Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Proteine
Sunt cele mai abundente macromolecule din celulele organismelor vii; Se disting prin mare diversitate structural i funcional; Toate proteinele sunt constituite din 20 de aminoacizi, legai covalent n secvene specifice.
Aminoacizii
Aminoacizii prezeni n structura proteinelor (20) sunt specificai de codul genetic i sunt denumii aa standard, primari, normali sau proteinogeni. Aa. naturali sunt -aa n care gruparea carboxil i amino sunt legate la acelai atom de carbon C; Proprietile aminoacizilor sunt determinate de gruprile care sunt grefate pe atomul de carbon din poziia . La acest atom de carbon se disting urmtoarele grupri: a) gruparea amino-grupare protonat (-NH3+) n condiii de pH fiziologic; b) gruparea carboxil-grupare deprotonat (-COO-) n condiii de pH fiziologic; c) catena lateral R-confer proprieti specifice aminoacizilor, fiind responsabil i de asimetria atomului de carbon din poziia .
Clasificarea dup structura chimic n funcie de gruprile din cadrul structurii generale (R) , aminoacizii se pot clasifica astfel: Aminoacizi cu R alifatic Glicina
Gly G
Ala A Val V Leu L
Alanina
Valina
Treonina
Leucina
Aminoacizi cu S in R Cisteina
Izoleucina
Ile I
Cys C
Met M
Metionina
Arginina Asparagina
Lizina
Lys K
Histidina
Glutamina
His H
Tirozina
Tyr Y
Triptofan
Trp W
Prolina
Aminoacizi neproteinogeni- aminoacizii care nu intr n compozitia proteinelor: -ornitina i citrulina -apar n ciclului ureei; -homocisteina; -Acid -aminobutiric GABA- rol de neurotransmitor --acid p-aminobenzoic- component al acidului folic -5-hidroxi-triptofan un precursor al serotoninei i un intermediar n metabolismul triptofanului; -homoserina este un intermediar al catabolismului metioninei; -taurina intr n componena acizilor biliari; --Alanina este parte a coenzimei A.
Aminoacizii eseniali nu pot fi sintetizai de organismul uman Aminoacizii care nu pot fi sintetizai de organismul uman, i ca atare pot fi suplimentai prin aport alimentar, poart se numesc aminoacizi eseniali. Pentru organismul uman sunt aa eseniali: valina, leucina, izoleucina, fenilalanina, triptofan, lisina, metionina i treonina. Ceilali aminoacizi, pot fi sintetizai de organismul uman plecnd de la aminoacizii eseniali sau prin scindarea proteinelor, i sunt denumiti neeseniali: alanina, asparagina, aspartat, glutamat, glutamina, glicina, prolina, serina, arginina, histidina. Aminoacizii semieseniali se pot forma n organism din metionin i fenilalanin: cisteina, tirozina.
Proprietile aminoacizilor
Proprieti fizice Aa sunt substane solide, cristaline, cu puncte de topire ridicate, solubili n solveni polari (ap, etanol) i insolubili n solveni nepolari (eter, cloroform, benzen); Toi -aa, cu excepia Gly prezint izomerie optic, datorit prezenei atomului de C asimetric (cele 4 valene sunt realizate de substitueni diferii) , ceea ce determin apariia stereoizomerilor optic activi. Nr. maxim de stereoizomeri ai unui compus cu n atomi de C asimetrici n molecul este 2n . Compuii optic acivi sunt mprii n 2 serii D i L, dup nrudirea conformaional cu glicerina. Aa cu configuraia atomului C identic cu a C* din D-gliceralidehid aparin seriei sterice D, iar cei cu configuraia atomului C identic cu a C* din Lgliceralidehid aparin seriei sterice L. Aa naturali aparin seriei L (L- aa); D-aa apar ocazional n organism: celule canceroase, bacterii antibiotice).
Proprieti acido-bazice ntre gruparea acid i cea bazic exist un transfer de protoni
Aa au caracter amfoter, n mediu acid se comport ca baz iar n mediu bazic ca acid Echilibrul reaciei este deplasat spre dreapta, att n cristale ct i n soluie. Capacitatea de tampon- capacitatea de a se opune modificrii pH-ului soluiei la adugarea de acizi sau baze n cantiti limitate. Pentru caracterizarea capacitii de tampon se utilizeaz exponeni de aciditate pKa pKa= -logKa , Ka este constanta de aciditate n funcie de pH-ul soluiei, aa sunt sub form de cationi, anioni sau amfioni.
pH izoelectric pH-ul la care aa este sub form de amfion i are sarcina net nul se numete pH izoelectric (pHi sau pI) La acest pH aa au solubilitate minim i nu migreaz n cmp electric. La pH<pI aa este ncrcat pozitiv La pH>pI aa este ncrcat negativ
Pentru aa monoamino-monocarboxilici pI este dat de semisuma valorilor pKa ale gruprilor -COOH i -NH3 Considerm reacia de disociere: HA = A- + H+ pI= pK-COOH + pK-NH3 / 2
Pentru aa care conin grupri acide sau bazice n catena lateral, pI este dat de semisuma valorilor pKa ale speciilor care genereaz amfionul.
Histamin GABA
2. Reacii ale gruprii NH2 Reacii de condensare cu compui carbonilici cu formare de azometine R-CH-COOH + R-C=O R-CH-COOH
NH2 H (R) N=CH(R)-R Reacia de alchilare (metilare) cu formare de betaine R-CH-COOH + CH3X R-CH-COONH2 -3HX N(CH3)3
Reacia de acilare rezultnd amide N-substituite C6H5-COOH + H2N-CH2-COOH C6H5-CO-NH-CH2-COOH Acid benzoic glicina -H2O benzoil glicina (acid hipuric) Reacii de dezaminare cu ndeprtarea gruprii amino, sub form de amoniac a. Dezaminarea reductiv R-CH-COOH + 2H R-CH2-COOH + NH3 NH2 acid carboxilic b. Dezaminarea oxidativ R-CH-COOH R-C-COOH NH2 -2H NH iminoacid
R-C-COOH + NH3
O cetoacid
Reacia cu NH3 cu formare de amide Ex. reacia de formare a glutaminei, care transport amoniacul i-i reduce toxicitatea
+ NH3 + ATP
Acid glutamic glutamina
+ ADP
Reacii ale gruprilor OH cu formare de esteri Aa. Ser, Thr, Tyr formeaz cu acidul fosforic esteri fosforici care au roluri biologice. Reacii ale nucleelor aromatice (halogenarea) Reacii ale gruprii SH Cys Cys Cistina (prin oxidare blnd) Taurina (oxidare energic)
- Legtura peptidic este o legtur de tip amidic, format prin eliminarea unei moleule de ap ntre gruparea COOH a unui aa i gruparea NH3 a altui aa