozomi. Sedii secundare sunt: mitocondriile i cloroplastele (n celula vegetal).

Dogma Central a geneticii moleculare

DNA

Acid dezoxiribonucleic

Propus de ctre Francis Crick n 1958 pentru a descrie fluxul informaiei genetice n celul. Informaia depozitat n ADN este transferat ARN-ului, care mai departe o transfer proteinelor.

RNA

Acid ribonucleic

Dogma Central propus de Crick a suferit numeroase revizii n ultimii 47 de ani.

Protein

Dogma Central a Geneticii

ADN
Transcriere

ARN

proteine
Traducere

transcrierea = transferul informaiei genetice de la ADN la ARN (sintez de ARN pe matri de ADN) traducerea = transferul informaiei genetice de la ARN la proteinele functionale, a cror secven de aminoacizi este codificat n structura ADN-ului. replicarea = transferul informaiei genetice de la celula mam la celulele-fiice prin copierea ADN-ului parental cu formarea a dou molecule de ADN cu structur identic ADN-ului parental

Dogma Central Revizuit

Recombinarea= reaaranjarea materialului genetic Mutaii/Reparare = lezarea ADN cu alterarea informaiei genetice/ corectarea leziunilor ADN

Revers- transcrierea = transferul informaiei genetice de la ARN la ADN

Ce sunt acizii nucleici (ADN and ARN)?

Acizii nucleici sunt polinucleotide (produi de policondensarea aunor uniti denumite nucleotide). Nucleotidele reprezint unitatea monomeric a acizilor nucleici i sunt compuse din: - o baz azotat heterociclic: - purine: adenin (A) i guanin (G) - pirimidine: citozin (C) i timin (T) pentru ADN citozin (C) i uracil (U) pentru ARN - o pentoz: - dezoxiriboza (este prezent n ADN) - riboza (este prezent n ARN) - fosfat

STRUCTURA BAZELOR AZOTATE

Pirimidinele
Citozina
NH2
4 5 3 2

Timina
O H3C NH O

Uracil
O NH

NH
1

NH

NH

Atomii heterociclului pirimidinic sunt numerotai de la 1 la 6 (astfel ncat atomii de N din ciclu s primeasc indicele minim).

Bazele azotate prezint fenomenul de tautomerie

NH2 NH2 C N N NH C NH

NH

forma amino

forma imino

Citozina

C HN O N

C OH

forma lactam

forma lactim

Bazele azotate prezint fenonemul de tautomerie

Formele mai stabile:
Forma lactam este mai stabil dect forma lactim Forma amino este mai stabil dect forma imino
n acizii nucleici exist formele lactam i amino

Purine
Adenina
NH2
6 1

Guanina
O N
7

N
2

HN H2N N

N NH

N
3

NH
9

Atomii heterociclului purinic sunt numerotai de la 1 la 9 (astfel ncat atomii de N din ciclu s primeasc indicele minim).

STRUCTURA PENTOZELOR DIN ACIZII NUCLEICI

Pentoze
Riboza
HO

Dezoxiriboza
HO CH2 OH O
1

5 CH2
4

OH O
2

OH OH

OH

lipsete 2-OH

Atomii de carbon ai pentozelor sunt numerotai de la 1 la 5. Pentoza din ADN este dezoxiriboza, cruia i lipsete gruparea hidroxil 2-OH. Pentoza din ARN este riboza.

STRUCTURA NUCLEOZIDELOR

Structura nucleozidelor: baz + pentoz

Nucleozidele sunt derivai ai bazelor azotate care au o pentoz legat de un atom de azot din heterociclu: N9 pentru purine N1 for pirimidine printr-o legtur -Nglicozidic.

Legtur -N-glicozidic

STRUCTURA NUCLEOTIDELOR

Structura nucleotidelor
Nucleotidele sunt compose din nucleozide (bas + pentoz) i 1, 2, sau 3 grupri fosfat (se formeaz o legtur esteric ntre fosfat i 5-OH). Mononucleotide (nucleozid-monofosfat)= nucleozid + 1 fosfat Nucleozid-difosfat = nucleozid + 2 fosfat Nucleozid-trifosfat = nucleozid + 3 fosfat

Terminologie Ribonucleozide/Ribonucleotide (pentoza = riboz)

Baza Adenina (A) Nucleozidul Adenozina (A) Nucleotidul Adenozin monofosfat (AMP) sau adenilat Adenozin difosfat (ADP) Adenozin trifosfat (ATP)

Terminologie Ribonucleozide/Ribonucleotide (pentoza = riboz)

Baza Adenina (A) Nucleozidul Adenozina (A) Nucleotidul Adenozin monofosfat (AMP) Adenozin difosfat (ADP) Adenozin trifosfat (ATP) Guanozin monofosfat (GMP) Guanozin difosfat (GDP) Guanozin trifosfat (GTP) Citidin monofosfat (CMP) Citidin difosfat (CDP) Citidin trifosfat (CTP) Uridin monofosfat (UMP) Uridin difosfat (UDP) Uridin trifosfat (UTP) Timidin monofosfat (TMP) Timidin difosfat (TDP) Timidin trifosfat (TTP)

Guanina (G)

Guanozina (G)

Citozina (C)

Citidina (C)

Uracil (U)

Uridina (U)

Timina (T)

Timidina (T)

Terminologie comparativ
Ribonucleotide
Adenozin monofosfat (AMP) sau adenilat
Adenozin difosfat (ADP) Adenozin trifosfat

Dezoxiribonucleotide
Dezoxiadenozin monofosfat (dAMP) sau dezoxiadenilat
Dezoxiadenozin difosfat (dADP) Dezoxiadenozin trifosfat (dATP)

Terminologie Dezoxiribo-nucleozide/nucleotide (cnd pentoza = dezoxiriboz)

Baza Adenina (A) Nucleozidul Dezoxiadenozina (A) Nucleotidul Dezoxiadenozin monofosfat (dAMP) Dezoxiadenozin difosfat (dADP) Dezoxiadenozin trifosfat (dATP) Dezoxiguanozin monofosfat (dGMP) Dezoxiguanozin difosfat (dGDP) Dezoxiguanozin trifosfat (dGTP) Dezoxicitidin monofosfat (dCMP) Dezoxicitidin difosfat (dCDP) Dezoxicitidin trifosfat (dCTP) Dezoxiuridin monofosfat (dUMP) Dezoxiuridin difosfat (dUDP) Dezoxiuridin trifosfat (dUTP) Dezoxitimidin monofosfat (dTMP) Dezoxitimidin difosfat (dTDP) Dezoxitimidin trifosfat (dTTP)

Guanina (G)

Dezoxiguanozina (G)

Citozina (C)

Dezoxicitidina (C)

Uracil (U)

Dezoxiuridina (U)

Timina (T)

Dezoxitimidina (T)

Funciile fiziologice ale nucleotidelor

Crmizi pentru sinteza acizilor nucleici Compui macroergici care furnizeaz energia necesar diferitelor procese biologice (ex. ATP, GTP) Reglatori alosterici ai diferitelor enzime (ex.ADP e activator alosteric al ICDH din ciclul Krebs) Donori de grupe metil (ex.S-adenozilmetionina) Mesageri intracelulari ai hormonilor hidrofili (ex. AMPc, GMCc)

Nucleotide naturale libere: AMPc

NH2 N N
O CH 2

Adenine

N N

Ribose
OH

O P O

3,5adenozin monofosfatul ciclic (AMPc) este mesager secund imlicat n transmiterea mesajului hormonal din mediul extracelular n interiorul celulei.

AMPc

STRUCTURA ADN 1. structura primar 2. structura secundar 3. structura teriar

STRUCTURA PRIMAR A ADN-ULUI

O HN H2N
5' end HO

Guanine
N N

Lanul polinucleotidic al ADN (structura primar/covalent)

N
CH 2

NH2 N

Cytosine
O

3linkage

O O P O O
CH 2

N
O

ADN este un polidezoxiribonucleotid n care gruparea 3OH a unui dezoxiriobonucleotid este legat la gruparea 5OH a dezoxiriobonucleotidului vecin printr-o legtur fosfat diesteric. Lanul polinucleotidic este polar:prezint dou capete distincte.

5linkage

O P O O
H3C O

Captul 3este cel cu gruparea 3OH liber. Thymine Captul 5este cel cu gruparea 5OH liber sau fosforilat. NH
O

NH

O P O O

CH 2

Lanul polinucleotidic al ADN este ncrcat negativ la pH-ul fiziologic.

OH 3' end

O HN H2N
5' end HO

Reprezentare simplificat a lanului ADN

Guanine
N N

N
CH 2

Pentoza: linie orizontal

NH2 N

OH 5 P 5 3 C 3 G

Cytosine
O

Baza: litera corespondent Leg. fosfodiesteric: linie oblic i P la mijloc

O O P O O
O CH 2

N
O

P
O H3C

O P O O

Thymine
NH

NH

P 5 OH 3 T

O P O O

CH 2

OH 3' end

Reprezentarea simplificat a catenei de ADN

O HN H2N
5' end HO

Guanine
N N

N
CH 2

NH2 N

Cytosine
O

Prin convenie o caten de ADN se scrie n direcia 5- 3.

O O P O O
O CH 2

N
O

ex. GCT nseamn 5GCT 3

O P O O
H3C O

Thymine
NH

NH

O P O O

CH 2

OH 3' end

ntrebare

Identificai care este captul 3al acestui oligonucleotid? Scriei reprezentarea simplificat a acestui oligonucleotid.

STRUCTURA SECUNDAR A ADN

Dublu helixul ADN

Watson i Crick au decoperit c structura secundar a ADN este un dublu helix format din dou catene de ADN asociate prin mperecherea bazelor Inelele glucidice legate prin resturi fosfat constituie scheletul extern al dublu helixului, n timp ce bazele azotate hidrofobe sunt orientate spre interior i perpendicular pe axa helixului. ADN-ul uman conine aproximativ 3,5 x 109 perechi de baze.

Dublul helix al ADN ( structura secundar)

1. Stabilitatea ADNdc este asigurat de: - interaciunile hidrofobe dintre bazele azotate suprapuse (stivuite) de pe aceeai caten - legturile de hidrogen ce se stabilesc ntre bazele azotate de pe o caten i cele complementare de pe cealalt caten. 1. Cele dou catene de ADN sunt antiparalele.

ADN dublu helix (structura secundara)

3. G-C are 3 legturi de H. A-T are 2 legturi de H. Cele dou catene sunt complementare (G is complementar C, A is complementare T). Nr. A = Nr. T Nr. G = Nr. C

4.

5.

Dublu helix ADN (structura secundar)

6. Exist mai multe confomaii ale ADN; Conformaia B: descris de Watson i Crick are orientare dreapt, pasul dublu helixului este 34 (3,4nm), diametrul de 2nm, iar nr. perechi baze per tur este 10; cea mai rspndit. Conformaia A: dublu helix de dreapta dar mai compact, pasul elicei este de 2,8nm, nr. perechi baze per tur este 11. Conformaia Z: dublu helix de stinga, pasul elicei 4,56nm i nr. perechi baze per tur este 12.

STRUCTURA TERTIAR A ADN: polinucleozomul

De la ADN la cromozomi
In eucariote ADN-ul este stocat n nucleu. Deoarece nu este suficient sapiu iar molecula ADN-ului este extrem de mare (lungimea ADN de la o singur celula uman e 2m!!!), ADN-ul trebuie compactat.
Exist cinci nivele de compactare a ADN care conduce la o scdere de 10.000 de ori lungimii ADN.

Nivelele de compactare a ADN n nucleu -Primul nivel-

Dublul helix de ADN se nfoar n jurul unui octamer proteic format din histonefiecare unitate de ADN spiralat de 1,75 ori n jurul unui compelx histonic se numete nucleozom.

Histonele sunt proteine bazice cu mas molecular mic (max. 20.000), bogate n aa bazici (Arg pt.H2A, H2B i, Lys pt H3, H4).

Nivelele de compactare a ADN n nucleu -Primul nivel-

n jurul octamerului histonic (H2A H2B H3 H4)x2 este spiralat ADN-ul nucleozomic fomat din 140 perechi de baze. Nucleozomii sunt legai ntre ei prin ADN intrenucleozomic sau ADN linker format din 30 perechi de baze).Histona H1 itercaioneaz cu ADN linker, avnd rol n superspiralizarea nucleozomilor. Polinulceozomul seamn cu nite mrgele pe a (=fibrile de cromatin de 10nm ).

Mrgele de ametist

Aparena de mrgele pe a a ADN

Nivelele de compactare a ADN n nucleu -al doilea nivel Polinucleozomul se superspiraleaz pentru a forma structura de solenoid.
Solenoidul conine 6-7 nucleozomi per tur.Pasul e de 10nm, diametrul de 30 nm. Solenoidul formeaz fibrele de cromatin de 30 nm.

Nivelele de compactare a ADN n nucleu -nivelele 3,4 i 5-

r
- Fibrele de cromatin se compacteaz i mai mult form domenii n form de bucl. - Aceste domenii n bucl sunt superspiralizate i organizate n structuri distincte numite cromozomi. - ADN -ul uman nuclear ( genomul) const n 23 perechi de cromozomi.

Diferena dintre celulele diploide i celulele haploide

Majoritatea celulelor eucariote conin perechi de cromozomi i sunt astfel denumite diploide. Celulele care conin cromozomi nepereche sunt denumite haploide.